Биология клетки/Одностраничная версия: различия между версиями

м (замена категории на шаблон для работы полки, removed: Категория:Биология с помощью AWB)
<span style="background-color:Aqua"><big>'''Биология клетки'''</big></span>{{stage short|50%|12 сентября 2009}}
{{Учебник
|Иллюстрация = [[Файл:P_CellP Cell.svg|left|45px]]
|Название = Биология клетки
|Описание = Данная книга — разноуровневый учебник, рассчитанный на всех, кто интересуется клеточной биологией и общими проблемами биологии. В первую очередь он предназначен для школьников старших классов биологического профиля и студентов биологических факультетов вузов.
|Дисциплины = Биология
}}
 
{{ВикиверситетИ|Лаборатория биоинформатики}}
'''Доступны две версии учебника:'''
* [[Биология клетки/Одностраничная версия|Одностраничная версия]]
* [[Биология клетки/Многостраничная версия|Многостраничная версия]] (для экономии трафика)
 
Данная книга — разноуровневый учебник, рассчитанный на всех, кто интересуется клеточной биологией и общими проблемами биологии. В первую очередь он предназначен для школьников старших классов биологического профиля и студентов биологических факультетов ВУЗов.
'''Полезные сайты для пользователей даного учебника:'''
 
* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mboc4.TOC&depth=2| Molecular Biology Of The Cell, 4е издание, 2002 г. — учебник по молекулярной биологии на английском языке]
'''Жирным шрифтом''' или <big>крупными буквами</big> выделен наиболее простой материал, обязательный для запоминания при изучении школьной программы или при подготовке в ВУЗ. Обычный шрифт — основная часть информации, часто необходимая для понимания того, что выделено жирным или крупным шрифтом. <small>Мелкий шрифт</small> — сведения из истории науки или другая информация, интересная лишь части читателей. ''Курсив'' — материал повышенной сложности, предназначенный в основном для студентов биологических специальностей или для тех, кто серьезно интересуется клеточной и молекулярной биологией.
 
Полезные сайты для пользователей данного учебника:
 
* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mboc4.TOC&depth=2| Molecular Biology Of The Cell, 4е издание, 2002 г. — учебник по молекулярной биологии на английском языке]
* [http://lib.e-science.ru/book/104/ Молекулярная биология клетки 2-е издание (без иллюстраций)]
* [http://yanko.lib.ru/books/biolog/nagl_biochem/index.htm Наглядная биохимия Ян Кольман, Клаус-Генрих Рем, Юрген Вирт]
* [http://www.googleelementy.ru/#hl=ru&q=%D1%8D%D0%BB%D0%B5%D0%BC%D0%B5%D0%BD%D1%82%D1%8B&lr=&aq=0s&fp=5beb1b94e2ce7627 Элементы: Популярный сайт о фундаментальной науке]
* [http://humbio.ru/ База знаний по биологии человека]
* Проект [[v:en:Cell Biology|«Cell Biology»]] в Wikiversity (на английском языке)
 
{{BookCat}}
 
= Часть 1. Клетка как она есть =
{{Темы|Биология}}
 
== Введение ==
 
=== Клетка — основа жизни ===
<big>[[w:Клетка|Клетки]] — маленькие мешочки, окруженные очень тонкой жировой пленочкой и содержащие водный раствор нескольких тысяч разных молекул. Большинство организмов на Земле (по численности - наверняка, по биомассе - вероятно, а возможно, и по числу видов) — одноклеточные: их тела состоят из одного такого мешочка. Но и тела крупных организмов — белого гриба, сосны или человека — состоят из множества подобных мешочков. В организме человека их более 10<sup>13</sup> — 10.000.000.000.000 штук!
Как это ни удивительно, каждый из этих мешочков — живой. Он обладает всеми основными свойствами живого, в том числе главным из них — способен размножаться с сохранением наследственных свойств. </big>
 
; Задание
: Прежде чем читать дальше, перечислите основные свойства живого. После выполнения задания — см. [[#Основные научные проблемы биологии и их связь с изучением клеток|Основные научные проблемы биологии и их связь с изучением клеток]]
Благодаря каким своим свойствам клетка — живая? Поиски ответа на этот вопрос, выяснение деталей строения и работы клеток — одно из главных направлений работы современных биологов.
 
=== Уровни организации живого и система биологических наук ===
 
==== Обычно выделяют четыре основных уровня организации живого ====
<big>Клетки, живые организмы и в целом жизнь на Земле представляют собой сложные [[w:Система|системы]]. Для этих систем характерна иерархичность — одни системы входят в состав других (систем более высокого уровня) в качестве их подсистем. У более сложных систем высшего уровня появляются новые свойства, которые на предыдущем уровне отсутствуют. Кроме того, системы разного уровня имеют очень разные [[w:Меры длины|размеры]]: от нескольких [[w:нанометр|нанометров]] (крупные молекулы и мелкие [[w:органоиды|органоиды]]) до нескольких тысяч километров (крупные [[w:экосистема|экосистемы]] и вся [[w:биосфера|биосфера]]). Обычно выделяют четыре основных уровня организации -
* молекулярно-клеточный,
* организменный,
* популяционно-видовой,
* экосистемный.</big>
 
; Вопрос 1
: Какие принципиально новые свойства появляются на каждом из четырех основных уровней организации?
 
Преимущество этого подхода — в том, что любая живая система «включена» во все эти уровни организации. Недостатки — прежде всего в том, что к каждому из этих уровней относятся системы принципиально разного уровня сложности. Даже клеточный уровень включает клетки прокариот и эукариот — а это как раз системы принципиально разного уровня сложности. Организменный же уровень включает и бактерий, и человека — системы, еще сильнее различающиеся по уровню сложности. Кроме того, до уровня вида все объекты этой классификации связаны генетически и представляют собой систему с единым [[w:генофонд|генофондом]]. [[w:Экосистема|Экосистема]], даже несмотря на наличие [[w:Горизонтальный перенос генов|горизонтального переноса генов]], такой системой не является. Эти недостатки побуждают многих авторов искать другие критерии выделения уровней организации — например, использовать длительность их существования (выделяя [[w:онтогенез|онтогенетический]] и [[w:филогенез|филогенетический]] уровни).
 
; Вопрос 2
: Какие из основных уровней относятся к онтогентическому, а какие — к филогенетическому?
 
Часто (особенно в школьных учебниках и программах) предлагается выделять более дробные уровни:
* Молекулярный
* Субклеточный
* Клеточный
* Тканевой
* Органный
* Организменный
* Популяционно-видовой
* Биоценотический (экосистемный)
* Биосферный
 
Недостатки такого варианта еще более очевидны.
 
; Вопрос 3
: Какие недостатки вы видите в дробной иерархии уровней?
 
; Задание
: Попробуйте предложить свои критерии для выделения уровней организации и создать свою классификацию этих уровней.
 
<small>Впрочем, иногда на вопрос "''Какие бывают уровни организации живого?''" от учащегося могут требовать и ответа вроде "'''Ядерный и доядерный'''". Под такую классификацию также могут попадать системы разной сложности, но на вышеупомянутом клеточно-молекулярном уровне все они будут обладать гораздо более схожими свойствами.</small>
<!-- Полагаю, в основном только в школьной традиции принято выделять подобные иерархичные структуры, хотя, возможно, предложенная классификация бытует только между молекулярными биологами.-->
 
==== Особенности клеточного уровня ====
Главная особенность клеточного уровня состоит в том, что только целая клетка имеет все '''основные признаки живого''', причем не только потому, что клетка обладает всеми этими признаками, но и потому, что существуют популяции и виды одноклеточных организмов. Более того — недавно была открыта и экосистема, состоящая из единственного вида бактерий <ref>http://elementy.ru/news/430872</ref> <ref>http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/322/5899/275</ref><ref>[[w:en:Desulforudis audaxviator|Desulforudis audaxviator]]</ref>. С момента появления первых клеток жизнь, несомненно, уже существовала в виде экосистем, то есть начала приобретать современные [[w:Геохимический цикл углерода |геохимические функции]].
 
==== Система биологических наук. Разделы биологии, изучающие клетку ====
Сложность живых систем отражена в сложности биологии как науки и многообразии ее разделов. Во-первых, существуют частные науки, изучающие отдельные группы живых организмов — [[w:зоология|зоология]], [[w:микология|микология]], [[w:ботаника|ботаника]], [[w:протистология|протистология]], [[w:бактериология|бактериология]], [[w:вирусология|вирусология]]. Нашим собственным видом занимается [[w:антропология|антропология]].
 
<small>Каждая из них делится на ряд ещё боле частных разделов. Например, в зоологии выделяют [[w:энтомология|энтомологию]], [[w:орнитология|орнитологию]], [[w:ихтиология|ихтиологию]] и др., в ботанике — [[бриология|бриологию]], [[альгология|альгологию]] (последняя наука, правда, может быть отнесена и к протистологии).</small>
 
Другие биологические науки в основном связаны с определенными уровнями организации живого. <big>Молекулярный уровень изучают [[w:биохимия|биохимия]], [[w:молекулярная биология|молекулярная биология]], [[w:молекулярная генетика|молекулярная генетика]]. По своим методам (а отчасти и по объекту изучения) близка к этим наукам [[w:вирусология|вирусология]].</big>
 
<big>Тесно связаны с ними и науки, изучающие клеточный уровень — [[w:цитология|цитология]] ([[w:Биология клетки|клеточная биология]]), [[w:гистология|гистология]], [[w:иммунология|иммунология]] и др.</big>
 
Организменный уровень изучают такие науки, как [[w:анатомия|анатомия]], [[w:физиология|физиология]] и [[w:эмбриология|эмбриология]] ([[w:Биология развития|биология развития]]). С этим уровнем тесно связаны и многие разделы [[w:генетика|генетики]] (например, генетика развития).
 
Популяционно-видовой уровень изучают [[w:популяционная генетика|популяционная генетика]] и [[w:популяционная экология|популяционная экология]]. Кроме того, этим уровнем занимается [[w:эволюционная биология|эволюционная биология]], так как на этом уровне организации происходят процессы [[w:микроэволюция|микроэволюции]]. Этот же уровень — объект изучения [[w:систематика|систематики]].
 
Экосистемный уровень — основной объект изучения большинства разделов [[w:экология|экологии]]. К этому уровню смещаются в последние годы и интересы [[w:палеонтология|палеонтологов]]: всё больше внимание они уделяют не отдельным видам, а экосистемам былых геологических эпох. Наконец, одна из основных проблем современной эволюционной биологии — разработка теории эволюции экосистем.
 
Есть и науки, объект изучения которых — не уровень организации или группа организмов, а какой-то аспект свойств живого. К таким наукам можно отнести, например, [[w:биоинформатика|биоинформатику]] и [[w:биофизика|биофизику]].
 
На первый взгляд, биологические науки очень резко различаются и сильно изолированы друг от друга. Например, биохимия по своим методам (а во многом и предмету изучения) — это почти что химия, а [[w:геоботаника|геоботаника]] — почти что география. Где и как могут встретиться и что будут обсуждать при встрече орнитолог и вирусолог? Так действительно и обстояло дело до недавнего времени.
В настоящее врем взаимопроникновение биологических наук усиливается, всё чаще применяется междисциплинарный подход в биологических исследованиях. Всё чаще можно встретить словосочетания «[[w:экологическая генетика|экологическая генетика]]» [http://www.bionet.nsc.ru/vogis/pict_pdf/2009/2009_2/19.pdf]или «[[w:химическая экология|химическая экология]]» <ref>[[w:en:Chemical ecology|Chemical ecology]]</ref>. [[w:Метагеномика|Метагеномика]] <ref>[[w:en:Metagenomics|Metagenomics]]</ref> обеспечила настоящий прорыв в изучении состава экосистем.
 
;Вопрос 4
:А действительно, где и как могут встретиться и что (с наибольшей вероятностью) будут обсуждать при встрече орнитолог и вирусолог? Попробуйте ответить на этот вопрос (допустим, что обсуждать они будут биологические проблемы, представляющие взаимный интерес, а не результаты чемпионата мира по футболу).
 
=== Редукционистский подход сыграл решающую роль в прогрессе биологии в XX веке ===
За последние десятилетия наибольших успехов достигла молекулярная биология. Во многом эти успехи связаны с использованием <big>принципа редукционизма.</big> В применении к изучении клетки этот принцип состоит в том, что <big>возможно объяснение сложных процессов в клетке и организме как результата простых химических реакций.</big>
 
<big>Законы физики и химии (часто имеющие вид запретов) выполняются в живой природе, так как живые организмы состоят из тех же атомов и полей, что и неживая природа. В основе жизнедеятельности клеток лежат химические реакции, а в основе жизнедеятельности и развития организма — работа клеток. Значит, понять работу организма можно, изучая химию. Можно изучить атомы, потом молекулы, химические реакции, в которых участвуют эти молекулы, и мы поймем, например, процесс пищеварения. Так во многих случаях и произошло. Оказалось, что очень многие биологические процессы можно описать «на языке» химии.</big>
 
=== Редукционистский подход имеет границы применимости в биологии ===
А можно ли понять, как человек думает, если изучить все химические процессы в отдельных нейронах — нервных клетках его мозга? Поможет ли изучение химических реакций понять, почему у жирафа для добывания листьев с деревьев служит длинная шея, а у слона — хобот? Или объяснить, почему численность насекомых в разные годы различается сильно, а птиц — слабо?
 
Вряд ли это возможно — ведь даже самый точный химический анализ отдельных деталей компьютера не поможет понять принцип его работы. Дело в том, что <big>любая система, состоящая из нескольких элементов, может приобретать новые свойства. Свойства системы зависят не только от свойств элементов, но и от взаимосвязей между ними. Изучая отдельные элементы, мы не поймем принципов работы системы. Поэтому так важен для многих разделов биологии системный подход</big>. Например, чтобы понять работу мозга человека, важно изучать не только отдельные молекулы или клетки, но и сложные взаимодействия между клетками мозга, взаимосвязи мозга с органами чувств и с другими системами органов.
 
[http://lub.molbiol.ru/02_14.html] А. А. Любищев. Редукционизм и развитие морфологии и систематики. (Точка зрения авторов цитированных работ может не совпадать с точкой зрения авторов учебника).
 
=== Многие важнейшие научные проблемы биологии связаны с изучением клеток ===
 
; Задание
 
К своему 125-летию журнал Science опубликовал список 125 важнейших научных проблем современности, из которых выделил 25 главных. Из этих 25 проблем 16 (!) перечисленных ниже имеют непосредственное отношение к биологии, а из этих 16-ти большинство связано с изучением клеточного уровня.
 
 
Важнейшие научные проблемы биологии по версии журнала Science ====
* 2. Каковы биологические основы сознания?
* 3. Почему у человека так мало генов? Как вся наследственная информация помещается в 20-25 тыс. генов, имеющихся в нашей ДНК?
* 4. Насколько индивидуальные генетические особенности человека важны для его лечения?
* 6. На сколько можно увеличить продолжительность жизни человека?
* 7. Как контролируется регенерация органов?
* 8. Как клетка кожи может превратиться в нервную клетку?
* 9. Как единственная соматическая клетка превращается в целое растение?
* 12. Когда и где зародилась земная жизнь?
* 13. Какие факторы среды определяют видовое разнообразие экосистем?
* 14. Какие генетические особенности делают человека человеком?
* 15. Как хранится в мозге и как извлекается хранящаяся информация?
* 16. Как возникло поведение, ориентированное на сотрудничество, и зачем в животном мире нужен альтруизм?
* 17. Как обрабатывать и обобщать большие массивы данных в биологии, и будет ли создана на этом пути «системная биология»?
* 20. Можно ли избирательно блокировать реакции иммунной системы?
* 22. Можно ли создать вакцину от СПИДа?
* 25. Можно ли при продолжающемся росте народонаселения достичь всеобщего благосостояния, не опустошив планету?
 
В голове у редакторов, которые составляли этот список, царила приличная каша. Попробуйте в ней разобраться, а именно
# назовите проблемы, которые, на ваш взгляд, уже полностью или в значительной степени решены;
# назовите проблемы, которые не являются научными (то есть не требуют новых научных открытий, теорий и обобщений), а являются чисто прикладными.
 
[http://www.sciencemag.org/sciext/125th/] Важнейшие научные проблемы по версии журнала Science]
 
На самом деле в число основных '''научных''' проблем биологии имеет смысл включать только проблемы фундаментальных, но не прикладных исследований. Очевидно, что фундаментальные научные проблемы тесно связаны с основными свойствами живого. Ниже мы сформулируем их, учитывая и те, которые в общих чертах уже решены.
 
==== Важнейшие научные проблемы биологии по версии учебника «Биология клетки» ====
 
# '''Как происходит передача наследственных свойств при размножении?'''
#: В целом эта проблема решена. Первый шаг к её решению сделал [[w:Мендель, Грегор Иоганн|Грегор Иоганн Мендель]], открывший в 1865 г основные законы наследования. Следующий шаг был сделан, когда в 1870-е-1890-е годы были описаны [[w:митоз|митоз]], [[w:мейоз|мейоз]] и [[w: оплодотворение| оплодотворение]]. Ещё на шаг ученые приблизились к разгадке тайны наследственности, когда в 1910-е годы [[w:Морган, Томас Гент|Томасом Гент Морганом]] и его сотрудниками была создана [[w:хромосомная теория наследственности|хромосомная теория наследственности]]. В 1920-е годы [[w:Кольцов, Николай Константинович|Николай Константинович Кольцов]] предсказал молекулярный механизм записи наследственной информации и разработал теорию матричного синтеза наследственных молекул. В 1940-е-1950-е годы было доказано, что молекулы наследственности действительно существуют и что это - молекулы ДНК. Наконец, решающий шаг был сделан в 1953 году, когда [[w:Уотсон, Джеймс|Джеймс Уотсон]] и [[w:Крик, Фрэнсис|Фрэнсис Крик]] создали модель двойной спирали [[w:ДНК|ДНК]] и предсказали механизм её удвоения.
# '''Как линейная запись наследственной информации в виде генетического кода молекул ДНК превращается в сложную трехмерную организацию клеток и многоклеточных организмов?''' (проблема реализации наследственной информации).
#: В целом эта проблема не решена и остается одной из главных проблем, которые пытается решить биология.
# '''Как происходит обмен веществ и энергии в клетках?'''
#: В целом эта проблема решена в течение ХХ века.
# '''Как и под влиянием каких причин возникают изменения наследственной информации и в целом различия между организмами одного вида?''' (проблема природы изменчивости)
#: В целом эта проблема решена.
# '''Как в ряду поколений происходят приспособительные изменения и возникают новые виды живых организмов?''' (проблема механизмов эволюции)
#: В целом эта проблема решена [[w:Дарвин,Чарльз|Чарльзом Дарвином]], который для объяснения механизмов эволюции предложил теорию [[w:естественный отбор|естественного отбора]]. Однако детали процессов видообразования и появления новых признаков понятны далеко не полностью, и все время происходят открытия новых важных деталей механизмов эволюции.
# '''Как клетки и другие биосистемы воспринимают сигналы и в зависимости от условий меняют свою работу?''' (проблема регуляции)
#: Хотя эта проблема решена в общих чертах, до более полного её решения ещё очень далеко. Отметим, что к этой области исследований относятся многие проблемы, перечисленные в списке журнала Science.
 
== Клетка — основа жизни ==
 
=== [[w:Клеточная теория|Клеточная теория]] — одно из главных научных обобщений в биологии ===
 
Клеточная теория — основополагающая для общей биологии теория, сформулированная в середине XIX века. Она предоставила базу для понимания строения и развития организмов и для развития [[w:Эволюционное учение|эволюционного учения]]. [[w:Шлейден, Маттиас|Маттиас Шлейден]] и [[w:Шванн, Теодор|Теодор Шванн]] сформулировали '''клеточную теорию''', основываясь на множестве исследований о [[w:клетка|клетке]] (1838—1839). [[w:Вирхов, Рудольф|Рудольф Вирхов]] позднее (1858) дополнил её важнейшим положением (всякая клетка из клетки).
 
<big>Шлейден и Шванн, обобщив имеющиеся знания о клетке, доказали, что клетка является основной единицей любого [[w:организм|организма]]. Клетки [[w:Животное|животных]], [[w:Растение|растений]] и [[w:Бактерия|бактерии]] имеют схожее строение. Позднее эти заключения стали основой для доказательства единства происхождения организмов. Т.&nbsp;Шванн и М.&nbsp;Шлейден ввели в науку основополагающее представление о клетке: вне клеток нет жизни.</big>
 
==== История ====
'''XVII век'''
 
В 1665 году английский физик Роберт Гук в работе «Микрография» описывает строение пробки, на тонких срезах которой он нашёл правильно расположенные пустоты. Эти пустоты Гук назвал «порами, или клетками». Наличие подобной структуры было известно ему и в некоторых других частях растений.
 
В 1670-е годы итальянский медик и натуралист М. Мальпиги и английский натуралист Н. Грю описали в разных органах растений «мешочки, или пузырьки» и показали широкое распространение у растений клеточного строения. Клетки изображал на своих рисунках голландский микроскопист А. Левенгук. Он же первым открыл мир одноклеточных организмов — описал бактерий и протистов (инфузорий).
 
''Исследователи XVII века, показавшие распространённость «клеточного строения» растений, не оценили значение открытия клетки. Они представляли клетки в качестве пустот в непрерывной массе растительных тканей. Грю рассматривал стенки клеток как волокна, поэтому он ввёл термин «ткань», по аналогии с текстильной тканью. Исследования микроскопического строения органов животных носили случайный характер и не дали каких-либо знаний об их клеточном строении.''
 
'''XVIII век'''
 
<small>В XVIII веке совершаются первые попытки сопоставления микроструктуры клеток растений и животных. К. Ф. Вольф в работе «Теории зарождения» (1759) пытается сравнить развитие микроскопического строения растений и животных. По Вольфу, зародыш как у растений, так и у животных развивается из бесструктурного вещества, в котором движения создают каналы (сосуды) и пустоты (клетки). Фактические данные, приводившиеся Вольфом, были им ошибочно истолкованы и не прибавили новых знаний к тому, что было известно микроскопистам XVII века. Однако его теоретические представления в значительной мере предвосхитили идеи будущей клеточной теории.
 
Вероятно, первым ученым, который наблюдал деление клетки (у одноклеточных водорослей), был [[w:Трамбле, Авраам|Авраам Трамбле]].
 
'''XIX век'''
 
В первую четверть XIX века происходит значительное углубление представлений о клеточном строении растений, что связано с существенными улучшениями в конструкции микроскопа (в частности, с созданием [[w:ахроматическая линза|ахроматических линз]]).
 
Линк и Молднхоуэр устанавливают наличие у растительных клеток самостоятельных стенок. Выясняется, что клетка есть некая морфологически обособленная структура. В 1831 году Моль доказывает, что даже такие, казалось бы, неклеточные структуры растений, как водоносные трубки, развиваются из клеток.
 
Мейен в «Фитотомии» (1830) описывает растительные клетки, которые «бывают или одиночными, так что каждая клетка представляет собой особый индивид, как это встречается у водорослей и грибов, или же, образуя более высоко организованные растения, они соединяются в более и менее значительные массы». Мейен подчёркивает самостоятельность обмена веществ каждой клетки.</small>
 
В 1831 году Роберт Броун описывает ядро и высказывает предположение, что оно является постоянной составной частью растительной клетки.
 
''' Школа Пуркинье '''
 
<small>В 1801 году Вигиа ввёл понятие о тканях животных, однако он выделял ткани на основании анатомического препарирования и не применял микроскопа. Развитие представлений о микроскопическом строении тканей животных связано прежде всего с исследованиями [[w:Пуркине, Ян Эвангелиста|Яна Пуркинье]], основавшего в Бреславле свою школу.
 
Пуркинье и его ученики (особенно следует выделить Г. Валентина) выявили в первом и самом общем виде микроскопическое строение тканей и органов млекопитающих (в том числе и человека). Пуркинье и Валентин сравнивали отдельные клетки растений с частными микроскопическими тканевыми структурами животных, которые Пуркинье чаще всего называл «зёрнышками» (для некоторых животных структур в его школе применялся термин «клетка»).
 
В 1837 г. Пуркинье выступил в Праге с серией докладов. В них он сообщил о своих наблюдениях над строением желудочных желёз, нервной системы и т. д. В таблице, приложенной к его докладу, были даны ясные изображения некоторых клеток животных тканей. Тем не менее установить гомологию клеток растений и клеток животных Пуркинье не смог:
* во-первых, под зёрнышками он понимал то клетки, то клеточные ядра;
* во-вторых, термин «клетка» тогда понимался буквально как «пространство, ограниченное стенками».
 
Сопоставление клеток растений и «зёрнышек» животных Пуркинье вёл в плане аналогии, а не гомологии этих структур (понимая термины «аналогия» и «гомология» в современном смысле).</small>
 
''' Школа Мюллера и работа Шванна '''
 
Второй школой, где изучали микроскопическое строение животных тканей, была лаборатория Иоганнеса Мюллера в Берлине. Мюллер изучал микроскопическое строение спинной струны (хорды); его ученик Генле опубликовал исследование о кишечном эпителии, в котором дал описание различных его видов и их клеточного строения.
 
'''Теодор Шванн сформулировал принципы клеточной теории'''
 
Здесь были выполнены классические исследования [[w:Шванн, Теодор|Теодора Шванна]], заложившие основание клеточной теории. На работу Шванна оказала сильное влияние школа Пуркинье и Генле. Шванн нашёл правильный принцип сравнения клеток растений и элементарных микроскопических структур животных. Шванн смог установить гомологию и доказать соответствие в строении и росте элементарных микроскопических структур растений и животных.
 
На значение ядра в клетке Шванна натолкнули исследования Матиаса Шлейдена, у которого в 1838 году вышла работа «Материалы по фитогенезу». Поэтому Шлейдена часто называют соавтором клеточной теории. Основная идея клеточной теории — соответствие клеток растений и элементарных структур животных — была чужда Шлейдену. Он сформулировал теорию новообразования клеток из бесструктурного вещества, согласно которой сначала из мельчайшей зернистости конденсируется ядрышко, вокруг него образуется ядро, являющееся образователем клетки (цитобластом). Однако эта теория опиралась на неверные факты.
 
В 1838 году Шванн публикует 3 предварительных сообщения, а в 1839 году появляется его классическое сочинение «Микроскопические исследования о соответствии в структуре и росте животных и растений», в самом заглавии которого выражена основная мысль клеточной теории:
* В первой части книги он рассматривает строение хорды и хряща, показывая, что их элементарные структуры — клетки развиваются одинаково. Далее он доказывает, что микроскопические структуры других тканей и органов животного организма — это тоже клетки, вполне сравнимые с клетками хряща и хорды.
* Во второй части книги сравниваются клетки растений и клетки животных и показывается их соответствие.
* В третьей части развиваются теоретические положения и формулируются принципы клеточной теории.
 
Именно исследования Шванна оформили клеточную теорию и доказали (на уровне знаний того времени) единство элементарной структуры животных и растений. Главной ошибкой Шванна было высказанное им вслед за Шлейденом мнение о возможности возникновения клеток из бесструктурного неклеточного вещества.
 
'''Развитие клеточной теории во второй половине XIX века'''
 
С 1840-х века учение о клетке оказывается в центре внимания всей биологии и бурно развивается, превратившись в самостоятельную отрасль науки — цитологию.
 
Для дальнейшего развития клеточной теории существенное значение имело её распространение на протистов (простейших), которые были признаны свободно живущими клетками (Сибольд, 1848).
 
В это время изменяется представление о составе клетки. Выясняется второстепенное значение клеточной оболочки, которая ранее признавалась самой существенной частью клетки, и выдвигается на первый план значение протоплазмы (цитоплазмы) и ядра клеток (Моль, Кон, Л. С. Ценковский, Лейдиг, Гексли), что нашло своё выражение в определении клетки, данном М. Шульце в 1861 г.: «Клетка — это комочек протоплазмы с содержащимся внутри ядром».
 
<small>В 1861 году Брюкко выдвигает теорию о сложном строении клетки, которую он определяет как «элементарный организм», выясняет далее развитую Шлейденом и Шванном теорию клеткообразования из бесструктурного вещества (цитобластемы). Обнаружено, что способом образования новых клеток является клеточное деление, которое впервые было изучено Молем на нитчатых водорослях. В опровержении теории цитобластемы на ботаническом материале большую роль сыграли исследования Негели и Н. И. Желе.</small>
 
Деление тканевых клеток у животных было открыто в 1841 г. Ремаком. Выяснилось, что дробление бластомеров есть серия последовательных делений (Биштюф, Н. А. Келликер). Идея о всеобщем распространении клеточного деления как способа образования новых клеток закрепляется Р. Вирховом в виде афоризма:
 
* «Omnis cellulae ex cellula».
* Всякая клетка — из другой клетки.
 
<small>Уже у Шванна встречается попытка рассматривать организм как сумму клеток. Эта тенденция получает особое развитие в «Целлюлярной патологии» Вирхова (1858).
 
Работы Вирхова оказали неоднозначное влияние на развитие клеточного учения:
* Клеточная теория распространялась им на область патологии, что способствовало признанию универсальности клеточного учения. Труды Вирхова закрепили отказ от теории цитобластемы Шлейдена и Шванна, привлекли внимание к протоплазме и ядру, признанными наиболее существенными частями клетки.
* Вирхов направил развитие клеточной теории по пути чисто механистической трактовки организма.
* Вирхов возводил клетки в степень самостоятельного существа, вследствие чего организм рассматривался не как целое, а просто как сумма клеток.</small>
* Будучи врачом, Вирхов обратил внимание на то, что нарушение функций организма есть следствие нарушений функций клеток, предвосхитив современную медицину. Поэтому его книга «Целлюлярная патология» имела огромный успех и во многом определила дальнейшее развитие медицинской науки.
 
Во второй половине XIX века были открыты и изучены основные механизмы деления клеток эукариот — [[w:митоз|митоз]] и [[w:мейоз|мейоз]], описаны [[w:Хромосома|хромосомы]].
 
'''XX век'''
 
<small>Взгляды Вирхова были развиты в «Целлюлярной физиологии» Ферворна, рассматривавшего любой физиологический процесс, протекающий в организме, как простую сумму физиологических проявлений отдельных клеток. В завершении этой линии развития клеточной теории появилась механистическая теория «клеточного государства», в качестве сторонника которой выступал в том числе и Геккель. Согласно данной теории организм сравнивается с государством, а его клетки — с гражданами. Подобная теория противоречила принципу целостности организма.
 
Механистическое направление в развитии клеточной теории подверглось острой критике. В 1860 году с критикой представления Вирхова о клетке выступил И. М. Сеченов. Позднее клеточная теория подверглась критическим оценкам со стороны других авторов. Наиболее серьёзные и принципиальные возражения были сделаны Гертвигом, А. Г. Гурвичем (1904), М. Гейденгайном (1907), Добеллом (1911). С обширной критикой клеточного учения выступил чешский гистолог Студничка (1929, 1934).</small>
 
В 1950-е советский биолог О. Б. Лепешинская, основываясь на данных своих исследований, выдвинула «новую клеточную теорию» в противовес «вирховианству». В её основу было положено представление, что в онтогенезе клетки могут развиваться из некоего неклеточного живого вещества. Критическая проверка фактов, положенных О. Б. Лепешинской и её приверженцами в основу выдвигаемой ею теории, не подтвердила данных о развитии клеточных ядер из безъядерного «живого вещества».
 
В XX веке были изучены основные процессы клеточного метаболизма, а также установлена природа наследственной передачи признаков при размножении клеток — структура и механизм удвоения ДНК.
 
XX век внёс в клеточную теорию ряд корректив. Во-первых, была окончательно доказана неклеточная природа [[w:вирусы|вирусов]] — особых форм жизни. Во-вторых, получила развитие теория [[w:Симбиогенез|симбиогенеза]], внесшая корективы в представления о гомологии клеток (см.ниже). Однако в целом клеточная теория была подтверждена всем ходом развития биологии, а ее основные положения (в особенности положение о сходстве химического состава и процессов жизнедеятельности всех клеток) были более полно доказаны.
 
==== <big> Клеточная теория включает три основных положения </big> ====
<big>Современная клеточная теория включает следующие основные положения:
 
'''Клетка — элементарная единица живого'''
:1. [[w:Клетка|Клетка]] — элементарная единица живого, основная единица строения, функционирования, размножения и развития всех живых организмов.
 
'''Все клетки сходны по строению и химическому составу'''
:2. Клетки всех [[w:Одноклеточные организмы|одноклеточных]] и многоклеточных организмов имеют общее происхождение и сходны по своему строению и химическому составу, основным проявлениям жизнедеятельности и [[w:Метаболизм|обмену веществ]].
 
'''Клетки размножаются только делением'''
:3. [[w:Размножение|Размножение]] клеток происходит путём их деления. Новые клетки всегда возникают из предшествующих клеток.</big>
 
==== Суть и значение основных положений клеточной теории ====
<big>
===== Клетка — простейшая биологическая система, обладающая полным набором свойств живого =====
Клетка — элементарная единица живого. Как мы уже обсуждали, части клетки (макромолекулы. органеллы) не являются живыми, так как не обладают всем набором свойств живого. В большинстве своём они не могут размножаться. Могут размножаться митохондрии и хлоропласты — но это как раз связано с тем, что они — бывшие клетки бактерий (см. [[#Теория симбиогенеза: происхождение митохондрий и хлоропластов|Теория симбиогенеза: происхождение митохондрий и хлоропластов]]). Кроме того, могут размножаться молекулы [[w:ДНК|ДНК]]; но они (как и вирусы) способны делать это только внутри клеток, в присутствии произведенных на клеточных [[w:рибосомы|рибосомах]] ферментов. К тому же ни молекулы ДНК, ни вирусы не обладают другими свойствами живого (например, у них нет собственного обмена веществ). Поэтому только там, где есть клетки, могут присутствовать и реализовывать свои свойства другие уровни организации живого — особи, популяции и экосистемы.
 
===== Все клетки имеют общее происхождение и общие черты строения: замкнутую наружную мембрану, рибосомы и наследственный материал в виде молекул ДНК =====
 
Клетки всех одноклеточных и многоклеточных организмов имеют общее происхождение и сходны по своему строению и химическому составу, основным проявлениям жизнедеятельности и обмену веществ. Иногда говорят, что все клетки [[w:Гомология (биология)|гомологичны]] друг другу. В XX веке выяснилось, что клетки прокариот и эукариот — системы разного уровня организации (см.ниже). Гомология всех клеток свелась к наличию у них замкнутой наружной мембраны из двойного слоя фосфолипидов (да и то у [[w:археи|архебактерий]] она имеет иной химический состав, чем у остальных групп организмов), [[w:хромосомы|хромосом]] — наследственного материала в виде молекул ДНК, образующих комплекс с белками — и [[w:рибосомы|рибосом]]. Это, конечно, не отменяет общего происхождения всех клеток, которое подтверждается общностью их химического состава.
 
===== Все клетки строят свои белки и ДНК из универсального набора мономеров — аминокислот и нуклеотидов =====
В чем же состоит сходство химического состава всех клеток? Часто на этот счет пишут, что во всех клетках есть белки, жиры, углеводы и нуклеиновые кислоты. Но ведь они-то (особенно белки, РНК и ДНК) как раз во всех клетках разные!
На самом деле сходство химического состава состоит в том, что все белки всех живых организмов построены из одних и тех же [[w:Мономер|мономеров]] — двадцати [[w:Аминокислоты|аминокислот]] (хотя мыслимых аминокислот существуют многие сотни), а ДНК всех организмов состоит из одних и тех же четырех [[w:Нуклеотид|нуклеотидов]].
 
Кроме того, процессы функционирования (и некоторые белки, которые за них отвечают) в разных клетках настолько похожи, что с [[w:Ген|генов]] человека, встроенных в клетку бактерии, нормально считывается записанная в них [[w:Генетическая информация|генетическая информация]] и синтезируются человеческие белки!
 
===== Клетки не могут возникать путём самосборки =====
Клетки размножаются только путем деления. Размножаться иначе клетки не могут потому, что в основе размножения клеток лежит удвоение ДНК. А условия для этого процесса ныне существуют только внутри клеток (правда, искусственно их можно создать и в пробирке). Отсюда следует непрерывность жизни с момента возникновения клетки; если жизнь возникла один раз (а это, скорее всего, так [http://elementy.ru/news/431322]), то все живые организмы на Земле имеют общих предков [http://elementy.ru/news/430955] — отсюда удивительное сходство строения и химического состава клеток. Из невозможности самосборки клеток в современных условиях следует невозможность [[w:Самозарождение|самозарождения]]. Появляться же из предшествующих клеток новые клетки могут либо путем деления, либо путем слияния (так образуются, например, [[w:зигота|зиготы]] или клетки поперечнополосатых мышц из [[w:миобласт|миобластов]]).</big>
 
=
 
==== Дополнительные положения клеточной теории ====
 
Для приведения клеточной теории в более полное соответствие с данными современной клеточной биологии список её положений часто дополняют и расширяют. Во многих источниках эти дополнительные положения различаются, их набор достаточно произволен.
# Клетки прокариот и эукариот являются системами разного уровня сложности и не полностью гомологичны друг другу (см.ниже).
# В основе деления клетки и размножения организмов лежит копирование наследственной информации — молекул нуклеиновых кислот («каждая молекула из молекулы»). Положения о генетической непрерывности относится не только к [[w:Клетка|клетке]] в целом, но и к некоторым из её более мелких компонентов — к [[w:митохондрия|митохондриям]], [[w:хлоропласт|хлоропластам]], [[w:ген|генам]] и [[w:хромосома|хромосомам]].
# Многоклеточный организм представляет собой новую систему, сложный ансамбль из множества клеток, объединённых и интегрированных в системе тканей и органов, связанных друг с другом с помощью сложной системы межклеточной сигнализации.
# Клетки многоклеточных тотипотенты, то есть обладают генетическими потенциями всех клеток данного организма, равнозначны по генетической информации, но отличаются друг от друга разной экспрессией (работой) различных генов, что приводит к их морфологическому и функциональному разнообразию — к дифференцировке. (Из этого положения существует достаточно много исключений.)
 
==== Современное состояние клеточной теории ====
 
<big>Некоторые положения клеточной теории подверглись уточнению, детализации или изменению.
* Клеточная структура является главной, но не единственной формой существования жизни. Неклеточными формами жизни можно считать [[#Вирусы, неклеточные формы жизни|вирусы]]. Правда, признаки живого (обмен веществ, способность к размножению и т. п.) они проявляют только внутри клеток, вне клеток вирус является сложным химическим веществом. По мнению большинства учёных, в своём происхождении по крайней мере некоторые вирусы связаны с клеткой - являются частью её генетического материала, «одичавшими» генами.
* Выяснилось, что существует два типа клеток — прокариотические (клетки бактерий и архебактерий), не имеющие отграниченного мембранами ядра, и эукариотические (клетки растений, животных, грибов и протистов), имеющие ядро, окружённое двойной мембраной с ядерными порами. Между клетками прокариот и эукариот существует и множество иных различий. У большинства прокариот нет внутренних мембранных органоидов, а у большинства эукариот есть митохондрии и хлоропласты. В соответствии с теорией [[w:симбиогенез|симбиогенеза]], эти полуавтономные органоиды — потомки бактериальных клеток. Таким образом, эукариотическая клетка — система более высокого уровня организации, она не может считаться целиком [[w:Гомология (биология)|гомологичной]] клетке бактерии (клетка бактерии гомологична одной митохондрии клетки человека).
* Считая клетку всеобщим структурным элементом, клеточная теория рассматривала как вполне гомологичные структуры тканевые клетки и гаметы, протистов и бластомеры. Применимость понятия клетки к протистам является дискуссионным вопросом клеточного учения в том смысле, что многие сложно устроенные многоядерные клетки протистов могут рассматриваться как надклеточные структуры. [[w:Гаметы|Гаметы]] животных или растений — это не просто клетки многоклеточного организма, а особое гаплоидное поколение их [[w:жизненный цикл|жизненного цикла]], обладающее генетическими, морфологическими, а иногда и экологическими особенностями и подверженное независимому действию [[w:естественный отбор|естественного отбора]]. В то же время практически все эукариотические клетки, несомненно, имеют общее происхождение и набор гомологичных структур — элементы [[w:цитоскелет|цитоскелета]], [[w:рибосомы|рибосомы]] эукариотического типа и др.</big>
* В многоклеточных организмах кроме клеток есть многоядерные надклеточные структуры ([[w:синцитий|синцитии]], [[w:симпласт|симпласты]]) и [[w:межклеточное вещество|межклеточное вещество]], обладающее способностью к метаболизму и потому живое. В то же время и многоядерные структуры, и межклеточное вещество появляются только из клеток. Синцитии и симпласты многоклеточных — продукт слияния исходных клеток, а межклеточное вещество — продукт их секреции, то есть образуется оно в результате метаболизма клеток.
* Клетки многоклеточного организма не являются индивидуумами, способными существовать самостоятельно (так называемые культуры клеток вне организма представляют собой искусственно создаваемые биологические системы). К самостоятельному существованию способны, как правило, лишь те клетки многоклеточных, которые дают начало новым особям (гаметы, зиготы или споры) и могут рассматриваться как отдельные организмы. Клетка не может быть оторвана от окружающей среды (как, впрочем, и любые живые системы). Для понимания работы организма недостаточно изучить отдельные клетки — необходимо разобраться в их взаимодействиях.
 
Дополненная новыми данными клеточная теория остается одним из важнейших биологических обобщений.
 
=== Происхождение жизни и происхождение клеток ===
 
[[w:en:Last universal ancestor|Last Universal Common Ancestor]] (LUCA; последний универсальный общий предок, англ.)
 
==== Происхождение клеток и происхождение эукариот ====
 
 
'''Эукариотические клетки - системы более высокого уровня организации, чем прокариотические'''
 
 
Клетки эукариот — сложные генетические системы, имеющие другой уровень организации, чем прокариотические клетки.
 
Во-первых, у эукариот намного сложнее устроена система регуляции работы генов. Это позволяет им приспосабливаться к более разнообразным условиям среды без изменений в их ДНК. Многоклеточным организмам это позволяет создавать разные типы клеток, имеющие один и тот же генотип.
 
Во-вторых, у подавляющего большинства эукариот есть [[w:митохондрии|митохондрии]], а у многих ещё и [[w:пластиды|пластиды]].
Согласно общепризнанной в настоящее время точке зрения, эти органоиды имеют симбиотическое происхождения. Их предками были
бактерии, которые вступили в [[w:симбиоз|симбиоз]] с предками эукариот.
 
Теория симбиотического (симбиогенного) происхождения органоидов клетки получила название теории [[w:симбиогенез|симбиогенеза]].
 
[http://macroevolution.narod.ru/eucaryots.htm Подборка статей по проблеме происхождения эукариот]
 
==== Теория симбиогенеза ====
 
===== Теорию симбиогенеза создали русские учёные, а ввела в современный научный обиход американский исследователь Линн Маргелис =====
 
Теория эндосимбиотического происхождения хлоропластов впервые была предложена в 1883 году [[w:Шимпер, Андреас|Андреасом Шимпером]], показавшим их саморепликацию внутри клетки. Её возникновению предшествовал вывод А. С. Фаминцина и О. В. Баранецкого о двойственой природе [[w:лишайники|лишайников]] — [[w:симбиоз|симбиотического]] комплекса [[w:грибы|гриба]] и [[w:водоросли|водоросли]] (1867 год). [[w:Мережковский, Константин Сергеевич|К. С. Мережковский]] в 1905 году предложил само название «симбиогенез», впервые детально сформулировал теорию и даже создал на её основе новую систему органического мира.
 
<small>Он предложил деление органическлого мира на "микоплазму" и "амебоплазму", во многом предугадав деление, соответственно, на прокариот и эукариот (правда, к прокариотам он ошибочно отнес грибы). Мережковский также предполагал симбиогеное присхождение ядра от клетки прокаиота, внедрившегося в другую клетку - эту идею и сейчас поддреживают некоторые ученые.</small>
 
Фаминцин в 1907 году, опираясь на работы Шимпера, также пришел к выводу, что хлоропласты являются симбионтами, как и в случае с водорослями лишайника.
 
В 1920-е годы теорию симбиогенеза развивал российский ботаник Б.М. Козо-Полянский [http://www.science.marshall.edu/fet/euscorpius/fetpubl/Fet%20&%20Margulis%202008.pdf]. Его работы, публиковавшиеся на русском языке, остались полностью неизвестными на западе. Еще более четко, чем Мережковский, Козо-Полянский осознал и обозначил границу между про- и эукариотами. Теорию симбиогенеза он распространил на митохондрии (и другие органоиды, включая ядро). Он также отчасти предвосхитил современные представления о внеядерной наследственности.
Хотя у симбиогенеза находились адепты и в 30-40-е годы, в целом эту теорию большинство ученых считали ненаучной фантастикой. Второе рождение расширенная и конкретизированная теория получила в работах [[w:Линн Маргулис|Линн Маргулис]] (Маргелис) начиная с 1960-х гг. Маргелис высказала предположение о симбиотическом происхождении не только митохондрий и хлоропластов, но и жгутиков (от спирохет), которое в дальнейшем не получило подтверждения.
 
===== Согласно теории симбиогенеза, митохондрии и хлоропласты — потомки бактерий, вступившие в симбиоз с предками эукариот =====
 
<big>Современная теория симбиогенеза утверждает, что митохондрии и хлоропласты — потомки определённых групп бактерий, которые вступили в симбиоз с предками современных эукариот. В ходе эволюции бактерии-эндосимбионты превратились в полуавтономные органоиды. Они сохранили способность синтезировать некоторые белки автономно от клетки-хозяина и способность размножаться путем деления. Но значительная часть генетического материала митохондрий и хлоропластов переместилась в ядро. В результате эти органоиды утратили способность размножаться вне клетки-хозяина, свойственную многим симбиотическим бактериям.</big>
 
===== Митохондрии и хлоропласты имеют признаки минимальной клетки — замкнутую наружную мембрану, ДНК, белоксинтезирующий аппарат и размножение делением =====
 
<big>[[w:Митохондрии|Митохондрии]] и [[w:пластиды|пластиды]]:
* имеют две полностью замкнутые [[w:мембрана|мембраны]]. При этом их внутренняя мембрана сходна по составу с [[w:плазмалемма|плазмалеммой]] [[w:бактерии|бактерий]].
* размножаются [[w:деление клетки|делением пополам]], причем делятся иногда независимо от деления [[w:клетка|клетки]], никогда не синтезируются заново.
* генетический материал — кольцевая [[w:ДНК|ДНК]], не связанная с [[w:гистоны|гистонами]] (По доле [[w:Гуанин|Г]][[w:Цитозин|Ц]]-пар ДНК [[w:митохондрии|митохондрий]] и [[w:пластиды|пластид]] ближе к ДНК бактерий, чем к [[w:ядро|ядерной]] ДНК [[w:эукариоты|эукариот]])
* имеют свой аппарат [[w:биосинтез белка|синтеза белка]] — [[w:рибосомы|рибосомы]] и др.
* [[w:рибосомы|рибосомы]] [[w:прокариоты|прокариотического]] типа — c [[w:Седиментационный анализ#Методы седиментационного анализа|константой седиментации]] 70S. По строению [[w:16s рРНК|16s рРНК]] близки к бактериальной.
* многие [[w:белки|белки]] этих органелл похожи по своей первичной структуре на аналогичные белки бактерий и не похожи на соответствующие белки цитоплазмы.</big>
 
Анализ нуклеотидных последовательностей ДНК митохондрий и хлоропластов свидетельствует о том, что каждый из этих органоидов был приобретены предками эукариот однократно. Все митохондрии всех современных эукариот имеют одного общего предка, сходного с современными [[w:протеобактерии|альфа-протеобактериями]]. Все хлоропласты тоже имеют одного общего предка, сходного с современными [[w:цианобактерии|цианобактериями]]. Особенно близки к предкам хлоропластов по строению мембран и составу фотосинтетических пигментов бактерии рода прохлорон (''Prochloron'').
 
Отдельного комментария заслуживает наличие двух мембран у митохондрии и «типичных» хлоропластов. Широко распространенное заблуждение – бактериальное происхождение одной внутренней мембраны и возникновение внешней мембраны из мембраны пищеварительной вакуоли. Оно настолько укоренилось, что тиражируется во вполне солидных и уважаемых источниках (см., например, h учебник Альбертса «Молекулярная биология клетки», 5-е издание).
 
На самом же деле наружная мембрана митохондрий и хлоропластов гомологична наружной мембране их предков – грамотрицательных бактерий. «Бегство» из пищеварительной вакуоли – обычная тактика многих внутриклеточных бактерий. Так ведут себя многие возбудители болезней человека – листерии, риккетсии и др.
 
Во-первых, если бы наружная мембрана была гомологична мембране фагосомы, то белки в нее доставлялись путем везикулярного транспорта. Если это и происходит, то в виде исключения; в целом митохондрии и пластиды изолированы от «единой» мембранной системы, белки и липиды доставляются в них с помощью особых механизмов. Во-вторых, только в наружной мембране митохондрий, хлоропластов и грамм-отрицательных бактерий встречается уникальное семейство белков из группы бета-бочек, и только в этих мембранах работает уникальный, имеющий общее происхождение механизм встраивания этих белков.
 
===== [[w:Геном|Геном]] полуавтономных органелл резко уменьшен, многие их гены перенесены в ядро =====
 
'''Геном митохондрий'''
 
Наиболее полный из изученных геномов митохондрий у протиста ''Reclinomonas''. В ДНК его митохондрии содержится более 60 «белковых» генов. У этого протиста в [[w:митохондриальная ДНК|митохондриальной ДНК]] закодированы 27 рибосомальных белков, а также 23 белка, участвующих в работе [[w:электронтранспортная цепь|электронтранспортной цепи]] и в [[w:окислительное фосфорилирование|окислительном фосфорилировании]]. Кроме того, у этого же протиста в мтДНК закодированы как минимум пять белков, участвующих в [[w:транскрипция|транскрипции]] (субъединицы РНК-полимеразы) и [[w:трансляция|трансляции]].
 
У человека (как и у большинства животных) в ДНК митохондрий кодируются [[w:рибосомальная РНК|рРНК]] митохондриальных рибосом и большинство типов митохондриальных [[w:транспортная РНК|тРНК]]. При этом геном митохондрий человека и других млекопитающих содержит всего 13 «белковых» генов из примерно 1500 генов, кодирующих белки митохондриального [[w:протеом|протеома]].
 
'''Геном пластид'''
 
'''Перенос генов из органоидов в ядро'''
 
Таким образом, очевидно, что большинство генов предков митохондрий и хлоропластов переместились из митохондрий в ядро и встроились в ядерный материал клетки-хозяина. Механизмы этого процесса не вполне ясны; предполагается участие в них мобильных генетических элементов или вирусов. Но сама возможность «горизонтального переноса генов» между бактериями и ядром эукариотической клетки не подлежит никакому сомнению. Сейчас известно множество генов растений, протистов и животных, явно полученных путем горизонтального переноса от прокариот. Наблюдается такой перенос и от внутриклеточных эндосимбионтов или паразитов. Так, бактерия [[w:Agrobacterium tumefaciens|Agrobacterium tumefaciens]] встраивает свои гены в хромосомы растений с помощью специальных [[w:плазмида|плазмид]], а бактерия [[w:Wolbachia|Wolbachia]] встроила в хромосому некоторых насекомых-хозяев свой практически полный геном.
 
===== Геном митохондрий имеет необычные черты, в том числе отклонения от универсального генетического кода =====
 
'''Необычные черты генома митохондрий'''
 
В иРНК митохондрий особенно часто встречаются вариации стандартного [[w:Генетический код|генетического кода]], которые приведены в таблице.
 
{| class="prettytable centered"
 
!Пример
!Кодон
!Обычное значение
!Читается как:
 
|-
|Митохондрии, в частности у ''[[w:Saccharomyces cerevisiae|Saccharomyces cerevisiae]]''
|CU(U, C, A, G)
|Лейцин
|Серин
|-
|Митохондрии высших растений
|CGG
|Аргинин
|Триптофан
|-
|Митохондрии (у всех без исключения исследованных организмов)
|UGA
|Стоп
|Триптофан
|-
|Митохондирии млекопитающих, [[w:дрозофилы|дрозофилы]], ''S. cerevisiae'' и многих простейших
|AUA
|Изолейцин
|Метионин = Старт
|-
|Митохондрии млекопитающих
|AGC, AGU
|Серин
|Стоп
|-
|Митохондрии [[w:дрозофилы|дрозофилы]]
|AGA
|Аргинин
|Стоп
|-
|Митохондрии млекопитающих
|AG(A, G)
|Аргинин
|Стоп
|}
 
 
У большинства изученных организмов митохондрии содержат только кольцевые молекулы ДНК, у некоторых растений одновременно присутствуют и кольцевые, и линейные молекулы, а у ряда протистов (например, инфузорий) имеются только линейные молекулы.
 
Митохондрии млекопитающих обычно содержат от двух до десяти идентичных копий кольцевых молекул ДНК.
 
У растений каждая митохондрия содержит несколько молекул ДНК разного размера, которые способны к рекомбинации.
 
===== Митохондрии кинетопластид имеют необычное строение и генетический аппарат =====
 
У протистов из отряда [[w:кинетопластиды|кинетопластид]] (например, у [[w:трипаносомы|трипаносом]]) в особом участке митохондрии ([[w:кинетопласт|кинетопласте]]) содержится два типа молекул ДНК — идентичные макси-кольца (20-50 штук) длиной около 21 т.п.о. и мини-кольца (20 000 — 55 000 штук, около 300 разновидностей, средняя длина около 1000 п.о.). Все кольца соединены в единую сеть (катенаны), которая разрушается и восстанавливается при каждом цикле репликации. Макси-кольца гомологичны митохондриальной ДНК других организмов. Каждое мини-кольцо содержит четыре сходных консервативных участка и четыре уникальных гипервариабельных участка.
 
В мини-кольцах закодированы короткие молекулы направляющих РНК ([[w:guideRNA|guideRNA]]), которые осуществляют [[w:редактирование РНК|редактирование РНК]], транскрибируемых с генов макси-колец.
 
 
* [http://vivovoco.rsl.ru/VV/JOURNAL/NATURE/06_02/MITO.HTM] Дымшиц Г. М. Сюрпризы митохондриального генома. Природа, 2002, N 6
* [http://gemi.mpl.ird.fr/PDF/jt01.pdf] Статья об особенностях кинетопластного генома трипаносом (англ.)
* [http://mmbr.asm.org/cgi/reprint/64/4/786.pdf] Origin and evolution of mitochondrial proteome
 
===== Пластиды многих водорослей отличаются от пластид высших растений строением и составом пигментов =====
 
В большинстве учебников ботаники и физиологии растений описаны пластиды (хлоропласты), характерные для цветковых растений. Они имеют две наружные мембраны, [[w:тилакоид|тилакоиды]], собранные в стопки — граны, и два основных фотосинтетических [[w:пигмент|пигмента]] — [[w:хлорофилл|хлорофилл]] а и хлорофилл b.Но на самом деле пластиды гораздо разнообразнее и по строению, и по составу пигментов.
 
'''Первичные пластиды''' характерны, кроме [[w:высшие растения|высших растений]], для [[w:зеленые водросли|зеленых]] и [[w:харовые водоросли|харовых водорослей]], [[w:красные водоросли|красных водорослей]] и [[w:глаукофитовые водоросли|глаукофитовых]]. Все эти пластиды окружены двумя мембранами. Считается. что они были приобретены в результате симбиоза гетеротрофных жгутиковых эукариот с предками хлоропластов — цианобактериями.
 
При этом и у этих групп водорослей пластиды заметно различаются. У зеленых и харовых водорослей пластиды по строению и составу пигментов такие же, как у высших растений. Считается, что высшие растения произошли от водорослей, сходных с харовыми. По строению их хлоропласты наиболее сходны с цианобактерией [[w:прохлорон|Prochloron]]. Эти пластиды содержат две формы хлорофилла - хлорофилл а и хлорофилл b. Те же формы хлорофилла имеет и Prochloron.
 
У красных и глаукофитовых водорослей тилакоиды не собраны в граны, а на их поверхности сидят особые тельца — [[w:фикобилисомы|фикобилисомы]]. Они состоят из белков [[w:фикобилипротеины|фикобилипротеинов]]. Окраску им придают входящие в их состав [[w:хромофор|хромофоры]] [[w:фикобилины|фикобилины]]: [[w:фикоэритрин|фикоэритрин]] — красную, а [[w:фикоцианин|фикоцианин]] — голубоватую. Они улавливают свет и передают его хлорофиллу а. У красных водорослей и некоторых цианобактерий есть также хлорофилл d.
 
По строению и составу пигментов эти хлоропласты наиболее сходны с большинством видов цианобактерий. При этом хлоропласты глаукофитовых водорослей имеют удивительную особенность: между двумя мембранами у них есть слой пептидогликана — вещества, образующего клеточные стенки бактерий. Эти хлоропласты, называемые часто [[w:цианеллы|цианеллы]], рассматривают как «живые ископаемые» — эндосимбиотические органеллы, сохранившие примитивные предковые признаки.
 
'''Вторичные пластиды''' характерны для большинства групп водорослей. Они были приобретены в результате эндосимбиоза гетеротрофных протистов с автотрофными протистами, то есть в результате поглощения хищником-эукариотом другого эукариота — автотрофа, уже имевшего первичные пластиды. Исходно вторичные пластиды окружены четырьмя мембранами (снаружи внутрь - мембрана пищеварительной вакуоли, плазмалемма эукариотической клетки, две мембраны первичной пластиды). Впоследствии у многих групп водорослей одна или две их четырех мембран вторичных пластид редуцировались, а у некоторых все четыре мембраны сохранились.
 
Наиболее близки к исходному строению хлоропласты [[w:криптофитовые водоросли|криптофитовых водорослей]] и хлорарахиевых водорослей. У этих небольших групп одноклеточных водорослей хлоропласты окружены четырьмя мембранами. У криптофитовых они содержат хлорофилл а, хлорофилл с и фикобилипротеины. У хлорарахниевых присутствуют хлорофилл а и хлорофилл b. Между второй и третьей мембраной находится [[w:нуклеоморф|нуклеоморф]] — рудиментарное ядро с сильно уменьшенным ядерным геномом.
 
Сейчас секвенированы полные геномы всех компартментов обоих групп водорослей. Оба исследованных нуклеоморфа содержат по три маленькие хромосомы (у изученной криптофитовой водоросли общий размер генома всего 550.000 п.н.). Из белковых генов нуклеоморфов всего примерно по 30 генов кодируют белки для первичной пластиды; остальные – это в основном «гены домашнего хозяйства» Их тоже не хватает: в перипластидное пространство (т.е. в эукариота-симбионта) попадает из цитоплазмы хозяина более 2000 белков у криптофитовых и около 1000 у хлорарахниевых. В свою очередь, из нуклеоморфов в ядро переместились сотни генов. Геном нуклеоморфа у криптофитовых очень компактный: в нем короткие интроны, почти нет спейсеров, а 91% последовательностей – кодирующие, как у прокариот!
 
У гаптофитовых и диатомовых водрослей, недавно открытого фототрофного протиста Chromera velia и у ее ближайших родствеников споровиков (Apycomplexa) есть четырехмембранные пластиды, утратившие нуклеоморф. У других водорослей (например, динофлагеллят и эвгленовых) встречаются трехмембранные хлоропласты со своеобразным набором хлорофиллов. Наличие трех мембран можно объяснить тем, что после двойного симбиоза (как у криптофитовых) одна из мембран редуцировалась.
 
По-видимому, в данном случае это была наружная мембрана клетки эукариотического симбионта; сохранились обе мембраны первичной пластиды и мембрана фагосомы.
 
Кем же были предки вторичных пластид? Сейчас считается, что хлорарахниевые и эвгленовые независимо друг от друга поработили зеленые водоросли. Все остальные группы, имеющие вторичные пластиды, приобрели в свое время в качестве симбионта красную водоросль
 
 
[http://www.botany.ubc.ca/keeling/PDF/04plastidAJB.pdf]Patrick J. Keeling. Diversity and evolutionary history of plastids and their hosts.
 
=== Царства живой природы ===
 
==== Две крупнейшие группы клеточных организмов — прокариоты и эукариоты ====
<big>Две основные группы клеточных организмов — прокариоты и эукариоты. Хотя в последнее время всё чаще используется деление живых организмов на три группы самого высокого ранга — [[w:археи|археи]] (архебактерии), [[w:бактерии|бактерии]] (эубактерии) и [[w:эукариоты|эукариоты]] — археи, несомненно, являются типичными прокариотами. Так что надцарство прокариот можно разделить на два царства — бактерии и археи. Правда, иногда предполагают, что археи отделились от общего [[w:филогенетическео дерево|эволюционного древа]] позднее бактерий [[http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/A/Archaea.html]], и тогда в соответствии с принципами [[w:кладистика|кладистики]] их следовало бы объединить в один [[w:таксон|таксон]] с эукариотами. Однако эта точка зрения не общепризнана. </big>
 
==== К прокариотам относятся царства бактерий и архей ====
 
==== Деление эукариот на царства не устоялось ====
Гораздо сложнее обстоит дело с царствами в пределах надцарства эукариот (см. [[w:Система органического мира|Система органического мира]]). Ещё недавно эукариот делили на три царства — растения, животные и грибы (это деление сохранилось в школьных учебниках, а отчасти и в вузовских — см., например, И. Х. Шарова. Зоология беспозвоночных. М., Владос, 2002).
 
 
При этом всех одноклеточных и колониальных эукариот пытались «распихать» по этим трём царствам — инфузорий и амёб относили к животным, хлореллу и хламидомонаду (и всех остальных водорослей) — к растениям, а [[w:миксомицеты|миксомицетов]] — к грибам. Затем всё чаще стали выделять четвертое царство — протисты. Выделить его пришлось из-за того, что стало ясно — многие одноклеточные эукариоты вовсе не родственны ни растениям, ни животным, ни грибам.
 
Но одновременно благодаря исследованию ультраструктуры клеток выяснилось, что и друг другу разные протисты — очень дальние родственники. В то же время среди них есть формы, явно близкородственные и высшим растениям (это [[w:зеленые водоросли|зеленые водоросли]] и [[w:харовые водоросли|харовые водоросли]]), и животным (это [[w:воротничковые жгутиконосцы|воротничковые жгутиконосцы]]), и грибам (а сами грибы, как оказалось — довольно близкие родственники животных).
 
В дальнейшем эти данные были подтверждены и при сравнении последовательностей ДНК, методы анализа которых всё время усовершенствуются (см. [[w:биоинформатика|биоинформатика]]).
 
Что же с этим делать? Если следовать принципам [[w:кладистика|кладистики]], необходимо «пожертвовать» привычными нам царствами растений, животных и грибов (и уж тем более протистов) и выделить новые царства, основанные на истинном родстве составляющих их групп организмов.
 
Этим и заняты сейчас специалисты (см. [[w:Система органического мира|Система органического мира]], [http://www.tolweb.org/Eukaryotes/3]). Некоторые из них идут по компромиссному пути: сохраняя царства животных и растений (выделенные на основе их сложного тканевого строения и особенностей размножения и жизненного цикла), в остальном используют кладистический подход (см., напр., [http://herba.msu.ru/shipunov/os/current/synat.pdf]).
 
<big>Учитывая цели данного учебника, мы будем придерживаться традиционного деления эукариот на четыре царства (растения, животные, грибы и протисты) и будем сравнивать клетки животных, растений и грибов между собой. Помните, что среди протистов встречаются все три варианта строения (то есть клетки, сходные с клетками животных, растений и грибов), а также множество иных вариантов, не похожих на клетки представителей трёх «высших» царств.</big>
 
==== Прокариоты и эукариоты различаются комплексом взаимосвязанных признаков ====
 
{| class="wikitable"
|-
! Признаки
! Прокариоты
! Эукариоты
|-
| Типичные размеры<sup>1</sup>
| Диаметр клетки 1-2 [[w:микрометр|мкм]]
| Диаметр клетки 10-20 мкм
|-
| Клеточная стенка
|Обычно имеется, у большинства содержит [[w:пептидогликан|пептидогликан]]
|Часто отсутствует; при наличии не содержит пептидогликана
|-
| Наличие цитоскелета
| Слабее развит, используется только для делении и поддержания формы клетки
| Хорошо развит, часто используется при локомоции
|-
| Жгутики
| Бактериальный жгутик — флагелла; внуклеточная трубка из белка [[w:флагеллин|флагеллина]], при движении вращается
| Эукариотический жгутик — ундулиподия; вырост клетки, окруженный мембраной, при движении изгибается
|-
| Эндоцитоз и внутриклеточное пищеварение
| У всех отсутствуют
| У большинства имеются
|-
| Ядерная оболочка
| Всегда отсутствует
| Всегда имеется, состоит из двух мембран, содержит [[w:ядерные поры|ядерные поры]]
|-
| ДНК основной части генома
| Как правило, одна кольцевая молекула ДНК (генофор)
| Как правило, несколько линейных молекул ДНК (хромосомы)
|-
| Строение рибосом
| 70S-типа, содержат 3 молекулы рРНК
| В цитоплазме 80S-типа, содержат 4 молекулы [[w:рРНК|рРНК]]; в митохондриях и хлоропластах 70S-типа, содержат 2 или 3 молекулы рРНК
|-
| Эндомембранная система
| Обычно слабо развита
| Обычно хорошо развита, включает [[w:эндоплазматическая сеть|ЭПС]], [[w:аппарат Гольджи|аппарат Гольджи]], [[w:лизосомы|лизосомы]] и другие мембранные органоиды
|-
| Эндосимбиоз с другими клетками
| Не встречается
| Практически все клетки содержат эндосимбионтов — митохондрии, хлоропласты, симбиотические бактерии
|-
| Способы деления клетки
| «Прямое» деление (в том числе почкование) без участия веретена деления
| [[w:Митоз |Митоз и]] [[w:мейоз|мейоз]] с участием [[w:веретено деления|веретена деления]] из [[w:микротрубочки|микротрубочек]]
|-
| Обмен веществ
| Разнообразный, у многих есть [[w:азотфиксация|азотфиксация]] и [[w:хемосинтез|хемосинтез]]
| [[w:Гликолиз|Гликолиз]] в цитоплазме, оксигенный [[w:|фотосинтез]] в хлоропластах, кислородное (реже нитратное) [[w:клеточное дыхание|дыхание]] в митохондриях.
|}
 
<sup>1</sup>Пределы размеров широко перекрываются
 
=== Клетки прокариот имеют сравнительно простое строение ===
[[Файл:Average prokaryote cell- ru.svg|thumb|right|300px|Строение типичной клетки прокариот: [[w:Капсула (бактериальная)|капсула]], [[w:клеточная стенка|клеточная стенка]], [[w:Клеточные мембраны|плазмалемма]], [[w:цитоплазма|цитоплазма]], [[w:Рибосома|рибосомы]], [[w:Плазмиды|плазмида]], [[w:пили|пили]], [[w:жгутик|;жгутик (флагелла)]], [[w:нуклеоид|нуклеоид]].]]
 
 
[[Файл:Gram negative cell wall.svg|thumb|350px|Структура оболочки клетки грамотрицательных бактерий]]
 
 
 
<big>Как и у любой клетки, у клетки бактерий есть замкнутая наружная мембрана. У большинства бактерий поверх наружной мембраны имеется толстая клеточная стенка, а поверх неё иногда есть еще слизистая [[w:Капсула (бактериальная)|капсула]]. Внутренние мембраны для прокариот не характерны, хотя у части видов есть внутриклеточные мембранные органоиды — [[w:мезосомы|мезосомы]], [[w:вакуоль|газовые вакуоли]], мембраны, участвующие в фотосинтезе. Как и у всех клеток, у прокариот присутствуют [[w:рибосомы|рибосомы]]. Они отличаются от рибосом эукариот тем, что имеют меньшие размеры, содержат не 4, а 3 молекулы рРНК и меньшее число белков (см. [[# Рибосомы — машины для синтеза белка|Рибосомы — машины для синтеза белка]]).
 
В клетках прокариот отсутствует [[w:Клеточное ядро|ядро]], окруженное у эукариот двумя мембранами. Их [[w:ДНК|ДНК]] содержится в особой области цитоплазмы — [[w:нуклеоид|нуклеоиде]]. Там содержатся также РНК и белки, в том числе и связанные с ДНК. Однако у большинства прокариот нет [[w:нуклеосомы|нуклеосомной укладки ДНК]]. </big>
 
Клеточная стенка защищает клетку от разрушения при осмотическом шоке. Обычно внутри клетки бактерии высоко [[w:осмос|осмотическое давление]]. Если клетку бактерии в её обычной среде лишить клеточной стенки, она лопнет. На этом основано действие [[w:пенициллин|антибиотиков пенициллинового ряда]]. Они блокируют работу [[w:фермент|фермента]] DD-транспептидазы, осуществляющего синтез муреина. Делящиеся клетки не могут достраивать клеточную стенку и лопаются.
 
[[Файл:Muramin Peptidoglykan von E.coli.jpg|thumb|right|200px|Структура пептидогликана E. coli]]
 
 
''У [[w:грамположительные бактерии|грамположительных бактерий]] поверх мембраны имеется [[w:клеточная стенка|клеточная стенка]], содержащая особое вещество — [[w:муреин|муреин]], или [[w:пептидогликан|пептидогликан]]. Толщина пептидогликанового слоя у них составляет 20-80 нм. У [[w:грамотрицательные бактерии|грамотрицательных бактерий]] пептидогликановый слой гораздо тоньше (7-8 нм), а поверх него имеется еще одна — наружная — мембрана. Таким образом, у грамотрицательных бактерий клетка окружена двумя мембранами, между которыми есть периплазматическое пространство, содержащее тонкий пептидогликановый слой. К наружной мембране грамотрицательных бактерий крепятся [[w:липополисахариды|липополисахариды]], часто отвечающие за их патогенность.
 
Клетки бактерий обычно покрыты также S-слоем — слоем из одного белка, толщиной в одну молекулу, который у грамположительных бактерий крепится к пептидогликановой клеточной стенке, а у грамотрицательных — к наружной мембране, образуя комплекс с липополисахаридами.''
 
 
 
* [http://micro-biology.ru/] — Микробиология (учебник для студентов фармацевтических институтов)
* [http://textbookofbacteriology.net/kt_toc.html] — Современная бактериология (англ.)
 
=== Клетки [[w:эукариоты|эукариот]] имеют более крупные размеры и сложное строение ===
 
Хотя размеры клеток прокариот и эукариот широко варьируют и сильно (почти полностью) перекрываются, тем не менее, характерные размеры прокариотических и эукариотических клеток все же заметно различаются. Клетка типичной бактерии или археи имеет диаметр 1-2 мкм. Большинство клеток животных имеют диаметр около 10-20 мкм, клетки растений и грибов в среднем еще крупнее. обратите внимание, что десятикратные различия в диаметре означают тысячекратные различия в объеме и массе: внутри клетки человека могут поместиться не десять бактерий, а тысяча.
 
Разберем подробнее основные признаки клеток эукариот и их отличия от прокариот.
 
=== Основные органеллы эукариотической клетки имеют однотипное строение и функции у представителей разных царств ===
 
1.) [[w:Клеточная мембрана|<big>Клеточная мембрана</big>]]
 
 
Клеточная мембрана (плазмалемма) состоит из двух слоёв молекул фосфолипидов. Фосфолипиды состоят из гидрофильной «головки» и из двух гидрофобных «хвостов». Кроме липидов, в состав мембраны входят белки, помогающие мембране выполнять самые разные функции. Толщина мембраны 6-7 нм. На внешней стороне мембраны у животных находится слой олигосахаридов – гликокаликс.
 
Основные свойства мембраны - '''''полупроницаемость''''', '''''текучесть''''', '''''гибкость''''', '''''способность к самозамыканию''''' и неспособность сильно растягиваться.
 
Функции мембраны:
 
1. '''''Отграничение от внешней среды.'''''Мембрана не позволяет клетке «растекаться», а её жидкому внутреннему содержимому - смешиваться с окружающей водной средой.
 
2. '''''Транспортная функция.''''' Вещества могут проходить через мембрану двумя способами - активным и пассивным. В случае пассивного транспорта вещества проходят мембрану с помощью диффузии. При активном транспорте затрачивается энергия, и обеспечивают его специальные белки-насосы.
 
3. '''''Восприятие сигналов из внешней среды.'' ''' На поверхности мембраны находятся белки-рецепторы, принимающие сигналы из внешней среды.
 
4. '''''Образование межклеточных контактов.'''''
 
Подробнее строение, свойства и функции мембраны разобраны в разделе [[#Строение и функции плазматической мембраны]]
 
2.) [[w:Цитоскелет|<big>Цитоскелет</big>]]
 
Цитоскелет находится в цитоплазме клетки. Он состоит из актиновых микрофиламентов, промежуточных филаментов (есть не во всех клетках) и микротрубочек.
 
[[w:Микрофиламенты|Актиновые филаменты.]] Диаметр актиновых филаментов 6-8 нм. Состоят из белка актина. Могут собираться и разбираться. ВЗаимодействуя с моторными белками миозинами, обеспечивают цитокинез (у животных), амебоидное движение, мышечное сокращение.
 
[[w:Промежуточные филаменты|Промежуточные филаменты.]] Диаметр промежуточных филаментов 9-11 нм. Состоят из кератинов и других фибриллярных белков. Обеспечивают механическую прочность эпителиев, аксонов нервных клеток и других структур. Образуют внутреннюю выстилку ядерной мембраны (ламину), к которой крепятся хромосомы.
 
[[w:Микротрубочки|Микротрубочки]] Диаметр микротрубочек 23-25 нм. Микротрубочки состоят из белка тубулина. Они могут собираться и разбираться. Наряду с другими органеллами входят в состав цитоскелета. Создают веретено деления при митозе и мейозе.
 
Функции:
 
1. '''''Поддержание и изменение формы клетки; цитокинез'''''
 
2. '''''Образование веретена деления''''', "растаскивание" хромосом при делении
 
3. '''''Ресничное движение.''''' Ресничное движение создается в результате работы ресничек. Реснички состоят из микротрубочек, которые соединены с центриолями.
 
4. '''''Амебоидное движение'''''
 
5. '''''Мышечное сокращение'''''
 
6. '''''Внутриклеточный транспорт везикул и макромолекул'''''
 
Подробнее строение и функции цитоскелета рассматриваются в разделе [[#Цитоскелет и клеточная подвижность]].
 
3.) [[w:Реснички|<big>Реснички</big>]] и [[w:жгутики|<big>жгутики</big>]]
 
Реснички и жгутики эукариот - подвижные выросты клетки, одетые наружной мембраной. Внутри них имеется сложная система микротрубочек, у подвижных ресничек и жгутиков их обычно 20 (9 пар по периферии и одна пара в центре). В основании ресничек и жгутиков лежит базальное тельце, сходное по строению с центриолью. Подвижные реснички обычно совершают удары в одной плоскости, жгутики - сложное вращательное движение.
 
Функции:
 
'''''Ресничное и жгутиковое движение ''''' используют одноклеточные эукариоты (жгутиокносцы, инфузории, гаметы многих животных) и мелкие многоклеточные (плоские черви, личинки губок, книдарий и других беспозвоночных)
 
'''''Подвижные реснички и жгутики могут обеспечивать ток жидкости у поверхности тела или во внутренних полостях''''' (например, у человека - ток спинномозговой жидкости. ток слизи в воздухоносных путях, выносящий из них пыль и микробов)
 
'''''Неподвижные видоизмененные реснички часто служат воспринимающим аппаратом клеток-рецепторов.''''' Так, у человека видоизмененные реснички обеспечивают восприятие света и запахов.
 
7.) [[w:Центриоль|<big>Центриоли</big>]]
 
Помогают в формировании веретена деления, как и микротрубочки. Обычно расположены в паре, около ядра.
 
Функции:
 
1. '''''Центр организации микротрубочек'''''
 
8.) [[w:Микроворсинка|<big>Микроворсинки</big>]]
 
Микроворсинки находятся в кишечнике.
Их основная функция - '''''всасывание питательных веществ.'''''
 
 
9.) [[w:Клеточное ядро|<big>Ядро</big>]]
 
Окружено двумя мембранами со множеством ядерных пор. Ядерные поры обеспечивают транспорт веществ. Самая крупная из органелл клетки.
 
Функции:
 
1. '''''Хранение генетической информации.'''''
 
2.'''''Управление делением.'''''
 
3.'''''Синтез ДНК и РНК'''''
 
10.)[[w:Ядрышко|<big>Ядрышко</big>]]
 
Ядрышко - это особая область ядра, содержит участки хромосом (ядрышковый организатор). Ядрышко состоит из белка и рибосомальной РНК и не окружено мембраной. В ядрышке самая высокая концентрация белка во всей клетке.
 
Функция:
 
1.'''''Синтез рРНК и сборка субъединиц рибосом'''''
 
11.)[[w:Рибосома|<big>Рибосомы</big>]]
 
Мелкие немембранные клеточные органеллы. Клетка содержит около десятка тысяч рибосом. Они состоят из белков и рибонуклеиновых кислот.
 
Функция:
 
1.'''''Синтез белков'''''
 
12.) [[w:Лизосома|<big>Лизосомы</big>]]
 
Лизосомы окружены одной мембраной. Они содержат до 40 различных ферментов, которые могут переваривать разные вещества, поступающие в клетку путем эндоцитоза. Производятся в аппарате Гольджи.
 
Функции:
 
1.'''''Внутриклеточное пищеварение'''''. Содержат большое количество пищеварительных ферментов, способных расщеплять все группы органических веществ.
 
2.'''''Аутофагия'''''. При остром голодании лизосомы способны переваривать органеллы клетки. Лизосомы «съедают» органеллы клетки и в случае их повреждения.
 
4.'''''Переваривание межклеточного вещества'''''.
 
 
13.) [[w:Митохондрия|<big>Митохондрии</big>]]
 
Окружены двумя мембранами. Их количество в некоторых клетках может достигать нескольких сотен. Существует теория, согласно которой митохондрии (и хлоропласты) – бывшие бактерии, вступившие в симбиоз с клеткой.
 
Функции:
 
1. '''''Синтез АТФ'''''
 
2. '''''Клеточное дыхание'''''
 
14.) [[w:Аппарат Гольджи|<big>Аппарат Гольджи</big>]]
 
Аппарат Гольджи — одномембранный органиод. Он состоит из мембранных структур - цистерн.
Функции:
 
1. '''''Сортировка белков''''', синтезированных в сидячих рибосомах.
 
2.'''''Образование лизосом'''''
 
3.'''''Секреция'''''
 
15.) <big>Эндоплазматическая сеть (ЭПС)</big>
ЭПС — одномембранный органоид.
 
Функции:
 
1.'''''Синтез белков, липидов и углеводов'''''
 
2.'''''Обезвреживание ядовитых веществ''''', попавших в организм
 
3.'''''Транспортная функция'''''
 
==== Клетки эукариот крупнее клеток прокариот на три порядка ====
 
<big>Типичные клетки эукариот имеют линейные размеры не 1-5, а 10-50 мкм. Это означает, что по объему такая клетка в 1 000 раз больше, чем типичная бактериальная.</big>
 
В последние десятилетия найдено несколько десятков видов очень мелких эукариот, входящих в состав морского планктона. В основном это представители празинофитовых водорослей и некоторых других групп водорослей. Празинофитовая водросль Ostreococcus — самый мелкий из известных свободноживущих эукариот — имеет средний диаметр клеток 0,8 мкм.
 
<big>Следствия этого очень важные. При увеличении размеров объём растет пропорционально кубу линейных размеров, а площадь поверхности тела — пропорционально квадрату. Если, например, взять куб с ребром 1 см, а затем увеличить ребро вдвое, то объём куба возрастет в 8 раз (у первого куба объём 1 см³, а у второго — 8 см³. Площадь поверхности первого куба равна 1х1х6 = 6 см², а второго куба — 2х2х6=24 см²; таким образом, площадь поверхности выросла только в 4 раза. '''Относительная площадь поверхности''' (отношение площади поверхности к объему) у первого куба — 6/1 (см²/ см³), а у второго — только 24/8 = 3/1 (см²/ см³).</big>
 
; Вопрос
: Какова относительная площадь поверхности у куба с ребром ''n'' см?
 
Так как бактерии поглощают питательные вещества всей поверхностью клетки, маленькие размеры обеспечивают им быстрые темпы роста и размножения. Этим обусловлена их важная роль в круговоротах веществ.
 
Скорость перемещения молекул при диффузии пропорциональна корню квадратному из расстояния. Это означает, что молекула, пройдя расстояние в 1 мкм за 1 секунду, пройдет расстояние в 2 мкм за 10 с, а расстояние в 10 мкм — за 100 с. Однако реально малые молекулы диффундируют в цитоплазме достаточно быстро — расстояние в 10 мкм они проходят в среднем за 0,1 с. Однако и эта сравнительно высокая скорость может лимитировать скорость обмена веществ. Как же можно повысить эту скорость?
 
==== Для клеток эукариот характерна компартментализация ====
 
Чтобы химические реакции шли быстрее, нужно увеличить концентрацию реагирующих веществ. Это можно сделать, если сконцентрировать определенные вещества — [[w:фермент|ферменты]] и их субстраты — внутри замкнутого пространства. В разных таких «отсеках» можно создать условия (например, [[w:рН|рН]]), оптимальные для протекания конкретных реакций.
 
Видимо, в связи с этим в клетках эукариот и возникли '''компартменты''' #— «отсеки», отделенные мембранами от цитоплазмы и друг от друга. Говорят, что для клеток эукариот характерна '''компартментализация''' (компартментация).
 
<small>Есть и другие способы повышения скорости химических реакций в клетке. Расчеты показывают, что для столкновения двух молекул (например, конкретных молекул фермента и субстрата) внутри сферы диаметром 10 мкм потребуется в среднем около 30 минут. Если же фермент закреплен на мембране, перегораживающей сферу пополам, а субстрат сначала при диффузии натыкается на мембрану, а затем диффундирует в её плоскости (внутри неё), то время до соударения уменьшается до 2 минут. Если же уменьшить площадь мембраны, то время становится ещё меньше — около 20 секунд. Видимо, этот факт играет важную роль в синтезе липидов, за который отвечают ферменты, закрепленные на мембранах [[w:эндоплазматическая сеть|эндоплазматической сети]]. Эти же закономерности могут играть важную роль в ускорении передачи сигналов, например, от [[w:GPCR|мембранных рецепторов]], в которой участвуют связанные с мембраной [[w:G-белок|G-белки]].</small>
 
==== Клетки животных, растений и грибов различаются деталями строения ====
Клетки животных, высших растений (а тем более водорослей) и грибов достаточно разнообразны. Когда в учебниках перечисляют их различия, обычно имеют в виду [[w:цветковые|цветковые]] растения, [[w:позвоночные|позвоночных]] животных и каких-нибудь высших грибов (например, [[w:базидиомицеты|базидиомицетов]]). Так же поступим и мы.
 
* Растительные и грибные клетки обладают плотной клеточной стенкой (целлюлозной и хитиновой соответственно) — животные клетки не имеют плотной клеточной стенки.
* В качестве энергетического резерва животные и грибы используют гликоген, растения — крахмал.
* Клетки растений содержат органеллы [[w:пластиды|пластиды]], которых нет у животных и грибов.
 
=== Вирусы — неклеточные формы жизни ===
[[Файл:Virion.png|350px|thumb|right|Примеры структур икосаэдрических вирионов.
<span style="font-size:smaller;">
<br />А. Вирус, не имеющий липидной оболочки (например, [[пикорнавирусы|пикорнавирус]]).
<br />B. Оболочечный вирус (например, [[герпесвирусы|герпесвирус]]).
<br />Цифрами обозначены: (1)&nbsp;капсид, (2)&nbsp;геномная нуклеиновая кислота, (3)&nbsp;капсомер, (4)&nbsp;нуклеокапсид, (5)&nbsp;вирион, (6)&nbsp;липидная оболочка, (7)&nbsp;мембранные белки оболочки.</span>]]
 
<big>'''[[w:Вирусы|Ви́рус]]''' (от {{lang-la|virus}} — яд) — микроскопическая частица, состоящая из [[w:белок|белков]] и [[w:нуклеиновые кислоты|нуклеиновых кислот]] и способная инфицировать [[w:клетка|клетки]] живых организмов. Вирусы являются [[w:облигатные паразиты|облигатными паразитами]] — они не способны размножаться вне клетки. В настоящее время известны вирусы, размножающиеся в клетках [[w:растения|растений]], [[w:животные|животных]], [[w:грибы|грибов]] и [[w:бактерии|бактерий]] (последних обычно называют [[w:бактериофаги|бактериофагами]]). Обнаружен также вирус, поражающий другие вирусы ([http://elementy.ru/news/430821 Вирусы тоже болеют вирусными заболеваниями]).
 
[[Файл:Tevenphage.svg|300px|thumb|Структура бактериофага T2.]]
 
 
 
Вирусы представляют собой молекулы [[w:нуклеиновые кислоты|нуклеиновых кислот]] (ДНК или РНК), заключённые в защитную белковую оболочку ([[w: капсид|капсид]]). Наличие капсида отличает вирусы от других инфекционных агентов, [[w:вироиды|вироидов]]. Вирусы содержат только один тип нуклеиновой кислоты: либо [[w:ДНК-содержащие вирусы|ДНК]], либо [[w: РНК-содержащие вирусы|РНК]]. Ранее к вирусам также ошибочно относили [[w:прионы|прионы]], однако впоследствии оказалось, что эти возбудители представляют собой особые [[w:Белки|белки]] и не содержат нуклеиновых кислот.</big>
 
[[Файл:Tobacco mosaic virus structure.png|right|thumb|350px|Палочковидная частица [[Вирус табачной мозаики|вируса табачной мозаики]].
<br /> <span style="font-size:smaller;"> Цифрами обозначены: (1) РНК-геном вируса, (2) капсомер, состоящий всего из одного протомера, (3) зрелый участок капсида.</span>]]
 
 
[[Файл:HI-Virion-en-2.png|thumb|300px|Схема строения [[w:Вирус иммунодефицита человека|ВИЧ]] (вирус иммунодефицита человека)]]
 
 
'''Роль вирусов в биосфере'''
 
Вирусы являются одной из самых распространённых форм существования органической материи на планете по численности: воды мирового океана содержат колоссальное количество бактериофагов (около 10<sup>11</sup> частиц на миллилитр воды), их общая численность в океане — около 4 х 10<sup>30</sup>, а численность вирусов (бактериофагов) в донных отложениях океана практически не зависит от глубины и всюду очень высока [http://elementy.ru/news/430811]. В океане обитают сотни тысяч видов (штаммов) вирусов, подавляющее большинство которых не описаны и тем более не изучены [http://www.plosbiology.org/article/info:doi/10.1371/journal.pbio.0040368][http://elementy.ru/news/430383]. Вирусы играют важную роль в регуляции численности популяций животных.
 
'''Строение вирионов'''
 
Вирусные частицы ([[w:Вирион|вирио́ны]]) представляют собой белковую капсулу — [[w:капсид|капсид]], содержащую геном вируса, представленный одной или несколькими молекулами ДНК или РНК. Капсид построен из '''капсомеров''' — [[w:белки|белковых]] комплексов, состоящих в свою очередь из '''протомеров'''. Нуклеиновая кислота в комплексе с белками обозначается термином '''нуклеокапсид'''.
Некоторые вирусы имеют также внешнюю липидную оболочку. Размеры различных вирусов колеблются от 20 нм ([[w:пикорнавирусы|пикорнавирусы]]) до 500 [[w:нанометр|нм]] ([[w:мимивирус|мимивирусы]]). Вирионы часто имеют правильную геометрическую форму ([[икосаэдр]], [[цилиндр]]). Такая структура капсида предусматривает идентичность связей между составляющими её белками, и, следовательно, может быть построена из стандартных белков одного или нескольких видов, что позволяет вирусу экономить место в геноме.
 
==== Фазы вирусной инфекции ====
 
Условно процесс вирусного инфицирования в масштабах одной клетки можно разбить на несколько взаимоперекрывающихся этапов:
 
* '''Присоединение к клеточной мембране''' — так называемая адсорбция. Обычно для того, чтобы вирион адсорбировался на поверхности клетки, она должна иметь в составе своей [[w:плазматическая мембрана|плазматической мембраны]] белок (часто [[w:гликопротеины|гликопротеин]]) — рецептор, специфичный для данного вируса. Наличие рецептора нередко определяет круг хозяев данного вируса, а также его [[w:ткани (биология)|тканеспецифичность]].
* '''Проникновение в клетку.''' На следующем этапе вирусу необходимо доставить внутрь клетки свою генетическую информацию. Некоторые вирусы привносят также собственные белки, необходимые для её реализации (особенно это характерно для вирусов, содержащих негативные РНК). Различные вирусы для проникновения в клетку используют разные стратегии: например, пикорнавирусы впрыскивают свою РНК через плазматическую мембрану, а вирионы [[w:ортомиксовирусы|ортомиксовирусов]] захватываются клеткой в ходе [[w:эндоцитоз|эндоцитоза]], попадают в кислую среду [[w:лизосомы|лизосом]], где происходит их окончательное созревание(депротеинизация вирусной частицы), после чего РНК в комплексе с вирусными белками преодолевает лизосомальную мембрану и попадает в цитоплазму. Вирусы также различаются по локализации их репликации, часть вирусов (например, те же пикорнавирусы) размножается в цитоплазме клетки, а часть (например, ортомиксовирусы) в её [[w:Клеточное ядро|ядре]].
* '''Перепрограммирование клетки'''. При заражении вирусом в клетке активируются специальные механизмы противовирусной защиты. Заражённые клетки начинают синтезировать сигнальные молекулы — [[w:интерферон|интерфероны]], переводящие окружающие здоровые клетки в противовирусное состояние и активирующие системы иммунитета. Повреждения, вызываемые размножением вируса в клетке, могут быть обнаружены системами внутреннего клеточного контроля, и такая клетка должна будет «покончить жизнь самоубийством» в ходе процесса, называемого [[w:апоптоз|апоптозом]] или программируемой клеточной смерти. От способности вируса преодолевать системы противовирусной защиты напрямую зависит его выживание. Неудивительно, что многие вирусы (например, пикорнавирусы, [[w:флавивирусы|флавивирусы]]) в ходе эволюции приобрели способность подавлять синтез интерферонов, апоптозную программу и так далее. Кроме подавления противовирусной защиты, вирусы стремятся создать в клетке максимально благоприятные условия для развития своего потомства.
 
<small>Примером перепрограммирования систем клетки-хозяина является [[w:трансляция|трансляция]] РНК [[w:энтеровирусы|энтеровирусов]]. Вирусная протеаза расщепляет клеточный белок '''eIF4G''', необходимый для инициации трансляции подавляющего большинства клеточных мРНК (транслирующихся по так называемому [[w:кэп|кэп]]-зависимому механизму). При этом инициация трансляции РНК самого вируса происходит другим способом ([[w:участок внутренней посадки рибосомы|IRES]]-зависимый механизм), для которого вполне достаточно отрезанного фрагмента eIF4G. Таким образом, вирусные РНК приобретают эксклюзивные «права» и не конкурируют за рибосомы с клеточными.</small>
 
* '''Персистенция.''' Некоторые вирусы могут переходить в латентное состояние (так называемая [[w:персистенция|персистенция]] для вирусов [[w:эукариоты|эукариот]] или [[w:лизогения|лизогения]] для [[w:бактериофаги|бактериофагов]] — вирусов [[w:бактерии|бактерий]]), слабо вмешиваясь в процессы, происходящие в клетке, и активироваться лишь при определённых условиях. Так построена, например, стратегия размножения некоторых бактериофагов — до тех пор пока заражённая клетка находится в благоприятной среде, фаг не убивает её, наследуется дочерними клетками и нередко [[w:интеграция (биология)|интегрируется]] в клеточный геном. Однако при попадании заражённой лизогенным фагом бактерии в неблагоприятную среду, возбудитель захватывает контроль над клеточными процессами так, что клетка начинает производить материалы, из которых строятся новые фаги (так называемая '''литическая стадия'''). Клетка превращается в фабрику, способную производить многие тысячи фагов. Зрелые частицы, выходя из клетки, разрывают [[w:клеточная мембрана|клеточную мембрану]], тем самым убивая клетку. С персистенцией вирусов (например, [[w:паповавирусы|паповавирусов]]) связаны некоторые [[w:Онкология|онкологические]] [[w:Заболевание|заболевания]].
* '''Создание новых вирусных компонентов.''' Размножение вирусов в самом общем случае включает три процесса — 1) [[w:транскрипция (биология)|транскрипция]] вирусного генома — то есть синтез вирусной мРНК, 2) её трансляция, то есть синтез вирусных белков и 3) репликация вирусного генома (в некоторых случаях, когда генетическая информация вируса закодирована в виде РНК, геномная РНК одновременно играет роль мРНК, и, следовательно, процесс транскрипции в зараженной клетке не происходит за ненадобностью). У многих вирусов существуют системы контроля, обеспечивающие оптимальное расходование материалов клетки-хозяина. Например, когда вирусной мРНК накоплено достаточно, транскрипция вирусного генома подавляется, а репликация, напротив, активируется.
* '''Созревание вирионов и выход из клетки.''' В конце концов, новосинтезированные геномные РНК или ДНК одеваются соответсвующими белками и выходят из клетки. Следует сказать, что активно размножающийся вирус не всегда убивает клетку-хозяина. В некоторых случаях (например, [[w:ортомиксвирусы|ортомиксовирусы]]) дочерние вирусы отпочковываются от плазматической мембраны, не вызывая её разрыва. Таким образом, клетка может продолжать жить и продуцировать вирус.
 
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/lifecyclehiv.html] Анимация «Жизненный цикл ВИЧ» (англ. текст)
 
==== Классификация Балтимора и жизненные циклы вирусов ====
<small>
Нобелевский лауреат, биолог [[w:Балтимор, Дэвид|Дэвид Балтимор]], предложил свою схему классификации вирусов, основываясь на различиях в механизме продукции [[w:мРНК|мРНК]] и связанных с этим особенностях жизненного цикла вирусов. .Эта система включает в себя семь основных групп:
* (I) Вирусы, содержащие двуцепочечную ДНК и не имеющие РНК-стадии (например, [[w:герпесвирусы|герпесвирусы]], [[w:поксвирусы|поксвирусы]], [[w:паповавирусы|паповавирусы]], [[w:мимивирус|мимивирус]]).
 
* (II) Вирусы, содержащие двуцепочечную РНК (например, [[w:ротавирусы|ротавирусы]]).
 
* (III) Вирусы, содержащие одноцепочечную молекулу ДНК (например, [[w:парвовирусы|парвовирусы]]).
 
* (IV) Вирусы, содержащие одноцепочечную молекулу РНК положительной полярности (например, [[w:пикорнавирусы|пикорнавирусы]], [[w:флавивирусы|флавивирусы]]).
 
* (V) Вирусы, содержащие одноцепочечную молекулу РНК негативной или двойной полярности (например, [[w:ортомиксовирусы|ортомиксовирусы]], [[w:филовирусы|филовирусы]]).
 
* (VI) Вирусы, содержащие одноцепочечную молекулу РНК и имеющие в своем жизненном цикле стадию синтеза ДНК на матрице РНК, [[w:ретровирусы|ретровирусы]] (например, [[w:ВИЧ|ВИЧ]]).
 
* (VII) Вирусы, содержащие двуцепочечную ДНК и имеющие в своем жизненном цикле стадию синтеза ДНК на матрице РНК, [[w:Гепаднавирусы|ретроидные]] вирусы (например, [[w:вирус гепатита B|вирус гепатита B]]).</small>
 
====История изучения вирусов====
<small>
Впервые существование вируса (как нового типа возбудителя болезней) доказал в 1892 году русский учёный [[w:Ивановский, Дмитрий Иосифович|Д. И. Ивановский]]. После многолетних исследований заболеваний [[w:табак|растений табака]], в работе, датированной 1892 годом, Д. И. Ивановский приходит к выводу, что [[w:мозаичная болезнь табака|мозаичная болезнь табака]] вызывается «бактериями, проходящими через [[w:фильтр Шамберлана|фильтр Шамберлана]], которые, однако, не способны расти на искусственных субстратах».
 
Пять лет спустя, при изучении заболеваний крупного рогатого скота, а именно — ящура, был выделен аналогичный фильтрующийся микроорганизм. А в 1898 году, при воспроизведении опытов Д. Ивановского голландским ботаником [[w:Бейеринк, Мартинус Виллем|М. Бейеринком]], он назвал такие микроорганизмы «фильтрующимися вирусами». В сокращённом виде, это название и стало обозначать данную группу микроорганизмов.
 
В 1901 г. было обнаружено первое вирусное заболевание человека — жёлтая лихорадка. Это открытие было сделано американским военным хирургом У. Ридом и его коллегами.
 
В 1911 г. [[w:Роус, Фрэнсис Пейтон|Фрэнсис Раус]] доказал вирусную природу рака — [[w:саркома Рауса|саркомы Рауса]] (лишь в 1966 г, спустя 55 лет, ему была вручена за это открытие [[w:Нобелевская премия по физиологии и медицине|Нобелевская премия по физиологии и медицине]]).
 
В последующие годы изучение вирусов сыграло важнейшую роль в развитии [[w:эпидемиология|эпидемиологии]], [[w:иммунология|иммунологии]], [[w:молекулярная генетика|молекулярной генетики]] и других разделов биологии.<big> Так, '''[[w:эксперимент Херши-Чейз|эксперимент Херши-Чейз]]''' стал решающих доказательством '''роли ДНК в передаче наследственных свойств.'''</big> В разные годы еще как минимум шесть Нобелевских премий по физиологии и медицине и три [[w:Нобелевская премия по химии|Нобелевских премии по химии]] были вручены за исследования, непосредственно связанные с изучением вирусов.
 
В 2002 году, в университете Нью-Йорка был создан первый синтетический вирус ([[w:вирус полиомиелита|вирус полиомиелита]]).</small>
 
=== Разнообразие клеток многоклеточного организма ===
[[Файл:GFPneuron.png|thumb|250px|right|Пирамидальные нейроны коры головного мозга мыши, окрашенные с помощью [[w:Зелёный флуоресцентный белок|зелёного флуоресцентного белка]]. Красным окрашены интернейроны, выделяющие в качестве [[w:нейромедиатор|нейромедиатора]] [[w:Гамма-аминомасляная кислота|гамма-аминомасляную кислоту]]]]
[[w: Многоклеточные организмы | Многоклеточный организм]] отличаются от [[w:Одноклеточные организмы |одноклеточных]] и [[w: Колониальные организмы | колониальных]] четко выраженной дифференциацией функций отдельных групп клеток. Специализация клеток повышает их эффективность в выполнении определённых функций, а их упорядоченность и согласованность действий позволяют целому многоклеточному организму приобретать свойства, недоступные одноклеточным и колониальным организмам.
Клетка в многоклеточном организме во многом действует так же, как и в одноклеточном организме при взаимодействии с внешней средой и клетками окружения. Однако усиление специализации клеток увеличивает и их взаимозависимость от клеток другой специализации.
 
Важную роль в строении многоклеточного организма играют [[w: стволовые клетки | стволовые клетки]]. Эти клетки способны делиться асимметрично, порождая клетку, подобную материнской, а также новую клетку, способную дифференцироваться, т.е. приобретать специализированные функции. Стволовые клетки разделяют по способности порождать другие виды клеток. Самыми широкими возможностями обладают т.н. [[w: Тотипотентность | тотипотентные]] стволовые клетки, такие как зигота и бластомеры, способные дать начало любым типам клеток. Далее, по мере сужения диапазона возможной дифференцировки, различают [[w: Плюрипотентность | плюрипотентные]], [[w: Мультипотентность | мультипотентные]] и [[w: Унипотентность | унипотентные]] стволовые клетки. В органах и тканях взрослого организма присутствуют стволовые клетки разной степени зрелости и потентности, способные при необходимости превратиться в клетки нужного типа.
 
Число типов клеток в многоклеточном организме может достигать нескольких сотен. Например, во взрослом организме млекопитающего насчитывается около 350 различных видов клеток. Клетки различаются по размеру, форме, числу ядер, степени развитости органоидов, химическому составу и функциям:
 
Эритроциты высших позвоночных имеют диаметр 4–7 микрон, а клетки мышц — это крупные [[w: Синцитий | синцитии]] длиной до нескольких сантиметров. Ещё более крупные линейные размеры имеют [[w: Нейрон | нейроны]] с их гигантскими аксонами, достигающими в длину около метра.
 
Клетки могут иметь разнообразную форму: близкую к шарообразной (клетка крови — лимфоцит), напоминающую многогранник (клетка печени — гепатоцит), звездчатую (клетка костной ткани — остеобласт), цилиндрическую (клетка мерцательного эпителия). У млекопитающих зрелые эритроциты лишены ядер и имеют форму двояковогнутого диска. Монополярные нервные клетки, нейроны, имеют тело размером в несколько десятков микрон и отростки, аксоны, длиной до нескольких десятков сантиметров.
 
В большинстве клеток имеется одно ядро, и такие клетки называют одноядерными. Существуют также клетки с двумя, тремя, несколькими десятками и даже сотнями ядер. Это — многоядерные клетки. Клетки мышц, например, являются многоядерными клетками (синцитиями), появившимися из одноядерных в процессе эмбриогенеза. А эритроциты в зрелом состоянии не имеют ядра вовсе (это безъядерные клетки).
 
Органоиды различных клеток многоклеточного организма различаются по степени развитости. Например, в клетках кишечного эпителия [[w: Лизосомы | лизосомы]] и [[w: аппарат Гольджи | аппарат Гольджи]] развиты лучше, чем в нейронах. А в клетках надпочечника цитоскелет развит слабее, чем в клетках мышечной ткани. Зато клетки надпочечника обладают сильно развитой эндоплазматической сетью; это связано с их секреторной активностью.
 
В ходе эволюции сходные клетки многоклеточного организма специализировались на выполнении определенных функций, что привело к формированию тканей. Разные ткани объединились в органы, а органы — в системы органов. Функции клеток различных тканей и органов, выполняющих специализированные функции, также существенно различаются. Так, эритроциты выполняют функцию переноса кислорода и углекислого газа, клетки различных эпителиев — защитную, выделительную, всасывающую и разграничительную функции, а нейроны, клетки нервной ткани — функцию восприятия раздражителей, генерации и передачи нервных импульсов.
 
Специализация клеток происходит вследствие дифференцированной работы [[w: Геном | генома]]. Репрессия и дерепрессия конкретных участков генома, а также биохимическая и анатомо-морфологическая дифференциация происходят из-за разной концентрации действующих на клетки сигнальных веществ, питательных веществ и ионов.
 
<gallery>
Файл:Neuron‎.jpg|Общее строение нейрона
Файл:Fibroblast.jpg|Фибробласты — клетки соединительной ткани
Файл:Parietal cells.jpg|Париетальные клетки желудочных желёз
Файл:Plagiomnium_affine_laminazellen.jpeg|Хлоропласты в растительных клетках
</gallery>
 
== Основные понятия химии и химический состав клеток ==
 
Полезные сайты по теме:
 
* http://repetitors.info/txt/chim/st_chim_def.doc — первоначальные химические понятия (файл в формате .doc)
* [http://www.hemi.nsu.ru/index.htm] — А. В. Мануйлов, В. И. Родионов. Основы химии. Электронный учебник.
* [[http://www.xumuk.ru/tm.html]] ХиМиК.ru
* [[w:Портал:Химия|Портал:Химия]] — Химический портал Википедии
* [http://www.web.virginia.edu/Heidi/home.htm] — Учебник биохимии (англ.)
* [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowTOC&rid=stryer.TOC&depth=2] — еще один учебник биохимии (англ.)
 
=== Атомы ===
 
==== Атом — наименьшая частица химического элемента ====
[[Файл:Helium atom QM uk.svg|thumb|250px|Атом гелия]]
<big>'''А́том''' ({{lang-grc|ἄτομος}} — неделимый) — наименьшая частица [[w:химический элемент|химического элемента]], являющаяся носителем его свойств. Атом состоит из [[w:атомное ядро|атомного ядра]] и окружающего его [[w:Электронная конфигурация|электронного облака]]. Ядро атома состоит из положительно [[w:электрический заряд|заряженных]] [[w:протон|протонов]] и электрически нейтральных [[w:нейтрон|нейтронов]], а окружающее его облако состоит из отрицательно заряженных [[w:электрон|электронов]].</big>
 
<big>Поскольку число протонов в ядре совпадает с числом электронов, то атом в целом оказывается электрически нейтральным. Атом, который отдал или приобрел электроны, обладает некоторым положительным или отрицательным зарядом и называется [[w:|ионом]] (ион может представлять собой и группу атомов — часть молекулы).</big>
 
<big>Атомы классифицируются по числу протонов и нейтронов в ядре: число протонов определяет принадлежность атома некоторому химическому элементу. Число нейтронов у атомов одного химического элемента может различаться, атомы с одинаковым числом протонов, но разным числом нейтронов называют [[w:изотоп|изотопами]] данного элемента.</big>
 
<big>Атомы, связанные межатомными связями, образуют [[w:Молекула|молекулы]].</big>
 
 
''' Модели атомов '''
 
''В разные эпохи предлагались различные модели атомов, наиболее известная из которых — '''планетарная модель атома Бора-Резерфорда'''. В 1911 году Эрнест Резерфорд, проделав ряд экспериментов, пришёл к выводу, что атом представляет собой подобие [[w:планетная система|планетной системы]], в которой электроны движутся по орбитам вокруг расположенного в центре атома тяжёлого положительно заряженного ядра («модель атома Резерфорда»). Однако такое описание атома вошло в противоречие с [[w:Электродинамика|классической электродинамикой]]. Дело в том, что, согласно классической электродинамике, электрон при движении с [[w:Центростремительное ускорение|центростремительным ускорением]] должен излучать [[w:электромагнитное излучение|электромагнитные волны]], а следовательно, терять [[w:Энергия|энергию]]. Расчеты показывали, что время, за которое электрон в таком атоме упадёт на ядро, совершенно ничтожно. Для объяснения стабильности атомов [[w:Бор, Нильс|Нильсу Бору]] пришлось ввести [[w:постулаты Бора|постулаты]], которые сводились к тому, что электрон в атоме, находясь в некоторых специальных энергетических состояниях, не излучает («модель атома Бора-Резерфорда»). Постулаты Бора показали, что для описания атома классическая механика неприменима. Дальнейшее изучение излучения атома привело к созданию [[w:квантовая механика|квантовой механики]], которая позволила объяснить подавляющее большинство наблюдаемых фактов.''
 
''' Современные представления об атоме '''
 
Сегодня общепринятой является модель атома, являющаяся развитием планетарной модели. Считается, что ядро атома состоит из положительно заряженных [[w:протон|протонов]] и не имеющих заряда [[w:нейтрон|нейтронов]] и окружено отрицательно заряженными [[w:электрон|электронами]].
 
''Однако представления квантовой механики не позволяют считать, что электроны движутся вокруг ядра по сколько-нибудь определённым траекториям ([[w:принцип неопределённости Гейзенберга|неопределённость]] координаты электрона в атоме может быть сравнима с размерами самого атома).''
Химические свойства атомов определяются конфигурацией электронной оболочки и описываются c помощью [[w:Квантовая механика|квантовой механикой]]. Положение атома в [[w:Периодическая система элементов|таблице Менделеева]] определяется числом протонов, в то время как число нейтронов принципиально на химические свойства не влияет; при этом нейтронов в ядре, как правило, не меньше, чем протонов (см. [[w:атомное ядро|атомное ядро]]). Если атом находится в нейтральном состоянии, то число электронов в нём равно числу протонов. Основная масса атома сосредоточена в ядре, а массовая доля электронов в общей массе атома незначительна (несколько сотых процента массы ядра).
 
Массу атома принято измерять в [[w:Атомная единица массы|атомных единицах массы]], равных 1/12 от массы атома стабильного [[w:Изотопы углерода|изотопа углерода]] <sup>12</sup>C.
 
==== Атомы состоят из [[w:Субатомные частицы|субатомных частиц]] ''' ====
 
Хотя слово ''атом'' в первоначальном значении обозначало частицу, которая не делится на меньшие части, согласно современным представлениям он состоит из более мелких частиц, называемых [[w:Элементарная частица|субатомными частицами]]. Атом состоит из [[w:электрон|электронов]], [[w:протон|протонов]], все атомы, кроме [[w:атом водорода|водорода-1]], содержат также [[w:нейтрон|нейтроны]].
 
Электрон является самой лёгкой из составляющих атом частиц с [[w:масса|массой]] 9,11 х 10<sup>−28</sup> [[w:грамм|г]], отрицательным [[w:элементарный заряд|зарядом]] и размером, слишком малым для измерения современными методами. Протоны обладают положительным зарядом и в 1836 раз тяжелее электрона (1,6726 х 10<sup>−24</sup> г). Нейтроны не обладают электрическим зарядом и в 1839 раз тяжелее электрона (1,6929 х 10<sup>−24</sup> г).
 
''При этом масса ядра меньше суммы масс составляющих её протонов и нейтронов из-за эффекта [[w:дефект массы|дефекта массы]]. Нейтроны и протоны имеют сравнимый размер, около 2,5 х 10<sup>−15</sup> [[метр|м]], хотя размеры этих частиц определены плохо.''
 
''В [[w:стандартная модель|стандартной модели]] элементарных частиц как протоны, так и нейтроны состоят из элементарных частиц, называемых [[w:кварк|кварками]]. Наряду с [[w:лептон|лептонами]], кварки являются одной из основных составляющих материи. И первые и вторые являются [[w:фермион|фермионами]]. Существует шесть типов кварков, каждый из которых имеет дробный электрический заряд, равный +2/3 или −1/3 [[w:Элементарный электрический заряд|элементарного]]. Протоны состоят из двух [[w:u-кварк|u-кварков]] и одного [[w:d-кварк|d-кварка]], а нейтрон — из одного u-кварка и двух d-кварков. Это различие объясняет разницу в массах и зарядах протона и нейтрона. Кварки связаны между собой [[w:Сильное взаимодействие|сильными ядерными взаимодействиями]], которые передаются [[w:глюон|глюонами]].''
 
==== [[w:Радиус атома|Размер атомов]] в миллионы раз меньше размеров клеток ====
 
Атомы не имеют отчётливо выраженной внешней границы, поэтому их размеры часто определяют по расстоянию между ядрами соседних атомов, которые образовали [[w:химическая связь|химическую связь]]. Половина этого расстояния — радиус атома.
 
''Есть и другой вариант определения радиуса атома (см. статью [[w:Радиус атома|Размер атомов]]).''
 
В [[w:периодическая система элементов|периодической системе элементов]] размер атома увеличивается при движении сверху вниз по столбцу и уменьшается при движении по строке слева направо. Соответственно, самый маленький атом — это атом [[w:Гелий|гелия]], имеющий радиус 32 [[w:пикометр|пм]], а самый большой — атом [[w:цезий|цезия]] (225 пм). Эти размеры в тысячи раз меньше длины волны видимого [[w:|света]] (400—700 [[w:нанометр|нм]]), поэтому атомы нельзя увидеть в [[w:|оптический микроскоп]]. Однако отдельные атомы можно наблюдать (например, на поверхности металлов) с помощью [[w:Сканирующий туннельный микроскоп|сканирующего туннельного микроскопа]]. Диаметр [[w:Атомное ядро|ядра атома]] примерно в 100.000 раз меньше диаметра самого атома.
 
''Радиус зависит от положения атома, его типа, вида химической связи, числа ближайших атомов ([[w:координационное число|координационного числа]]) и [[w:квантовая механика|квантово-механического]] свойства, известного как [[w:|спин]].''
 
Малость атомов демонстрируют следующие примеры. Человеческий волос по толщине в миллион раз больше атома углерода. Толщина человеческого волоса примерно 10<sup>5</sup> нм, а 10 углеродных атомов, выстроенных в цепочку, по толщине составляют 1 нм. Одна капля воды содержит 2 x 10 <sup>21</sup> атомов [[w:|кислорода]] и в два раза больше атомов [[w:|водорода]]. Если бы яблоко можно было увеличить до размеров [[Земля|Земли]], то атомы достигли бы исходных размеров яблока.
 
Клетка мелкой бактерии имеет объем около 1 мкм³. Даже в такой мелкой клетке содержится несколько миллионов атомов.
 
==== Электронные орбитали и энергетические уровни ====
 
См. статью [[w:Атомная орбиталь|Атомная орбиталь]]
См. статью [[w:|Энергетический уровень]]
 
Когда электрон находится в связанном состоянии в атоме, он обладает [[w:потенциальная энергия|потенциальной энергией]], которая обратно пропорциональна его расстоянию от ядра. Эта энергия обычно измеряется в [[w:|электронвольтах]] (эВ) и равна энергии, которую надо передать электрону, чтобы сделать его свободным (оторвать от атома).<big> Согласно квантовомеханической модели атома связанный электрон может занимать только дискретный набор разрешённых '''энергетических уровней''' — состояний с определённой энергией. Наинизшее из разрешённых энергетических состояний называется ''основным'', а все остальные — возбуждёнными.</big>
 
Для перехода электрона с одного энергетического уровня на другой нужно передать ему или отнять у него энергию. Это происходит путём соответственно поглощения или испускания [[w:|фотона]], причём энергия этого фотона равна абсолютной величине разности энергий начального и конечного уровней электрона. Энергия испущенного фотона пропорциональна его [[w:частота|частоте]], поэтому переходы между разными энергетическими уровнями проявляются в различных областях электромагнитного [[w:|спектра]]. Каждый элемент имеет уникальный [[w:|спектр испускания]], который зависит от заряда ядра, заполнения электронных подоболочек, взаимодействия электронов, а также других факторов.
 
 
''Когда излучение с непрерывным спектром проходит через вещество (например, [[w:|газ]] или [[w:плазма|плазму]]), некоторые фотоны поглощаются атомами или ионами, вызывая электронные переходы между энергетическим состояниями, разность энергий которых равна энергии поглощённого фотона. Затем эти возбуждённые электроны спонтанно переходят на уровень, лежащий ниже по энергии, снова испуская фотоны. Таким образом, вещество ведёт себя как фильтр, превращая исходный непрерывный спектр в [[w:|спектр поглощения]], в котором имеются серии тёмных полос. При наблюдении с тех углов, куда не направлено исходное излучение, можно заметить излучение с [[w:эмиссионный спектр|спектр испускания]], излучаемого атомами. [[w:Спектроскопия|Спектроскопический анализ]] — измерения энергии, амплитуды и ширины спектральных линий излучения — позволяют определить вид излучающего вещества и физические условия в нём.''
 
Электроны в атоме притягиваются к протонам, находящимся в ядре, под действием [[w:электромагнитное взаимодействие|электромагнитных сил]]. Для того, чтобы электрон смог преодолеть притяжение ядра, ему необходимо передать энергию от внешнего источника. Чем ближе электрон находится к ядру, тем больше энергии для этого необходимо.
 
''Электромагнитные силы удерживают электроны внутри [[w:потенциальный барьер|потенциального барьера]], окружающего ядро.''
 
Электронам, как и другим субатомным частицам, свойственен [[w:|корпускулярно-волновой дуализм]] — они представляют собой одновременно и частицу, и волну. В электронном облаке электронам соответствуют трёхмерные [[w:|стоячие волны]], не изменяющие своей формы с течением времени относительно ядра. Говорят, что электрон движется по [[w:орбиталь|орбитали]]. Существует дискретный набор таких орбиталей, и электроны могут находиться длительное время только в этих состояниях, так как они наиболее устойчивые.
 
''На самом же деле это состояние описывают [[w:волновая функция|волновой функцией]], квадрат которой характеризует плотность вероятности нахождения частицы в данной точке пространства в данный момент времени.''
 
Каждой орбитали соответствует свой [[w:энергетический уровень|уровень энергии]]. Электрон может перейти на уровень с большей энергией (новую орбиталь), поглотив [[w:|фотон]] — квант света. При этом он окажется в новом состоянии с большей энергией. Аналогично, он может перейти на уровень с меньшей энергией, излучив фотон. Энергия фотона при этом будет равна разности энергий электрона на этих уровнях (см. [[w:|постулаты Бора]]).
 
'''Главное (радиальное) [[w:|квантовое число]]''' — целое число, обозначающее номер энергетического уровня. Характеризует [[w:энергия|энергию]] электронов, занимающих данный энергетический уровень. Оно обозначается как <math>n</math>. При увеличении главного квантового числа возрастают радиус орбитали и энергия электрона.
 
<big>Наибольшее число электронов на энергетическом уровне, с учетом [[w:спин|спина]] электрона, определяется по формуле <math>~N=2n^2</math>, где N — число электронов на уровне, а n — главное квантовое число (номер уровня). Таким образом, на первом энергетическом уровне может находиться максимум 2 электрона, на втором — 8, на третьем — 18 и т. п. На каждом энергетическом уровне орбиталей вдвое меньше, чем электронов (1 орбиталь на первом уровне, 3 — на втором, 9 — на третьем). На каждой орбитали может находиться максимум по два электрона, отличающихся спином.
Участвуют в образовании химических связей и определяют химические свойства атомов данного химического элемента почти исключительно электроны внешнего (самого далекого от ядра) электронного уровня. </big>
 
''Главное квантовое число является первым в ряду квантовых чисел, который включает в себя главное, [[w:орбитальное квантовое число|орбитальное]] и [[w:магнитное квантовое число|магнитное]] квантовые числа, а также [[w:|спин]]. Эти четыре квантовые числа определяют уникальное состояние электрона в атоме (его [[w:волновая функция|волновую функцию]]).''
 
'''[[w:электронные оболочки|Электронные оболочки]]'''
 
<big>При увеличении номера элемента (числа протонов в ядре) растёт и число электронов. В какой последовательности они занимают электронные орбитали? Оказывается, чем меньше энергия данной орбитали, тем «быстрее» она заполняется электронами. Если же есть несколько орбиталей с равными энергиями, то электроны «стремятся» располагаться на них поодиночке, если есть такая возможность.</big>
 
'''Электронная оболочка''' [[w:|атома]] — область пространства вероятного местонахождения [[w:|электронов]], характеризующихся одинаковым значением [[w:главное квантовое число|главного квантового числа]] ''n'' и, как следствие, располагающихся на близких [[w:энергетический уровень|энергетических уровнях]]. Каждая электронная оболочка может иметь определённое максимальное число электронов.
 
Электронные оболочки обозначаются буквами s, p, d, f, g или цифрами от 0 до 4. Электроны внешних оболочек обладают большей энергией, и, по сравнению с электронами внутренних оболочек, находятся дальше от ядра, что делает их более важными в анализе поведения атома в химических реакциях и в роли проводника, так как их связь с ядром слабее и легче разрывается.
 
''Подуровни оболочек''
 
Каждая оболочка состоит из одного или нескольких подуровней, каждый из которых состоит из [[w:Атомная орбиталь|атомных орбиталей]].
К примеру, первая оболочка (K) состоит из одного подуровня «1s». Вторая оболочка (L) состоит из двух подуровней, 2s и 2p. Третья оболочка — из «3s», «3p» и «3d».
Возможные варианты подуровней оболочек приведены в следующей таблице:
{| class="wikitable"
! Обозначение подуровня !! [[Орбитальное квантовое число|''l'']] !! Макс. кол-во электронов !! Содержание в оболочках !! Историческое наименование
|-
| s || 0 || 2 || В каждой || '''s'''harp
|-
| p || 1 || 6 || Во всех, начиная со 2 || '''p'''rincipal
|-
| d || 2 || 10 || Во всех, начиная с 3 || '''d'''iffuse
|-
| f || 3 || 14 || Во всех, начиная с 4 || '''f'''undamental
|-
| g || 4 || 18 || Во всех, начиная с 5 ||
|-
| h || 5 || 22 || Во всех, начиная с 6 ||
|-
| i || 6 || 26 || Во всех, начиная с 7 ||
|}
 
''Валентные оболочки''
 
<big>'''Валентная оболочка''' — самая внешняя оболочка атома. Электроны этой оболочки зачастую называют [[w:Валентный электрон|валентными электронами]], так как в основном именно эти электроны определяют поведение атома в химических реакциях. При образовании химических связей атомы «стремятся» заполнить свои внешние валентные оболочки.</big>
 
С точки зрения химической активности, наименее активными считаются атомы, в которых валентная оболочка окончательно заполнена (инертные газы). Наибольшей химической активностью обладают атомы, в которых валентная оболочка состоит всего из одного электрона (щелочные металлы), и атомы, в которых одного электрона не хватает для окончательного заполнения оболочки (галогены).
 
На самом деле всё немного сложнее. Поведение атома в химических реакциях определяют электроны, обладающие большей энергией, то есть те электроны, которые расположены дальше от ядра. Электроны внутренних подуровней оболочек имеют меньшую энергию, чем электроны внешних подуровней. Несмотря на то, что электроны подуровня оболочки 3d могут не принадлежать к т. н. валентной оболочке, они могут иметь энергию большую, чем электроны подуровня оболочки 4s, что делает их [[w:Валентныq электрон|валентными электронами]] (см. [[#Валентные электроны и валентность|Валентные электроны и валентность]]).
 
Чтобы показать повторяющиеся химические свойства [[w:химический элемент|химических элементов]], их упорядочивают в виде [[w:Периодическая система элементов|периодической таблицы]] (таблицы [[w:Менделеев, Дмитрий Иванович|Менделеева]]). Элементы с одинаковым числом валентных электронов формируют группу, которая изображается в таблице в виде столбца (движение по горизонтальному ряду соответствуют заполнению валентной оболочки электронами). Элементы, находящиеся в самом правом столбце таблицы, имеют полностью заполненную электронами внешнюю оболочку, поэтому они отличаются крайне низкой химической активностью и называются инертными, или [[w:благородный газ|благородными газами]].
 
'''Порядок заполнения электронных оболочек'''
 
Порядок заполнения электроннных оболочек ([[w:Атомная орбиталь|орбиталей]] с одинаковым значением главного квантового числа ''n'') определяется [[w:Правило Клечковского|правилом Клечковского]], порядок заполнения электронами орбиталей в пределах одного подуровня ([[w:Атомная орбиталь|орбиталей]] с одинаковыми значениями [[w:главное квантовое число|главного квантового числа]] ''n'' и [[w:орбитальное квантовое число|орбитального квантового числа]] ''l'') определяется [[w:Правило Хунда|правилом Хунда]].
 
<big>Для начала разберемся в заполнении двух первых энергетических уровней. На первом уровне всего одна орбиталь (1s), на которой могут располагаться максимум два электрона. Энергия этой орбитали у любого атома ниже, чем у всех остальных орбиталей, поэтому она всегда заполняется первой. На втором уровне имеется четыре орбитали — 2s, 2px, 2py и 2pz. Сначала целиком заполняется 2s орбиталь (ее энергия меньше, чем у 2p-орбиталей). Затем заполняются p-орбитали. У них энергия равная, поэтому сначала электроны располагаются на них поодиночке. Так, у элемента N 7 ([[w:|азот]]) [[w:электронная конфигурация|электронная формула]], которая описывает распределение электронов по орбиталям, будет 1s2 2s2 2px1 2py1 2pz1. Это означает, что по два электрона находятся на двух s-орбиталях и по одному — на каждой из трех p-орбиталей (см.[[http://www.alhimikov.net/elektronbuch/Page-5.html]].</big>
 
; Вопрос 1
: Какова электронная формула элемента №6 (углерода)?
; Вопрос 2
: Сколько валентных электронов у бора? У углерода?
 
==== [[w:Химический элемент|Химические элементы]] ====
 
<big>По определению, любые два атома с одним и тем же числом ''протонов'' в их ядрах относятся к одному [[w:химический элемент|химическому элементу]]. Итак, '''химический элемент — это сорт атомов с определенным числом протонов в ядре'''.</big>
 
На июнь 2009 года известно 117 химических элементов (с порядковыми номерами с 1 по 116 и 118), из них 94 обнаружены в природе (некоторые — лишь в следовых количествах), остальные 23 получены искусственно в результате ядерных реакций.
 
''Первые 112 элементов имеют постоянные названия, остальные — временные. Открытие 112-го элемента (самый тяжелый из официальных) признано Международным союзом теоретической и прикладной химии (en:International Union for Pure and Applied Chemistry). Самый стабильный из известных изотопов данного элемента имеет период полураспада 34 секунды. На начало июня 2009 года носит неофициальное имя унунбий, был впервые синтезирован в феврале 1996 года на ускорителе тяжелых ионов в Институте тяжелых ионов (Gesellschaft für Schwerionenforschung, GSI) в Дармштадте, Германия (в результате бомбардировки свинцовой мишени ядрами цинка). Первооткрыватели имеют полгода, чтобы предложить новое официальное название для добавления в таблицу (ими уже предлагались Виксхаузий, Гельмгольций, Венусий, Фриший, Штрассманий и Гейзенбергий). В настоящее время известны трансурановые элементы с номерами 113—116 и 118, полученные в Объединенном институте ядерных исследований в Дубне, однако они официально пока не признаны. ''
 
'''Химические символы'''
Символы химических элементов используются как сокращения для названия элементов. В качестве символа обычно берут начальную букву названия элемента и в случае необходимости добавляют следующую или одну из следующих. Обычно это начальные буквы латинских названий элементов: Cu — медь (cuprum), Ag — серебро (argentum), Fe — железо (ferrum), Au — золото (aurum), Hg — ртуть (hydrargirum).
 
Пока Вам необходимо запомнить символы следующих элементов:
* C — [[w:углерод|углерод]]
* H — [[w:водород|водород]]
* O — [[w:кислород|кислород]]
* N — [[w:азот|азот]]
* S — [[w:сера|сера]]
* P — [[w:фосфор|фосфор]]
* K — [[w:калий|калий]]
* Ca — [[w:кальций|кальций]]
* Mg — [[w:магний|магний]]
* Fe — [[w:железо|железо]]
* Cl — [[w:хлор|хлор]]
 
 
 
'''Карточка химического элемента'''включает краткую информацию о его свойствах. На рисунке показана карточка [[w:рутений|рутения]].
 
[[Файл:Muster Ruthenia.svg|200 px|right]]
* '''1''' — обозначение химического элемента.
* '''2''' — русское название.
* '''3''' — [[w:порядковый номер химического элемента|порядковый номер химического элемента]], равный количеству протонов в атоме.
* '''4''' — [[w:атомная масса|атомная масса]].
* '''5''' — распределение электронов по энергетическим уровням.
* '''6''' — [[w:электронная конфигурация|электронная конфигурация]].
 
<big>'''Атомы с одним и тем же количеством протонов, но разным количеством ''нейтронов'' называют [[w:|изотопами]] данного элемента'''. Например, атомы водорода всегда содержат один протон, но существуют изотопы без нейтронов ([[w:атом водорода|водород-1]], иногда также называемый ''протием'' — наиболее распространённая форма), с одним нейтроном ([[w:|дейтерий]]) и двумя нейтронами ([[w:|тритий]]). </big>
 
 
Известные элементы составляют непрерывный натуральный ряд по числу протонов в ядре, начиная с атома водорода с одним протоном и заканчивая атомом [[w:Унуноктий|унуноктия]], в ядре которого 118 протонов.
 
'''[[w:Атомная масса|Масса атома]]'''
 
<big>Поскольку наибольший вклад в массу атома вносят протоны и нейтроны, полное число этих частиц называют [[w:массовое число|массовым числом]]. [[w:Масса покоя|Массу покоя атома]] часто выражают в [[w:Атомная единица массы|атомных единицах массы]] (а.&nbsp;е.&nbsp;м.), которая также называется ''дальтоном'' (Да). Эта единица определяется как 1/12 часть массы покоя нейтрального атома [[w:Изотопы углерода|обычного изотопа углерода — углерода-12]], которая приблизительно равна 1,66 x 10<sup>−24</sup> г.
Масса атома приблизительно равна произведению [[w:массовое число|массового числа]] на атомную единицу массы.</big>
 
[[w:атом водорода|Водород-1]] — наилегчайший изотоп водорода и атом с наименьшей массой, он имеет атомную массу около 1,007825 а.&nbsp;е.&nbsp;м.
 
Атомная масса '''химического элемента''' (также «средняя атомная масса», «стандартная атомная масса») является средневзвешенной атомной массой всех стабильных изотопов данного химического элемента с учётом их природной распространённости в земной коре и атмосфере. Например, [[w:хлор|хлор]] в природных соединениях находится в виде двух изотопов: <sup>35</sup>Cl (75,5 % массы) и <sup>37</sup>Cl (24,5 % массы). Среднюю атомную массу природного хлора равна 0,755∙35 + 0,245∙37 = 35,5
 
 
Именно эта атомная масса представлена в периодической таблице Д. И. Менделеева, её используют в [[w:Стехиометрия|стехиометрических расчётах]].
 
'''[[w:Моль (единица количества вещества)|Моль (единица количества вещества)]]'''
 
Так как массы даже самых тяжёлых атомов в обычных единицах (например, в граммах) очень малы, то в химии для измерения этих масс используют [[w:Моль|моли]].
 
<big>В одном моле любого вещества по определению содержится одно и тоже число атомов или иных частиц (молекул, ионов)— примерно 6,022×10<sup>23</sup>. Это число ([[w:|число Авогадро]]) выбрано таким образом, что если масса элемента равна 1 а.&nbsp;е.&nbsp;м., то моль атомов этого элемента будет иметь массу 1 г. Например, [[w:|углерод]] (точнее, изотоп углерод-12)имеет массу 12 а.&nbsp;е.&nbsp;м., поэтому 1 моль углерода весит 12 г.
 
Моль — одно из важнейших для химии понятий, и вот почему. Химические вещества вступают в [[w:Химическая реакция|химические реакции]]
в определенных соотношениях, которые определяются их формулами. Например, при реакции горения водорода образуется вода. При этом в конечном продукте (Н<sub>2</sub>О) на каждый атом кислорода приходится два атома водорода. Значит, если мы хотим, чтобы исходные вещества целиком израсходовались в ходе реакции (ни одно из них не оказалось в избытке), на каждые два атома водорода нужно взять один атом кислорода. Но как это сделать? Нужно взять 1 моль кислорода и 2 моля водорода (или 0,1 моль кислорода и 0,2 моля водорода — важно соотношение 1:2). А это можно сделать, зная молекулярную массу кислорода O<sub>2</sub>(32 Да) и водорода H<sub>2</sub>(2 Да). Молекулярную массу легко перевести в молярную массу.
 
'''Моля́рная ма́сса''' вещества — масса одного моль вещества. Для отдельных химических элементов молярной массой является масса одного моля отдельных атомов этого элемента. В этом случае молярная масса элемента, выраженная в г/моль, численно совпадает с массой атома элемента, выраженной в а.е.м. (атомная единица массы). Однако надо четко представлять разницу между молярной массой и [[w:молекулярная масса|молекулярной массой]], понимая, что они равны лишь численно и отличаются по размерности.
 
Молярные массы сложных молекул можно определить, суммируя молярные массы входящих в них элементов. Например, молярная масса воды (H<sub>2</sub>O) есть M<sub>H<sub>2</sub>O</sub> = 2 M<sub>H</sub> +M<sub>O</sub> = 2·1+16 = 18&nbsp;(г/моль).</big>
 
; Вопрос 1
: Так сколько же грамм кислорода и водорода нужно взять, чтобы получить 96 г воды и чтобы при горении ни одно вещество не оказалось в избытке?
 
'''[[w:|Радиоактивный распад]]'''
 
У каждого химического элемента есть один или более изотопов с нестабильными ядрами, которые подвержены [[w:Радиоактивный распад|радиоактивному распаду]], в результате чего атомы испускают частицы или электромагнитное излучение. Радиоактивность возникает, когда радиус ядра больше радиуса действия сильных взаимодействий (расстояний порядка 1 [[w:фемтометр|фм]].
 
Существуют три основные формы радиоактивного распада:
* [[w:|Альфа-распад]] происходит, когда ядро испускает альфа-частицу — ядро атома [[w:гелий|гелия]], состоящее из двух протонов и двух нейтронов. В результате испускания этой частицы возникает элемент с меньшим на два [[w:атомный номер|атомным номером]].
* [[w:|Бета-распад]] происходит из-за [[w:слабое взаимодействие|слабых взаимодействий]], и в результате нейтрон превращается в протон или наоборот. В первом случае происходит испускание электрона и [[w:|антинейтрино]], во втором — испускание [[w:|позитрона]] и [[w:|нейтрино]]. Электрон и позитрон называют бета-частицами. Бета-распад увеличивает или уменьшает атомный номер на единицу.
* [[w:|Гамма-излучение]] происходит из-за перехода ядра в состояние с более низкой энергией с испусканием электромагнитного излучения. Гамма-излучение может происходить вслед за испусканием альфа- или бета-частицы после радиоактивного распада.
 
Каждый радиоактивный изотоп характеризуется [[w:период полураспада|периодом полураспада]], то есть временем, за которое распадается половина ядер образца. Количество оставшихся ядер уменьшается экспоненциально — вдвое за каждый период полураспада. Например, по прошествии двух периодов полураспада в образце останется только 25 % ядер исходного изотопа.
 
Радиоактивный распад играет важную роль в жизни организмов и в современных методах их исследования. Во-первых. разные виды [[w:Ионизирующее излучение|ионизирующего излучения]] оказывают воздействие на все живые клетки, являются важным источником [[w:мутации|мутаций]] и других поверждений макромолекул. Во-вторых, метод [[w:меченые атомы|меченых атомов]] (радиоизотопный метод) широко использщуется для исследования биохимических и молекулярно-биологических процессов, происходящих в клетках. В-третьих, в медицине (в особенности в [[w:Онкология|онкологии]]) широко используются методы [[w:Радиотерапия|радиотерапии]]. Наконец, только с появлением радиоизотопного анализа появилась возможность определять абсолютный возраст горных пород, что играет важную роль в геологии и палеонтологии (см.[[http://geo.web.ru/db/msg.html?uri=part18-02.htm&mid=1163814]]).
 
=== [[w:Валентность|Валентность]] ===
 
<big>'''Валентность''' (от лат. valens — имеющий силу) — способность [[w:|атомов]] [[w:химический элемент|химических элементов]] образовывать [[w:химическая связь|химические связи]] с атомами других элементов. '''В свете строения атома валентность — это способность атомов отдавать или присоединять определенное число [[w:|электронов]].''' В соединениях, образованных при помощи [[w:ионная связь|ионных связей]], валентность атомов определяется числом присоединенных или отданных электронов. В соединениях с [[w:ковалентная связь|ковалентными связями]] валентность атомов определяется числом образовавшихся «общих» электронных пар.</big>
 
''Однако в настоящее время весьма затруднительно найти единую меру для характеристики способности атома к образованию химической связи. Существуют разные количественные характеристики способности атомов соединяться друг с другом: понятие валентности (ковалентности), понятие [[w:степень окисления|степени (состояния) окисления]] и понятие [[w:координационное число|координационного числа]].''
 
'''Валентности некоторых химических элементов'''
 
* [[w:|Водород]], [[w:|калий]], [[w:|натрий]], [[w:|хлор]], [[w:|фтор]] — I.
* [[w:|Кислород]], [[w:|кальций]], [[w:|магний]] — II
* [[w:|Алюминий]], [[w:|хром]] — III.
* [[w:|Углерод]] в [[w:органические соединения|органических соединениях]] — IV.
 
==== Валентные электроны и валентность ====
 
В химии '''валентными электронами''' называют [[w:Электрон|электроны]], находящиеся на внешней, или валентной, [[w:Электронная оболочка|оболочке]] [[w:Атом|атома]]. Валентные электроны определяют поведение [[w:Химический элемент|химического элемента]] в [[w:Химическая реакция|химических реакциях]]. Чем меньше валентных электронов имеет элемент, тем легче он отдаёт эти электроны (проявляет свойства [[w:восстановитель|восстановителя]]) в реакциях с другими элементами. И наоборот, чем больше валентных электронов содержится в атоме химического элемента, тем легче он приобретает электроны (проявляет свойства [[w:окислитель|окислителя]]) в химических реакциях при прочих равных условиях. Полностью заполненные внешние электронные оболочки имеют инертные газы, которые проявляют минимальную химическую активность. Периодичность заполнения электронами внешней электронной оболочки определяет периодическое изменение химических свойств элементов в таблице Менделеева.
 
Валентность элемента часто совпадает с числом валентных электронов (например, у [[w:щелочные металлы|щелочных металлов]] 1 валентный электрон, и валентность у них всегда I, у [[w:щелочноземельные металлы|щелочноземельных металлов]]) 2 валентных электрона, и валентность у них II) или с числом электронов, которых не хватает до заполнения внешнего уровня (например, у [[галогены|галогенов]] до заполнения внешнего уровня не хватает одного электрона, и валентность у них I).
 
У части элементов встречается переменная валентность — в зависимости от того, с какими элементами он вступает в соединения и какие молекулы при этом образуются. Так, [[w:|азот]] может иметь валентности I, II, III, IV и V (а [[w:|степени окисления]] — −3, −2, −1, +1, +2, +3, +4, +5).
 
Рассмотрение причин этого выходит за рамки данного учебника. Интересующиеся этой темой могут воспользоваться электронным учебником химиии [http://www.hemi.nsu.ru/ucheb135.htm]
 
=== [[w:Электроотрицательность|Электроотрицательность]] ===
 
<big>Электроотрицательность (χ) — фундаментальное химическое свойство атома, количественная характеристика способности атома в молекуле притягивать к себе общие электронные пары.</big>
 
''Современное понятие об электроотрицательности атомов было введено американским химиком [[w:Полинг, Лайнус|Л. Полингом]]. Л. Полинг использовал понятие электроотрицательности для объяснения того факта, что энергия гетероатомной связи A—B (A, B — символы любых химических элементов) в общем случае больше среднего геометрического значения гомоатомных связей A—A и B—B. В настоящее время для определения электроотрицательностей атомов существует много различных методов, результаты которых хорошо согласуются друг с другом, за исключением относительно небольших различий, и во всяком случае внутренне непротиворечивы.''
 
Первая и широко известная шкала относительных атомных электроотрицательностей Полинга охватывает значения от 0,7 для атомов цезия до 4,0 для атомов фтора. Фтор — наиболее электроотрицательный элемент, за ним следует кислород (3,5) и далее азот и хлор (3,0). Активные щелочные и щёлочноземельные металлы имеют наименьшие значения электроотрицательности, лежащие в интервале 0,7—1,2, а галогены — наибольшие значения, находящиеся в интервале 4,0—2,5. Электроотрицательность типичных неметаллов находится в середине общего интервала значений и, как правило, близка к 2 или немного больше 2. Электроотрицательность водорода принята равной 2,1. Для большинства переходных металлов значения электроотрицательности лежат в интервале 1,5—2,0. Близки к 2,0 значения электроотрицательностей тяжёлых элементов главных подгрупп. Существует также несколько других шкал электроотрицательности, в основу которых положены разные свойства веществ. Но относительное расположение элементов в них примерно одинаково.
 
=== Молекулы ===
 
<big>'''Моле́кула''' (новолатинское ''molecula'', уменьшительное от moles} — масса) — наименьшая частица вещества, несущая его химические свойства. Молекула состоит из двух или более [[w:атом|атомов]], характеризуется количеством входящих в неё [[w:Атомное ядро|атомных ядер]] и [[w:электрон|электронов]], а также определённой структурой.</big>
 
''Нередко (особенно в физике) говорят про одноатомные молекулы инертных газов или [[w:идеальный газ|идеального газа]].'' <big>Нужно иметь в виду, что далеко не все вещества состоят из молекул!</big>
 
 
Обычно подразумевается, что молекулы нейтральны (не несут электрических зарядов) и не несут неспаренных электронов (все валентности насыщены); заряженные молекулы называют [[w:ион|ионами]], молекулы с [[w:Мультиплетность|мультиплетностью]], отличной от единицы (то есть с неспаренными электронами и ненасыщенными [[w:Валентность|валентностями]]) — [[w:Свободные радикалы|радикалами]].
 
Молекулы, образованные сотнями или тысячами атомов, называются [[w:Макромолекула|макромолекулами]]. Особенности строения молекул определяют физические и химические свойства [[w:вещество|вещества]], состоящего из этих молекул.
 
Молекулы состоят из атомов, расположение которых в молекуле передаёт [[w:структурная формула|структурная формула]] (для передачи состава используется т. н. [[w:брутто-формула|брутто-формула]]).
 
'''[[w:Химическая формула|Химические формулы]]'''
 
'''Хими́ческая фо́рмула''' — отражение информации о составе и [[w:Структура|структуре]] [[w:Вещество|веществ]] с помощью [[w:Химические знаки|химических знаков]], чисел (индексов) и разделяющих знаков — скобок.
 
В настоящее время различают следующие виды химических формул:
 
 
 
* Простейшая формула. Может быть получена опытным путем через определение соотношения [[w:Химические элементы|химических элементов]] в веществе с применением значений [[w:Атомная масса|атомной массы]] элементов. Так, простейшая формула [[w:Вода|воды]] будет H<sub>2</sub>O, а простейшая формула [[w:Бензол|бензола]] СН. Атомы в формулах обозначаются знаками химических элементов, а относительное их количество — числами в формате нижних индексов.
 
* <big></big>Истинная формула. Может быть получена, если известна [[w:молекулярная масса|молекулярная масса]] вещества. Истинная формула воды Н<sub>2</sub>О, что совпадает с простейшей. Истинная формула бензола С<sub>6</sub>Н<sub>6</sub>, что отличается от простейшей. Истинные формулы также называют [[w:Брутто-формула|брутто-формулами]] или [[w:эмпирическая формула|эмпирическими]]. Они отражают состав, но не структуру молекул вещества.</big>
 
* Рациональная формула. В рациональных формулах выделяются группы атомов, характерные для классов химических соединений. Например, для спиртов выделяется группа -ОН. При записи рациональной формулы такие группы атомов заключаются в круглые скобки (ОН). Количество повторяющихся групп обозначаются числами в формате нижних индексов, которые ставятся сразу за закрывающей скобкой. Квадратные скобки применяются для отражения структуры [[Комплексные соединения|комплексных соединений]]. Например, К<sub>4</sub>[Co(CN)<sub>6</sub>] — гексацианокобальтоат калия. Рациональные формулы часто встречаются в полуразвернутом виде, когда часть одинаковых атомов показывается по отдельности для лучшего отражения строения молекулы вещества.
 
* [[Структурная формула]]. В графическом виде показывает взаимное расположение атомов в молекуле. [[Химическая связь|Химические связи]] между атомами обозначаются линиями. Различают двухмерные (2D) и трехмерные (3D) формулы. Двухмерные представляют собой отражение структуры вещества на плоскости. Трехмерные позволяют наиболее близко к теоретическим моделям строения вещества представлять его состав, взаимное расположение, связи и расстояния между атомами.
 
 
 
Пример: [[w:Этанол|Этанол]] (этиловый спирт):
* Простейшая формула С<sub>2</sub>Н<sub>6</sub>О
* Истинная, эмпирическая, или брутто-формула: С<sub>2</sub>Н<sub>6</sub>О
* Рациональная формула: С<sub>2</sub>Н<sub>5</sub>ОН
* Рациональная формула в полуразвернутом виде: СН<sub>3</sub>СН<sub>2</sub>ОН
 
==== [[w:Структурная формула|Структурная формула]] ====
 
<big>Структурная формула этанола (2D):
 
: [[Файл:Ethanol flat structure.png|100px|Flat structure of ethanol]]
 
Видя перед собой структурную формулу этанола, мы можем определить валентности входящих в его состав атомов. Число отходящих от атома линий (химических связей) — это и есть его валентность.</big>
 
''О других способах представления структурных формул см. [[w:en:Structural formula|Structural formula]]''
 
 
<big>Отнюдь не все химические вещества построены из молекул. Так, многие вещества имеют ионную (NaCl — поваренная соль), металлическую (Fe — железо) или атомную (С — углерод, например, алмаз или графит) кристаллическую решетку (см.[[http://www.alhimikov.net/elektronbuch/Page-11.html]]). Эти вещества не состоят из молекул!</big> (Есть и вещества с молекулярной кристаллической решеткой — например, иод (I<sub>2</sub>). В определенных условиях можно получить '''кристаллы [[w: белков|белков]] или ДНК''').
 
В итоге мы видим, что первоначальное определение (мельчайшая частица вещества, сохраняющая его (химические) свойства — весьма неточное. Отдельная молекула не имеет ни части химических, ни, тем более, физических свойств вещества, а некоторые вещества (естественно. имеющие химические свойства) «не имеют» молекул… Было предложено более точное определение: «Молекула — электронейтральная частица вещества, представляющая собой замкнутую совокупность конечного числа атомов, связанных между собой силами ковалентной связи и образующих определённую структуру.»
 
 
''Молекулы являются объектом изучения [[w:теория строения молекул|теории строения молекул]], [[w:квантовая химия|квантовой химии]], аппарат которых активно использует достижения [[w:квантовая физика|квантовой физики]], в том числе релятивистских её разделов. Также в настоящее время развивается такая область химии, как [[w:молекулярный дизайн|молекулярный дизайн]]. Для определения строения молекул конкретного вещества используются разные методы: [[w:электронная спектроскопия|электронная спектроскопия]], [[w:колебательная спектроскопия|колебательная спектроскопия]], [[w:ядерный магнитный резонанс|ядерный магнитный резонанс]] и [[w:электронный парамагнитный резонанс|электронный парамагнитный резонанс]] и многие другие. Однако единственными прямыми методами в настоящее время являются дифракционные методы: [[w:рентгеноструктурный анализ|рентгеноструктурный анализ]] и [[w:дифракция нейтронов|дифракция нейтронов]].
 
* [[http://www.xumuk.ru/biochem/14.html]] — Строение молекул (Наглядная биохимия)
* [http://www.femto.com.ua/articles/part_1/2328.html Статья ''«Молекула»'' в Физической энциклопедии]
 
=== [[w:Химическая реакция|Химические реакции]] ===
 
<big>Химическая реакция — превращение одного или нескольких исходных веществ (реагентов) в отличающиеся от них по химическому составу или строению вещества (продукты реакции). В отличие от ядерных реакций, при химических реакциях ядра атомов не меняются, в частности не изменяется их общее число и изотопный состав химических элементов.
 
Важнейшая особенность химических реакций состоит в том, что в ходе них '''атомы не появляются, не исчезают и не превращаются друг в друга.''' Это означает. что сколько атомов каждого из элементов было в начале реакции, столько же их останется в конце. На этом основано составление [[w: химическое уравнение|'''химических уравнений''']].
 
'''Порядок составления химического уравнения'''
 
''1. Определяем, какие вещества вступают (исходные) в реакцию и какие получаются в её результате (продукт реакции).''
* Например: простое вещество медь Cu при прокаливании в кислороде O<sub>2</sub> реагирует с ним, в результате чего получается оксид меди CuO — сложное вещество.
 
''2. Химическое уравнение состоит из двух частей.''
* В левой части пишут формулы исходных веществ (реагентов), в правой — полученные вещества (продукты реакции). Между исходными веществами и продуктами реакции ставят знак «превращения» (→). Если в левой или правой стороне по несколько веществ, между нами ставят плюс (+).
* Пример: Cu + O<sub>2</sub> (исходные вещества) → CuO (продукт реакции).
 
''3. Расставляем '''коэффициенты''' так, чтобы число атомов каждого элемента в обеих частях уравнения было одинаково (подбор коэффициентов; уравнивание).''
* Пример: 2Cu + O<sub>2</sub> → 2CuO
</big>
 
Некоторые химические реакции происходят при смешении или физическом контакте реагентов самопроизвольно. Другие реакции начинаются только при нагревании, участии катализаторов (катализ), действии света (фотохимические реакции), электрического тока (электродные процессы), ионизирующих излучений (радиационно-химические реакции), механического воздействия (механохимические реакции), в низкотемпературной плазме (плазмохимические реакции) и т. п. Самопроизвольное превращение веществ осуществляется при условии, что они обладают энергией, достаточной для преодоления потенциального барьера, разделяющего исходное и конечное состояния системы (см. [[w:Энергия активации|Энергия активации]]).
 
Все химические реакции сопровождаются тепловыми эффектами. При разрыве химических связей в реагентах выделяется энергия, которая, в основном, идет на образование новых химических связей. В некоторых реакциях энергии этих процессов близки, и в таком случае общий тепловой эффект реакции приближается к нулю. В остальных случаях можно выделить
 
* '''экзотермические реакции''', которые идут с выделением тепла, например, горение водорода и другие реакции горения, и
* '''эндотермические реакции''', в ходе которых тепло поглощается из окружающей среды.
 
''Тепловой эффект реакции ([[w: Энтальпия|энтальпию]] реакции, ΔH), часто имеющий очень важное значение, можно вычислить по [[w: Закон Гесса|закону Гесса]], если известны энтальпии образования реагентов и продуктов. Когда сумма энтальпий продуктов меньше суммы энтальпий реагентов (ΔrH < 0), наблюдается выделение тепла, в противном случае (ΔrH > 0) — поглощение [http://www.xumuk.ru/biochem/26.html].''
 
В живых клетках некоторые реакции протекают с поглощением энергии (эндергонические реакции), а некоторые — с выделением энергии (экзергонические). Реакции, идущие с поглощением энергии, не могут протекать самопроизвольно — они сопрягаются в клетках с экзергоническими реакциями (см.[[#Обмен веществ и превращения энергии в клетках|Обмен веществ и превращения энергии в клетках]]
 
См. также
* [[http://www.xumuk.ru/biochem/20.html]] Химические реакции (Наглядная биохимия)
* [[http://www.xumuk.ru/biochem/22.html]] Энергетика (Наглядная биохимия)
 
=== Типы химической связи ===
<big>'''Химическая связь''' — явление взаимодействия атомов, обусловленное перекрыванием электронных облаков связывающихся частиц, которое сопровождается уменьшением полной энергии системы.</big>
 
'''История'''
 
Термин «химическое строение» впервые ввёл [[w:Бутлеров, Александр Михайлович|А. М. Бутлеров]] в 1861 году. Также он заложил основы теории химического строения. Главные положения этой теории следующие:
 
# Атомы в молекулах соединены друг с другом в определенной последовательности. Изменение этой последовательности приводит к образованию нового вещества с новыми свойствами.
# Соединение атомов происходит в соответствии с [[w: валентность|валентностью]].
# Свойства веществ зависят не только от их состава, но и от «химического строения», то есть от порядка соединения атомов в молекулах и характера их взаимного влияния. Наиболее сильно влияют друг на друга атомы, непосредственно связанные между собой.
 
'''<big>Основные типы химической связи</big>''' —
* [[w:Ковалентная связь|Ковалентная связь]]
* [[w:Ионная связь|Ионная связь]]
* [[w:Водородная связь|Водородная связь]]
* [[w:Металлическая связь|Металлическая связь]]
 
<big>'''Ковалентной связью''' называется химическая связь, образующаяся за счёт обобществления атомами своих валентных электронов. Обязательным условием образования ковалентной связи является перекрывание атомных орбиталей (АО), на которых расположены валентные электроны. Различают две основные разновидности ковалентной связи:
* ''Ковалентная неполярная'' связь образуется между атомами неметалла одного и того же химического элемента. Такую связь имеют [[w:простые вещества|простые вещества]], например О<sub>2</sub>; N<sub>2</sub>; C<sub>12</sub>.
* ''Ковалентная полярная'' связь образуется между атомами различных неметаллов (например, она присутствует в молекулах CO, NH<sub>3</sub>, H<sub>2</sub>O).
В случае, например, с [[w:соляная кислота|HCl]] общая электронная плотность оказывается смещенной в сторону хлора, который обладает большей электроотрицательностью, в результате чего на атоме хлора возникает частичный отрицательный заряд, а на атоме водорода — частичный положительный.</big>
 
<small>В простейшем случае перекрывание двух АО приводит к образованию двух молекулярных орбиталей (МО): связывающей МО и антисвязывающей (разрыхляющей) МО. Обобществленные электроны располагаются на более низкой по энергии связывающей МО/</small>
 
<big>'''Ионная связь''' — прочная химическая связь, образующаяся между атомами с большой разностью [[w:электроотрицательность|электроотрицательностей]], при которой общая электронная пара полностью переходит к атому с большей электроотрицательностью. Ионная связь — крайний случай поляризации [[w:ковалентная связь|ковалентной полярной связи]]. Образуется между типичными [[w:металл|металлом]] и [[w:неметалл|неметаллом]].
 
Так как ионная связь образуется между атомами, которые имеют очень большую разность [[w:электроотрицательность|электроотрицательностей]] (разность ЭО > 1.7 по Полингу), то общая электронная пара полностью переходит к атому с большей ЭО. Результатом этого является образование соединения противоположно заряженных [[w:ион|ионов]]:
 
А• + •В = А<sup>+</sup> + [:В]<sup>-</sup>
ионы
 
Между образовавшимися [[w:ион|ионами]] возникает электростатическое притяжение, которое называется ионной связью. Примером может служить соединение CsF, в котором «степень ионности» составляет 97 %. </big>
 
[[Файл:Na%2BH2O.svg|thumb|right|Ион натрия, окруженный в растворе молекулами воды]]
 
<small>Ионная связь между атомами в чистом виде не реализуется нигде или почти нигде, обычно на деле связь носит частично ионный, а частично ковалентный характер. В то же время связь сложных молекулярных ионов часто может считаться чисто ионной. Важнейшие отличия ионной связи от других типов [[w:химическая связь|химической связи]] заключаются в ненаправленности и ненасыщаемости. Именно поэтому кристаллы, образованные за счёт ионной связи, тяготеют к различным плотнейшим упаковкам соответствующих ионов.</small>
 
Для соединений с ионной связью характерна хорошая растворимость в полярных растворителях (вода, кислоты и т. д.). Это происходит из-за заряженности ионов. При этом диполи растворителя притягиваются к заряженным ионам, и, в результате [[w:Броуновское движение|броуновского движения]], «растаскивают» кристаллическую решетку вещества вещества на ионы и окружают их, не давая соединиться вновь. В итоге получается раствор, в котором ионы окружены диполями растворителя.
 
==== [[w:Водородная связь|Водородная связь]] ====
 
<big>Атом водорода, соединенный с атомом сильно электроотрицательного элемента, способен к образованию еще одной химической связи с другим сильно электроотрицательным атомом. Эта связь называется водородной. Результатом таких взаимодействий являются комплексы '''RA-H•••BR''' различной степени стабильности, в которых атом водорода выступает в роли мостика, связывающего молекулы или их фрагменты '''RA''' и '''BR'''.</big>
 
В образовании водородной связи принимают участие атомы водорода -ОН, =NH и -SH-гpупп (доноров водородной связи) и атомы-акцепторы (например, О, N или S), имеющие свободную пару электронов.
 
Возникновение водородной связи можно в первом приближении объяснить действием электростатических сил. Атом с большой электроотрицательностью, например, фтор в молекуле HF смещает на себя электронное облако, приобретая значительный эффективный отрицательный заряд, а ядро атома водорода (протон) почти лишается электронного облака и приобретает эффективный положительный заряд. Между протоном атома водорода и отрицательно заряженным атомом фтора соседней молекулы возникает электростатическое притяжение, что и приводит к образованию водородной связи.
 
<big>Энергия водородной связи составляет 10-40 кДж/моль, что значительно (в 10-40 раз) меньше энергии обычной ковалентной связи. </big> Однако этой энергии достаточно, чтобы вызвать ассоциацию молекул, то есть их объединение в димеры или полимеры. Именно ассоциация молекул служит причиной аномально высоких температур плавления и кипения таких веществ, как фтороводород, вода, аммиак.
 
Водородная связь в значительной мере определяет свойства и таких биологически важных веществ, как белки и нуклеиновые кислоты. Часто в макромолекулах образуются многочисленные внутримолекулярные водородные связи, которые определяют, например, [[#Вторичная структура белка|вторичную структуру белков]].
 
'''Интересные факты'''
 
Именно водородные связи в значительной степени определяют высокую упорядоченность строения и чрезвычайно высокую прочность [[w:кевлар|кевлара]].
 
* В. В. Москва. Водородная связь в органической химии. Соросовский образовательный журнал, 11999,N 2, с.58-64 [http://www.pereplet.ru/nauka/Soros/pdf/9902_058.pdf]
 
=== [[w:Ионы|Ионы]]. [[w:Кислоты|Кислоты]] и [[w:Щелочи|основания]] ===
<big>'''Ио́н''' ({{lang-el|ιόν}} — «идущий») — одноатомная или многоатомная электрически [[w:заряженная частица|заряженная частица]], образующаяся в результате потери или присоединения одного или нескольких электронов атомами или молекулами. [[w:Заряд|Заряд]] иона кратен заряду электрона. </big>
 
Понятие и термин ион ввёл в 1834 г [[w:Фарадей, Майкл|Майкл Фарадей]], который, изучая действие [[w:электрический ток|электрического тока]] на водные [[w:раствор|растворы]] [[w:кислота|кислот]], [[w:щёлочи|щелочей]] и [[w:соли|солей]], предположил, что [[w:электропроводность|электропроводность]] таких растворов обусловлена движением ионов.
 
Положительно заряженные ионы, движущиеся в растворе к отрицательному полюсу ([[w:катод|катоду]]), Фарадей назвал [[w:катион|катионами]], а отрицательно заряженные, движущиеся к положительному полюсу ([[w:анод|аноду]]) — [[w:анион|анионами]].
 
''В виде самостоятельных частиц они встречаются во всех агрегатных состояниях вещества — в [[w:газ|газах]] (в частности, в [[w:Атмосфера Земли|атмосфере]]), в [[w:жидкость|жидкостях]] (в [[w:расплавы|расплавах]] и [[w:раствор|растворах]]), в [[w:кристалл|кристаллах]] и в [[w:плазма|плазме]].''
 
Являясь химически активными частицами, ионы вступают в реакции с атомами, молекулами и между собой. <big>В растворах ионы образуются в результате [[w:электролитическая диссоциация|электролитической диссоциации]]</big> и обусловливают свойства [[w:электролит|электролитов]].
 
'''[[w:Цвиттер-ион|Цвиттер-ион]]''' (''биполярный ион'') (от {{lang-de|Zwitter}} — гибрид, гермафродит) — молекула, которая, являясь в целом электронейтральной, в своей структуре имеет части, несущие как отрицательный, так и положительный заряды, локализованные на разных атомах. Цвиттер-ионы относятся к полярным веществам и, как правило, обладают хорошей растворимостью в воде и слабой — в большинстве органических растворителей. Многие органические молекулы (например, аминокислоты и белки) представляют собой цвиттер-ионы.
 
<big>Существует 3 теории кислот и оснований — их создали [[w:Аррениус, Сванте Август|Сванте Аррениус]], [[w:Брёнстед, Йоханнес Николаус|Й. Н. Брёнстед]] и [[w:Льюис, Гилберт Ньютон|Г. Н. Льюис]].</big>
 
'''Теория Аррениуса'''
 
Согласно теории Аррениуса, [[w:кислоты|кислоты]]- это вещества, при [[w:электролитическая диссоциация|электролитической диссоциации]] в водном растворе образующие катионы водорода Н<sup>+</sup> и анионы кислотного остатка.
[[w:Основания|Основания]] — это вещества, в водном растворе подвергающиеся [[w:электролитическая диссоциация|электролитической диссоциации]] с образованием катионов металла и гидроксид-анионов ОН<sup>-</sup> Эту теорию обычно проходят в школе на уроках химии, хотя она сильно устарела. Для нас такое определение кислоты и основания не подходит хотя бы потому, что многие органические вещества являются основаниями (имеют щелочные свойства), хотя и не содержат никаких катионов металлов.
 
<big>''' Теория Бренстеда'''
 
Согласно теории Бренстеда, [[w:кислота|кислота]] — это соединение, способное отдавать основанию катионы водорода Н<sup>+</sup> (является донором Н<sup>+</sup>).
[[w:Основания|Основания]] — это соединения, способные принимать у кислоты катионы водорода Н<sup>+</sup> (является акцептором Н<sup>+</sup>).
Таким образом, в этой теории одно и то же вещество в зависимости от взаимодействия может быть и кислотой, и основанием.
Например, вода при взаимодействии с протоном
 
H<sub>2</sub>O + H<sup>+</sup> = H<sub>3</sub>О<sup>+</sup>
 
является основанием, а реагируя с аммиаком
 
NH<sub>3</sub> + H<sub>2</sub>O = NH<sub>4</sub><sup>+</sup> + OH<sup>-</sup>,
 
является кислотой.
 
Эта теория также отчасти устарела, но для целей данного учебника её вполне можно принять. Итак,
 
* '''кислота — вещество, способное в водных растворах отдавать протоны,'''
* ''' основание — вещество, способное в водных растворах принимать (присоединять) протоны.'''</big>
 
'''Теория кислот и оснований Льюиса'''
 
В теории Льюиса было еще более расширено понятие кислоты и основания.
Кислота — это молекула, имеющая вакантные электронные орбитали, вследствие чего она способна принимать электронные пары, например BF<sub>3</sub>, AlCl<sub>3</sub>.
Основание — это молекула, способная быть донором электронных пар. Например, основания Льюиса — все анионы, [[w:аммиак|аммиак]] и [[w:амины|амины]], [[w:вода|вода]], [[w:спирты|спирты]], [[w:галогены|галогены]]. Именно эта теория лежит в основе современных представлений о свойствах веществ и ходе химических реакций.
 
=== [[w:Водородный показатель|Водородный показатель (рН)]] среды показывает концентрацию в ней протонов ===
 
''Водоро́дный показа́тель''', ''pH'' (произносится «пэ аш»), — это мера [[w:активность (химия)|активности]] (в случае разбавленных растворов отражает [[w:концентрация|концентрацию]]) ионов водорода в растворе, количественно выражающая его кислотность. рН вычисляется как отрицательный (взятый с обратным знаком) десятичный [[w:логарифм|логарифм]] активности водородных ионов, выраженной в [[w:моль|молях]] на литр:
 
: <math>\mbox{pH} = -\lg \left[ \mbox{H}^+ \right]\!</math>
 
В чистой воде при 25 °C молярные [[w:концентрация растворов|концентрации]] ионов водорода (<nowiki>[</nowiki>H<sup>+</sup><nowiki>]</nowiki>) и [[w:гидроксид-ион|гидроксид-ионов]] (<nowiki>[</nowiki>OH<sup>-</sup><nowiki>]</nowiki>) одинаковы и составляют 10<sup>−7</sup> моль/л, это напрямую следует из определения [[w:ионное произведение воды|ионного произведения воды]], которое равно <nowiki>[</nowiki>H<sup>+</sup><nowiki>]</nowiki>&nbsp;·&nbsp;<nowiki>[</nowiki>OH<sup>-</sup><nowiki>]</nowiki> и составляет 10<sup>−14</sup> моль²/л² (при 25 °C).
 
Когда концентрации обоих видов ионов в растворе одинаковы, говорят, что раствор имеет '''нейтральную''' реакцию. При добавлении к воде [[w:кислота|кислоты]] концентрация ионов водорода увеличивается, а концентрация гидроксид-ионов соответственно уменьшается, при добавлении [[w:основание|основания]] — наоборот, повышается содержание гидроксид-ионов, а концентрация ионов водорода падает. Когда <nowiki>[</nowiki>H<sup>+</sup><nowiki>]</nowiki>&nbsp;>&nbsp;<nowiki>[</nowiki>OH<sup>-</sup><nowiki>]</nowiki> говорят, что раствор является '''кислым''', а при <nowiki>[</nowiki>OH<sup>-</sup><nowiki>]</nowiki>&nbsp;>&nbsp;<nowiki>[</nowiki>H<sup>+</sup><nowiki>]</nowiki> — '''щелочным'''.
 
Для удобства представления, чтобы избавиться от отрицательного показателя степени, вместо концентраций ионов водорода пользуются их десятичным логарифмом, взятым с обратным знаком, который собственно и является водородным показателем — pH.
 
: <math>\mbox{pH} = -\lg \left[ \mbox{H}^+ \right]\!</math>
 
<big>Итак, рН — показатель концентрации ионов водорода (протонов) в растворе. При рН = 7 среда считается нейтральной. При этом концентрация протонов равна 10<sup>−7</sup> моль/л. Если рН < 7, то среда кислая. Например, рН желудочного сока — примерно 1,5-2. При рН = 2 концентрация ионов водорода — 10 <sup>−2</sup> моль/л, то есть в 10.000 раз больше, чем при рН = 7. Кислотность кишечного сока — около 8-8,5. При рН = 8 концентрация протонов — 10<sup>−8</sup> моль/л. Итак, концентрация ионов водорода в желудке и кишечнике отличается в 100.000 раз.
 
Водородный показатель pH широко используется для характеристики кислотно-основных свойств различных биологических сред.
 
Вопрос 1. А какова концентрация протонов при рН 8,5? при рН 8,7? Как её вычислить?
 
Вопрос 2. Объем клетки бактерии — около 2 мкм³, рН цитоплазмы — 7. Сколько протонов содержится в этой клетке?</big>
 
=== Кислотность среды влияет на многие химические и биологические процессы ===
 
[[w:Кислотность среды|Кислотность среды]] имеет важное значение для множества химических процессов. Возможность протекания или результат той или иной реакции часто зависит от pH среды. Для поддержания определённого значения pH в реакционной системе при проведении лабораторных исследований или на производстве применяют [[w:буферные растворы|буферные растворы]]. Они позволяют сохранять практически постоянное значение pH при разбавлении или при добавлении в раствор небольших количеств кислоты или щёлочи.
 
pH среды имеет особое значение для биохимических реакций. Концентрация в растворе ионов водорода часто влияет на свойства и биологическую активность [[w:белки|белков]] и [[w:нуклеиновые кислоты|нуклеиновых кислот]]. Поэтому для нормальной работы организма поддержание постоянных значений рН в клетках и внеклеточных жидкостях (например, в крови) — задача исключительной важности. Цитоплазма, плазма крови и другие жидкости организма обладают [[w:буферные растворы|буферными свойствами]]; это помогает поддерживать рН на более постоянном уровне.
 
Кислотность в разных частях тела человека сильно различается. Самая высокая кислотность в полости желудка; там при выделении желудочного сока рН в норме около 1-1,5.
[http://www.xumuk.ru/biologhim/255.html] Буферные системы крови
 
=== Химический состав живого: химические элементы ===
 
Элементный состав тела человека
 
{|class="wikitable"
|-
!Элемент
!Массовая доля.%
|-
|[[w:Кислород|Кислород]]
|65
|-
|[[w:Углерод|Углерод]]
|18
|-
|[[w:Водород|Водород]]
|10
|-
|[[w:Азот|Азот]]
|3
|-
|[[w:Кальций|Кальций]]
|1.5
|-
|[[w:Фосфор|Фосфор]]
|1.2
|-
|[[w:Калий|Калий]]
|0.2
|-
|[[w:Сера|Сера]]
|0.2
|-
|[[w:Хлор|Хлор]]
|0.2
|-
|[[w:Натрий|Натрий]]
|0.1
|-
|[[w:Магний|Магний]]
|0.05
|-
|[[w:Железо|Железо]]
|3.8[[w:грамм|г]] у мужчин, 2.3 г у женщин
|-
|[[w:Кобальт|Кобальт]], [[w:Медь|Медь]], [[w:Цинк|Цинк]], [[w:Иод|Иод]]
|<&nbsp;0.05 каждый
|-
|[[w:Селен|Селен]], [[w:Фтор|Фтор]]
|<&nbsp;0.01 каждый
|-
|}
 
[[w:en:Chemical makeup of the human body|Chemical makeup of the human body]] — Химический состав тела человека (англ.)
 
=== Химический состав живого: молекулы ===
 
==== [[w:Вода|Вода]] — основное вещество живых клеток ====
[[Файл:Water-2D-labelled.png|right|250px|Структурная формула молекулы воды]]
[[Файл:3D model hydrogen bonds in water.jpg|right|thumb|Модель водородных связей между молекулами воды]]
 
Вода в активных клетках составляет обычно 75-85 % по массе. Воды меньше в клетках жировой ткани (около 40 %), ещё меньше может быть в клетках покоящихся стадий (в семенах растений 5-15 % воды). Как в клетке, так и в целом в биосфере Земли вода выполняет важнейшие функции, связанные с ее уникальными свойствами. Свойства эти, в свою очередь, зависят от строения молекул воды.
 
==== [[w:Молекула|Молекула]] воды сильно полярна ====
<big>Молекула воды состоит из одного атома кислорода и присоединенных к нему двух атомов водорода. Связь между ними — [[w:ковалентная связь|ковалентная полярная]]. Электронная плотность сильно смещена в сторону кислорода, так как он имеет высокую [[w:электроотрицательность|электроотрицательность]]. Так как химические связи расположены в молекуле воды под углом, на одном полюсе (к которому ближе атомы водорода) сосредотачивается частичный положительный заряд, на другом (там, где находится атом кислорода) — частичный отрицательный заряд. Таким образом, молекула воды представляет собой электрический [[w:диполь|диполь]].</big>
 
==== В воде присутствуют межмолекулярные водородные связи ====
Между молекулами воды образуются [[w:водородная связь|водородные связи]], причём каждая молекула воды может образовать такие связи, в первом приближении, с четырьмя «соседними».
 
<small>В жидкой воде молекулы хаотически движутся, и «соседство» это непостоянное; подробнее о структуре жидкой воды см. [http://elementy.ru/news/430353]. </small>
 
[[Файл:cryst struct ice.png|thumb|250px|Кристаллическая структура льда I<sub>h</sub>. Пунктирные линии — водородные связи]]
 
Во льду каждая молекула образует связи ровно с четырьмя соседними. Тем не менее, обычный природный [[w:лёд|лёд]] имеет гексагональную
кристаллическую решётку, причём молекулы в ней упакованы менее плотно, чем в жидкой воде.
 
==== Водородные связи определяют уникальные свойства воды ====
 
У воды очень высокие [[w:Температура|температуры]] [[w:Кипение|кипения]], [[w:Плавление|плавления]] и [[w:Парообразование|парообразования]], так как нужно затратить дополнительную энергию на разрыв водородных связей. Только вода в обычных земных условиях находится во всех трех агрегатных состояниях одновременно. Другие вещества со сходным строением и молекулярной массой, такие как [[w:H2S|H<sub>2</sub>S]], [[w:HCl|HCl]], [[w:NH3|NH<sub>3</sub>]] при обычных условиях являются [[w:Газ|газами]].
 
==== По их отношению к воде все вещества делятся на [[w:Гидрофильность|гидрофильные]] и [[w:Гидрофобность|гидрофобные]] ====
[[Файл:Dew 2.jpg|thumb|Капелька [[w:роса|росы]] на гидрофобной поверхности [[w:лист|листа]]]]
<big>Все вещества по отношению их к воде в первом приближении делятся на '''гидрофильные'' и ''гидрофобные'''. Гидрофильные («любящие воду») вещества обычно имеют полярные молекулы (или кристаллические решетки с ионными связями).</big>
 
<big>Многие гидрофильные вещества хорошо растворяются в воде (а если это жидкости — то смешиваются с ней в любых соотношениях).</big> К гидрофильным веществам можно отнести поваренную соль NaCl, аммиак NH<sub>3</sub>, спирт C<sub>2</sub>H<sub>5</sub>OH.
 
<big>Но многие гидрофильные вещества нерастворимы. Тогда их поверхность хорошо смачивается водой.</big> К таким веществам относится, например, шерсть (состоящая из белка [[w:кератин|кератина]]), бумага (состоящая из [[w:целлюлоза|целлюлозы]]) и др.
 
<big>Гидрофобные («боящиеся воды») вещества плохо растворяются в воде, не смачиваются ею (а если это жидкости — то не смешиваются с ней).</big>
 
; Вопрос 1
: Почему вещества с полярными молекулами и ионной кристаллической решеткой гидрофильны, а вещества с неполярными молекулами гидрофобны?
; Вопрос 2
: Почему некоторые гидрофильные вещества растворимы в воде, а другие — нет?
 
<small>Гидрофильность и гидрофобность — частный случай [[w:лиофильность и лиофобность|лиофильности и лиофобности]]. Кроме гидрофильности, можно говорить про [[w:липофильность|липофильность]] (олеофильность) и др.</small>
 
'''Задача 1 '''
 
Мениск — поверхность воды, налитой, например. в пробирку. Какую форму — вогнутую или выпуклую — будет иметь мениск, если налить воду в пробирку из гидрофильного материала? гидрофобного материала? Объясните, почему.
 
{{Задача|1 к разделу "Вода" (ответ)|[[w:Мениск (физика)|Мениск]] — искривлённая свободная поверхность жидкости в месте её соприкосновения с поверхностью твёрдого тела. В пробирке из гидрофильного материала мениск будет вогнутым, а из гидрофобного - выпуклым. В первом случае взаимное притяжение молекул жидкости ([[w:Когезия (физика)|когезия]]) слабее их притяжения молекулами поверхности твёрдого тела ([[w:Адгезия|адгезии]]). Во втором, наоборот, силы когезии преобладают над силами адгезии. [[Image:Reading the meniscus.png|thumb|300px|'''A:''' Вогнутый мениск.<br>'''B:''' Выпуклый мениск.]]}}
 
==== Некоторые органические вещества [[w:амфифильность|амфифильны]] ====
[[Файл:Soapfunction1.jpg|thumb|right|Схема строения молекулы мыла и механизма его моющего действия. Гидрофобные части молекул мыла погружены в загрязняющее вещество (например, жир), гидрофильные — взаимодействуют с водой. В результате загрязнитель превращается в [[w:эмульсия|эмульсию]] и смывается.]]
'''Амфифильность''' — свойство молекул, одна часть которых [[w:гидрофильность|гидрофильна]], а другая [[w:гидрофобность|гидрофобна]]. К амфифильным веществам относятся [[w:фосфолипиды|фосфолипиды]], [[w:жирные кислоты|жирные кислоты]] и их соли (например, [[w:мыло|мыло]]), а также [[w:липопротеиды|липопротеиды]] и др.. [[w:Белки|Белки]] также обладают амфифильными свойствами, так как обычно в их состав входят [[w:аминокислота|аминокислоты]] с гидрофильными и с гидрофобными радикалами.
 
За счет амфифильных свойств фосфолипидов при взаимодействии с водой они формируют [[w:мицеллы|мицеллы]], [[w:липосома|липосомы]] и липидные бислои (см. [[#Взаимодействие фосфолипидов с водой|Взаимодействие фосфолипидов с водой]])..
 
Амфифильность белков влияет на образуемые ими третичные и четвертичные структуры молекул, а также позволяет молекулам мембранных белков встраиваться в клеточные мембраны.
 
==== Вода — полярный растворитель ====
Вода хорошо растворяет полярные, или '''[[w:Гидрофильность|гидрофильные]]''' [[w:Вещество|вещества]] — например, [[w:Растворимость|растворимые]] [[w:соли|соли]], [[w:аминокислоты|аминокислоты]], [[w:Углеводы|сахара]]. Молекулы воды окружают [[w:Ион|ионы]] или молекулы вещества, отделяя тем самым частицы друг от друга. Следовательно, в [[w:Раствор|растворе]] молекулы (или ионы) смогут двигаться более свободно, а значит, быстрее будут протекать [[w:химическая реакция|химические реакции]].
[[w:Гидрофобность|Гидрофобные]] вещества не будут растворяться в воде, зато молекулы H<sub>2</sub>O, притягиваясь друг к другу, смогут отделить гидрофобное вещество от самой толщи воды. Например, [[w:фосфолипиды|фосфолипиды]], из которых состоит [[w:клеточная мембрана|клеточная мембрана]], могут благодаря взаимодействию с водой формировать [[w:Клеточная мембрана|липидный бислой]].
 
==== Вода выполняет [[w:Роль воды в клетке|разнообразные функции]] в клетке и в организме ====
''' Вода — полярный растворитель (см.выше)'''
 
''' Вода — реагент'''
 
Вода в качестве реагента участвует во многих химических реакциях:
* В ходе [[w:Фотосинтез|фотосинтеза]] у [[w:Растения|растений]] происходит фотолиз воды — водород из состава воды входит в органические вещества, а свободный кислород выделяется в атмосферу.
Уравнение фотосинтеза:
 
6[[w:Вода|H<sub>2</sub>O]]+6[[w:Диоксид углерода|CO<sub>2</sub>]]=[[w:Глюкоза|C<sub>6</sub>H<sub>12</sub>O<sub>6</sub>]]+ 6[[w:кислород|O<sub>2</sub>]]
 
* Вода участвует в [[w:Гидролиз|гидролизе]] — разрушении веществ с присоединением воды. Например, гидролиз жиров, белков и углеводов происходит при переваривании пищи, а при гидролизе АТФ выделяется энергия, обеспечивающая нужда клетки.
* При гидролизе солей вода является источником протонов и электронов.
 
''' Вода поддерживает форму клеток'''
 
Вода практически несжимаема (в жидком состоянии), и поэтому служит [[w:гидроскелет|гидростатическим скелетом]] клетки. За счет [[w:Осмос|осмоса]] вода создает избыточное [[w:давление|давление]] внутри [[w:Вакуоль|вакуолей]] растительных клеток. это [[w:тургорное давление|тургорное давление]] обеспечивает упругость клеточной стенки и поддержание формы органов (например, листьев).
 
'''Вода обеспечивает транспорт веществ у растений и животных'''
 
* У растений, благодаря, в частности, [[w:Капиллярность|капиллярному эффекту]], осуществляется всасывание из почвы раствора минеральных солей и их подъем от [[w:Корень|корня]] к другим частям растения по [[w:сосуды (ботаника)|сосудам]]. Транспорт продуктов [[w:Фотосинтез|фотосинтеза]] происходит посредством перемещения по [[w:Флоэма|ситовидным трубкам]] водного раствора [[w:Сахароза|сахарозы]].
* Вода обеспечивает транспорт питательных веществ и выведение из организма в растворенном виде продуктов обмена веществ у [[w:Животные|животных]] (вода — основной компонент [[w:Плазма крови|плазмы крови]] и [[w:Лимфа|лимфы]]), а также играет важную роль в работе [[w:Выделительная система| выделительной системы]].
 
 
''' Вода участвует в терморегуляции '''
 
Вследствие своей большой [[w:Теплоемкость|теплоемкости]] — 4200 Дж/(кг x К) — вода обеспечивает примерное постоянство температуры внутри [[w:Клетка|клетки]]. Вода может переносить большое количество [[w:Теплота|теплоты]], отдавая ее там, где температура тканей ниже, и забирая там, где температура более высокая. Также при испарении воды происходит значительное охлаждение из-за того, что много энергии тратится на разрыв водородных связей при переходе из [[w:жидкость|жидкого]] состояния в [[w:газ|газообразное]]. Испарение жидкости — единственный способ, который позволяет теплокровным поддерживать постоянную температуру, когда температура окружающей среды становится выше температуры тела.
 
 
Полезные книги и статьи по теме:
* [http://www.litmir.net/bd/?b=189857] М. А. Констаниновский. Почему вода мокрая. (По этой ссылке можно скачать книгу в формате djvu). Простым и понятным языком описываются основные свойства воды.
* [http://n-t.ru/ri/kl/vz.htm]Вода знакомая и загадочная. Леонид Кульский, Воля Даль, Людмила Ленчина
(наряду с полезными сведениями книга содержит изложение непроверенных и неподтвержденных гипотез об «активированной» воде!)
* [http://www1.lsbu.ac.uk/water/index2.html]Water Structure and Science (англ.) — достаточно сложная научная книга о воде
* [[w:en:Hydrophobe|Hydrophobe]] — Статья о гидрофобности и '''сверхгидрофобности''' из англоязычной Википедии
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/propertiesofwater/water.html] Анимация "Свойства воды " (англ. текст)
 
==== Неорганические вещества. Функции ионов ====
[[w:Калий|Калий]] — один из главных '''биогенных элементов''', необходимых для роста растений. При его недостатке в почве резко падает урожайность, поэтому главное использование калия человеком — производство минеральных удобрений. В организме калий находится в виде катионов в основном в цитоплазме (у животных его концентрация в цитоплазме примерно в 40 раз выше, чем в крови), у растений также в клеточном соке вакуолей.
 
[[w:Кальций|Кальций]] — распространенный [[w:Биологически значимые элементы|макроэлемент]] в организме растений, животных и человека. В организме человека и других позвоночных большая его часть содержится в скелете и зубах в виде фосфатов. Из различных форм карбоната кальция (извести) состоят скелеты большинства групп беспозвоночных (губки, коралловые полипы, моллюски и др.). Ионы кальция участвуют в процессах [[w:Свёртывание крови|свёртывания крови]], а также в обеспечении постоянного [[w:осмос|осмотического давления]] крови. Ионы кальция также служат одним из универсальных [[w:вторичные посредники|вторичных посредников]] и регулируют самые разные внутриклеточные процессы — [[w:мышечное сокращение|мышечное сокращение]], [[w:экзоцитоз|экзоцитоз]], в том числе секрецию [[w:гормон|гормонов]] и [[w:нейромедиатор|нейромедиаторов]] и др. Концентрация ионов кальция в цитоплазме клеток человека составляет около 10<sup>−7</sup> моль, в межклеточных жидкостях около 10<sup>−3</sup> моль.
 
[[w:Фосфор|Фосфор]], как и кальций, в организме позвоночных в наибольшем количестве содержится в составе минеральных солей скелетных тканей. Скелет позвоночных состоит в основном из гидроксиапатита (его эмпирическая формула — Ca<sub>5</sub>(PO<sub>4</sub>)<sub>3</sub>(OH))
 
Внутриклеточная и внеклеточные концентрации некоторых ионов (внутриклеточные концентрации указаны для мышечной клетки теплокровного животного), ммоль/л
 
{| class="wikitable"
|-
! Ион
! Внутриклеточная концентрация
! Внеклеточная концентрация
|-
| Na<sup>+</sup>
| 12
| 145
|-
| K<sup>+</sup>
| 155
| 4
|-
| Cl<sup>-</sup>
| 4
| 110
|-
| HCO<sub>3</sub> <sup>-</sup>
| 8
| 27
|-
| Ca<sup>2+</sup>
| 10<sup>−4</sup>
| 2
|-
| Фосфат-ионы
| 2
| 2
|-
| Анионы органических соединений
| 155
| -
|}
 
[http://www.pereplet.ru/nauka/Soros/pdf/9602_028.pdf] И. С. Кулаев
Неорганические полифосфаты и их роль на разных этапах клеточной эволюции. Сросовский образовательный журнал, 1006, N 2, с.28-35
 
==== [[w:Органические вещества|Органические вещества]] ====
'''Органические вещества''', '''органические соединения''' — класс [[w:Химическое соединение|соединений]], в состав которых входит [[w:углерод|углерод]] (за исключением [[w:карбиды|карбидов]], [[w:карбонаты|карбонатов]], [[w:оксиды|оксидов]] углерода и [[w:цианид|цианидов]]).
 
Название '''органические соединения''' появилось на ранней стадии развития [[w:История химии|химии]] во время господства [[w:Витализм|виталистических воззрений]]. [[w:Вещество|Вещества]] при этом разделялись на минеральные — принадлежащие царству [[w:минерал|минералов]], и органические — принадлежащие царствам животных и растений. Считалось, что для синтеза органических веществ необходима особая «жизненная сила», присущая только живому, и поэтому синтез органических веществ из неорганических невозможен. Это представление было опровергнуто [[w:Вёлер, Фридрих|Фридрихом Вёлером]] в 1824 году путём синтеза «органической» [[w:Мочевина|мочевины]] из «минерального» цианата аммония, однако деление веществ на органические и неорганические сохранилось в химической терминологии и по сей день.
 
Количество известных органических соединений давно перевалило за 10 млн. Таким образом, органические соединения — самый обширный класс веществ. Многообразие органических соединений связано с уникальным свойством углерода образовывать цепочки из атомов углерода, что в свою очередь обусловлено высокой стабильностью (то есть [[w:энергия связи|энергией]]) [[w:углерод-углеродная связь|углерод-углеродной связи]]. Связь углерод-углерод может быть как одинарной, так и кратной — двойной или тройной. При увеличении кратности углерод-углеродной связи возрастает её энергия, то есть стабильность, а длина уменьшается. Высокая валентность углерода — 4, а также возможность образовывать [[w:кратность связи|кратные связи]] позволяет атомам углерода, содединяясь в молекулы, образовывать структуры различной размерности (линейные, плоские, объёмные).
 
Различная топология образования связей между атомами, образующими органические соединения (прежде всего, атомами углерода), приводит к появлению изомеров — соединений, имеющих один и тот же состав и молекулярную массу, но обладающих разной структурой и потому различными физико-химическими свойствами. Данное явление носит название [[w:изомерия|изомерии]].
 
Большинство органических веществ горючи, а при нагревании обугливаются.
 
=== Основные классы органических соединений клеток ===
Основными классами органических соединений клетки считают [[w:белки|белки]], [[w:нуклеиновые кислоты|нуклеиновые кислоты]], [[w:липиды|липиды]] и [[w:углеводы|углеводы]]. На долю этих групп веществ приходится более 25 % массы клетки и наибольшее разнообразие типов молекул. При этом такие малые молекулы, как [[w:аминокислоты|аминокислоты]] (и их предшественники), [[w:нуклеотиды|нуклеотиды]] и их предшественники, а также [[w:моносахардиы|моносахардиы]] и их предшественники (часть углеводов) и жирные кислоты и их предшественники (часть липидов), то есть малые молекулы, в сумме составляют не более 3 % массы клетки, хотя они тоже довольно разнообразны (см. таблицу).
 
Разнообразие органических веществ бактериальной клетки (по Альбертс и др.)
 
{| class="wikitable"
|-
! Вещество или класс веществ
! % от массы клетки
! Число типов молекул
|-
| Вода
| 70
| 1
|-
| Неорганические ионы
| 1
| 20
|-
| Моносахариды и их предшественники
| 1
| 250
|-
| Аминокислоты и их предшественники
| 0,4
| 100
|-
| Нуклеотиды и их предшественники
| 0,4
| 100
|-
| Жирные кислоты и их предшественники
| 1
| 250
|-
| Другие малые органические молкулы
| 0,2
| 300
|-
| Макромолекулы (белки, нуклеиновые кислоты, полисахариды)
| 26
| 3000
|}
 
=== [[w:Липиды|Липиды]], их функции ===
Липиды — группа органических соединений, хорошо растворимых в неполярных органических растворителях ([[w:бензол|бензол]], [[w:ацетон|ацетон]], [[w:хлороформ|хлороформ]]) и практически нерастворимых в воде.
 
C точки зрения современной органической химии это определение является неточным. Во-первых, такое определение вместо четкой характеристики класса химических соединений говорит лишь о физических свойствах. Во-вторых, в настоящее время известно достаточное количество соединений, нерастворимых в неполярных растворителях или же, наоборот, хорошо растворимых в воде, которые, тем не менее, относят к липидам. В современной органической химии определение термина «липиды» основано на биосинтетическом родстве данных соединений — к липидам относят жирные кислоты и их производные [http://bio.fizteh.ru/student/files/biology/bioarticles/f_2ai2]. В то же время в биохимии и других разделах биологии к липидам по-прежнему принято относить и [[w:гидрофобность|гидрофобные]] или [[w:амфифильность|амфифильные]] вещества другой химической природы [http://yanko.lib.ru/books/biolog/nagl_biochem/index.htm]. Мы будем придерживаться «биохимического» определения.
 
==== Нейтральные [[w:жиры|жиры]] ====
[[Файл:Tripalmitoylglycerol.png|250px|right|thumb|Триглицериды. Зелёным цветом выделен остов [[w:глицерин|глицерина]], чёрным на белом фоне — часть молекулы жирных кислот (на рисунке — это [[w:радикал|радикалы]] [[w:Пальмитиновая кислота|пальмитиновой кислоты]]).]]
 
'''Жиры''', или '''триглицериды''' — природные [[w:Органические вещества|органические соединения]], полные [[w:сложные эфиры|сложные эфиры]] [[w:глицерин|глицерина]] и одноосновных [[w:жирные кислоты|жирных кислот]].
 
Наряду с [[w:углеводы|углеводами]] и [[w:белки|белками]], жиры — один из главных компонентов [[w:клетка (биология)|клеток]] животных, растений и микроорганизмов.
 
Жидкие жиры растительного происхождения обычно называют [[w:растительные масла|маслами]] [http://www.oval.ru/enc/92000.html].
 
Состав жиров отвечает общей формуле:
CH<sub>2</sub>-O-C(O)-R¹
|
CH-О-C(O)-R<sup>2</sup>
|
CH<sub>2</sub>-O-C(O)-R³,
 
где R¹, R<sup>2</sup> и R³ — радикалы (иногда — различных) жирных кислот.
 
Как правило, в состав масел входят преимущественно ненасыщенные жирные кислоты (имеющие одну или несколько двойных связей между атомами углерода), а в состав твердых жиров — насыщенные. В составе природных жиров и масел преобладают жирные кислоты с 16-18 атомами углерода в цепи.
 
'''Функции жиров'''
* Запасающая
Главная функция жиров в животном (и отчасти — растительном) мире — запасающая. При полном [[w:окисление|окислении]] 1 г жира (до углекислого газа и воды) выделяется около 9 ккал энергии. (1 ккал = 1000 кал; [[w:калория|калория]] (кал, cal) — внесистемная единица количества [[w:Механическая работа|работы]] и [[w:энергия|энергии]], равная количеству теплоты, необходимому для нагревания 1 мл [[w:вода|воды]] на 1&nbsp;°C при [[w:атмосфера (единица измерения)|стандартном атмосферном давлении]] 101,325 к[[w:Паскаль (единица измерения)|Па]]; 1 ккал = 4,19 [[w:Джоуль (единица измерения)|кДж]]). При окислении (в организме) 1 г белков или углеводов выделяется только около 4 ккал/г.
 
; Вопрос 1
: Почему практически все животные используют жир в качестве основного запасного вещества практически во всех клетках и тканях, кроме яйцеклеток, а растения, как правило, запасают крахмал и только в семенах многие из них используют жиры? Подумайте, с чем связаны исключения; это поможет вам ответить на основной вопрос.
 
При окислении жира выделяется так называемая «метаболическая» вода, так что запасы жира отчасти служат и запасами воды.
 
* Уменьшение [[w:плотность|плотности]]
У самых разных водных организмов — от одноклеточных диатомовых водорослей до гигантских акул — жир служит «поплавком», уменьшая среднюю [[w:плотность|плотность]] тела. Плотность животных жиров составляет около 0,91-0,95 г/см³. Плотность костной ткани позвоночных близка к 1,7-1.8 г/см³, а средняя плотность большинства других тканей близка к 1 г/см³.
Понятно, что жира нужно довольно много, чтобы «уравновесить» тяжелый скелет.
 
; Вопрос 2
: Плотность воздуха примерно в 600 раз меньше плотности воды, и некоторые организмы используют воздушные пузыри как поплавки (например, у многих рыб есть плавательный пузырь). В чём состоят возможные преимущества жирового «поплавка» по сравнению с воздушным?
 
* Теплоизоляция (у теплокровных)
 
Часто жир служит теплоизоляцией для теплокровных животных. Особенно это важно для таких животных, как киты или тюлени, много времени проводящих в холодной воде. У них подкожный слой жира особенно толстый.
 
; Вопрос 3
: Почему тюлени имеют более толстый слой подкожного жира, чем, например, волк или белый медведь? Ведь они бывают активны при температуре ниже −30<sup>о</sup>С, а температура воды, в которой живут тюлени, всегда выше 0<sup>о</sup>С.
 
; Вопрос 4
: У некоторых животных жир запасается не под кожей, а в определенных органах (на определенных участках тела). Что это за животные? Как эта особенность связана с их образом жизни?
 
* Механическая защита
Толстый подкожный слой жира — довольно надежная защита внутренних органов от механических повреждений при ударах.
 
==== Фосфолипиды ====
 
[[Файл:Phosphatidylcholine.png|thumb|'''Фосфатидилхолин'''― один из самых распространенных фосфолипидов клеточных мембран]]
 
[[w:Фосфолипиды|Фосфолипиды]] похожи на нейтральные жиры тем, что в их состав тоже входят остатки глицерина и жирных кислот. Но фосфолипиды отличаются от нейтральных жиров тем, что в состав фосфолипидов входят только два остатка жирной кислоты. Третья [[w:эфир|эфирная связь]] образуется между глицерином и остатком фосфорной кислоты (фосфатом), к которому присоединена группа атомов, разная у различных фосфолипидов (радикал), содержащая обычно положительно заряженный атом азота (см.рис.).
 
Эта часть молекулы фосфолипидов («голова») гидрофильна, а состоящие из жирных кислот «хвосты» гидрофобны. Таким образом, фосфолипиды — типичные [[w:амфифильность|амфифильные]] вещества (см. [[#Взаимодействие фосфолипидов с водой|Взаимодействие фосфолипидов с водой]]).
 
==== Другие группы липидов ====
 
=== [[w:Углеводы|Углеводы]], их функции ===
'''Углево́ды''' — общее название обширного класса природных органических соединений. Название происходит от слов «уголь» и «вода». Причиной этого является то, что первые из известных науке углеводов описывались брутто-формулой C<sub>x</sub>(H<sub>2</sub>O)<sub>y</sub>, формально являясь соединениями [[w:углерод|углерода]] и [[w:вода|воды]].
 
В животных клетках углеводы составляют не более 5 % сухой массы, а в некоторых растительных(например, клубни картофеля) их содержание достигает 90 % сухой массы.
 
По способности к [[w:гидролиз|гидролизу]] на [[w:мономеры|мономеры]] углеводы делятся на две группы: простые ([[w:моносахариды|моносахариды]]) и сложные ([[w:олигосахариды|олигосахариды]] и [[w:полисахариды|полисахариды]]). Сложные углеводы, в отличие от простых, способны гидролизоваться с образованием простых углеводов, мономеров.
 
Биологическое значение углеводов:
 
# Углеводы выполняют [[w:структура|структурную функцию]], то есть участвуют в построении различных клеточных структур (например, [[w:клеточная стенка|клеточных стенок]] растений.
# Углеводы выполняют защитную роль у растений (клеточные стенки, состоящие из клеточных стенок мертвых клеток защитные образования — шипы, колючки и др.).
# Углеводы выполняют [[w:пластический обмен|пластическую функцию]] — хранятся в виде запаса питательных веществ, а также входят в состав сложных молекул (например, [[w:пентозы|пентозы]] ([[w:рибоза|рибоза]] и [[w:дезоксирибоза|дезоксирибоза]]) участвуют в построении [[w:АТФ|АТФ]], [[w:ДНК|ДНК]] и [[w:РНК|РНК]].
# Углеводы являются основным [[w:энергия|энергетическим]] материалом. При окислении 1 [[w:грамм|грамма]] углеводов выделяются 4,1 ккал энергии и 0,4 г [[w:вода|воды]].
# Углеводы участвуют в обеспечении осмотического давления и осморегуляции. Так, в [[w:кровь|крови]] содержится 100—110 мг/% глюкозы. От концентрации [[w:глюкоза|глюкозы]] зависит [[w:осмотическое давление|осмотическое давление]] крови.
# Углеводы выполняют рецепторную функцию — многие олигосахариды входят в состав воспринимающей части [[w:клеточный рецептор|клеточных рецепторов]] или молекул-[[w:лиганд|лигандов]].
 
 
В суточном рационе человека и животных преобладают углеводы. [[w:травоядные|Травоядные]] получают [[w:крахмал|крахмал]], [[w:клетчатка|клетчатку]], [[w:сахароза|сахарозу]]. [[w:Хищные|Хищники]] получают [[w:гликоген|гликоген]] с мясом.
 
Организмы животных не способны синтезировать углеводы из неорганических веществ. Они получают их от растений с пищей и используют в качестве главного источника энергии, получаемой в процессе окисления.
 
==== Моносахариды ====
Моносахариды хорошо растворяются в воде. Многие из них синтезируются в клетках растений.
[[Файл:Alpha-D-Glucopyranose.svg|thumb|α-глюкоза]]
Моносахариды [[w:рибоза|рибоза]] и дезоксирибоза входят в состав нуклеиновых кислот. [[w:Глюкоза|Глюкоза]] С<sub>6</sub>Н<sub>12</sub>О<sub>6</sub> присутствует в клетках всех организмов и является одним из источников энергии для животных. У человека глюкоза переносится кровью и опглощается клетками с помощью нескольких белков-транспортеров. Поглощение глюкозы клетками регулирует гормон [[w:инсулин|инсулин]].
 
==== Дисахариды ====
'''[[w:|Дисахариды]]''' — это общее название подкласса олигосахаридов. Молекула дисахарида состоит из двух молекул моносахаридов, которые соединены [[w:гликозидная связь|гликозидной связью]]. Дисахариды образуются в результате реакции [[w:конденсация(химия)|конденсации]] между двумя моносахаридами, обычно [[w:гексоза|гексозами]]. При реакции конденсации происходит удаление воды. После соединения моносахаридных единиц их называют остатками.
Наиболее распространенные дисахариды — это [[w:лактоза|лактоза]] и [[w:сахароза|сахароза]]. Также к дисахаридам относится [[w:мальтоза|мальтоза]].
 
==== Олигосахариды ====
[[Файл:ABO blood group diagram.svg|thumb|right|Структура олигосахаридов H-антигена, отвечающего за группы крови системы АВО]]
 
'''[[w:Олигосахариды|Олигосахариды]]''' — это [[w:олигомеры|олигомеры]], состоящие из нескольких (обычно от 3 до 10, не более 20) [[w:мономеры|мономеров]] — [[w:моносахариды|моносахаридов]], связанных между собой [[w:гликозидная связь|гликозидной связью]]. В отличие от них [[w:полисахариды|полисахариды]] состоят из десятков, сотен или тысяч моносахаридов. [[w:Дисахариды|Дисахариды]] иногда считают частным случаем олигосахаридов.
 
Многие олигосахариды соединены либо с белками (тогда образуются [[w:гликопротеины|гликопротеины]]), либо с липидами (образуются [[w:гликолипиды|гликолипиды]]).
 
Олигосахариды часто служат «метками» при внутриклеточном транспорте белков. Эти «метки», опознаваемые белками-рецепторами, позволяют доставить белок внутри мембранного пузырька в нужный [[w:компартмент|компартмент]] клетки.
 
Специфические олигосахариды (входящие в состав гликопротеидов) на поверхности [[w:эритроцит|эритроцитов]] определяю группу крови человека.
 
Многие рецепторы [[w:плазмалемма|плазмалеммы]] — это гликопротеиды, в состав которых входят специфичные олигосахариды. Видимо, они участвуют в «опознавании» и связывании сигнальных молекул.
 
Заякоренные на мембране олигосахариды образуют [[w:гликокаликс|гликокаликс]] — слой на наружной поверхности животных клеток. Толщина этого слоя от 15 до 150 нм. В хорошо развитом гликокаликсе на поверхности [[w:энтероцит|энтероцитов]] содержатся пищеварительные ферменты и происходит один их этапов [[w:пристеночное пищеварение|пристеночного пищеварения]].
 
==== Наиболее распространенные [[w:Полисахариды|полисахариды]] — целлюлоза, крахмал и гликоген ====
 
'''Полисахари́ды''' — общее название класса сложных высокомолекулярных [[w:углеводы|углеводов]], [[w:молекула|молекулы]] которых состоят из десятков, сотен или тысяч [[w:мономер|мономеров]] — [[w:моносахарид|моносахаридов]].
Важнейшие (для человека, а возможно, и для всей биосферы) полисахариды — [[w:целлюлоза|целлюлоза]], [[w:крахмал|крахмал]] и [[w:гликоген|гликоген]].
 
[[Файл:Cellulose-Ibeta-from-xtal-2002-3D-balls.png|thumb|right|Схема строения молекулы целлюлозы. Атомы углерода показаны чёрным, кислорода — красным, водорода — белым.]]
 
==== Целлюлоза — основной компонент клеточных стенок растений и главная пища травоядных животных ====
'''[[w:Целлюлоза|Целлюлоза]]''' — гомополимер. Её молекула состоит из остатков молекул [[w:глюкоза|глюкозы]], которая образуется при [[w:гидролиз|кислотном гидролизе]] целлюлозы (под действием сильных кислот при высокой температуре):
 
<center>(C<sub>6</sub>H<sub>10</sub>O<sub>5</sub>)<sub>n</sub> + nH<sub>2</sub>O -> nC<sub>6</sub>H<sub>12</sub>O<sub>6</sub></center>
 
Целлюлоза — линейный полимер. Молекулы целлюлозы представляют собой длинные нити, содержащие 300-10.000 остатков глюкозы, без боковых ответвлений. Эти нити соединены между собой множеством [[w:Водородная связь|водородных связей]], что придает целлюлозе большую механическую прочность. Водородные связи соединяют молекулы целлюлозы в волокна — фибриллы.
 
Целлюлоза нерастворима в воде, но очень [[w:Гидрофильность|гидрофильна]].
 
Целлюлоза — один из главных компонентов клеточных стенок растений.
 
Считается, что в составе биомассы целлюлозы больше, чем любого другого вещества. В растительной биомассе целлюлозы около трети, в древесине — 50 %, в хлопковой вате — около 90 %.
 
Её разновидности (или похожие на неё вещества)содержатся в клеточных стенках многих [[w:протисты|протистов]] и некоторых [[w:бактерии|бактерий]]. Покровы [[w:Асцидии|асцидий]] пропитаны похожим на целлюлозу веществом туницином; видимо, это единственный случай синтеза целлюлозы животными.
 
Целлюлозой питаются многочисленные организмы — бактерии, грибы, протисты и животные. Целлюлоза — главный источник питательных веществ для большинства травоядных животных. У [[w:Млекопитающие|млекопитающих]] (как и у большинства других животных) нет [[w:Ферменты|ферментов]], способных расщеплять целлюлозу. Однако многие травоядные животные (например, жвачные) имеют в пищеварительном тракте бактерий-симбионтов, которые расщепляют и помогают хозяевам усваивать этот полисахарид.
 
==== Крахмал — основное запасное вещество растений и главная пища для человека ====
[[Файл:Amylose2.svg|thumb|right|Структура амилозы]]
[[Файл:Amylopektin Sessel.svg|thumb|right|Структура амилопектина]]
'''[[w:Крахмал|Крахмал]]''', как и целлюлоза, состоит из остатков глюкозы. Это — смесь двух полисахаридов, [[w:амилоза|амилозы]] и [[w:амилопектин|амилопектина]]. Обычно в крахмале 20-25 % амилозы и 75-80 % амилопектина.
 
Амилоза — длинные линейные цепочки остатков глюкозы, соединенных 1,4-связью (связь между первых и четвертым атомами углерода). Как правило, в молекуле амилозы от 300 до 3.000 остатков глюкозы. В воде амилоза хорошо растворяется. Именно амилоза дает синее окрашивание с раствором иода.
 
Амилопектин представляет собой разветвленные цепочки. В точках ветвления, отстоящих в среднем на 25-30 остатков глюкозы, имеются не только 1,4-, но и 1,6-связи. Молекула амилопектина содержит от 2.000 до 200.000 остатков глюкозы. С раствором иода амилопектин даёт красноватое окрашивание.
 
==== Гликоген используется для запасания энергии в клетках животных ====
[[w:Гликоген|Гликоген]] по строению очень похож на амилопектин. Он отличается только большей разветвленностью молекулы (точки ветвления отстоят в среднем на 8-12 остатков). В клетках животных и грибов гликоген накапливается как запасное питательное вещество, которое легко превратить в глюкозу. У человека гликоген запасается в печени (до 8 % сырой массы) и скелетных мышцах (1-2 % сырой массы).
 
=== Нуклеиновые кислоты, их функции ===
 
==== ДНК — носитель наследственной информации ====
<big>'''[[w:Дезоксирибонуклеиновая кислота|Дезоксирибонуклеи́новая кислота́]]''' ('''ДНК''') — один из двух типов [[w:нуклеиновая кислота|нуклеиновых кислот]], обеспечивающих хранение, передачу из поколения в поколение и реализацию [[w:генетическая информация|генетической информации]]. Основная роль ДНК в клетках — долговременное хранение и передача из поколения в поколение [[w:информация|информации]] о структуре [[w:РНК|РНК]] и [[w:белки|белков]].</big>
 
В клетках [[w:эукариоты|эукариот]] ДНК находится в [[w:клеточное ядро|ядре клетки]] в составе [[w:хромосома|хромосом]], а также в некоторых клеточных органоидах ([[w:|митохондриях]] и [[w:пластида]]х). В клетках [[w:прокариоты|прокариот]] кольцевая (за редкими исключениями) молекула ДНК, так называемый генофор, входит в состав [[w:нуклеоид|нуклеоида]].
 
''У прокариот и у низших эукариот (например, у [[w:дрожжи|дрожжей]]) встречаются также небольшие автономные, преимущественно кольцевые молекулы ДНК, называемые [[w:плазмиды|плазмидами]]. В клетках молекулы ДНК всегда двухцепочечные, то есть состоят из двух цепей [[w:нуклеотиды|нуклеотидов]]. Кроме того, одно- или двухцепочечные молекулы ДНК могут образовывать [[w:|геном]] ДНК-содержащих [[w:|вирусов]].''
 
 
 
[[Файл:Nucleotides.RU.1.svg|thumb|450 px| Строение нуклеотидов]]
[[Файл:Ribose structure 2.png|thumb| Структура рибозы, показана нумерация атомов углерода (обратите внимание, что в состав нулеотидов ДНК входит дезоксирибоза).]]
 
ДНК — это длинная [[w:|полимерная]] молекула, состоящая из повторяющихся блоков, [[w:нуклеотид|нуклеотидов]]. Каждый нуклеотид состоит из [[w:азотистые основания|азотистого основания]], сахара ([[w:дезоксирибоза|дезоксирибозы]]) и [[w:ортофосфорная кислота|фосфатной группы]] (остатка фосфорной кислоты). Связи между нуклеотидами в одной цепи [[w:ковалентная связь|ковалентные]], они образуются за счёт дезоксирибозы и фосфатной группы. Говорят, что за счет ковалентных связей образуется «сахарофосфатный остов» молекулы.
 
В подавляющем большинстве случаев макромолекула ДНК состоит из двух цепей, ориентированных азотистыми основаниями друг к другу; только некоторые вирусы содержат одноцепочечную ДНК.
 
'''Размер генома широко варьирует среди различных организмов'''
 
ДНК — это длинная [[w:|полимерная]] молекула, состоящая из четырех типов мономеров, [[w:нуклеотид|нуклеотидов]][http://yanko.lib.ru/books/biolog/nagl_biochem/86.htm].
 
Но что значит «длинная»? Длина ДНК из митохондрий человека — около 16.000 п.н. (пар нуклеотидов). Характерный размер ДНК вируса — около 100.000 п.н., бактерий — от 500.000 до 5.000.000 п.н. (это — размер одной молекулы ДНК). В [[w:Геном человека|геноме человека]] около 3.000.000.000 п.н., распределенных по 23 хромосомам. Это значит, что средняя длина молекулы ДНК из ядра человеческой клетки — более 100.000.000 п.н.!</big>
 
Длина всех молекул ДНК двойного набора хромосом в одной клетке человека равна примерно 2 м. Тело взрослого человека состоит примерно из 5·10<sup>13</sup>13 — 10·10<sup>13</sup> клеток. Расчеты показывают, что общая длина молекул ДНК всех клеток одного человека около 10<sup>11</sup> км, что примерно в тысячу раз больше расстояния от Земли до Солнца.
 
 
'''Образование связей между основаниями'''
 
Между азотистыми основаниями двух разных цепей образуются [[w:водородная связь|водородные связи]], которые удерживают вместе две цепи. Эта двухцепочечная молекула спирализована. В целом структура молекулы ДНК получила название «двойной спирали».
 
[[Файл:A-DNA, B-DNA and Z-DNA.png|thumb|right|290px|В зависимости от концентрации ионов и нуклеотидного состава молекулы, двойная спираль ДНК в живых организмах существует в разных формах. На рисунке (слева направо) представлены A, B и Z формы. Модель Уотсона и Крика предсказала существование наиболее распространенной В-формы]]
 
В ДНК встречается четыре вида азотистых оснований: [[w:|аденин]], [[w:|гуанин]], [[w:|тимин]] и [[w:|цитозин]]. Азотистые основания одной из цепей соединены с азотистыми основаниями другой цепи [[w:водородная связь|водородными связями]] согласно [[w:Комплементарность|принципу комплементарности]]: аденин соединяется только с тимином, гуанин — только с цитозином. </big>
 
Биологический закон, в соответствии с которым установлены количественные соотношения между азотистыми основаниями разных типов, назван правилом Чаргаффа в честь ученого биохимика Эрвина Чаргаффа, под руководством которого были обнаружены закономерности в соотношении нуклеотидов.
Для того, чтобы определить точные количественные соотношения нуклеотидов, Чаргафф разделил нуклеотиды ДНК методом [[Бумажная хроматография|бумажной хроматографии]]. Ему удалось выявить три закономерности:
* Число аденинов равно числу тиминов, а число гуанинов — числу цитозинов: А=Т, Г=Ц
* Число пуринов равно числу пиримидинов: А+Г=Т+Ц
* Число аденина и цитозина равно числу гуанина и тимина: А+Ц=Г+Т
 
Соотношение комплементарных нуклеотидов может быть различным у разных ДНК. В одних ДНК могут преобладать пары аденин-тимин, а в других — гуанин-цитозин.
На основе правила Чаргаффа можно сделать вывод, что состав нуклеотидов в разных ДНК отличается лишь суммарным числом комплементарных оснований.
 
 
[[Файл:DNA chemical structure.svg|thumb|Cтроение двойной цепи ДНК]]
 
Каждое основание на одной из цепей связывается с одним определённым основанием на второй цепи. Такое специфическое связывание называется [[w:комплементарность|комплементарным]]. [[w:|Пурины]] (основания, которые состоят из двух колец и имеют более крупные размеры — аденин и гуанин) комплементарны [[w:|пиримидинам]] (тимину и цитозину, которые состоят из одного кольца и меньше по размерам): аденин образует связи только с тимином, а цитозин — с гуанином. Благодаря этому каждая пара оснований имеет «стандартные» размеры, а вся спираль ДНК сохраняет одинаковый диаметр и регулярную структуру.
 
''В двойной спирали цепочки также связаны с помощью [[w:гидрофобная связь|гидрофобных связей]] и [[w:стэкинг|стэкинга]], которые не зависят от последовательности оснований ДНК.''
 
 
 
<big>Последовательность нуклеотидов позволяет «кодировать» информацию и составляет [[w:Генетический код|генетический код]]. Прежде всего в ДНК закодирована информация о различных типах [[w:РНК|РНК]]. Для реализации наследственной информации наиболее важны информационные, или матричные ([[w:мРНК|мРНК]]), рибосомные ([[w:рРНК|рРНК]]) и транспортные ([[w:тРНК|тРНК]]). На информационную РНК «переписывается» содержащаяся в ДНК информация о последовательности [[w:Аминокислоты|аминокислот]] в белках.</big>
 
Все эти типы РНК синтезируются на матрице ДНК за счёт копирования последовательности ДНК в последовательность РНК, синтезируемой в процессе [[w:транскрипция (биология)|транскрипции]] и принимают участие в биосинтезе белков (процессе [[w:трансляция (биология)|трансляции]]).
 
В одной цепи ДНК последовательность нуклеотидов (порядок их чередования) может быть любым. Поэтому молекулы ДНК практически бесконечно разнообразны. Разные виды живых организмов и разные особи одного вида различаются, в частности, порядком расположения нуклеотидов в ДНК. Комплементарность двойной спирали означает, что информация, содержащаяся в одной цепи, содержится и в другой цепи (порядок нуклеотидов одной цепи однозначно задает порядок расположения нуклеотидов в противоположной, комплементарной цепи). Такое «дублирование» информации очень важно для удвоения ДНК, [[w:репарация ДНК|репарации (исправления повреждений в ДНК)]] и всех остальных функций ДНК в живых организмах.
 
 
''Помимо кодирующих последовательностей, ДНК клеток содержит последовательности, выполняющие регуляторные и структурные функции. Кроме того, в геноме эукариот часто встречаются участки, принадлежащие «генетическим паразитам», например, [[w:|транспозонам]].''
 
<big></big>Так как водородные связи слабые, они легко разрываются и восстанавливаются. Цепочки двойной спирали могут расходиться как замок-молния под действием ферментов — [[w:хеликазы|хеликаз]]. Разрыв водородных связей необходим для процессов [[w:Репликация ДНК|удвоения ДНК]].</big>
 
Разные пары оснований образуют разное количество водородных связей. Аденин и тимин связаны двумя, а гуанин и цитозин — тремя водородными связями, поэтому на разрыв ГЦ-пары требуется больше энергии, чем на разрыв АТ-пары.
 
''Две цепи одной спирали ДНК также расходятся (диссоциируют) при высокой температуре. Процент ГЦ-пар и длина молекулы ДНК определяют количество энергии, необходимой для разделения цепей: длинные молекулы ДНК с большим содержанием ГЦ более тугоплавки.''
 
''Части молекул ДНК, которые из-за их функций должны быть легко разделяемы, например ТАТА последовательность в бактериальных [[w:Промотор (молекулярная генетика)|промоторах]], обычно содержат большое количество А и Т.''
 
Расшифровка структуры ДНК (1953 г.) стала одним из поворотных моментов в истории биологии. За выдающийся вклад в это открытие [[w:Фрэнсис Крик|Фрэнсису Крику]], [[w:Джеймс Уотсон|Джеймсу Уотсону]], [[w:Морис Уилкинс|Морису Уилкинсу]] была присуждена [[w:Нобелевская премия по физиологии и медицине|Нобелевская премия по физиологии и медицине]] 1962 г.
 
==== Разные типы молекул [[w:РНК|РНК]] выполняют различные функции в клетке ====
'''Рибонуклеи́новые кисло́ты''' ('''РНК''') — [[w:Нуклеиновая кислота|нуклеиновые кислоты]], [[w:полимер|полимеры]] [[w:нуклеотид|нуклеотидов]], в состав которых входят остаток [[w:ортофосфорная кислота|ортофосфорной кислоты]], [[w:рибоза|рибоза]] (в отличие от [[w:ДНК|ДНК]], содержащей [[w:дезоксирибоза|дезоксирибозу]]) и азотистые основания — [[w:аденин|аденин]], [[w:цитозин|цитозин]], [[w:гуанин|гуанин]] и [[w:урацил|урацил]] (в отличие от [[w:ДНК|ДНК]], содержащей вместо урацила [[w:тимин|тимин]]). Эти молекулы содержатся в клетках всех живых [[w:организм|организмов]], а также в некоторых [[w:Вирус (биология)|вирусах]].
 
В клетках эукариот, как выяснилось за последние десятилетия, есть множество разных типов молекул РНК, многие из которых никогда не покидают ядра (мяРНК, малые ядерные РНК). Функции многих из них не известны. Другие малые РНК (например, siРНК) участвуют в процессе [[w:РНК-интерференция|РНК-интерференции]].
 
Главную роль в процессе синтеза белка играют три типа РНК:
 
* [[w:информационная РНК|информационная РНК]], или иРНК (сейчас её всё чаще называют мРНК — от англ. messenger RNA, хотя по-русски «м» чаще расшифровывают как «матричная»);
* [[w:транспортная РНК|транспортная РНК]], или тРНК;
* [[w:рибосомальная РНК|рибосомальная РНК]], или рРНК.
 
Все эти молекулы РНК, как и другие типы РНК, синтезируются на матрице [[w:ДНК|ДНК]] и закодированы в специальных [[w:генах|генах]]. Гены, которые кодируют иРНК, кодируют также и белки, поскольку иРНК содержит информацию о последовательности аминокислот в одном или нескольких белках. Гены, которые кодируют другие типы РНК, не кодируют белков. Поэтому с современных позиций правильнее определять ген как участок ДНК, кодирующий одну молекулу РНК (а не белок).
 
=== Белки, их функции ===
 
<blockquote>
<small>-Без белка жить можно,- сказал я,- а вот как он живет без потрохов? <br />
-А вот товарищ Амперян говорит, что без белка жить нельзя,- сказал Витька, заставляя струю табачного дыма сворачиваться в смерч и
ходить по комнате, огибая предметы. <br />
-Я говорю, что жизнь- это белок,- возразил Эдик. <br />
-Не ощущаю разницы,- сказал Витька.- Ты говоришь, что если нет белка, то нет и жизни. <br />
'''А. и Б. Стругацкие «Понедельник начинается в субботу»'''</small>
</blockquote>
 
==== Мономеры белков — [[w:аминокислоты|аминокислоты]]. Разнообразие и химические свойства аминокислот ====
[[Файл:AminoAcidball.svg|thumb|240px|Структура аминокислоты с аминогруппой слева и карбоксильной группой справа. R — радикал (группа атомов, различная у разных аминокислот)]]
 
<big>Для синтеза [[w:белки|белков]] используются '''двадцать стандартных аминокислот''': именно они закодированы в ДНК [[w:триплет|триплетами]] [[w:генетический код|генетического кода]].</big> Примечательно, что живые организмы используют в основном [[w:Энантиомеры|L-аминокислоты]].
 
''У некоторых организмов триплеты могут кодировать и «неканонические», нестандартные аминокислоты (например, [[w:селеноцистеин|селеноцистеин]]). Некоторые аминокислоты могут (обычно при участии ферментов) химически модифицироваться после синтеза белков, так что в составе «зрелых» белков обнаруживается более 20 разновидностей аминокислот.''
 
Аминокислоты обычно присутствуют в растворах в виде [[w:цвиттер-ионы|цвиттер-ионов]] и являются амфолитами. ''Амфолитами'' называют молекулы, в структуре которых присутствуют как кислотные, так и основные группы, существующие в виде цвиттер-ионов при определённых значениях pH. Этот pH обозначается как [[w:изоэлектрическая точка|изоэлектрическая точка]] молекулы.
 
''Амфолиты образуют ''[[w:буферный раствор|буферные растворы]]''. Благодаря способности к выборочной ионизации они противодействуют изменению pH при добавлении кислоты или основания. В присутствии кислот они принимают на себя протоны, удаляя последние из раствора, и противодействуют повышению его кислотности. При добавлении оснований амфолиты высвобождают ионы водорода в раствор, препятствуя возрастанию pH, и тем сохраняя его равновесие.''
 
[http://yanko.lib.ru/books/biolog/nagl_biochem/64.htm] Физическиe и химичeскиe cвойства аминокислот
 
==== Функции аминокислот разнообразны ====
Аминокислоты играют важнейшую роль в обмене веществ.
 
Кроме того, что аминокислоты служат мономерами для синтеза белков, они входят в состав некоторых небелковых веществ — [[w:муреин|муреина]], некоторых [[w:антибиотики|антибиотиков]] и др. [[w:Глицин|Глицин]] и [[w:глутаминовая кислота|глутаминовая кислота]] — важные [[w:нейромедиатор|нейромедиаторы]].
 
==== Выделяют несколько уровней укладки белковых молекул ====
Выделяют четыре основных уровня укладки белковых молекул (уровни структуры белка):
 
* '''Первичная структура''' — последовательность аминокислот в полипептидной цепи.
* '''Вторичная структура''' — локальное упорядочивание фрагментов полипептидной цепи, стабилизированное [[w:Водородная связь|водородными связями]] и [[w:гидрофобность|гидрофобными взаимодействиями]].
* '''Третичная структура''' — пространственное строение полипептидной цепи; взаимное расположение элементов вторичной структуры, стабилизированное различными типами связей.
* '''Четверичная структура''' — взаимное расположение нескольких полипептидных цепей в составе единого белкового комплекса.
[[Файл:Protein-structure ru.jpg|thumb|left|200px|Уровни структуры белков: 1 — первичная, 2 — вторичная, 3 — третичная, 4 — четвертичная]]
 
==== Первичная структура белка — последовательность аминокислот, соединенных пептидными связями ====
[[Файл:Amino-veresterung.jpg|thumb|1000px|Схематическое изображение образования пептидной связи (справа). Подобная реакция происходит в молекулярной машине по образованию белка — [[w:рибосома|рибосоме]]]]
 
<big>Молекулы белков представляют собой [[w:полимер|полимеры]], состоящие из [[w:мономер|мономеров]] — [[w:аминокислоты|α-L-аминокислот]] и, в некоторых случаях, из модифицированных аминокислот. По своей структуре белки — линейные нерегулярные гетерополимеры. Это означает, что полипептидные цепочки из аминокислот обычно не ветвятся и не образуют колец, в их состав входят разные мономеры, и они могут чередоваться в различной последовательности.
 
При образовании белка в результате взаимодействия α-аминогруппы (-NH<sub>2</sub>) одной аминокислоты с α-карбоксильной группой (-СООН) другой аминокислоты образуются [[w:пептидная связь|пептидные связи]]. Концы белка называют С- и N-концом (в зависимости от того, какая из групп концевой аминокислоты свободна: -COOH или -NH<sub>2</sub>, соответственно). При синтезе белка на рибосоме новые аминокислоты присоединяются к C-концу, поэтому название пептида или белка даётся путём перечисления аминокислотных остатков начиная с N-конца.</big>
 
 
''Для обозначения [[w:аминокислоты|аминокислот]] в научной литературе используются одно- или трёхбуквенные сокращения. На первый взгляд может показаться, что использование в большинстве белков «всего» 20 видов аминокислот ограничивает разнообразие белков. На самом деле количество вариантов трудно переоценить: для цепочки всего из 5 аминокислот оно составляет уже более 3 миллионов, а цепочка из 100 аминокислот (небольшой белок) может быть представлена более чем в 10<sup>130</sup> вариантах. Однако большинство вариантов не реализуются в природе, так как такие белки не смогли бы выполнять никаких функций.
 
Белки длиной от 2 до нескольких десятков аминокислотных остатков часто называют '''пептидами''', а более длинные — '''белками''', хотя это деление весьма условно.''
 
==== Вторичная структура белка — α-спирали и β-слои====
 
 
* '''Вторичная структура''' — локальное упорядочивание фрагмента полипептидной цепи, стабилизированное [[w:Водородная связь|водородными связями]] и [[w:гидрофобность|гидрофильно-гидрофобными взаимодействиями]]. Две наиболее распространенные вторичные структуры -
α-спирали иβ-листы (складчатые слои).
 
:* α-спирали — плотные витки вокруг длинной оси молекулы. Один виток составляют 3,6 аминокислотных остатка, спираль стабилизирована водородными связями между H и O пептидных групп, отстоящих друг от друга на 4 звена. Спираль построена исключительно из одного типа [[w:стереоизомеры|стереоизомеров]] аминокислот (L). Хотя она может быть как левозакрученной, так и правозакрученной, в белках преобладает правозакрученные спирали.
 
''Спираль нарушают электростатические взаимодействия [[w:глутаминовая кислота|глутаминовой кислоты]], [[w:лизин|лизина]], [[w:аргинин|аргинина]]; близко расположенные остатки [[w:аспарагин|аспарагина]], [[w:серин|серина]], [[w:треонин|треонина]] и [[w:лейцин|лейцина]] могут стерически мешать образованию спирали, остаток [[w:пролин|пролина]] вызывает изгиб цепи и также нарушает α-спирали.''
 
:* β-листы (складчатые слои) — несколько зигзагообразных полипептидных цепей, в которых водородные связи образуются между относительно удалёнными друг от друга в первичной структуре аминокислотами или разными цепями белка, а не близко расположенными, как имеет место в α-спирали. Эти цепи обычно направлены N-концами в противоположные стороны (антипараллельная ориентация). Для образования β-листов важны небольшие размеры R-групп аминокислот, преобладают обычно [[w:глицин|глицин]] и [[w:аланин|аланин]].
 
[[Файл:Proteinviews-1tim.png|thumb|300px|Разные способы изображения трёхмерной структуры белка на примере фермента триозофосфатизомеразы. Слева — «палочковая» модель, с изображением всех атомов и связей между ними; цветами показаны элементы. В середине изображены структурные мотивы, α-спирали и β-листы. Справа изображена контактная поверхность белка, на основании [[w:Радиус Ван-дер-Ваальса|Ван-дер-Ваальсовых радиусов]] атомов; цветами показаны особенности активности участков]]
 
==== Образование третичной структуры. Глобулярные и фибриллярные белки. Связи, участвующие в формировании третичной структуры ====
 
<big>Кроме последовательности аминокислот полипептида (первичной структуры), крайне важна трёхмерная структура белка, которая формируется в процессе [[w:фолдинг белка|фолдинга]] (от {{lang-en|folding}}), «сворачивание»). Трёхмерная структура формируется в результате взаимодействия структур более низких уровней.
* ''' Третичная структура''' — пространственное строение полипептидной цепи; взаимное расположение элементов вторичной структуры, стабилизированное различными типами взаимодействий. В стабилизации третичной структуры принимают участие:
:* [[w:ковалентная связь|ковалентные связи]] между двумя отсатками [[w:цистеин|цистеина]] — [[w:дисульфидная связь|дисульфидные мостики]];
:* [[w:ионная связь|ионные связи]] между противоположно заряженными боковыми группами аминокислотных остатков;
:* водородные связи;
:* [[w:гидрофобность|гидрофильно-гидрофобные]] взаимодействия. При взаимодействии с окружающими молекулами воды белковая молекула «стремится» свернуться так, чтобы неполярные боковые группы аминокислот оказались изолированы от водного раствора; на поверхности молекулы оказываются полярные гидрофильные боковые группы. </big>
 
Белки разделяют на две основные группы с разной трёхмерной структурой. Большинство белков — ''глобулярные'': общая форма из молекулы более или менее сферическая. Меньшая часть белков ''фибриллярные'': их молекулы (обычно и надмолекулярные комплексы) в работающем состоянии — вытянутые волокна. К фибриллярным белкам относятся, например, [[w:кератин|кератин]] и [[w:коллаген|коллаген]].
 
''Среди глобулярных и фибриллярных белков выделяют подгруппы. Например, изображённый на картинке справа глобулярный белок триозофосфатизомераза состоит из восьми α-спиралей, расположенных на внешней поверхности структуры, и восьми параллельных β-слоёв внутри структуры. Белки с подобным трёхмерным строением называются αβ-баррелы (от англ. barrel — бочка). ''
 
==== Четвертичная структура ====
* '''Четверичная структура''' — взаимное расположение нескольких полипептидных цепей в составе единого белкового комплекса.
 
<big>Белковые молекулы, входящие в состав белка с четвертичной структурой, образуются на рибосомах по отдельности и лишь после окончания синтеза образуют общую надмолекулярную структуру (можно считать её и молекулой, если между разными полипептидными цепями, как это нередко бывает, образуются дисульфидные мостики). В состав белка с четвертичной структурой могут входить как идентичные, так и различающиеся полипептидные цепочки. В стабилизации четвертичной структуры принимают участие те же типы взаимодействий, что и в стабилизации третичной. </big>
 
Надмолекулярные белковые комплексы могут состоять из десятков молекул, многие из них сравнимы по размеру с рибосомами и в последние годы часто описываются как органоиды (см., напр., [[w:протеасома|протеасома]]). Нередко в их состав входят молекулы РНК (см., напр., [[w:сплайсосома|сплайсосома]]).
 
==== Постулат Полинга и принцип самосборки. Нарушения постулата Полинга ====
'''Суть постулата Полинга заключается в том, что первичная структура белка (последовательность аминокислот) определяет вторичную, третичную и, наконец, четвертичную.''' Это означает, что все структуры белка, кроме первичной, детерминированы и полностью зависят от начальной последовательности аминокислот. Однако у этого принципа есть исключение - это белки [[w:прионы| прионы]]. Прион может существовать в двух конформациях — первая— PrPC, которую он имеет в нормальных клетках (в ней преобладают α-спирали) и «патологическая» — PrPSc (имеет β складчатую структуру).'' Белок PrPSc при попадании в здоровую клетку катализирует переход клеточного PrPC в патологическую конформацию, что в конечном итоге приводит к гибели клетки.''
 
==== Белки как молекулярные машины ====
 
==== Основные функции белков в клетке ====
 
===== Запасающая (энергетическая) функция =====
Белки редко используются как специальные запасные вещества. Вероятно, отчасти это связано с высокими энергозатратами, которые требуются для синтеза белка из аминокислот, а частично — с тем, что при «сжигании» белков в ходе [[w:катаболизм|катаболизма]] выделяются ядовитые «осколки» — аммиак, который в организме человека обезвреживается за счет превращения в менее токсичную [[w:мочевина|мочевину]].
 
Тем не менее, в яйцеклетках животных в состав желточных гранул входят белки в качестве запасных веществ (белок яйца — это белок, и желток — тоже белок!). Белки в значительных количествах запасаются в семенах семенных растений; особенно высокий процент их содержится в семенах [[w:бобовые|бобовых]]. Питательную (энергетическую) функцию выполняют белки молока ([[w:казеин|казеин]] и др.).
 
Так как белки не полностью окисляются в ходе обмена веществ, при их использовании в организме выделяется всего около 4-4,1 ккал/г, а при полном окислении — сжигании в калориметре — около 5,6 ккал/г.
 
===== Структурная функция =====
 
'''[[w:Структурная функция белков|Структурная функция белков]]''' заключается в том, что белки
* участвуют в образовании практически всех [[w:органоид|органоидов]] клеток, во многом определяя их структуру (форму);
* образуют [[w:цитоскелет|цитоскелет]], придающий форму клеткам и многим органоидам и обеспечивающий механическую форму ряда тканей;
* входят в состав межклеточного вещества, во многом определяющего структуру тканей и форму тела животных.
 
'''Белки межклеточного вещества'''
[[Файл:Fibers of Collagen Type I - TEM.jpg|thumb|right|Волокна белка коллагена из соединительной ткани млекопитающих (электронная микрофотография)]]
В теле человека белков [[w:межклеточное вещество|межклеточного вещества]] больше, чем всех остальных белков. Основными структурными белками межклеточного вещества являются фибриллярные белки.
 
Коллагены — семейство белков, входящих в состав межклеточного вещества. В теле человека составляют до 25 — 30 % общей массы всех белков. Кроме структурной функции коллаген выполняет также механическую, защитную, питательную и репаративную функции. Молекула коллагена представляет собой правозакрученную спираль из трёх α-цепей. Всего у человека имеется 28 типов коллагена. Все они сходны по структуре.
 
[[w:Эластин|Эластин]] широко распространён в соединительной ткани, особенно в коже, легких и кровеносных сосудах. Общими характеристиками для эластина и коллагена являются большое содержание глицина и пролина. В эластине значительно больше валина и аланина и меньше глутаминовой кислоты и аргинина, чем в коллагене. В эластине содержатся [[w:десмозин|десмозин]] и [[w:изодесмозин|изодесмозин]]. Эти соединения можно обнаружить только в эластине. Эластин нерастворим в водных растворах (как и коллаген), в растворах солей, кислот и щелочей даже при нагревании. В эластине большое количество аминокислотных остатков с неполярными боковыми группами, что, по-видимому, обусловливает высокую эластичность его волокон.
 
Другие белки [[w:внеклеточный матрикс|внеклеточного матрикса]] — [[w:ламинин|ламинины]], [[w:фибронектин|фибронектин]] и др. — выполняют как структурную, так и сигнальную функции. Взаимодействуя с мембранными [[w:клеточный рецептор|рецепторами]], они влияют на миграции клеток и другие стороны их поведения.
 
'''Белки [[w:цитоскелет|цитоскелета]]'''
Один из основных структурных белков — [[w:кератин|кератин]]. В основном из кератина состоят мертвые клетки ороговевающего [[w:эпителий|эпителия]] и их производные (волосы млекопитющих, рога, копыта, когти, перья птиц, чешуя рептилий и др.). В живых клетках эпителиальных тканей кератины образуют [[w:промежуточные филаменты|промежуточные филаменты]].
 
Кератины разделяются на две группы: α-кератины и β-кератины. Прочность кератина уступает, пожалуй, только хитину. Характерной особенностью кератинов является их полная нерастворимость в воде при pH 7,0. Содержат в молекуле остатки всех аминокислот. Отличаются от других фибриллярных структурных белков (например, коллагена) в первую очередь повышенным содержанием остатков цистеина. Первичная структура полипептидных цепей a-кератинов не имеет периодичности.
 
В других типах тканей (кроме эпителиев) промежуточные филаменты образованы похожими на кератин по структуре белками — [[w:виментин|виментином]], белками [[w:нейрофиламенты|нейрофиламентов]] и др. Белки [[w:ламин|ламины]] в большинстве клеток жукариот образуют внутреннюю выстилку оболочки ядра. Состоящая из них ядерная ламина поддерживает ядерную мембрану и контактирует с хроматином и ядерными РНК.
 
[[w:Тубулин|Тубулин]] относится к филаментозным белкам. Димеры тубулина после полимеризации превращаются в нити (протофиламенты). Из них собираются [[w:микротрубочка|микротрубочки]], образующие цитоскелет, который помогает клетке поддерживать форму, обеспечивает связь между органеллами и выполняет ряд других функций.
 
[[w:Актин|Актин]] — тоже филаментозный белок. Из его мономеров при полимеризации образуются тонкие филаменты мышц и [[w:микрофиламенты|микрофиламенты]] немышечных клеток.
 
Хотя [[w:миозин|миозин]] обычно относят к моторным белкам, в мышечных клетках он входит в состав постоянных структур. В скелетных и сердечной мышцах миозин входит в состав [[w:саркомер|саркомеров]], образуя толстые филаменты.
 
К структурным относятся и многие вспомогательные белки, входящие в состав цитоскелета. Так, в образовании саркомеров участвуют белки [[w:титин|титин]], [[w:тропомиозин|тропомиозин]] и др.
 
'''Структурные белки [[w:органелла|органелл]]'''
 
Белки создают и определяют форму (структуру) многих клеточных [[w:органелла|органелл]]. В основном из белков состоят такие органеллы, как [[w:рибосома|рибосомы]], [[w:протеасома|протеасомы]], [[w:ядерные поры|ядерные поры]] и др. [[w:Гистоны|Гистоны]] необходимы для сборки и упаковки нитей ДНК в хромосомы. Из белков состоят [[w:клеточная стенка|клеточные стенки]] некоторых [[w:протисты|протистов]] (например,[[w:хламидомонада|хламидомонады]]); в составе оболочки клеток многих бактерий и [[w:археи|архей]] присутствует белковый слой (S-слой), который крепится у [[w:окраска по Граму|грамположительных]] видов к клеточной стенке, а у грамотрицательных — к наружной мембране. Из белка [[w:флагеллин|флагеллина]] состоят прокариотические [[w:жгутик|жгутики]].
 
===== Транспортная функция =====
'''Транспортная функция белков''' — участие белков в переносе веществ в [[w:клетка (биология)|клетки]] и из клеток, в их перемещениях внутри клеток, а также в их транспорте кровью и другими жидкостями по организму.
 
Есть разные виды транспорта, которые осуществляются при помощи белков.
 
''' Перенос веществ через клеточную мембрану '''
 
У всех клеток есть [[w:мембрана|мембрана]], состоящая из двойного слоя липидов. В клетку должны поступать многие необходимые для жизни вещества ([[w:сахар|сахара]], [[w:аминокислоты|аминокислоты]], ионы щелочных металлов), но мембрана для них непроницаема. Поэтому в состав мембраны входят транспортные [[w:белки|белки]], которые и осуществляют перенос всех необходимых соединений.
Транспорт этих соединений осуществляют две группы белков:
 
1) '''белки-переносчики''' связываются с молекулой или ионом переносимого вещества и каким-либо способом доставляют её внутрь клетки.
 
2) '''каналообразующие белки''' образуют в мембране водные поры, через которые (когда они открыты) могут проходить вещества.
 
Каналообразующие белки коннексины и паннексины формируют щелевые контакты, через которые низкомолекулярные вещества могут транспортироваться из одной клетки в другую (через паннексины вещества могут проходить и в клетки из внешней среды).
 
''' Перенос веществ внутри клетки '''
 
Между ядром, другими органоидами и цитоплазмой клетки постоянно идет обмен разными веществами. Например, перенос белков между ядром и цитоплазмой (ядерно-цитоплазматический транспорт)происходит благодаря ядерным порам, которые пронизывают двухслойную оболочку ядра. Они состоят примерно из тридцати белков — нуклеопоринов. Вещества переносятся из цитоплазмы в ядро клетки вместе с беклами — транспортинами. Эти белки узнают вещества, предназначенные для транспорта в [[w:ядро|ядро]], и связываются с ними. Затем этот комплекс белков заякоривается на белках ядерной поры и попадает в её канал, а затем в ядро. Там она связывается ещё с одним белком и распадается, а транспортины направляются обратно в цитоплазму.
 
Также для транспортировки веществ внутри клеток используются [[w:микротрубочки|микротрубочки]]. По их поверхности могут передвигаться [[w:митохондрии|митохондрии]] и мембранные пузырьки. Этот транспорт осуществляют моторные белки. Они делятся на два типа: цитоплазматические динеины и кинезины. Эти две группы белков различаются тем, от какого конца микротрубочки они перемещают груз: динеины от + конца к — концу, а кинезины наоборот.
 
 
''' Перенос веществ по организму '''
 
Наиболее известный транспортный белок, транспортирующий вещества по организму — это [[w:гемоглобин|гемоглобин]]. Он переносит [[w:кислород|кислород]] по кровеносной системе от лёгких к органам и тканям. Также 15 % углекислого газа транспортируется к лёгким с помощью гемоглобина. В скелетных и сердечной мышцах перенос кислорода выполняется белком [[w:миоглобин|миоглобином]].
[[w:Жирные кислоты|Жирные кислоты]] транспортируются [[w:альбумин|альбуминами]] сыворотки крови. Кроме того, белки группы альбуминов, например, транстиретин, транспортируют [[w:гормоны|гормоны]] щитовидной железы. Также важнейшей транспортной функцией альбуминов является перенос [[w:билирубин|билирубина]], желчных кислот, стероидных гормонов, лекарств и неорганических ионов.
 
Другие белки крови — глобулины переносят различные гормоны, [[w:липиды|липиды]] и [[w:витамины|витамины]]. Транспорт ионов меди в организме осуществляет [[w:глобулин|глобулин]] — [[w:церулоплазмин|церулоплазмин]], а транспорт ионов железа — белок [[w:трансферрин|трансферрин]].
 
===== Защитная функция =====
 
Защитная функция белков — способность белков обеспечивать защиту организмов от неблагоприятного воздействия различных факторов. Эту функцию белки могут выполнять несколькими различными способами.
 
'''Механическая защита'''
 
Белки могут обеспечивать механическую защиту клетки или всего организма. Из белков состоит клеточная стенка некоторых протистов (например. одноклеточной водоросли хламидомонады), кутикула нематод и другие покровные образования. У наземных позвоночных ороговение покровного эпителия кожи обеспечивает белок кератин, синтезируемый в клетках эпидермиса. К роговых производных кожи относятся, роговые чешуи рептилий, перья и чехол клюва птиц, шерсть, копыта и рога млекопитающих и др. Состоящие из белков покровные образования могут обеспечивать не только механическую защиту, но и термоизоляцию, защиту от воздействия ультрафиолетового излучения и химических веществ, от потерь жидкости и проникновения в организм бактерий и других паразитов.
 
'''Свертывание крови'''
 
К механическим защитным функциям белков можно отнести способность крови свертываться, что обеспечивается благодаря белку фибриноген, содержащийся в плазме крови. Когда кровь начинает свертываться, фибриноген расщепляется ферментом тромбином; после расщепления образуется мономер — фибрин, который, в свою очередь, полимеризуется и образует длинные белые нити. Из нитей фибрина и эритроцитов образуется тромб, который при последующей сокращении фибрина затвердевает. Таким образом, фибрин играет главную роль в процессе свертывания крови и предотвращении кровопотери.
 
'''Химическая защита'''
 
Связывание [[w:токсин|токсинов]] белковыми молекулами и действие на токсины ферментов может обеспечивать их обезвреживание. Особенно важную роль в детоксикации у человека играют [[w:фермент|ферменты]] [[w:печень|печени]], расщепляющие яды или переводящие их в растворимую форму, что способствует их быстрому выведению из организма.
 
В защите клеток от вредных веществ могут принимать участие также транспортные белки, например, многие белки суперсемейства [[w:АВС-транспортер|АВС-транспортеров]]. Эти белки, имеющиеся у всех живых организмов, транспортируют через клеточную мембрану различные вещества ([[w:липиды|липиды]], многие [[w:ксенобиотик|ксенобиотики]] и др.). АВС-транспортеры обеспечивают защиту бактерий от действия многих [[w:антибиотик|антибиотиков]], отвечают за явление [[w:множественная лекарственная устойчивость|множественной лекарственной устойчивости|]] раковых клеток.
 
'''Иммунная защита'''
 
[[w:Иммунитет|Иммуная]] функция белков играет очень важную роль в организме животных. В тот момент, когда в организм попадают [[w:патоген|возбудители]] — [[w:вирусы|вирусы]] или [[w:бактерии|бактерии]], в специализированных органах начинают вырабатываться специальные белки — [[w:антитело|антитела]], которые связывают и обезвреживают возбудителей. Особенность иммунной системы заключается в том, что за счет антител она может бороться с почти любыми видами возбудителей.
 
В иммунной системе играют важную роль не только белки-антитела, но и [[w:лизоцим|лизоцимы]] и белки [[w:система комплемента|системы комплемента]]. [[w:Лизоцим|Лизоцимы]] — белки-ферменты, которые разрушают стенки бактерий путем [[w:гидролиз|гидролизу]] их компонентов. Белки комплемента запускают каскад реакций, в результате которых образуется белок МАК (мембраноатакующий комплекс). МАК атакует бактерию, разрушая ее [[w:клеточные мембраны|клеточную мембрану]]. Если этого не произошло, другие белки системы комплемента помечают эту клетку для последующего её уничтожения [[w:фагоцит|фагоцитами]].
 
К защитным белкам иммунной системы относятся также [[w:интерферон|интерфероны]]. Эти белки производят клетки, зараженные вирусами. Их воздействие на соседине клетки обеспечивает противовирусную устойчивость, блокируя в клетках-мишенях размножение вирусов или сборку вирусных частиц. Интерфероны обладают и иными механизмами действия, например, влияют на активность лимфоцитов и других клеток иммунной системы.
 
 
'''Защитная функция токсинов'''
 
Белки обеспечивают активную и пассивную ядовитость многих организмов, которая служит для защитыу от врагов или для нападения на добычу. Белки — основной компонент ядов большинства животных, а также некоторых грибов и бактерий. Попадая в организм жертвы, ядовитые белки (токсины) действуют на определенные молекулы или клетки-мишени. Мишенями для большинства токсинов служат клетки нервной системы.
 
Белки и [[w:пептид|пептиды]] содержатся в ядах большинства животных (например, змей, скорпионов, [[w:стрекающие|стрекающих]] и др.). Содержащиеся в ядах белки имеют различные механизмы действия. Так, яды [[w:гадюковые|гадюковых]] змей часто содержат [[w:фермент|фермент]] [[w:фосфолипаза|фосфолипазу]], который вызывает разрушение клеточных мембран и, как следствие, [[w:гемолиз|гемолиз]] [[w:эритроцит|эритроцитов]] и [[w:геморрагия|геморрагию]]. В яде [[w:аспиды|аспидов]] преобладают [[w:нейротоксин|нейротоксины]]; например, в яде [[w:крайты|крайтов]] содержатся белки [[w:α-бунгаротоксин|α-бунгаротоксин]] (блокатор [[w:холинергические синапсы|никотиновых рецепторов ацетилхолина]] и [[w:β-бунгаротоксин|β-бунгаротоксин]](вызывает постоянное выделение [[w:ацетилхолин|ацетилхолина]] из нервных окончаний и тем самым истощение его запасов); совместное действие этих ядов вызывает смерть от паралича мышц.
 
Бактериальные белковые яды — [[w:ботулотоксин|ботулотоксин]], токсин [[w:тетаноспазмин|тетаноспазмин]], вырабатываемый возбудителями [[w:столбняк|столбняка]], [[w:дифтерийный токсин|дифтерийный токсин]] возбудителя [[w:дифтерия|дифтерии]], [[w:холерный токсин|холерный токсин]]. Многие из них являются смесью нескольких белков с разных механизмом действия. Некоторые бактериальные токсины белковой природы являются очень сильными ядами; компоненты ботулотоксина — наиболее ядовитое из известных природных веществ.
 
Токсины патогенных бактерий рода [[w:Clostridium|Clostridium]], видимо, требуются [[w:анаэробные организмы|анаэробным бактериям]] для воздействия на весь организм в целом, чтобы привести его к смерти — это дает бактериям «безнаказанно» питаться и размножаться, а уже сильно увеличив свою популяцию покидать организм в виде спор.
 
Биологическое значение токсинов многих других бактерий точно не известно.
 
У растений в качестве ядов обычно используются вещества небелковой природы ([[w:алкалоиды|алкалоиды]], [[w:гликозиды|гликозиды]] и др.). Однако у растений встречаются и белковые токсины. Так, в семенах растения семейства [[w:молочайные|молочайные]] [[w:клещевина|клещевине]] содержится белковых токсин [[w:рицин|рицин]]. Этот токсин проинкает в цитоплазму клеток кишечника, и его ферментативная субъединица, воздействуя на [[w:рибосома|рибосомы]], необратимо блокирует [[w:трансляция|трансляцию]].
 
 
* [http://humbio.ru/humbio/immunology/000638dd.htm] — Антитела
* [http://humbio.ru/humbio/physiology/0012516b.htm] — Гемостаз (система свертывания крови)
* [http://humbio.ru/humbio/immunology/0012f65b.htm] — Интерфероны
* [http://textbookofbacteriology.net/proteintoxins.html] — Бактериальные белковые токсины
* [http://images.google.com/imgres?imgurl=http://www.neurotoxininstitute.org/images/moa003.jpg&imgrefurl=http://www.neurotoxininstitute.org/chapter_moa.asp&h=371&w=364&sz=19&hl=en&start=14&tbnid=aY0T2N6mT37ojM:&tbnh=122&tbnw=120&prev=/images%3Fq%3Dneuromuscular%2Bsynapse%26svnum%3D10%26hl%3Den%26lr%3D%26client%3Dfirefox-a%26channel%3Ds%26rls%3Dorg.mozilla:en-US:official%26sa%3DX] — Механизм действия ботулотоксина (англ.)
* [[http://www.xumuk.ru/encyklopedia/2/5465.html]] — Яды животных
 
===== Двигательная функция =====
Двигательные, или моторные белки способны использовать энергию гидролиза АТФ или энергию ионного градиента для совершения механической работы. К моторным белкам относятся, например, [[w:миозин|миозины]], [[w:динеин|динеины]] и [[w:кинезин|кинезины]].
Все эти белки относятся к АТФ-азам, так что они обладают и ферментативной функцией. Однако в изолированном виде они расщепляют лишь одну молекулу АТФ (на одну молекулу белка); образующаяся молекула АДФ остается связанной с белком и препятствует его работе. Расщеплять АТФ постоянно (циклически) они способны при взаимодействии с другими белками. Миозин расщепляет АТФ при взаимодействии с [[w:актин|актином]] в составе [[w:микрофиламент|микрофиламентов]], а динеин и кинезин - при взаимодействии с [[w:тубулин|тубулином]] в составе [[w:микротрубочка|микротрубочек]].
 
===== Рецепторная функция =====
Многие белки выполняют функцию рецепторов. Слово «рецептор» в биологии употребляется в двух значениях. Рецепторами называются клетки, специализирующиеся на восприятии раздражителей. Это могут быть чувствительные нейроны или другие (не нервные) клетки (например, мышечные веретена).
 
Рецепторами также называются белки, молекулы которых служат для восприятия сигналов, получаемых клеткой, и запускают ответную реакцию клетки на тот или иной сигнал.
 
'''Белок-рецептор''' — молекула (обычно [[w:Белки|белок]] или [[w:гликопротеид|гликопротеид]])? распложеннная на поверхности [[w:клетка|клетки]], клеточных [[w:органоид| органелл]] или растворенная в [[w:цитоплазма|цитоплазме]], специфически реагирующая изменением своей формы на присоединение к ней молекулы определенного химического вещества, передающего внешний регуляторный сигнал и, в свою очередь, передающая этот сигнал внутрь клетки или клеточной органеллы, нередко при помощи так называемых [[w:вторичный посредник|вторичных посредников]] или трансмембранных ионных токов.
 
Вещество, специфически соединяющееся с рецептором, называется [[w:лиганд|лигандом]] этого рецептора. Внутри организма это обычно [[w:гормон|гормон]] или [[w:нейромедиатор|нейромедиатор]] либо их искусственные заменители, применяемые в качестве лекарственных средств и ядов (агонисты). Некоторые лиганды, напротив, блокируют рецепторы (антагонисты). Когда речь идет об органах чувств, лигандами являются вещества, воздействующие на рецепторы [[w:Обонятельная сенсорная система| обоняния]] или [[w:Вкусовая сенсорная система| вкуса]]. Кроме того [[w:родопсин| зрительные рецепторы]] реагируют на свет, а в органах [[w:Слуховая сенсорная система| слуха]] и [[w:Кожа| осязания]] рецепторы чувствительны к механическому давлению, вызываемому колебаниями воздуха и иными воздействиями.
 
'''Мембранные рецепторы'''
 
Очень часто у белков есть гидрофобные участки, которые взаимодействуют с липидами, и гидрофильные участки, которые находятся на поверхности [[w:клеточные мембраны|мембраны клетки]], соприкасаясь с водным содержимым клетки. Большинство мембранных рецепторов — именно такие трансмембранные белки.
 
Многие из мембранных белков-рецепторов связаны с углеводными цепями, то есть представляют собой [[w:гликопротеиды|гликопротеиды]]. На их внеклеточных поверхностях находятся олигосахаридные цепи (гликозильные группы), похожие на антенны. Такие цепочки, состоящие из нескольких моносахаридных остатков, имеют самые различные формы, что объясняется разнообразием связей между моносахаридными остатками и существованием α- и β-[[w:изомеры|изомеров]].
 
Функция «антенн» — это распознавание внешних сигналов. Распознающие участки двух соседних клеток могут обеспечивать сцепление клеток, связываясь друг с другом. Благодаря этому клетки ориентируются и создают ткани в процессе дифференцировки. Распознающие участки присутствуют и в некоторых молекулах, которые находятся в растворе, благодаря чему они избирательно поглощаются клетками, имеющими комплементарные распознающие участки (так, например, поглощаются [[w:ЛПНП|ЛПНП]] с помощью рецепторов ЛПНП).
 
Два основных класса мембранных рецепторов — это [[w:метаботропные рецепторы|метаботропные рецепторы]] и [[w:ионотропные рецепторы|ионотропные рецепторы]].
 
Ионотропные рецепторы представляют собой [[w:мембранные каналы|мембранные каналы]], открываемые или закрываемые при связывании с лигандом. Возникающие при этом ионные токи вызывают изменения трансмембранной разности потенциалов и, вследствие этого, возбудимости клетки, а также меняют внутриклеточные концентрации ионов, что может вторично приводитъ к активации систем внутриклеточных посредников. Одним из наиболее полно изученных ионотропных рецепторов является [[w:н-холинорецептор|н-холинорецептор]].
 
[[Файл:G-Protein.png|300px|thumb|right|Структура гетеротримерного G-белка, состоящего из трёх разных субъединиц — αt/αi (голубые), β (красная) и γ (зелёная)]]
 
Метаботропные рецепторы связаны с системами внутриклеточных посредников. Изменения их конформации при связывании с лигандом приводит к запуску каскада биохимических реакций, и, в конечном счете, изменению функционального состояния клетки.
Основные типы мембранных рецепторов:
# Рецепторы, связанные с гетеротримерными [[w:G-белки|G-белками]] (например, рецептор [[w:вазопрессин|вазопрессина]]).
# Рецепторы, обладающие тирозинкиназной активностью (например, рецептор [[w:инсулин|инсулина]] или [[w:рецептор эпидермального фактора роста|рецептор эпидермального фактора роста]]).
 
Рецепторы, связанные с G-белками, представляют собой трансмембранные белки, имеющие 7 трансмембранных доменов, внеклеточный N-конец и внутриклеточный C-конец. Сайт связывания с лигандом находится на внеклеточных петлях, домен связывания с G-белком — вблизи C-конца в цитоплазме.
 
Активация рецептора приводит к тому, что его α-[[w:субъединица|субъединица]] диссоциирует от βγ-субъединичного комплекса и таким образом активируется. После этого она либо активирует, либо, наоборот инактивирует [[w:фермент|фермент]], продуцирующий вторичные посредники.
 
Рецепторы с тирозинкиназной активностью [[w:фосфорилирование|фосфорилируют]] последующие внутриклеточные белки, часто тоже являющиеся [[w:протеинкиназа|протеинкиназами]], и таким образом передают сигнал внутрь клетки. По структуре это — трансмембранные белки с одним мембранным доменом. Как правило, в активированном состоянии они образуют гомодимеры, субъединицы которых связаны [[w:дисульфидный мостик|дисульфидными мостиками]].
 
'''Внутриклеточные рецепторы'''
 
Внутриклеточные рецепторы — как правило, [[w:транскрипционный фактор|факторы транскрипции]] (например, рецепторы [[w:глюкокортикоид]]ов) или белки, взаимодействующие с факторами транскрипции. Большинство внутриклеточных рецепторов связываются с лигандами в цитоплазме, переходят в активное состояние, транспортируются вместе с лигандом в ядро клетки, там связываются с ДНК и либо индуцируют, либо подавляют экспрессию некоторого гена или группы генов. <br />
Особым механизмом действия обладает [[w:оксид азота|оксид азота]] (NO). Проникая через мембрану, этот гормон связывается с растворимой (цитозольной) гуанилатциклазой, которая одновременно является и рецептором оксида азота, и ферментом, который синтезирует вторичный посредник — цГМФ.
 
===== Сигнальная функция =====
'''Сигнальная функция белков''' — способность [[w:белки|белков]] служить сигнальными веществами, передавая сигналы между тканями, клетками или организмами.
 
Сигнальную функцию выполняют белки-[[w:гормоны|гормоны]]. Связывание гормона с рецептором является сигналом, запускающим в клетке физиологические процессы. Гормоны регулируют концентрации веществ в крови и клетках, рост, размножение и другие процессы. Например, инсулин снижает содержание сахара в крови, [[w:гормон роста|гормон роста]] регулирует [[w:рост|рост]] [[w:скелет|скелета]], [[w:лептин|лептин]] регулирует [[w:аппетит|аппетит]].
 
Клетки могут взаимодействуют друг с другом на расстоянии с помощью сигнальных белков, передаваемых через межклеточное вещество. К таким белкам относятся [[w:цитокины|цитокины]], [[w:факторы роста|факторы роста]] и др.
 
[[w:Цитокины|Цитокины]] — небольшие пептидные информационные молекулы. Они регулируют взаимодействия между клетками, определяют жизнедеятельность клеток, их выживаемость, стимулируют или подавляют рост, дифференциацию, функциональную активность и [[w:апоптоз|апоптоз]] (явление программируемой клеточной смерти), обеспечивают согласованность и упорядоченность действий иммунной, эндокринной и нервной систем. Примером цитокинов может служить [[w:ФНО|фактор некроза опухолей|]], который передаёт сигналы воспаления между клетками организма
 
===== Регуляторная функция =====
'''Регуляторная функция [[w:белки|белков]]''' ― осуществление белками регуляции процессов в клетке или в организме, что связано с их способностью к приему и передаче информации. Действие регуляторных белков обратимо и, как правило, требует присутствия [[лиганд]]а. Постоянно открывают все новые и новые регуляторные белки, в настоящее время известна, вероятно, только малая их часть.
 
Существует несколько разновидностей белков, выполняющих регуляторную функцию:
* белки — [[w:клеточный рецептор|рецепторы]], воспринимающие сигнал (см. раздел "Рецепторная функция)
* сигнальные белки — [[w:гормоны|гормоны]] и другие вещества, осуществляющие [[w:межклеточная сигнализация|межклеточную сигнализацию]] (многие, хотя и далеко не все, из них является белками или пептидами) (см. раздел «Сигнальная функция»)
* регуляторные белки, которые регулируют многие процессы внутри клеток.
 
Белки регулируют процессы, происходщие внутри клеток, при помощи нескольких механизмов:
* взаимодействия с молекулами ДНК (транскрипционные факторы)
* при помощи фосфорилирования (протеинкиназы) или дефосфорилирования (протеинфосфатазы) других белков
* при помощи взаимодействия с рибосомой или молекулами РНК (факторы регуляции трансляции)
* воздействия на процесс удаления интронов (факторы регуляции сплайсинга)
 
'''Белки-регуляторы транскрипции '''
'''[[w:Транскрипционный фактор|Транскрипционный фактор]]''' — это белок, который, попадая в ядро клетки, регулирует транскрипцию ДНК, то есть синтез мРНК по матрице ДНК.
Некоторые транскрипционные факторы изменяют структуру хроматина, делая его более доступным для РНК-полимераз. Существуют различные вспомогательные транскрипционные факторы, которые создают нужную конформацию ДНК для последующего действия других транскрипционных факторов. Еще одна группа транскрипционных факторов — это те факторы, которые не связываются непосредственно с молекулами ДНК, а объединяются в более сложные комплексы с помощью белок-белковых взаимодействий.
 
'''Факторы регуляции трансляции'''
 
'''[[w:Трансляция|Трансляция]]''' — синтез полипептидных цепей белков по матрице мРНК, выполняемый рибосомами. Регуляция трансляции может осуществляться несколькими способами, в том числе и с помощью белков-репрессоров, которые связываются с мРНК. Известно много случаев, когда репрессором является белок, который кодируется этой мРНК. В этом случае происходит регуляция по типу обратной связи (примером этого может служить репрессия синтеза фермента треонил-тРНК-синтетазы).
 
'''Факторы регуляции сплайсинга'''
 
Внутри генов эукариот есть участки, не кодирующие аминокислот. Эти участки называются [[w:интроны|интронами]]. Они сначала переписываются на пре-мРНК при транскрипции, но затем вырезаются особым ферментом. Этот процесс удаления интронов, а затем последующее сшивание концов оставшихся участков называют [[w:сплайсинг|сплайсингом]] (сшивание, сращивание). Существует [[w:альтернативный сплайсинг|альтернативный сплайсинг]], при котором из одной пре-м-РНК могут образовываться несколько разных хрелых м-РНК. Сплайсинг осуществляется с помощью небольших РНК, обычно связанных с белками, которые называются факторами регуляции сплайсинга. В сплайсинге принимают участие белки, обладающие ферментативной активностью. Они придают пре-мРНК нужную конформацию. Для сборки комплекса([[w:сплайсосома|сплайсосомы]]) необходимо потребление энергии в виде расщепляемых молекул АТФ, поэтому в составе этого комплекса есть белки, обладающие АТФ-азной активностью.
 
Особенности сплайсинга определяются белками, способными связываться с молекулой РНК в областях интронов или участках на границе экзон-интрон. Эти белки могут препятствовать удалению одних интронов и в то же время способствовать вырезанию других. Направленная регуляция сплайсинга может иметь значительные биологические последствия. Например, у плодовой мушки [[w:дрозофила|дрозофилы]] альтернативный сплайсинг лежит в основе механизма определения пола.
 
'''Протеинкиназы и протеинфосфатазы'''
 
Важнейшую роль в регуляции внутриклеточных процессов играют [[w:Протеинкиназа|протеинкиназы]] — ферменты, которые активируют или подавляют активность других белков путем присоединения к ним фосфатных групп.
 
Протеинкиназы регулируют активность других белков путем [[w:фосфорилирование|фосфорилирования]] — присоединения остатков фосфорной кислоты к остаткам аминокислот, имеющих [[w:гидроксильная группа|гидроксильные группы]]. При фосфорилировании обычно изменяется функционирование данного белка, например, ферментативная активность, а также положение белка в клетке.
 
Существуют также [[w:протеинфосфатаза|протеинфосфатазы]] — белки, которые отщепляют фосфатные группы. Протеинкиназы и протеинфосфатазы регулируют обмен веществ, а также передачу сигналов внутри клетки. Фосфорилирование и дефосфорилирования белков — один из главных механизмов регуляции большинства внутриклеточных процессов.
 
==== Каталитическая функция белков. Обмен веществ и энергии как совокупность ферментативных реакций ====
 
'''[[w:Фермент|Ферменты]]''', или '''энзи́мы''' (от {{lang-la|fermentum}}, {{lang-el|ζύμη}}, {{lang-el2| ἔνζυμον}}&nbsp;— [[w:дрожжи|дрожжи]], закваска)&nbsp;— обычно [[w:белки|белковые молекулы]] или [[w:РНК|молекулы РНК]] ([[w:рибозим|рибозимы]]) или их комплексы, ускоряющие ([[w:Катализ|катализирующие]]) химические реакции в живых системах. [[w:Реагент|Реагенты]] в реакции, катализируемой ферментами, называются [[w:субстрат|субстратами]], а получающиеся вещества — [[w:продукт|продуктами]]. [[w:Белок|Белковые ферменты]] синтезируются на [[w:Рибосома|рибосомах]], а РНК — в ядре.
 
Термины «фермент» и «энзим» давно используют как [[w:синонимы|синонимы]] (первый в основном в русской и немецкой научной литературе, второй&nbsp;— в англо- и франкоязычной). <br />
Наука о ферментах называется '''энзимологией'''.
 
Ферменты специфичны к субстратам (АТФаза катализирует расщепление только АТФ, а киназа фосфорилазы [[w:Фосфорилирование|фосфорилирует]] только фосфорилазу).
 
<small>Ферменты обычно проявляют высокую специфичность по отношению к своим субстратам (субстратная специфичность). Это достигается частичной комплементарностью формы, распределения зарядов и гидрофобных областей на молекуле субстрата и в центре связывания субстрата на ферменте. Ферменты обычно демонстрируют также высокий уровень стереоспецифичности (образуют в качестве продукта только один из возможных стереоизомеров или используют в качестве субстрата только один стереоизомер), региоселективности (ообразуют или разрывают химическую связь только в одном из возможных положений субстрата) и хемоселективности (катализируют только одну химическую реакцию из нескольких возможных для данных условий). Несмотря на общий высокий уровень специфичности, степень субстратной и реакционной специфичности ферментов может быть различной. Например, [[w:эндопептидаза|эндопептидаза]] [[w:трипсин|трипсин]] разрывает пептидную связь только после [[w:аргинин|аргинина]] или [[w:лизин|лизина]], если за ними не следует пролин, а [[w:пепсин|пепсин]] гораздо менее специфичен и может разрывать пептичную связь, следующую за многими аминокислотами.</small>
 
 
Активность ферментов определяется их трёхмерной структурой. Как и все белки, ферменты синтезируются в виде линейной цепочки [[w:аминокислота|аминокислот]], которая сворачивается определённым образом. Каждая последовательность аминокислот сворачивается особым образом, и получающаяся молекула (белковая глобула) обладает уникальными свойствами. Многие ферменты обладают сложной [[w:четвертичная структура белка|четвертичной структурой]].
 
'''Механизм работы ферментов'''
 
<big>Чтобы катализировать реакцию, фермент должен связаться с одним или несколькими субстратами. Белковая цепь фермента сворачивается таким образом, что на поверхности глобулы образуется щель, или впадина, где связываются субстраты. Эта область называется сайтом связывания субстрата. Обычно он совпадает с активным центром фермента или находится вблизи него. Некоторые ферменты содержат также сайты связывания [[w:кофактор|кофакторов]] ([[w:кофермент|коферментов]], ионов металлов, АТФ и др.).
 
Фермент, соединяясь с субстратом:
* очищает субстрат от водяной «шубы»
* располагает реагирующие молекулы субстратов в пространстве нужным для протекания реакции образом
* подготавливает к реакции (например, поляризует) молекулы субстратов.
 
Обычно присоединение фермента к субстрату происходит за счет ионных или водородных связей, редко — за счет ковалентных. В конце реакции её продукт (или продукты) отделяются от фермента.
 
 
[[Файл:Two substrates c.png|thumb|300px|Более реалистичная ситуация в случае индуцированного соответствия. Неправильные субстраты&nbsp;— слишком большие или слишком маленькие&nbsp;— не подходят к активному центру]]
 
В результате фермент снижает энергию активации реакции. Это происходит потому, что в присутствии фермента реакция идет по другому пути (фактически происходит другая реакция), например:
 
 
В отсутствии фермента:
* А+В = АВ
 
В присутствии фермента:
* А+Ф = АФ
* АФ+В = АВФ
* АВФ = АВ+Ф
 
где А, В — субстраты, АВ — продукт реакции, Ф — фермент.</big>
 
'''Модель «ключ-замок»'''
 
[[Файл:Two substrates b.png|thumb|300px|Гипотеза Кошланда об индуцированом соответствии]]
 
 
В 1890 г. [[w:Фишер, Эмиль|Эмиль Фишер]] предположил, что специфичность ферментов определяется точным соответствием формы фермента и субстрата. Такое предположение называется моделью «ключ-замок». Фермент соединяется с субстратом с образованием короткоживущего фермент-субстратного комплекса. Однако, хотя эта модель объясняет высокую специфичность ферментов, она не объясняет явления стабилизации переходного состояния, которое наблюдается на практике.
 
===== Регуляция работы ферментов =====
Ферментативная активность может регулироваться [[w:активатор|активаторами]] и [[w:ингибитор|ингибиторами]] ферментов (активаторы — повышают, ингибиторы — понижают).
 
 
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/enzymes/enzymes.html] Анимация «Снижение энергии активации: роль ферментов» (англ. текст)
 
== Основные молекулярно-генетические процессы ==
[http://www.nsu.ru/education/biology/genetics/glava6.pdf] — Структура и организация генома. И. Ф. Жимулев
 
=== Роль ДНК в клетке и история её открытия ===
[[Файл:Friedrich Miescher.jpg|thumb|right|Фридрих Мишер]]
 
==== Нуклеиновые кислоты открыл Ф. Мишер в XIX веке ====
[[w:ДНК|ДНК]] как представитель отдельного класса органических веществ — [[w:нуклеиновые кислоты|нуклеиновых кислот]] — была открыта швейцарским врачом и биологом [[w:Мишер, Иоганн-Фридрих|Фридрихом Мишером]] в 1869 г. Мишер изучал химический состав гноя — погибших клеток-[[w:лейкоцит|лейкоцитов]]. Ему удалось выделить из ядер лейкоцитов вещество, не расщепляемое [[w:протеаза|протеазами]], не растворяющееся в эфире и содержащее большое количество фосфора. Мишер назвал его «нуклеин» (от слова «нуклеус» — ядро) (когда это вещество было переименовано в «нуклеиновую кислоту», это вызвало большое недовольство Мишера). Позднее Мишеру удалось найти удобный материал для выделения ДНК — молоки лососевых рыб (для выделения больших количества ДНК их используют до сих пор, так как процентное содержание ДНК в [[w:сперматозоид|сперматозоидах]] гораздо выше, чем в любых других клетках).
 
==== А. Вейсман предположил, что существует «бессмертная» зародышевая плазма — особое вещество наследственности ====
В конце 19-ого века [[w:Вейсман,Август|А. Вейсман]] высказал гипотезу, что существует особое «наследственное вещество», которое он назвал зародышевой плазмой. Она, как предполагал Вейсман, находится в [[w:хромосома|хромосомах]], а её элементы располагаются в линейном порядке. Две гипотезы, которые он выдвинул, подтвердились в ходе развития [[w:генетика|генетики]]:
 
1) Вейсман предположил, что зародышевая плазма содержится только в [[w:половые клетки|половых клетках]] и отсутствует в соматических (клетках тела). Как предполагал Вейсман, зародышевая плазма не зависит от того, что происходит с соматическими клетками (приобретенные признаки не наследуются). Для доказательства этой теории Вейсман проводил опыты на мышах. В двадцати поколениях мышам подрезали хвосты, но при этом у их детенышей хвосты короткими не становились. Этот несколько наивный опыт в то время рассматривался как важное доказательство того, что приобретенные признаки не наследуются: клетки тела не могут сообщить половым клеткам о происходящих с ними изменениях.
 
2) Идея Вейсмана о роли хромосом и о линейном расположении в них элементарных единиц наследственности оказалась верной и сохранилась в науке до наших дней, изменилась только терминология.
 
==== Генетические опыты на дрозофиле показали, что гены расположены в хромосомах в линейной последовательности ====
 
Открытие [[w:кроссинговер|кроссинговера]] (обмена участками между гомологичными хромосомами) не только внесло поправку в представления о сцепленном наследовании. После этого открытия ученые смогли изучить расположение генов в хромосоме. Идея была предложена ученым Т. Х. Морганом и его сотрудником Стертевантом. Они предположили, что: 1) Хромосома представляет собой линейную структуру. 2) Гены в хромосоме расположены линейно, как бусины на нитке. 3) Точка пересечения хромосом при кроссинговере лежит в любом месте хромосом.
 
Из этих предположений можно сделать вывод, что чем дальше гены расположены друг от друга, тем чаще будет наблюдаться кроссинговер, чем гены ближе друг к другу, тем кроссинговер будет наблюдаться реже. Если гены лежат на разных концах хромосомы, то при каждом перекрещивании гены разойдутся в разные хромосомы, но если гены расположены близко друг к другу, то кроссинговер будет происходить только если точка перекреста хромосом окажется на коротком участке, находящемся между ними между ними, то есть редко.
 
Если изучать кроссинговер трех генов, то можно определить расстояние между ними по частоте кроссинговеров. Морган скрещивал самок дрозофил с рецессивными генами w (белые глаза), y (желтый цвет тела)и bi (вильчатые крылья). При этом частота кроссинговеров между генами y и w составила 1,2 %, между генами w и bi — 3,5 %, между генами y и bi — 4,7 %. Из этого можно сделать вывод, что ген w находится между генами y и bi, причем расстояние между данными генами пропорционально проценту кроссинговеров меду ними.
 
==== Н. К. Кольцов предсказал, что наследственная информация записана на молекулярном уровне, а наследственные молекулы размножаются в помощью матричного принципа ====
В 1927 году [[w:Кольцов, Николай Константинович|Н. К. Кольцов]], выступая с докладом, прибавил к двум уже существующим биологическим принципам («Omne vivum ex ovo», «Omnis cellula ex cellula») третий — «Omnis molecula ex molecula» — «Всякая молекула от молекулы». Речь шла о «наследственных молекулах», которые, как считал Кольцов, несут наследственную информацию. По представлениям Кольцова, «наследственные молекулы» — это [[w:белок|белковые макромолекулы]] огромной длины; информация в них шифруется последовательностью [[w:аминокислоты|аминокислот]]. При удвоении хромосом информация копируется по матричному принципу: исходная молекула служит матрицей, по которой строится её копия. В том, что наследственная информация закодирована в белках, Кольцов ошибся (одной из причин этого было кажущееся исчезновение [[w:ДНК|ДНК]] при позднем [[w:овогенез|овогенезе]] и в гигантских [[w:хромосома|хромосомах]]). Зато в том, что «наследственная молекула» удваивается по матричному принципу, он оказался прав.
 
==== Э. Шрёдингер стимулировал интерес биологов к физической природе наследственности ====
[[w:Шрёдингер, Эривн|Эрвин Шрёдингер]] — один из создателей [[ w: квантовая физика | квантовой механики ]] — в 1944 г. написал книгу «Что такое жизнь? С точки зрения физика». В этой книге автор подробно описывает строение [[ w: хромосомы | хромосом ]] и их функцию. Он подробно разобрал явление [[ w:мутация|мутаций]] и их причины. Также он разработал некоторые положения теории наследственности. Вот некоторые выдержки из его книги:
«Именно эти хромосомы или, возможно, только осевая или скелетная нить того, что мы видим под микроскопом как хромосому, содержат в виде своего рода шифровального кода весь „план“ будущего развития индивидуума и его функционирования в зрелом состоянии. Каждый полный набор хромосом содержит весь шифр, поэтому, как правило, имеются две копии последнего в оплодотворенной яйцеклетке, которая представляет самую раннюю стадию будущего индивидуума…»
 
«Называя структуру хромосомных нитей шифровальным кодом, мы подразумеваем, что всеохватывающий ум, вроде такого, который некогда представлял себе Лаплас и которому каждая причинная связь непосредственно открыта, мог бы, исходя из структуры хромосом, сказать, разовьется ли яйцо при благоприятных условиях в черного петуха или в крапчатую курицу, в муху или растение маиса, в рододендрон, жука, мышь или человека…»
 
По этим цитатам видно, что Шредингер разбирал темы, которые раньше почти не затрагивались биологической теорией. Здесь Шредингер впервые использует для хромосом термин «наследственный шифровальный код». Шрёдингер был знаменитым физиком, и его книга вызвала неподдельный интерес у других представителей естественных наук, в том числе у биологов, хотя многие не сразу оценили ее значение.
 
[http://www.i-u.ru/biblio/archive/shredinger_chto/] Э.Шредингер. Что такое жизнь? С точки зрения физика. (Русский перевод)
 
==== Ф. Гриффит открыл трансформацию: вещества убитых бактерий могут вызывать изменение наследственных свойств других штаммов, проникая в их клетки ====
[[Файл:Griffith experiment.svg|thumb|450px|right|Схема опыта Гриффита. Rough strain — шероховатый штамм ([[w:вирулентность|невирулентный]]), smooth strain — гладкий штамм (вирулентный)]].
 
[[Файл:Fred Griffith and "Bobby" 1936.jpg|thumb|right|190px|Фредерик Гриффит, 1936.]]
 
Немецкий бактериолог Фред Нойфельд впервые описал [[w:штамм|штаммы пневмококка]] ''Streptococcus pneumoniae''. Среди колоний [[w:Вирулентность|вирулентных]] (способных вызывать заболевание) пневмококков, имеющих гладкую поверхность ([[w:штамм|R-штамм]]) изредка в результате мутации появляются шероховатые колонии невирулентного S-штамма. Утрата болезнетворности связана с тем, что мутантные пневмококки не синтезируют полисахаридную капсулу. Сейчас известно, что полисахаридная капсула препятствует [[w:опсонизация|опсонизации]] и последующему [[w:фагоцитоз|фагоцитированию]] бактерий.
 
До эпохи [[w:антибиотик|антибиотиков]] пневмония была грозной, часто смертельной болезнью. Нужно отметить, что и сегодня пневмония занимает одно из первых мест среди инфекционных болезней как причина смертности. В наши дни существует и в некоторых странах широко применяется вакцина от пневмонии.
 
Английский врач и генетик Фредерик Гриффит начал опыты, приведшие к открытию трансформации, а надежде получить [[w:вакцина|вакцину]] от [[w:пневмония|пневмонии]]. Пневмококки — один из самых обычных возбудителей, которые вызывают эту болезнь. Результаты своих экспериментов Ф. Гриффит опубликовал в 1928 году.
 
[[w:Гриффит, Фредерик|Гриффит]] брал два [[w:штамм|штамма]] [[w:пневмококки|пневмококков]]: капсульный и бескапсульный. Капсульный — патогенный ([[w:патогенность|болезнетворный]]), при [[w:инфекция|инфицировании]] таким штаммом [[w:мышь|мыши]] погибают через 1-2 дня, бескапсульный — непатогенный. При введении мышам смеси убитых нагреванием (и, следовательно, потерявших болезнетворность) капсульных пневмококков и живых бескапсульных (непатогенных) бактерий животные погибали в результате размножения в их организме капсульных болезнетворных форм.
 
Следовательно, убитые пневмококки с капсулой каким-то образом передавали свой наследственный признак (способность синтезировать капсулу) бескапсульному штамму. Эта способность сохранялась и у последующих поколений при разведении. Обнаруженное явление Гриффит назвал [[w:трансформация (генетика)|трансформацией]].
 
Описание опытов Гриффита:
 
1) После заражения [[w:пневмококк|пневмококками]] капсульного патогенного(штамма мыши погибают. Капсульные пневмококки размножаются в их крови и могут быть выделены в чистую культуру.
 
2) При инфицировании пневмококками бескапсульного непатогенного штамма животные не погибают. Бескапсульные пневмококки уничтожаются иммунной системой мыши и не обнаруживаются в её крови.
 
3) После заражения пневмококками капсульного патогенного штамма, предварительно убитыми нагреванием, мыши не погибают. Убитые пневмококки, естественно, не размножаются.
 
4) При введении мышам одновременно бескапсульных неболезнетворных пневмококков и капсульных, убитых нагреванием, животные погибают. Бескапсульные пневмококки становятся капсульными и размножаются в организме мыши. выделенные из её организма в чистую культуру, они и в последующих попоклениях сохраняют способность синтезировать капсулу.
 
Бескапсульные неболезнетворные пневмококки приобрели наследуемый признак убитых капсульных бактерий — произошла [[w:трансформация (генетика)|трансформация]].
 
В 1941 г Ф. Гриффит погиб в своей лаборатории в пригороде Лондона во время бомбежки.
 
До исследований Гриффита бактериологи полагали, что [[w:штамм|штаммы]] не изменяются от поколения к поколению. Данные, полученные Гриффитом, позднее были подтверждены Фредом Нойфельдом в Институте Коха и Мартином Генри Доусоном в Институте Рокфеллера. Мартин Генри совместно с Ричардом Сиа разработал метод трансформации клеток бактерий [[w:in vitro|in vitro]] ([[w:эксперимент Гриффитса|эксперимент Гриффита]] был проделан в условиях [[w:in vivo|in vivo]]). После отъезда Доусона в 1930 году Джеймс Эллоуэй в 1933 году предпринял попытки продолжить исследования Гриффитса и получить водный экстракт трансформирующего агента. Колин Маклеод работал над выделением этих водных растворов с 1934 по 1937 год, исследования по выделению фракций были продолжены в 1940 году и завершены Маклином Маккарти.
 
В 1944 г. эта серия экспериментов была завершена [[w:Эйвери, Освальд|Освальдом Эйвери]], [[w:Мак-Леод, Колин|Колином МакЛеодом]] и [[w:Мак-Карти, Маклин|Маклином МакКарти]]. Они смешивали бескапсульных пневмококков со взятыми от капсульных [[w:белки|белками]], [[w:полисахарид|полисахаридами]] или [[w:ДНК|ДНК]]. При введении смеси из бескапсульных пневмококков и белков или полисахаридов животные оставались живы; значит, наследственная информация в них не содержится. А при введении смеси из бескапсульных пневмококков и ДНК мыши умирали; значит, именно в ДНК и записана информация, определяющая способность синтезировать капсулу.
 
==== Опыт Эйвери, МакЛеода и МакКарти доказал, что трансформирующее начало — ДНК ====
[[w:Эксперимент|Эксперимент]] [[w:Освальд Эвери|Освальда Эвери]], [[w: Маклеод, Колин|Колина Маклеод]] и [[w:Маккарти, Маклин|Маклина Маккарти]], проиведенный в 1944 году, доказал что [[w:ДНК|ДНК]] является веществом, вызывающим [[w:трансформация|трансформацию]] [[w:клетка|клеток]] [[w:бактерия|бактерий]], то есть передает некоторый наследственный признак.
 
[[w:Эксперимент Эвери, Маклеода и Маккарти|Эксперимент Эвери, Маклеода и Маккарти]] стал кульминацией исследований, проводившихся в Рокфеллеровском институте медицинских исследований в 1930-х — 1940-х годах и начатых [[w:Эксперимент Гриффита|экспериментом Гриффита]] в 1928 году. В эксперименте Гриффита убитые [[w:пневмококки|пневмококки]] штамма III-S (обладают олигосахаридной капсулой, [[w:вирулентность|вирулентные]]), введенные в [[w:кровь|кровь]] [[w:мышь|мыши]] с живыми пневмококками штамма II-R (безкапсульные, невирулентные), вызывали инфекцию типа III-S (мышь погибала).
В статье, опубликованной в феврале 1944 года в Журнале экспериментальной медицины, Эвери с соавторами показали, что ДНК, но не [[w:белки|белки]] являются веществом, отвечающим за передачу наследственных признаков у бактерий.
 
 
[[Файл:Oswald T. Avery portrait 1937.jpg|thumb|150px|[[w:Освальд Эвери|Освальд Эвери]]]]
 
В ходе эксперимента болезнетворные пневмококки, имеющие капсулу, были убиты нагреванием. Для выделения ДНК было произведено осаждение белков [[w:хлороформ|хлороформом]]. [[w:Полисахаридные капсулы|Полисахаридные капсулы]], обуславливающие вредные свойства бактерий, были [[w:гидролиз|гидролизованы]] специфичным [[w:фермент|ферментом]]. Из оставшейся части экстракта были выделены прозрачные тяжи. Химический анализ показал, что соотношение в них [[w:атом|атомов]] [[w:углерод|углерода]], [[w:водород|водорода]], [[w:азот|азота]] и [[w:фосфор|фосфора]] соответствует соотношению этих же атомов в молекуле [[w:ДНК|ДНК]]. Для подтверждения того, что действующим началом трансформации является именно [[w:ДНК|ДНК]], а не [[w:РНК|РНК]], белки или другие компоненты клетки, Эвери с сотрудниками добавляли к выделенному веществу [[w:трипсин|трипсин]] (расщепляет [[w:пептиды|пептиды]] и [[w:белки|белки]]) и [[w:рибонуклеаза|рибонуклеазу]] (разрушает [[w:РНК|РНК]]), но это никак не влияло на трансформирующие свойства. Лишь обработка [[w:ДНКаза|ДНКазой]] (разрушает [[w:ДНК|ДНК]]) приводила к разрушению трансформирующего начала.
 
==== Опыт Херши и Чейз: при заражении бактерий бактериофаг вводит внутрь клетки ДНК, но не белки ====
'''[[w:Эксперимент Херши — Чейз|Эксперимент Херши—Чейз]]''' окончательно доказал, что носитель генетической информации — это [[w:ДНК|ДНК]]. Эксперимент состоял из серии опытов, которые были проведены в 1952 году американскими [[w:Генетика|генетиками]] [[w:Херши, Алфред|Алфредом Херши]] и Мартой Коулз Чейз. Хотя ДНК была известна ещё с 1869 года, ко времени эксперимента многие учёные считали, что наследственная информация находится в [[w:Белки|белках]].
 
[[Файл:HersheyChaseEx.png|300px|thumb|Схема эскперимента Херши—Чейз.]]
Эксперимент проводился на [[w:бактериофаг|бактериофаге]] T2, структура которого к тому времени была выяснена с помощью электронной микроскопии. Оказалось, что бактериофаг состоит из белковой оболочки, внутри которой находится ДНК. Эксперимент был спланирован таким образом, чтобы выяснить, что же — белок или ДНК — является носителем наследственной информации.
 
Херши и Чейз выращивали две группы [[w:Бактерии|бактерий]]: одну в среде, содержащей радиоактивный [[w:фосфор|фосфор]]-32 в составе фосфат-иона, другую — в среде с радиоактивной [[w:Сера|серой]]-35 в составе сульфат-иона. Бактериофаги, добавленные в среду с бактериями и размножавшиеся в них, поглощали эти радиоактивные изотопы, которые служили маркёрами, при построении своей ДНК и белков. Фосфор содержится в ДНК, но отсутствует в белках, а сера, наоборот, содержится в белках (точнее в двух [[w:аминокислота|аминокислотах]]: [[w:цистеин|цистеин]] и [[w:метионин|метионин]]), но её нет в ДНК. Таким образом, одни бактериофаги содержали меченые серой белки, а другие — меченую фосфором ДНК.
 
После выделения радиоактивно-меченых бактериофагов их добавляли к культуре свежих (не содержащих изотопов) бактерий и позволяли бактериофагам инфицировать эти бактерии. После этого среду с бактериями подвергали энергичному встряхиванию в специальном смесителе (было показано, что при этом оболочки фага отделяются от поверхности бактериальных клеток), а затем инфицированных бактерий отделяли от среды. Когда в первом опыте к бактериям добавлялись меченые фосфором-32 бактериофаги, оказалось, что радиоактивная метка находилась в бактериальных клетках. Когда же во втором опыте к бактериям добавлялись бактериофаги, меченые серой-35, то метка была обнаружена во фракции среды с белковыми оболочками, но её не было в бактериальных клетках. Это подтвердило, что '''<big>материалом, которым инфицировались бактерии, является ДНК</big>'''. Поскольку внутри инфицированных бактерий формируются полные вирусные частицы, содержащие белки вируса, данный опыт был признан одним из решающих доказательств того факта, что генетическая информация (информация о структуре белков) содержится в ДНК.
 
В 1969 году Алфред Херши получил [[w:Нобелевская премия по физиологии и медицине|Нобелевскую премию]] за открытия генетической структуры вирусов.
 
[http://www.sinauer.com/cooper/4e/animations0401.html] Анимация «Опыт Эйвери, Маклеода и Маккарти (трансформирующее начало — это ДНК)» (англ.)
 
=== Строение двойной спирали ДНК ===
 
==== Мономеры ДНК — дезоксирибонуклеотиды ====
Дезоксирибонуклеотиды — мономеры [[w:дезоксирибонуклеиновая кислота|ДНК]]. Каждый дезоксирибонуклеотид состоит из [[w:азотистые основания|азотистого основания]], остатка фосфорной кислоты и пятиуглеродного сахара (дезоксирибозы).[[Файл:Desoxyadenosinmonophosphat protoniert.svg|thumb|Дезоксиаденозинмонофосфат.]] Они отличаются от рибонуклеотидов строением пятиуглеродного сахара ([[w:дезоксирибоза|дезоксирибоза]] или [[w:рибоза|рибоза]]). Между собой дезоксирибонуклеотиды отличаются только азотистыми основаниями ([[w:аденин|аденин]], [[w:гуанин|гуанин]], [[w:цитозин|цитозин]], [[w:тимин|тимин]]), которые присоединяются к 1' атому дезоксирибозы [[w:ковалентная связь|ковалентной связью]]. Дезоксирибонуклеотиды одной цепи соединены между собой ковалентной связью, возникающей между фосфатной группой одного и 3' атомом углерода другого дезоксирибонуклеотида. Между азотистыми основаниями дезоксирибонуклеотидов двух разных цепочек образуется три или две [[w:водородная связь|водородные связи]] (гуанин связывается с цитозином тремя связями, а аденин с тимином двумя).
 
==== Азотистые основания нуклеотидов ДНК — аденин, гуанин, тимин и цитозин ====
К азотистым основаниям относят аденин (A), гуанин (G), цитозин (C) и тимин (T), который входит в состав только ДНК, а урацил (U) заменяет его в РНК. Они обладают схожими структурами и химическими свойствами.
Это [[w:гетероциклические соединения|гетероциклические]] органические соединения, производные пиримидина и пурина, входящие в состав нуклеотидов. Аденин и гуанин — производные пурина, а цитозин, урацил и тимин — производные пиримидина.
 
Когда азотистые основания присоединяются [[w:ковалентная связь|ковалентной связью]] к 1' атомам [[w:рибоза|рибозы]] (в РНК) или [[w:дезоксирибоза|дезоксирибозы]] (в ДНК), а к 5'-гидроксильной группе сахара присоединяется одна или несколько фосфатных групп, образуются [[w:нуклеотиды|нуклеотиды]].
 
стандартные нуклеотиды ДНК составляют триплеты — участки ДНК, кодирующие одну аминокислоту. Например, с [[w:триплет(биология)|триплета]] АУГ (ему соответствует [[w:аминокислота|аминокислота]] [[w:метионин|метионин]]) обычно начинается синтез белка на рибосомах.
 
В таблице приведена структура главных азотистых оснований.
{| border="1" cellpadding="2" cellspacing="0" align="none" style="margin-left:1em"
|- align="center" valign="bottom"
| '''Азотистое <br /> основание'''|| [[Файл:Adenine.svg|58px|Структурная формула аденина]]<br />[[w:Аденин|Аденин]]|| [[Файл:Guanine chemical structure.png|86px|Структурная формула гуанина]]<br />[[w:Гуанин|Гуанин]]|| [[Файл:Thymine chemical structure.png|63px|Структурная формула тимина]]<br />[[w:Тимин|Тимин]]|| [[Файл:Cytosine chemical structure.png|51px|Структурная формула цитозина]]<br />[[w:Цитозин|Цитозин]]|| [[Файл:Uracil chemical structure.png|51px|Структурная формула урацила]]<br />[[w:урацил|урацил]]
|- align="center" valign="bottom"
| '''Нуклеозид'''|| [[Файл:Adenosin.svg|95px|Структурная формула аденозина]]<br />[[w:Аденозин|Аденозин]]<br />A || [[Файл:G chemical structure.png|123px|Структурная формула гуанозина]]<br />[[w:Гуанозин|Гуанозин]]<br />G || [[Файл:T chemical structure.png|87px|Структурная формула тимидина]]<br />[[w:Тимидин|Тимидин]]<br />T || [[Файл:C chemical structure.png|87px|Структурная формула цитидина]]<br />[[w:Цитидин|Цитидин]]<br />C || [[Файл:U chemical structure.png|87px|Структурная формула уридина]]<br />[[w:Уридин|Уридин]]<br />U
|-
|}
 
Нуклеозиды, приведённые в таблице, входят в состав моно-, ди- и трифосфатов. Например, аденозин входит в состав [[w:АТФ|АТФ]] — важнейшего энергетического ресурса организма.
 
'''[[w:пурин|Пуринs]]''' C<sub>5</sub>N<sub>4</sub>H<sub>4</sub> — гетероциклические соединения, [[w:имидазол|имидазольные]] производные [[w:пиримидин|пиримидинов]].
Производные пурина играют важную роль в химии природных соединений (пуриновые основания ДНК и РНК; [[w:НАД|кофермент NAD]]; [[w:алкалоиды|алкалоиды]], [[w:кофеин|кофеин]] и т. д.) и, благодаря этому, в фармацевтике — ядро пурина входит в состав некоторых антибиотиков. Пурин и ряд его производных обладают противоопухолевой, противовирусной и противоаллергической активностью.
 
В таблице приведены производные пурина.
 
 
[[Файл:purines.gif]]
 
 
 
 
'''Аденин''' — азотистое основание, аминопроизводное пурина. Образует две водородных связи с урацилом (в РНК) и тимином (в ДНК) по правилу комплементарности.
 
Представляет собой бесцветные кристаллы. Химическая формула С<sub>5</sub>H<sub>5</sub>N<sub>5</sub>. Аденин проявляет основные свойства.
 
Аденин входит в состав многих жизненно важных для живых организмов соединений, таких как аденозин, аденозинфосфорные кислоты, нуклеиновые кислоты, адениновые нуклеотиды и др. В виде этих соединений аденин широко распространен в живой природе.
 
'''Гуанин''' — азотистое основание, аминопроизводное пурина, является составной частью нуклеиновых кислот. Химическая формула — C<sub>5</sub>H<sub>5</sub>N<sub>5</sub>O.
 
В ДНК и РНК образует три водородные связи с цитозином по правилу комплементарности. Производные гуанилового нуклеотида — ГДФ, ГТФ и цАМФ — участвуют во многих [[w:гормоны|сигнальных путях клетки]]. Для некоторых процессов, происходящих в клетке — например, для сборки [[w:микротрубочки|микротрубочек]] — [[w:ГТФ|ГТФ]] используется как источник энергии.
 
'''[[w:пиримидин|Пиримидин]]''' C<sub>4</sub>N<sub>2</sub>H<sub>4</sub> — гетероциклическое соединение, имеющее плоскую молекулу, простейший представитель [[w:диазины|диазинов]].
 
Пиримидин представляет собой бесцветные кристаллы с характерным запахом. Пиримидин проявляет свойства слабого двукислотного основания, так как атомы азота могут присоединять протоны.
Производные пиримидина широко распространены в живой природе, где участвуют во многих важных биологических процессах. Его производные цитозин, тимин, урацил входят в состав нуклеотидов.
 
Биологическая роль пиримидинов не ограничена нуклеиновыми кислотами. Некоторые пиримидиновые нуклеотиды играют важную роль в процессах обмена [[w:углеводы|углеводов]] и [[w:липиды|липидов]]. [[w:тиамин|Витамин В1]] (тиамин) — пиримидиновое производное. Пиримидиновое ядро входит в состав некоторых [[w:коферменты|коферментов]] и [[w:антибиотики|антибиотиков]].
 
'''Тимин''' — производное пиримидина. Формула C<sub>5</sub>H<sub>6</sub>N<sub>2</sub>O<sub>2</sub>.
 
Присутствует во всех живых организмах, где вместе с дезоксирибозой входит в состав нуклеозида тимидина, который может фосфорилироваться 1-3 остатками фосфорной кислоты с образованием нуклеотидов тимидин моно-, ди- или трифосфорной кислоты (ТМФ, ТДФ и ТТФ).
 
Дезоксирибонуклеотиды тимина входят в состав ДНК, в РНК на его месте располагается рибонуклеотид урацила. Тимин комплементарен аденину, образует с ним 2 [[w:водородная связь|водородные связи]].
 
'''Цитозин''' — азотистое основание, производное пиримидина. С рибозой образует нуклеозид цитидин, входит в состав нуклеотидов ДНК и РНК. Во время [[w:репликация|репликации]] и [[w:транскрипция|транскрипции]] по правилу комплементарности образует три водородных связи с гуанином.
 
Представляет собой бесцветные кристаллы. Химическая формула C<sub>4</sub>H<sub>5</sub>N<sub>3</sub>O. Его производные цитозин, тимин, урацил входят в состав нуклеотидов, проявляет основные свойства.
 
'''Урацил''' — пиримидиновое основание, которое является компонентом рибонуклеиновых кислот (РНК) и, как правило, отсутствует в дезоксирибонуклеиновых кислотах (ДНК). В составе РНК может комплементарно связываться с аденином, образуя две водородные связи.
 
==== Эрвин Чаргафф открыл правила, описывающие количественные соотношения нуклеотидов ====
Правило Чаргаффа — биологический закон, в соответствии с которым установлены количественные соотношения между азотистыми основаниями разных типов.
Для того, чтобы определить точные количественные соотношения нуклеотидов, Чаргафф разделил нуклеотиды ДНК методом бумажной хроматографии. Ему удалось выявить три закономерности:
* Число аденинов равно числу тиминов, а число гуанинов — числу цитозинов: А=Т, Г=Ц
* Число пуринов равно числу пиримидинов: А+Г=Т+Ц
* Число аденина и цитозина равно числу гуанина и тимина: А+Ц=Г+Т
 
Состав ДНК разных организмов различается суммарным числом комплементарных оснований. Соотношение комплементарных нуклеотидов тоже может быть различным в разных молекулах ДНК. У одних оорганизмов в ДНК преобладают пары аденин-тимин, а у других — гуанин-цитозин. При этом правила Чаргаффа будут выполняться в любом случае.
 
; Вопрос
: Если в ДНК содержится 21 % аденина, то какова долю (%) остальных нуклеотидов, содержащихся в ДНК?
 
==== Данные рентгеноструктурного анализа показали, что молекулы ДНК имеют спиральную структуру ====
В 50-х годах 20 века многие химики и биологи пытались исследовать структуру ДНК. В Королевском колледже в Лондоне '''Морис Уилкинс''' и '''Розалинда Франклин''' пытались решить эту проблему '''методом рентгеноструктурного анализа солей ДНК.''' Но такой способ позволял выявить только общую структуру молекулы.
Тем временем '''Джеймс Уотсон''' и '''Френсис Крик''' в Кавендишской лаборатории Кембриджского университета, используя данные, полученные М. Уилкинсом, стали строить пространственные 3-D модели ДНК. Они пытались создать структуру, которая согласовывалась бы со всеми данными рентгеноструктурного анализа. В итоге Уотсон и Крик пришли к выводу, что '''ДНК имеет спиральную структуру с периодичностью 0,34 нм вдоль оси.'''
 
==== В 1953 году [[w:Уотсон, Джеймс|Дж. Уотсон]] и [[w:Крик, Фрэнсис|Ф. Крик]] открыли строение [[w:ДНК|ДНК]], предложив модель двойной спирали ====
 
[[w:Нуклеиновые кислоты|Нуклеиновые кислоты]], подобно [[w:Белки|белкам]], обладают первичной структурой (под которой подразумевается их нуклеотидная последовательность) и трехмерной структурой. Интерес к структуре [[w:ДНК|ДНК]] усилился, когда в начале XX века возникло предположение, что [[w:ДНК|ДНК]], возможно, представляет собой [[w:Ген|генетический материал]].
 
В начале 50-х годов американский химик, лауреат Нобелевской премии Лайнус Полинг, уже изучивший к тому времени α-спиральную структуру, характерную для многих [[w: Фибриллярные белки|фибриллярных белков]], обратился к исследованию структуры ДНК, которая по имеющимся в то время сведениям также представлялась фибриллярной молекулой. Одновременно в Королевском колледже [[w:Уилкинс, Морис|Морис Уилкинс ]] и [[w:Франклин, Розалинд|Розалинда Франклин]] пытались решить ту же проблему методом рентгеноструктурного анализа. Их исследования требовали долгой и трудоёмкой работы по приготовлению чистых препаратов солей [[w:ДНК|ДНК]], для которых удавалось получать сложные дифракционные картины. С помощью этих картин можно было, однако, выявить лишь общую структуру молекулы [[w:ДНК|ДНК]], не столь детализированную, как та, которую позволяли получить чистые кристаллы белка.
 
Тем временем [[w:Крик, Фрэнсис|Фрэнсис Крик]] и [[w:Уотсон, Джеймс|Джеймс Уотсон]] в Кавендишской лаборатории Кембриджского университета избрали иной подход, который в конечном счёте и обеспечил успешное решение проблемы. Используя все физические и химические данные, какие оказались в их распоряжении, Уотсон и Крик стали строить пространственные модели [[w:ДНК|ДНК]] в надежде на то, что рано или поздно им удастся получить достаточно убедительную структуру, согласующуюся со всеми этими данными. Истории их поисков увлекательно описаны Уотсоном в его книге «Двойная спираль»[http://www.chem.msu.su/rus/books/watson/welcome.html].
 
Два обстоятельства оказались для [[w:Уотсон, Джеймс|Уотсона]] и [[w:Крик, Фрэнсис|Крика]] решающими. Во-первых, они имели возможность регулярно знакомиться с результатами работ [[w:Уилкинс, Морис|Уилкинса]] и, сопоставляя с его рентгенограммами свои модели, могли таким образом проверять эти модели. А рентгенограммы Уилкинса свидетельствовали в пользу спиральной структуры с периодичностью 0,34 нм вдоль оси. Во-вторых, Уотсон и Крик отдавали себе отчёт в важном значении закономерностей, касающихся соотношения различных оснований в ДНК. Обнаружил эти закономерности и сообщил о них в 1951 году [[w:Правила Чаргаффа| Эрвин Чаргафф]]. Это открытие, однако, при всей своей важности не привлекло к себе должного внимания.
 
Уотсон и Крик задались целью проверить предположение, что молекула [[w:ДНК|ДНК]] состоит из двух спиральных полинуклеотидных цепей, удерживаемых вместе благодаря спариванию [[w:Азотистые основания|оснований]], принадлежащих соседним цепям. Основания удерживаются вместе [[w:Водородная связь|водородными связями]]. [[w:Аденин|Аденин]] спаривается с [[w:Тимин|тимином]], [[w:Гуанин|гуанин]] — с [[w:Цитозин|цитозином]]; АТ-пара соединяется двумя водородными связями, а ГЦ-пара — тремя. Уотсон попытался представить себе такой порядок спаривания оснований и позже вспоминал об этом так: «От радости я почувствовал себя на седьмом небе, ибо тут я уловил возможный ответ на мучившую нас загадку: почему число остатков пуринов в точности равно числу остатков пиримидинов?»
 
Уотсон увидел, что при таком сочетании основания оказываются очень точно подогнанными друг к другу, а общий размер и форма этих двух пар оснований одинаковы, так как обе пары содержат по три кольца. Водородные связи при других сочетаниях оснований в принципе возможны, но они гораздо слабее. После того как все эти обстоятельства выяснились, можно было наконец приступить к созданию достоверной модели ДНК.
 
Уотсон и Крик показали, что [[w:ДНК|ДНК]] состоит из двух антипараллельных (направленных в противоположные стороны) полинуклеотидных цепей. Каждая цепь закручена в спираль вправо, и обе они свиты вместе, то есть закручены вправо вокруг одной и той же оси, образуя двойную спираль. Каждая цепь состоит из сахарофосфатного остова, вдоль которого перпендикулярно длинной оси спирали располагаются азотистые основания. Находящиеся друг против друга основания двух противоположных цепей двойной спирали связаны между собой водородными связями. Расстояние между сахарофосфатными остовами двух цепей постоянно и равно расстоянию, занимаемому парой оснований, то есть одним [[w:Пурин|пурином]] и одним [[w:Пиримидин|пиримидином]]. Два пурина занимали бы слишком много места, а два пиримидина — слишком мало для того, чтобы заполнить промежутки между двумя цепями. Вдоль оси молекулы соседние пары оснований располагаются на расстоянии 0,34 нм одна от другой, чем и объясняется обнаруженная на рентгенограммах периодичность. Полный оборот спирали приходится на 3,4 нм, то есть на 10 пар оснований. Никаких ограничений относительно последовательности нуклеотидов в одной цепи не существует, но в силу правила спариваний оснований эта последовательность в одной цепи определяет собой последовательность нуклеотидов в другой цепи. Поэтому мы говорим, что две цепи двойной спирали комплементарны друг другу.
 
Уотсон и Крик опубликовали сообщение о своей модели ДНК в журнале «Nature» в 1953 г., а в 1962 г. они вместе с [[w:Уилкинс, Морис|Морисом Уилкинсом]] были удостоены за эту работу Нобелевской премии. Розалинду Франклин, умершую от рака ранее присуждения этой премии, не включили в число лауреатов, поскольку [[w:Нобелевская премия|Нобелевская премия]] посмертно не присуждается.
 
Для того чтобы признать, что имеющая предложенную структуру молекула может выполнять роль генетического материала, требовалось показать, что она способна: 1) нести в себе закодированную информацию и 2) точно воспроизводиться ([[w:Репликация ДНК|реплицироваться]]). Уотсон и Крик отдавали себе отчет в том, что их модель удовлетворяет этим требованиям. В конце своей первой статьи они отметили: «От нашего внимания не ускользнуло, что постулированное нами специфическое спаривание оснований сразу же позволяет постулировать и возможный механизм копирования для генетического материала». Во второй статье, опубликованной в том же 1953 году, они обсудили выводы, которые следовали из их модели для возможного механизма передачи наследственной информации. Это открытие показало, сколь явно структура может быть связана с функцией уже на молекулярном уровне. Оно дало начало стремительному развитию [[w:Молекулярная биология|молекулярной биологии]].
 
[http://www.chem.msu.su/rus/books/watson/welcome.html]Дж. Уотсон. Двойная спираль. (русский перевод).
 
=== Удвоение ДНК ===
 
==== Удвоение ДНК — матричный синтез ====
[[Файл:DNA polymerase.svg|thumb|350px]]
'''Матричный биосинтез''' — запрограммированный с помощью [[w:нуклеиновые кислоты|нуклеиновых кислот (НК)]] процесс сборки новых цепей полимеров (нуклеиновые кислоты, используемые как программы в матричном биосинтезе, называют матрицами).
Реакции матричного биосинтеза:
* реакция синтеза РНК на ДНК
* удвоение ДНК
* синтез белка на матрице иРНК
 
Значение реакции матричного синтеза:
* способность к воспроизведению себе подобных
 
[[w:Репликация ДНК|Репликация ДНК]] — это процесс синтеза дочерней молекулы ДНК. Он происходит в процессе деления клетки на матрице родительской молекулы ДНК. Генетический материал, заключенный в ДНК, удваивается и делится между дочерними клетками. Репликацию ДНК осуществляет специальный фермент — [[w:ДНК-полимераза|ДНК-полимераза]]. Цепи ДНК расходятся, и каждая из них становится матрицей. Каждая синтезированная молекула ДНК состоит из одной цепи родительской молекулы и одной вновь синтезированной цепи. Такой механизм удвоения называется полуконсервативным.
 
==== Удвоение ДНК — полуконсервативная репликация ====
Уотсон и Крик предположили, что удвоение ДНК происходит по полуконсервативному механизму. Это означает, что каждой новой двойной спирали одна цепь нуклеотидов достаётся от старой, а вторая цепь достраивается заново. В 1958 г этот механизм был подтвержден в [[w:Эксперимент Мезельсона-Сталя|опыте Месельсона и Сталя]].
 
[[Файл:Meselson-Stahl-Versuch-Schema.svg|thumb|Распределение ДНК в последовательных поколениях после переноса на среду с легким изотопом азота]]
 
Каждая молекула ДНК содержит множество атомов [[w:азот|азота]]. Наиболее распространён [[w:изотоп|изотоп]] азота <sup>14</sup>N. Существует также изотоп <sup>15</sup>N, он не радиоактивен, а лишь тяжелее <sup>14</sup>N. Содержащие тяжелый изотоп молекулы ДНК функциональны и могут удваиваться.
 
Были выращены несколько поколений [[w:E. coli|E. coli]] в среде, где в качестве источника азота присутствовали соли аммония, содержащие тяжелый изотоп <sup>15</sup>N. Затем их ДНК была выделена и центрифугирована в градиенте плотность [[w:CsCl|CsCl]]. Каждая молекула ДНК останавливалась на том уровне в пробирке, где её плотность совпадает с плотностью раствора соли.
<small>При длительном центрифугировании с ускорением около 10.000 g ионы цезия и хлора распределяются в пробирке неравномерно — у дна их концентрация повышается.</small>
 
ДНК [[w:бактерия|бактерий]], выращенных в <sup>15</sup>N среде, была более тяжёлой. Эти бактерии затем были помещены обратно в <sup>14</sup>N среду, где им было позволено разделится только один раз. Затем из клеток были извлечена ДНК, её плавучая плотность оказалась больше плавучей плотности ДНК бактерий, выращенных в среде, богатой <sup>14</sup>N, но меньше плавучей плотности ДНК бактерий, выращенных в <sup>15</sup>N среде. Это противоречило гипотезе о консервативном характере репликации ДНК, когда одна дочерняя клетка получает материнскую ДНК, а вторая — вновь синтезированную, обе цепи которой — новые, так как в этом случае ДНК разделилась бы на две фракции — лёгкую, содержащую атомы <sup>14</sup>N, и тяжёлую, содержащую <sup>15</sup>N.
 
Однако этот результат не исключал дисперсный механизм репликации, когда куски материнской ДНК распределяются между дочерними ДНК случайным образом. Поэтому было выращено второе поколение бактерий, и их ДНК также была отцентрифугирована в градиенте хлористого цезия. Выяснилось, что клетки содержат в равном количестве как полностью «лёгкие» ДНК, так и «гибридные». Этот факт позволил исключить [[w:Гипотеза|гипотезу]] дисперсного механизма репликации.
 
; Задание 1
: Для проведения этого эксперимента потребовалось получить синхронизированную культуру бактерий — такую культуру, в которой все клетки делятся одновременно. Как вы думаете, зачем?
; Задание 2
: Придумайте способы, с помощью которых можно получить такую культуру. Затем найдите в литературе данные о том, как в действительности получают синхронизированные культуры.
; Задание 3
: Предскажите результаты, которые получили бы Месельсон и Сталь в случае а) консервативного и б) дисперсного механизмов удвоения ДНК, Нарисуйте, как выглядело бы распределение ДНК в градиенте хлористого цезия через одно, два и три деления после переноса в среду с легким изотопом азота в случаях а) и б).
 
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/meselson.html] Анимация «Полуконсервативная репликация ДНК — опыт Месельсона и Сталя» (англ. текст)
 
==== Источником энергии для удвоения ДНК служат макроэргические связи трифосфатнуклеотидов ====
[[Файл:ATP structure.svg|thumb|right|Структура АТФ]]
 
Молекулы [[w:нуклеотиды|трифосфатнуклеотидов]] ([[w:АТФ|АТФ]], [[w:ГТФ|ГТФ]], ЦТФ, ТТФ) состоят из азотистого основания, сахара дезоксирибозы и трёх остатков [[w:ортофосфорная кислота|ортофосфорной кислоты]].
 
Трифосфатнуклеотиды относятся к [[w:макроэргические соединения|макроэргическим соединениям]], то есть к химическим соединениям, содержащим связи, при [[w:гидролиз|гидролизе]] которых высвобождается значительное количество энергии. В данном случае запасающие энергию связи — связи между остатками фосфорной кислоты. Гидролиз такой связи, сопровождаемый отщеплением двух остатков, приводит к выделению от 40 до 60 кДж/моль (в зависимости от условий).
 
При синтезе новой цепочки [[w:ДНК|ДНК]] из трифосфатнуклеотидов от каждого из них отщепляется два остатка фосфорной кислоты. Выделяющейся при этом энергии хватает на образование [[w:ковалентная связь|ковалентной связи]] между неотщепившимся остатком фосфорной кислоты и третьим атомом углерода в [[w:дезоксирибоза|дезоксирибозе]] следующего [[w:нуклеотиды|нуклеотида]].
 
==== Фермент, катализирующий синтез ДНК — ДНК-зависимая ДНК-полимераза ====
ДНК-зависимые [[w:ДНК-полимераза|ДНК-полимеразы]] — это [[w:фермент|ферменты]], осуществляющий [[w:репликация ДНК|репликацию ДНК]] (удвоение молекул ДНК). ДНК-полимеразы считывают информацию с цепи ДНК и достраивают вторую цепочку [[w:нуклеотиды|нуклеотидов]], комплементарных данной, присоединяя к строящейся цепи нуклеотид, комплементарный нуклеотиду матричной цепи. Продукты этой реакции — удлиненная цепь ДНК и пирофосфат. Работа ДНК-полимеразы имеет свои особенности:
 
# ДНК-полимераза может двигаться только в одну сторону — от 5' к 3'-концу, вследствие чего образуются лидирующая и отстающая цепи.
# ДНК-полимеразе требуется затравка в виде короткого фрагмента РНК (она не может начать синтез цепи нуклеотидов «с нуля», а способна только добавлять нуклеотиды к цепи). Затравку создает фермент праймаза.
# ДНК-полимераза может двигаться только по цепи раскрученной спирали ДНК. Цепи ДНК раскручивает белок [[w:хеликазы|геликаза]].
 
В клетке может присутствовать до 4-5 разных типов ДНК-полимераз. У разных групп эукариот и прокариот встречаются альфа-, бета-, дельта-, гамма-, эпсилон-, дзета-, эта- ДНК-полимеразы. Различные ДНК-полимеразы могут выполнять разные функции. У эукариот непосредственно в репликации ДНК участвуют альфа-, дельта- и эпсилон- ДНК-полимеразы.
Каждый тип репликационных ДНК-полимераз имеет свою вероятность ошибки при репликации. У эукариот вероятность вставки некомплементарного азотистого основания ДНК-полимеразой альфа равна 1/10<sup>6</sup>, а ДНК-полимеразой эпсилон равна 1/10<sup>7</sup>. Пострепликационные системы репарации снижают вероятность ошибок репликации ещё на порядок.
 
Одна из самых важных вторичных функций ДНК-полимераз — эксцизионная [[w:репарация ДНК|репарация ДНК]] (замена некомплементарного основания на комплементарное). Присоединив очередной нуклеотид, ДНК-полимераза как бы «оборачивается назад» и проверяет, образовал ли он правильные водородные связи с нуклеотидом матричной цепи. Если нет — нуклеотид удаляется. За счет этого вероятность вставки некомплементарного нуклеотида снижается до 1/10<sup>7</sup>−1/10<sup>8</sup>.
 
Например, бета ДНК-полимераза может удалять основание с помощью специфической N-гликозилазы, а ресинтез азотистого основания может производить только в мононуклеотидных брешах [http://vivovoco.rsl.ru/VV/JOURNAL/NATURE/11_04/REPAIR.HTM]; ДНК-полимеразы дельта и эпсилон, вероятно, не могут производить удаление основания, но зато могут производить ресинтез на более протяженных участках. Однако не все типы ДНК-полимераз способны к репарации. ДНК-полимеразы интенсивно исследуются учеными; возможно, будут открыты их новые функции.
 
==== В удвоении ДНК участвуют и другие ферменты ====
[[Файл:DNA_replication_numbered.svg|thumb|350px|Схематическое изображение процесса репликации, цифрами отмечены: (1) запаздывающая нить, (2) лидирующая нить, (3) [[w:ДНК полимераза|ДНК полимераза]] (Polα), (4) ДНК [[w:лигаза|лигаза]], (5) РНК праймер, (6) ДНК [[w:праймаза|праймаза]], (7) [[w:фрагмент Оказаки|фрагмент Оказаки]], (8) ДНК полимераза (Polδ), (9) [[w:хеликаза|хеликаза]], (10) одиночная нить со связанными белками, (11) [[w:топоизомераза|топоизомераза]]]]
 
 
Реплика́ция ДНК — это процесс синтеза дочерней молекулы дезоксирибонуклеиновой кислоты, который происходит в процессе деления клетки на матрице родительской молекулы ДНК. Репликацию ДНК осуществляет фермент ДНК-полимераза (репликация у эукариот осуществляется несколькими разными ДНК-полимеразами).
 
ДНК-полимераза — фермент, участвующий в репликации ДНК. Ферменты этого класса катализируют полимеризацию дезоксирибонуклеотидов вдоль цепочки нуклеотидов ДНК, которую фермент «читает» и использует в качестве шаблона.
 
Кроме ДНК-полимераз в процессе редупликации участвуют другие ферменты:
 
1) Хеликазы перемещаются по сахаро-фосфатному остову нуклеиновых кислот и разрывают водородные связи между комплементарно соединенными основаниями (rep-белок).
 
2) ДНК-праймаза синтезирует короткий фрагмент РНК, называемый праймером, комплементарный одноцепочечной матрице ДНК.
 
3) ДНК-лигаза сшивает фрагменты ДНК «отстающей» цепи, образующиеся при репликации.
 
4) Топоизомераза оборачивается вокруг ДНК и вносит разрыв, который позволяет спирали ДНК вращаться и снимает напряжение. После релаксации, топоизомераза соединяет разорванные концы.
 
5) ДНК-связывающие белки, которые расплетают ДНК, удерживают матрицу в разведённом состоянии, тем самым не давая восстановиться водородным связям, и вращают молекулу ДНК.
 
==== Геликазы расплетают двойную спираль ====
[[Файл:Helicase.png|thumb|220px|Структура геликазы RuvA бактерии ''Escherichia coli'']]
[[w:Хеликазы|Геликазы]] (от англ. helix — спираль) — ферменты, раскручивающие двойную спираль [[w:ДНК|ДНК]] с затратой энергии [[w:АТФ|АТФ]] и [[w:ГТФ|ГТФ]]. ДНК-геликазы — лишь одна из групп [[w:Хеликазы|геликаз]], есть еще РНК-геликазы. ДНК-геликазы участвуют в [[w:репликация|репликации]], [[w:транскрипция|транскрипции]],[[w:репарация|репарации]] и [[w:рекомбинация (биология)|рекомбинации]]. [[w:Хеликазы|Геликазы]] могут быть активны в качестве мономера или димера, хотя, например, геликазы DnaB активны в качестве гексамера (комплекса из шести субъединиц), образующего баранкообразную структуру. Для расплетания спирали нужен один геликазный белок, но для достижения большей скорости раскручивания несколько [[w:Хеликазы|геликаз]] могут действовать совместно.
 
ДНК-геликазы рвут водордные связи между комплементарными [[w:нуклеотды|нуклеотидами]] двух цепей, двигаясь при этом в противоположных направлениях (5'->3' или 3'->5'). При этом образуются две одноцепочечные молекулы, которые потом будут служить матрицей для достраивания второй цепи. Образуется структура Y-образной формы, названная [[w:репликационная вилка|репликационной вилкой]]. Но при таком быстром расплетании нитей, без вращения относительно друг друга, будут образовываться «узелки» — сверхскрученные участки, как на витой веревке, если её пытаться расплести не с конца, а с середины, растягивая. Суперскрученность устраняет специальный фермент [[w:Топоизомераза|ДНК-топоизомераза]].
[[Файл:Replication fork.svg|right|thumb|Схема репликационной вилки.<br />a:мРНК, b: [[w:лидирующая цепь|лидирующая цепь]], c: [[w:отстающая цепь|отстающая цепь]], d: [[w:репликационная вилка|репликационная вилка]], e: РНК [[w:праймер|праймер]], f: [[w:фрагменты Оказаки|фрагменты Оказаки]]]]
В клетке присутствует много разновидностей [[w:Хеликазы|геликаз]]; так, у человека их 24. При нарушении их работы могут возникать болезни: [[w:ксеродерма|пигментная ксеродерма]], синдром Коккейна, синдром Блума, [[w:прогерия|синдром Вернера]].
 
По характеру и последствиям мутации можно объединить синдром Блума и синдром Вернера в одну группу, а синдром Коккейна и пигментную ксеродерму — в другую.
 
При синдроме Вернера происходят мутации в гене WRN, кодирующем ДНК-геликазу. Эта мутация вызывает нарушение процесса репарации и репликации, нестабильность [[w:геном|генома]], 10-кратное увеличение темпа мутаций и уменьшение потенциала делений клеток в культуре.
 
При синдроме Блума мутация происходит в гене BLM, принадлежащем к генам ДНК-геликаз. Синдром Блума также характеризуется нестабильностью генома и повышенным риском [[w:канцерогенез|канцерогенеза]].
 
При синдроме Коккейна, сходном с пигментной ксеродермой, основная причина заболевания — дефект одного из механизмов [[w:репарация ДНК|эксцизионной репарации нуклеотидов]]. При разных вариантах синдрома Коккейна причиной заболевания бывает нарушение функций нескольких генов (CSA,CSB,XPD,XPB,XPG), причём мутации в 3 последних генах бывают и при пигментной ксеродерме. Это заболевание вызвано тем, что после повреждений клеток кожи ультрафиолетовым облучением ДНК [[w:фибробласты|фибробластов]] не восстанавливается.
 
И при пигментной ксеродерме основная причина заболевания — дефекты раннего этапа [[w:репарация ДНК|эксцизионной репарации нуклеотидов]]. Мутации происходят в разных генах, кодирующих геликазы — от XPA до XPG. Однако основные причины пигментной ксеродермы — два вида нарушений генотипа: недостаток фермента УФ-эндонуклеазы, опознающего участки, поврежденные УФ-излучением, или дефект ДНК-полимеразы, участвующей в соединении разрывов ДНК (разрывы обычно появляются из-за повреждений кожи, вызванных УФ-облучением (как и при синдроме Коккейна)). Так что при синдроме Коккейна и пигментной ксеродерме мутации, связанные с ДНК-геликазами, не являются основными.
 
==== Топоизомеразы разрезают и сшивают нить ДНК, позволяя спирали раскручиваться ====
 
 
'''Топоизомеразы (topoisomerases)''' — класс ферментов-изомераз, которые влияют на [[w:топология|топологию]] ДНК.<ref name="pmid11395412">{{cite journal | author = Champoux JJ | title = DNA topoisomerases: structure, function, and mechanism | journal = Annu. Rev. Biochem. | volume = 70 | issue = | pages = 369–413 | year = 2001 | pmid = 11395412 | doi = 10.1146/annurev.biochem.70.1.369 | url = | issn = }}</ref> Впервые топоизомеразы были описаны профессором Гарвардского университета Джеймсом Вангом.
 
[[w:Молекулярная масса|Молекулярная масса]] топоизомераз колеблется в пределах от 60 тыс. до 140 тыс дальтон. После [[w:трансляция|трансляции]] фермент подвержен модификациям, в частности, [[w:фосфорилирование|фосфорилированию]]. Минимальный размер олигонуклеотидов, расщепляемых топоизомеразами ≈ 7-8 нуклеотидных остатков.
 
 
В обычном состоянии ДНК пребывает в форме двойной спирали, и такая структура не позволяет отдельным цепочкам расходиться. Для расплавления двойной спирали (разрыва водородных связей между основаниями) используются специальные ферменты — хеликазы, которые позволяют осуществлять транскрипцию или репликацию другим белкам.<ref>{{книга |автор=Альбертс Б., Брей Д., Льюис Дж., Рэфф М., Робертс К., Уотсон Дж. |часть= |заглавие=Молекулярная биология клетки: в трех томах |оригинал= |ссылка= |ответственный= |издание=2 |место=Москва |издательство=Мир |год =1994 |том =1 |страницы= |страниц=517 |серия= |isbn=5030019855 |тираж=10000 }}</ref>
 
Классификация ферментов основана на механизме их действия на молекулу ДНК: к топоизомеразам I группы относятся ферменты, катализирующие изменения топологическое состояния молекулы с помощью однонитевого разрыва-зашивания двухнитевой молекулы ДНК, к топоизомеразам II группы — с помощью двухнитевого разрыва-зашивания. В некоторых случаях реакция АТФ-зависимая.
 
Установлено, что топоизомеразы I группы образуют в ходе реакции ковалентный промежуточный комплекс ДНК-белок. Фермент эукариот соединяется через тирозиновый остаток с 3'-концом разорванной цепи ДНК, у прокариот — с 5'-концом. После перемещении разорванных концов ДНК относительно друг друга обе формы топоизомераз восстанавливают ее целостность.
 
Встраивание вирусной ДНК в хромосомы хозяина и другие формы [[w:Рекомбинация (биология)|рекомбинации]] также требуют присутствие топоизомераз.<ref>{{книга |автор=Жимулев И. Ф. |часть= |заглавие=Общая молекулярная генетика |оригинал= |ссылка= |ответственный= |издание=1 |место=Новосибирск |издательство=Издательство Новосибирского университета |год =2002 |том = |страницы= |страниц=459 |серия= |isbn=5761505096 |тираж=2000 }}</ref>
 
 
Активность топоизомеразы во многих случаях угнетается противоопухолевыми и противомикробными препаратами (например, [[w:налидиксовая кислота|налидиксовой]] и [[w:оксолиниевая кислота|оксолиниевой]] кислотами).
 
 
[http://www.pereplet.ru/nauka/Soros/pdf/9604_011.pdf] О. О. Фаворова. Сохранение ДНК в ряду поколений: репликация ДНК.
 
[http://www.wiley.com/college/pratt/0471393878/student/animations/dna_replication/index.html] Анимация: Удвоение ДНК (функции различных белков) (англ.)
 
=== Генетический код ===
 
==== В последовательности нуклеотидов ДНК закодирована последовательность аминокислот в белках ====
[[w:Дезоксирибонуклеи́новая кислота́ (ДНК)|Дезоксирибонуклеи́новая кислота́ (ДНК)]] представляет собой полимерную молекулу сложной структуры длиной от нескольких тысяч пар нуклеотидов (пн) до нескольких миллионов пар нуклеотидов.
 
# [[w:Кишечная палочка|кишечная палочка]] ~3,8 мпн (~ 1,3 мм)
# [[w:Дрожжи|дрожжи]] ~13,5 мпн
# [[w:Дрозофила|дрозофила]] ~105 мпн
# [[w:Человек|человек]] ~3000 мпн (~ 1 метр), длина всех 23 молекул ДНК гаплоидного набора хромосом)
 
В [[w:ДНК|ДНК]] зашифрована информация о первичной структуре белков посредством комбинации нуклеотидов. Процесс «переписывания» этого кода с ДНК в молекулы РНК называется транскрипцией, а синтез белка в рибосомах по матрице иРНК, в ходе которого происходит «перевод» нуклеотидного кода в последовательность аминокислот — трансляцией.
 
Генетический код ДНК состоит из триплетов, то есть из тройных комбинаций нуклеотидов. При транскрипции генетический код «переписывается» в последовательность нуклеотидов иРНК. Тройки нуклеотидов иРНК, кодирующие аминокислоты, называются кодонами.
Из 64 возможных триплетов (4³) 61 являются смысловым кодонами, то есть кодируют аминокислоты. Все кодоны триплетны, неразрывны и не перекрываются в тексте (как считалось по одной из гипотез), а также не разделены межкодонными знаками. Все кодоны однозначны, то есть каждый кодон кодирует единственную аминокислоту.
 
Генетический код содержит в себе также знаки пунктуации (начала и конца трансляции). Кодоны AUG, GUG и UUG у прокариот помимо кодирования аминокислот кодируют ещё и команду начала трансляции. Однако однозначность генетического кода при этом не нарушается, так как инициирующие знаки располагаются в определенном окружении (контексте), способном образовывать самокомплементарные субъединицы. У эукариот инициирующими триплетами являются AUG, UUG, AUA и ACG. Три кодона из 64 (UGA, UAG, UAA) не кодируют аминокислот, а служат знаками окончания трансляции (стоп-кодоны). Обычно ими заканчиваются все транслируемые гены. Возникновение в результате мутации нонсенс-кодонов внутри гена приводит к преждевременной терминации трансляции и прекращению синтеза [[w:белки|белка]].
 
==== Расшифровке генетического кода помог синтез искусственных РНК ====
В1953 году Фрэнсис Крик совместно с [[w: Уотсон, Джеймс|Джеймсом Уотсоном]] сделал предположение, что только 20 кодонов генетического кода имеют значение, а остальные 44 триплета являются бессмысленными. В 1961 [[w:Крик, Фрэнсис|Ф. Крик]] с сотрудниками получил подтверждение гипотезы триплетного неперекрывающегося кода без запятых.
 
Расшифровать [[w:генетический код|генетический код]] удалось in vitro, благодаря технике белкового синтеза в бесклеточных системах, то есть в клеточных экстрактах, содержащих все необходимые компоненты аппарата трансляции (тРНК, иРНК, рибосомы, аминокислоты, ферменты, источник энергии ([[w:АТФ|АТФ]] и [[w:ГТФ|ГТФ]]), а также вспомогательные компоненты), за исключением только принадлежащий клетке мРНК. Вводя в такие экстракты искусственно синтезированные мРНК, можно было изучать включения меченых аминокислот в строящиеся белки. М. Ниренберг и Ф. Ледер провели опыт по помещению в бесклеточную систему трансляции различных олигорибонуклеотидов и выявили, что конкретные тририбонуклеотиды, ассоциированные с рибосомами, связывают только определенные фракции тРНК, с определенными мечеными аминокислотами. Например, олигорибонуклеотид УУУ связывает тРНК, имеющую антикодон ААА и несущую аминокислоту фенилаланин. Следовательно, [[w:кодон|кодон]] мРНК УУУ кодирует аминокислоту фенилаланин. С помощью такого метода к 1965 году генетический код был расшифрован полностью.
 
Летом 1966 года на симпозиуме по количественной биологии в Колд-Спринг-Харборе (США) все полученные данные были систематизированы Ф. Криком. Расшифрованный генетический код E. coli, исследованный методом in vitro, полностью согласовывался также с другими независимыми данными, полученными методом in vivo для других видов.
 
==== Основные свойства генетического кода одинаковы у всех живых организмов ====
 
[[w:Генетический код|Генетический код]] — способ кодирования [[w:Нуклеотидная последовательность|последовательностью нуклеотидов]] в [[w:Дезоксирибонуклеиновая кислота|ДНК]] [[w:Аминокислоты|аминокислотной]] последовательности [[w:Белки|белков]]. Для [[w:Генетический код|генетического кода]] характерны следующие свойства (см. следующие разделы):
 
* Триплетность — каждая аминокислота закодирована триплетом — сочетанием трех соседних нуклеотидов ДНК
 
* Вырожденность — большинство аминокислот кодируются более чем одним триплетом
 
* Неперекрываемость — триплеты читаются подряд без перекрывания, начиная с одной стартовой точки
 
* Непрерывность — в пределах участка, кодирующего одну молекулу белка или РНК, триплеты читаются
подряд, без пропусков
 
* Однозначность — каждый [[w:Триплет (биология)|триплет]] кодирует только одну [[w:Аминокислоты|аминокислоту]] или является [[w:Терминатор (ДНК)|терминатором]] [[w:Трансляция (биология)|трансляции]]
* Универсальность — все живые существа используют одинаковые наборы [[w:Кодон|кодонов]] для кодирования одних и тех же аминокислот.
 
<!-- После признания универсальности [[w:Генетический код|генетического кода]] начали формулировать [[w:Гипотеза|гипотезы]] о его [[w:Эволюция|эволюции]]:
 
1) В самой примитивной [[w:Клетка|клетке]] первоначальный [[w:Генетический код|генетический код]] состоял из большого количества [[w:Кодон|кодонов]], имеющих не единственное значение, что приводило к невозможности правильной [[w:Трансляция (биология)|трансляции]] [[w:Генетическая информация|генетической информации]]. Следовательно, в процессе [[w:Эволюция|эволюции]] развитие [[w:Генетический код|генетического кода]] шло по линии исправления и сокращения ошибок в [[w:Трансляция (биология)|трансляции]], что привело в конце концов к [[w:Генетический код|генетическому коду]] в его современном виде.
 
2) По другой гипотезе к [[w:Генетический код|генетическому коду]] в современном виде привело сведение к минимуму [[w:Смерть|летальных исходов]] после воздействия [[w:Мутация|мутации]] в процессе [[w:Эволюция|эволюции]], а селективное давление (любое явление, изменяющее поведение и приспособленность живых организмов без изменения окружающей среды) приводило к устранению ненужных [[w:Кодон|кодонов]] и сокращению частоты [[w:Мутация|мутаций]] в [[w:Кодон|кодонах]], при этом не изменяя последовательность [[w:Аминокислоты|аминокислот]], или же сопровождались заменой [[w:Аминокислоты|аминокислоты]] на другие, функционально связанные.
 
3) По третьей гипотезе ранний [[w:Генетический код|генетический код]] был не [[w:Триплет|триплетным]], а дуплетным и состоял из 16 [[w:Кодон|кодонов]] (4 ²=16). Всего было 15 [[w:Аминокислоты|аминокислот]], и каждый из 15 [[w:Кодон|кодонов]] кодировал только одну [[w:Аминокислоты|аминокислоту]], а последний 16-ый дуплет играл роль стоп-кодона. Предполагают, что в примитивных клетках молекулы [[w:тРНК|тРНК]] сами катализировали связывание с [[w:Аминокислоты|аминокислотами]], роль рибосом выполняли [[w:Рибосомные рибонуклеиновые кислоты|рРНК]], что связано с высокой концентрацией [[w:Рибонуклеиновые кислоты|РНК]] в клетках и приобретением каталитической способности [[w:Рибонуклеиновые кислоты|РНК]]. В процессе эволюции образовалось еще 5 [[w:Аминокислоты|аминокислот]], что привело к замене дуплетов на [[w:Триплет|триплеты]], и в конце концов [[w:Дезоксирибонуклеиновая кислота|ДНК]] приобрела нынешний вид.
 
* Еще по одному предположению современный [[w:Генетический код|генетический код]] — это результат эволюции примитивного кода. По этой гипотезе [[w:Азотистые основания|азотистые основания]] в [[w:Нуклеотиды|нуклеотидах]] были всего двух видов, а кодировалось всего несколько [[w:Аминокислоты|аминокислот]] и всего несколькими [[w:Триплет|триплетами]]. Эволюция кода осуществлялась уменьшением количества ненужных [[w:Триплет|триплетов]] и увеличением числа смысловых. В конце концов увеличилось и число [[w:Аминокислоты|аминокислот]], «считываемых» соответствующими нуклеотидами, что привело к нынешнему состоянию молекулы [[w:Дезоксирибонуклеиновая кислота|ДНК]].
 
Заметно, что нынешние гипотезы весьма противоречивы, так как пока нет экспериментальных данных для подтверждения той или иной гипотезы. Этот текст нужно переработать, тогда его можно будет вставить в раздел про эволюцию клетки.--~~~~-->
 
'''Генные знаки препинания'''
Участок [[w:Дезоксирибонуклеиновая кислота|ДНК]], кодирующий одну [[w:Пептиды|полипептидную]] цепь или одну [[w:Молекула|молекулу]] [[w:Рибонуклеиновые кислоты|РНК]], называется [[w:Ген|геном]]. После каждого кодирующего белок участка [[w:Ген|гена]] находится [[w:Терминаторный кодон|стоп-кодон]], регулирующий [[w:Трансляция (биология)|трансляцию]]. К таким «знакам препинания» относятся и [[w:Терминаторный кодон|стоп-кодоны]] UAA, UAG и UGA.
Эти сигналы опознаёт рибосома, но не РНК_полимераза — для неё на ДНК есть свои «стоп-сигналы», состоящие более чем из трех нуклеотидов.
 
Кодон AUG (первый после лидерной последовательности) выполняет роль «заглавной буквы», то есть кодирует [[w:Метионин|метионин]] (у [[w:Эукариоты|эукариот]]) или формилметионин (у [[w:Прокариоты|прокариот]]), с которого начинается образование [[w:Пептиды|полипептидной]] цепи в процессе [[w:Трансляция (биология)|трансляции]].
 
Кодоны UAA (охра, или Ochre), UAG (амбер-кодон, или Amber) и UGA (опал, или Opal) являются [[w:Терминаторный кодон|терминаторными кодонами]] и кодируют прекращение (терминацию) [[w:Синтез|синтеза]] [[w:Пептиды|полипептиднойцепи]] [[w:Трансляция (биология)|трансляции]].
Если AUG — «заглавная буква», [[w:Терминаторный кодон|стоп-кодоны]] — «точки», то с «абзацем» можно сравнить [[w:Оперон|оперон]] и [[w:Комплементарность (биология)|комплементарная]] ему [[w:мРНК|мРНК]], присутствующие только в [[w:Прокариоты|прокариотической]] клетке. [[w:Оперон|Оперон]] — участок [[w:Дезоксирибонуклеиновая кислота|ДНК]] [[w:Бактерии|бактерии]], отвечающий за отдельный участок [[w:Метаболизм|метаболического]] пути. Он кодирует совместно или последовательно работающие [[w:Белки|белки]], объединенные под одним (или несколькими) [[w:Промотор|промоторами]].
 
У эукариот внутригенные стоп-кодоны и иные «знаки препинания» отсутствуют, что было экспериментально доказано Сеймуром Бензером и [[w:Крик, Фрэнсис|Фрэнсисом Криком]] в 1961 году. У прокариот с оперона часто считывается одна молекула полицистронной мРНК. В её нуклеотидной последовательности есть несколько стоп-кодонов, а между ними — рамки считывания для нескольких полипептидных цепочек. При трансляции прокариотическая рибосома «перепрыгивает» стоп-кодоны и продолжает синтез следующего белка, а синтезированная полипептидная цепь при этом отделяется от рибосомы.
 
==== Генетический код триплетный ====
У всех живых организмов генетический код триплетный. Это означает. что одна аминокислота кодируется тремя следующими друг за другом нуклеотидами ДНК - триплетом. Три нуклеотида иРНК, кодирующие одну аминокислоту или представляющие собой сигнал остановки синтеза, называются кодоном.
Трёхбуквенные "слова" нуклеотидного языка, в котором есть всего четыре буквы - самые короткие, с помощью которых можно закодировать все 20 основных аминокислот. Если составлять нуклеотидные слова из двух букв, то их будет всего 16 - не хватает! Трёхбуквенных слов хватает уже с избытком - их 64. Почти все триплеты (кроме трех, а в некоторых случаях - кроме одного) значащие, поэтому код вырожденный (см. ниже).
 
==== Генетический код неперекрывающийся ====
 
В 1956 году американский ученый [[w:Гамов, Георгий Антонович|Джордж Гамов]] высказал предположение о перекрываемости [[w:Генетический код|генетического кода]]. Оно заключается в следующем:
предположим, у нас есть следующая последовательность нуклеотидов:
УУАГУААЦГУАА
 
В этой последовательности могут действовать кодоны
УУА ГУА АЦГ УАА
ххУ УАГ УАА ЦГУ ААх
хУУ АГУ ААЦ ГУА Ахх
 
Плюс перекрываемого кода — компактность (недаром это свойство обнаружено у некоторых генов вирусов). Минус — явная зависимость структуры [[w:Белки|белка]] от замены [[w:Нуклеотиды|нуклеотида]].
 
После расшифровки [[w:Генетический код|генетического кода]] было показано, что он неперыкрывающийся, то есть в последовательности нуклеотидов УУАГУААЦГУАА действуют только [[w:Кодон|кодоны]] УУА ГУА АЦГ УАА.
 
Как правило, для каждого гена существует одна [[w:открытая рамка считывания|открытая рамка считывания]].
 
==== Генетический код непрерывный ====
До расшифровки генетического кода выдвигалось предположение, что только 20 кодонов - значащие, остальные пропускаются при считывании кода. Однако выяснилось, что значащих кодонов 61, и лишь три кодона (стоп-кодоны) не кодируют аминокислот. При синтезе белка (трансляции) рибосома движется по иРНК, пока не достигает стоп-кодона, считывая все кодоны подряд, без пропусков.
 
У бактерий многие иРНК полицистронные. Они кодируют несколько полипептидных цепей, и кодирующие их последовательности разделены стоп-кодонами. При трансляции бактериальная рибосома "перескакивает" стоп-кодоны, сразу же начиная синтез следующей полипептидной цепи; белок, синтез которого закончился, при этом отделяется от рибосомы.
 
==== Генетический код вырожденный ====
В 1954 году американский ученый [[w:Гамов, Георгий Антонович|Джордж Гамов]] высказал предположение о кодировании одним [[w:Кодон|кодоном]] одной [[w:Аминокислоты|аминокислоты]], но это предположение оказалось неверным. Так как [[w:Триплет (биология)|триплет]] состоит из трёх последовательных [[w:Нуклеотиды|нуклеотидов]], а всего этих [[w:Нуклеотиды|нуклеотидов]] четыре различных, возможных [[w:Триплет (биология)|триплетов]] может быть 4 ³=64 (кроме [[w:Терминаторный кодон|стоп-кодонов]] UAA, UAG и UGA, так что не 64, а 61), что превышает количество существующих [[w:Аминокислоты|аминокислот]]. В связи с этим было высказано предположение, подтвердившееся в дальнейшем, о так называемой вырожденности [[w:Генетический код|генетического кода]] — одну [[w:Аминокислоты|аминокислоту]] кодирует больше одного [[w:Триплет (биология)|триплета]], за исключением [[w:Метионин|метионина]] и [[w:Триптофан|триптофана]].
 
Отдельные аминокислоты кодируются группами (сериями) кодонов-синонимов. 18 серий из 20 содержат от двух до шести кодонов, две серии (для аминокислот метионина и триптофана) не вырождены и содержат по одному кодону. Средняя вырожденность генетического кода приблизительно равна трём кодонам на серию.
 
Вырожденность называется систематической, если синонимичные кодоны различаются либо пуринами, либо пиримидинами, либо вообще любыми из четырех своих нуклеотидов. Этим принципам удовлетворяют только 30 пар кодонов из 32 возможных, а также только восемь тетрад из 16. Остальные же варианты вырожденности называются несистематическими. Они относятся, как правило, к большим сериям: [[w:лейцин|лейцин]] и [[w:аргинин|аргинин]] — связные серии, серин — несвязная серия, [[w:изолейцин|изолейцин]], кодируемый в три кодона — полносвязная серия.
 
==== Генетический код однозначный ====
Единственный известный на сегодняшний день пример, когда это свойство нарушается — использование кодона UGA у инфузории Euplotes crassus. В зависимости от окружения он кодирует две [[w:Аминокислоты|аминокислоты]] — [[w:Цистеин|цистеин]] и [[w:Селеноцистеин|селеноцистеин]] [http://elementy.ru/news/430968].
 
==== Генетический код универсальный ====
Универсальность [[w:Генетический код|генетического кода]] означает использование всеми живыми организмами одного [[w:Генетический код|генетического кода]], то есть все живые существа используют одинаковые наборы [[w:Кодон|кодонов]] для кодирования одних и тех же аминокислот.
 
=== Мутации и их последствия ===
'''Мута́ция''' — стойкое (то есть такое, которое может быть унаследовано потомками данной клетки или организма) изменение [[w:Генотип |генотипа]]. Процесс возникновения мутаций называется '''[[w:мутагенез|мутагенез]]'''.
 
Мутации делятся на ''спонтанные'' и ''индуцированные''. Спонтанные мутации возникают самопроизвольно в нормальных для организма условиях окружающей среды с частотой около <math>10^{-9}</math> — <math>10^{-12}</math> на нуклеотид за клеточную генерацию.
 
Индуцированные мутации возникают в результате тех или иных [[w:мутагены|мутагенных]] воздействий в искусственных (экспериментальных) условиях или при неблагоприятных воздействиях окружающей среды.
 
Мутации появляются постоянно в ходе процессов, происходящих в живой клетке. Основные процессы, приводящие к возникновению мутаций — [[w:репликация ДНК|репликация ДНК]], нарушения [[w:репарация ДНК|репарация ДНК]] и [[w:генетическая рекомбинация|генетическая рекомбинация]].
 
'''Связь мутаций с репликацией ДНК''' <br />
Многие спонтанные химические изменения нуклеотидов приводят к мутациям, которые возникают при репликации. Например, из-за деаминирования цитозина напротив него в цепь ДНК может включаться урацил (образуется пара У-Г вместо канонической пары Ц-Г). При репликации ДНК напротив урацила в новую цепь включается аденин, образуется пара У-А, а при следующей репликации она заменяется на пару Т-А, то есть происходит [[w:транзиция|транзиция]].
 
'''Связь мутаций с рекомбинацией ДНК''' <br />
Из процессов, связанных с рекомбинацией, наиболее часто приводит к мутациям неравный [[w:кроссинговер|кроссинговер]]. Он происходит обычно в тех случаях, когда в хромосоме имеется несколько дуплицированных копий исходного гена, сохранивших похожую последовательность нуклеотидов. В результате неравного кроссинговера в одной из рекомбинантных хромосом происходит [[w:дупликация|дупликация]], а в другой — [[w:делеция|делеция]].
 
'''Связь мутаций с репарацией ДНК''' <br />
Спонтанные повреждения ДНК встречаются довольно часто, такие события имеют место в каждой клетке. Для устранения последствий подобных повреждений имеется специальные [[w:Репарация ДНК|репарационные механизмы]] (например, ошибочный участок ДНК вырезается и на этом месте восстанавливается исходный). Мутации возникают лишь тогда, когда репарационный механизм по каким-то причинам не работает или не справляется с устранением повреждений. Мутации, возникающие в генах белков, ответственных за репарацию, могут приводить к многократному повышению (мутаторный эффект) или понижению (антимутаторный эффект) частоты мутирования других генов.
Так, мутации генов многих ферментов системы [[w:эксцизионная репарация|эксцизионной репарации]] приводят к резкому повышению частоты соматических мутаций у человека, а это, в свою очередь, приводит к развитию пигментной [[w:ксеродерма|ксеродермы]] и злокачественных опухолей покровов.
 
=== Репарация ДНК ===
Репарация (от лат. reparatio — восстановление) — особая функция клеток, заключающаяся в способности исправлять химические повреждения и разрывы в молекулах ДНК, повреждённой при нормальном биосинтезе ДНК в клетке или в результате воздействия физических или химических агентов. Осуществляется специальными ферментными системами клетки.
==== Источники повреждения ДНК ====
* [[w:Ультрафиолетовое излучение|Ультрафиолетовое излучение]]
* [[w:Ионизирующее излучение|Радиация]]
* Химическое соединение|Химические вещества]]
* Ошибки [[w:репликация ДНК|репликации ДНК]]
* Апуринизация — отщепление азотистых оснований от сахарофосфатного остова
* [[w:Дезаминирование|Дезаминирование]] — отщепление аминогруппы от азотистого основания
 
==== Основные типы повреждения ДНК ====
* Повреждение одиночных нуклеотидов
* Повреждение пары нуклеотидов
* Разрыв цепи ДНК
* Образование поперечных сшивок между основаниями одной цепи или разных цепей ДНК
 
==== Устройство системы репарации ====
Каждая из систем репарации включает следующие компоненты:
* [[w:хеликаза|хеликаза]] — фермент, «узнающий» химически изменённые участки в цепи и осуществляющий разрыв цепи вблизи от повреждения;
* фермент, удаляющий повреждённый участок;
* [[w:ДНК-полимераза|ДНК-полимераза]] — фермент, синтезирующий соответствующий участок цепи ДНК взамен удалённого;
* [[w:ДНК-лигаза|ДНК-лигаза]] — фермент, замыкающий последнюю связь в полимерной цепи и тем самым восстанавливающий её непрерывно
 
==== Типы репарации ====
У [[w:бактерии|бактерий]] имеются по крайней мере 3 ферментные системы, ведущие репарацию — прямая, эксцизионная и пострепликативная. У эукариот к ним добавляется еще mismatch-репарация и Sos-репарация.
 
===== Прямая репарация =====
Прямая репарация — наиболее простой путь устранения повреждений в ДНК, в котором обычно задействованы специфические ферменты, способные быстро (как правило, в одну стадию) устранять соответствующее повреждение, восстанавливая исходную структуру [[нуклеотид]]ов. Так действует, например, O6-метилгуанин-[[w:ДНК-метилтрансфераза|ДНК-метилтрансфераза]], которая снимает метильную группу с азотистого основания на один из собственных остатков [[w:цистеин|цистеин]]а.
 
===== Эксцизионная репарация =====
Эксцизионная репарация ({{lang-en|excision}} — вырезание) включает удаление повреждённых азотистых оснований из ДНК и последующее восстановление нормальной структуры молекулы.
 
===== Пострепликативная репарация =====
Tип репарации, имеющей место в тех случаях, когда процесс эксцизионной репарации недостаточен для полного исправления повреждения: после репликации с образованием ДНК, содержащей поврежденные участки, образуются одноцепочечные бреши, заполняемые в процессе [[w:гомологичная рекомбинация|гомологичной рекомбинации]] при помощи белка [[RecA]].
 
Пострепликативная репарация была открыта в клетках ''E.сoli'', не способных выщеплять тиминовые димеры. Это единственный тип репарации, не имеющий этапа узнавания повреждения.
 
=== Транскрипция и трансляция — основные этапы синтеза белка ===
<big>'''[[w:Транскрипция|Транскрипция]]''' — синтез РНК по матрице ДНК. У эукариот транскрипция происходит в ядре, а также в митохондриях и пластидах (как вы помните, у этих органелл есть собственный геном). В ходе транскрипции происходит синтез [[w:мРНК|мРНК]], [[w:тРНК|тРНК]] и [[w:рРНК|рРНК]], которые непосредственно задействованы в синтезе белка, а также всех остальных типов РНК клетки ([[w:siРНК|siРНК]], [[w:piRNA|piРНК]], [[w:гидовые РНК|гидовые РНК]], малые ядерные РНК и др.).
 
'''[[w:Трансляция (биология)|Трансляция]]''' — процесс синтеза белка на рибосомах, который происходит в цитоплазме клеток, а у эукариот - также в митохондриях и хлоропластах. </big>
 
=== Транскрипция — синтез РНК на ДНК ===
Транскри́пция (от лат. transcriptio — переписывание) — процесс синтеза РНК с использованием ДНК в качестве матрицы, происходящий во всех живых клетках.
 
Транскрипция катализируется ферментом [[w:РНК-полимераза|ДНК-зависимой РНК-полимеразой]]. Процесс синтеза РНК протекает в направлении от 5'- к 3'- концу, то есть по матричной цепи ДНК РНК-полимераза движется в направлении 3'->5'.
 
Транскрипция - первый этап экспрессии гена. Если ген кодирует белок, то второй этап его экспрессии - трансляция, синтез белка на рибосомах. Но многие гены не кодируют белков. Это гены рРНК и тРНК, а также множества малых РНК, имеющих регуляторные или ферментативные функции. Такие гены при экспрессии не транслируются, а только транскрибируются; этаопм их экспрессии можно считать созревание ([[w:Процессинг РНК|процессинг]]) РНК.
 
Транскрипция состоит из стадий инициации, элонгации и терминации.
==== Транскрипция у прокариот ====
 
==== Особенности транскрипции у эукариот. Процессинг и сплайсинг РНК ====
 
Практические все гены эукариот имеют экзон-интронную структуру. Они содержат [[w:экзоны|экзоны]] (участки, кодирующие белок или РНК) и находящиеся между ними [[w:интроны|интроны]] - участки, которые ничего не кодируют. С ДНК при транскрипции считывается первичный транскрипт - РНК, содержащая и экзоны, и интроны. Затем интроны удаляются в ходе [[w:сплайсинг|сплайсинга]].
 
Сплайсинг - лишь один из этапов [[w:Процессинг РНК|процессинга РНК]]. Процессинг - совокупность процессов в клетках эукариот, которые приводят к превращению первичного транскрипта РНК в зрелую РНК. Например, в ходе процессинга иРНК происходит ее кэпирование и полиаденилирование (см. ниже).
 
[[File:MRNA structure.svg|thumb|700px|center|Структура зрелой эукариотической иРНК. После процессинга иРНК содержит 5' кэп, 5' некодирующий участок (UTR), кодирующий участок (CDS), 3' некодирующий участок (UTR) и поли-А хвост.]]
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/lifecyclemrna.html] Анимация «Жизненный цикл мРНК эукариот» (англ. текст)
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/mRNAsplicing.html] Анимация «Сплайсинг мРНК» (англ. ткст)
 
==== Роль рРНК, тРНК и иРНК в клетке ====
[[Файл:TRNA-Phe yeast 1ehz.png|thumb|right|Третичная структура тРНК. CCA-хвост показан оранжевым, акцепторный стебель — лиловым, D-плечо — красным, участок с антикодоном — голубым, антикодон — черным, Т-плечо — зелёным]]
 
[[w:тРНК|тРНК]] — небольшие (длиной обычно от 74 до 95 нуклеотидов) молекулы РНК, которые переносят аминокислоты в рибосомы и обеспечивают их включение в состав растущей белковой цепи в ходе [[w:трансляция (биология)|трансляции]].
 
=== Трансляция ===
[[w:Трансляция (биология)|Трансляция]] — осуществляемый [[w:рибосома|рибосомой]] [[w:синтез|синтез]] [[w:белок|белка]] из [[w:аминокислота|аминокислот]] на матрице информационной (или матричной) [[w:РНК|РНК]] (иРНК или [[w:мРНК|мРНК]]). Трансляция может происходить в клетках и в искусственных бесклеточных системах. Чтобы в пробирке с физиологическим раствором могла идти трансляция, туда необходимо добавить:
*рибосомы - "машины" для синтеза белка),
*иРНК - матрицы,
*тРНК - переносчики аминокислоты и "адаптеры", переводящие нуклеотидный код в последовательность аминокислот,
*аминокислоты - строительный материал,
*специальные ферменты [[w:Аминоацил-тРНК-синтетаза|аминоацил-тРНК-синтетазы]] - обеспечивают специфичное присоединение каждой аминокислоты к "своей" тРНК
*молекулы АТФ и ГТФ, гидролиз которых служит источником энергии для синтеза белка.
 
Кроме этого, для нормального синтеза белка необходим ряд дополнительных белков, не входящих в состав рибосом - факторы инициации, элонгации и терминации.
 
==== Рибосомы — машины для синтеза белка ====
Рибосомы - это немебранные органоиды, отвечающие за синтез белков и содержащиеся во всех клетках, и даже некоторых органоидах, а именно – [[w:митохондрия|митохондриях]] и [[w:хлоропласт|хлоропластах]]. Рибосомы состоят из двух субъединиц - большой и малой. Эти субъединицы собираются в [[w:ядрышко|ядрышке]].
Рибосомы можно поделить на две группы: сидячие и свободные. По функциям они принципиально не различаются. Единственное различие в том,что сидячие рибосомы расположены на [[w:эндоплазматический ретикулум|шероховатой эндоплазматической сети]], а свободные находятся в цитоплазме. Нередко рибосомы образуют полирибосомы (полисомы) — цепочки из рибосом, расположенных на нити [[w:Информационная РНК|иРНК]].
 
==== Особенности рибосом прокариот, эукариот и органоидов ====
 
==== Этапы трансляции ====
[[Файл:Translation 1543a.gif|thumb|right|Анимация «Элонгация и терминация»]]
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/translation.html] — Анимация «Синтез белка. Элонгация» (англ.текст)
Во время процесса транскрипции информация с [[w:ДНК|ДНК]] копируется на [[w:РНК|РНК]]. [[w:Информационная РНК|Информационная РНК]] (иРНК) становится матрицей для синтеза белка. [[w:Транспортная РНК|Транспортная РНК]] доставляет в рибосому строительный материал для синтеза белка — [[w:аминокислоты|аминокислоты]]. После того, как иРНК и аминокислоты попали в рибосому, тРНК переводит генетический код аминокислоты, считывая кодон РНК (т.к. имеет антикодон).А специфичное присоединение аминокислот к соответствующей тРНК обеспечивает особый фермент — [[w:Аминоацил-тРНК-синтетаза|аминоацил-тРНК-синтетаза]]. Энергию для синтеза обеспечивает [[w:гидролиз|гидролиз]] молекул [[w:гуанозинтрифосфат|ГТФ]].
К одной молекуле РНК часто присоединяется множество рибосом, образуя "бусы" из рибосом — полирибосому, или полисому. Рибосомы одна за другой "ползут" по нити иРНК. Когда рибосома достигает стоп-кодона, она распадается на половинки - субъединицы.
 
=== Другие типы РНК и их роль в клетке ===
 
=== Центральная догма молекулярной биологии. Передача и реализация наследственной информации ===
«Это был тот самый дух, который вскоре принес нам „центральную догму“,
против чего я выступил, по-моему, первым… Я увидел в этом первые
ростки чего-то нового — какой-то нормативной биологии, которая
повелевает природе вести себя в соответствии с нашими моделями.»
Э. Чаргафф
 
* [http://www.bionet.nsc.ru/vogis/pict_pdf/2004/29/03_Inge_Vichtomov.pdf] — Белковая «наследственность» (прионы)
 
=== Регуляция работы гена: [[w:лактозный оперон|лактозный оперон]] ===
 
==== Строение лактозного оперона ====
'''Оперон''' — функциональная единица [[w:геном|генома]] у [[w:прокариоты|прокариот]], в состав которой входят [[w:ген|гены]], кодирующие совместно или последовательно работающие белки и часто объединенные под одним [[w:Промотор (молекулярная генетика)|промотором]].
 
[[w:концепция|Концепцию]] оперона для прокариот предложили в 1961 году французские ученые [[w:Жакоб, Франсуа|Франсуа Жакоб]], [[w:Моно, Жак|Жан Моно]] и [[w:Львов, Андре|Андре Львов]], за что получили [[w:Нобелевская премия по физиологии или медицине|Нобелевскую премию]] в 1965 году.
 
Характерным примером оперонной организации генома прокариот является [[w:лактозный оперон|лактозный оперон]].
Регуляция [[w:экспрессия генов|экспрессии генов]] метаболизма [[w:Лактоза|лактозы]] у [[w:Бактерии группы кишечных палочек|кишечной палочки]] (''Escherichia coli'') была впервые описана в 1961 году учеными [[w:Жакоб, Франсуа|Ф. Жакобом]] и [[w:Моно, Жак|Ж. Моно]].
 
'''Лактозный оперон''' (lac оперон) — [[w:цистрон|полицистронный]] оперон бактерий, в состав которого входят гены, отвечающие за усвоение и расщепление [[w:лактоза|лактозы]].
 
Лактозный оперон состоит из [[w:промотор|промотора]], [[w:оператор|оператора]], трех структурных генов и [[w:Терминатор (ДНК)|терминатора]]. Иногда принимается, что в состав оперона входит также ген-регулятор, который кодирует белок-репрессор.
 
'''Промотор''' — последовательность [[w:нуклеотид|нуклеотидов]] [[w:ДНК|ДНК]], узнаваемая [[w:РНК-полимераза|РНК-полимеразой]] как стартовая площадка для начала специфической, или осмысленной, [[w:Транскрипция (биология)|транскрипции]]. У прокариот все промоторы включают ряд похожих последовательностей нуклеотидов, важных для узнавания их РНК-полимеразой; в то же время разные промоторы отличаются друг от друга по другим последовательностям. Промотор асимметричен, что позволяет РНК-полимеразе начать транскрипцию в правильном направлении и указывает то, какая из двух цепей ДНК будет служить матрицей для синтеза РНК.
Промотор может частично перекрываться или вовсе не перекрываться с оператором.
 
'''Оператор '''— это последовательность [[w:нуклеотид|нуклеотидов]] [[w:ДНК|ДНК]], с которой связывается регуляторный белок — репрессор или активатор.
 
'''Структурные гены''' — это гены, кодирующие белки.
 
Структурные гены лактозного оперона — ''lacZ'', ''lacY'' и ''lacA'':
* ''lacZ'' кодирует фермент [[w:бета-галактозидаза|β-галактозидазу]], которая расщепляет [[w:дисахарид|дисахарид]] лактозу на [[w:глюкоза|глюкозу]] и [[w:галактоза|галактозу]],
* ''lacY'' кодирует [[w:бета-галактозид пермеазу|β-галактозид пермеазу]], мембранный транспортный белок, который переносит лактозу внутрь клетки.
* ''lacA'' кодирует [[w:бета-галактозид трансацетилазу|β-галактозид трансацетилазу]], фермент, переносящий ацетилную группу от [[w:кофермент А|ацетил-КoA]] на [[w:бета-галактозид|бета-галактозиды]].
 
<small>Для усвоения лактозы необходимы только продукты генов ''lacZ'' и ''lacY'', роль продукта гена ''lacA'' не ясна.</small>
 
При транскрипции с лактозного оперона считывается одна полицистронная мРНК, в которой закодированы все три белка. С неё сразу же начинают считываться эти белки, причем рибосомы «перескакивают» [[w:стоп-кодон|стоп-кодоны]], разделяющие нуклеотидные последовательности, кодирующие каждый из белков. (Для прокариот полицистронные РНК обычны, у эукариот они практически не встречаются).
 
[[Файл:Lac operon.png|thumb|center|550px|''lac'' operon in detail]]
 
==== Регуляция работы лактозного оперона ====
Бактериальная клетка синтезирует ферменты, принимающие участие в [[w:метаболизм|метаболизме]] лактозы, лишь в том случае, когда лактоза присутствует в окружающей среде и клетка испытывает недостаток [[w:глюкоза|глюкозы]].
 
РНК-полимераза начинает [[w:Транскрипция (биология)|транскрипцию]] с [[w:промотор (биология)|промотора]], который в случае лактозного оперона перекрывается с [[w:Оператор (биология)|оператором]]. В отсутствие или при низкой концентрации лактозы в клетке белок-репрессор, который является продуктом гена ''LacI'', обратимо соединяется с оператором и препятствует транскрипции. Таким образом, в отсутствие лактозы в клетке ферменты для метаболизма лактозы не синтезируются.
 
Даже в случае, когда в плазматической мембране клетки отсутствует фермент β-галактозидпермеаза, лактоза из окружающей среды может попадать в клетку в небольших количествах. В клетке две молекулы лактозы связываются с белком-репрессором, что приводит к изменению его конформации и далее к отделению белка-репрессора от оператора. Теперь может осуществляться транскрипция генов лактозного оперона. При снижении [[w:Концентрация|концентрации]] лактозы новые порции белка-репрессора взаимодействуют с операторными последовательностями и препятствуют транскрипции. Данный механизм регуляции активности лактозного оперона называют '''позитивной индукцией'''. Веществом-индуктором служит лактоза; при её связывании с белков-репрессором происходит его отделение от оператора.
 
Если в клетке концентрация глюкозы достаточная для поддержания обмена веществ, активация лактозного оперона не происходит. Промотор лактозного оперона «слабый» — даже при отсутствии белка-репрессора на операторе транскрипция практически не инициируется без дополнительных условий. Когда концентрация глюкозы в клетке снижается, происходит активация фермента [[w:аденилатциклаза|аденилатциклазы]], которая катализирует превращение АТФ в циклическую форму — [[w:циклический аденозинмонофосфат|цАМФ]] (цАМФ в данном случае также называют «сигналом клеточного голода»). Глюкоза — [[w:ингибитор|ингибитор]] фермента аденилатциклазы; кроме того, она активирует [[w:фосфодиэстераза|фосфодиэстеразу]] — фермент, катализирующий расщепление цАМФ.
 
цАМФ соединяется с белком, активирующим катаболизм ({{lang-en|САР, catabolism activating protein}}). Образуется комплекс цАМФ-CAP, который взаимодействует с промотором лактозного оперона, изменяет его конформацию и приводит к повышению сродства РНК-полимеразы к данному участку. В присутствии лактозы и при высокой концентрации цАМФ (то есть в отсутствии глюкозы) происходит активная транскрипция генов оперона, активно синтезируются ферменты для усвоения лактозы. Механизм регуляции активности лактозного оперона глюкозой называют '''негативной индукцией''' — глюкоза служит «негативным индуктором», то есть веществом, в присутствии которого лактозный оперон «выключен».
 
Итак, ферменты для усвоения лактозы синтезируются в клетке кишечной палочки при двух условиях: 1) наличие лактозы; 2) отсутствие глюкозы.
 
; Вопрос 1
: Мутации каких участков в ДНК кишечной палочки могут привести к появлению бактерий:
:# Не способных усваивать лактозу?
:# Синтезирующих ферменты для усвоения лактозы даже в её отсутствие?
:# Способных усваивать лактозу при высокой концентрации глюкозы?
 
Для простоты будем считать. что любая мутация приводит к «поломке» (выходу из строя) гена или иного участка ДНК.
 
==== Биологический смысл ====
Благодаря описанному механизму регуляции транскрипции генов, входящих в состав лактозного оперона, бактерии оптимизируют энергетические затраты, синтезируя ферменты метаболизма лактозы не постоянно, а лишь тогда, когда клетке это необходимо. Сходный механизм регуляции имеется у большинства [[w:Прокариоты|прокариот]]; у [[w:Эукариоты|эукариот]] он устроен значительно сложнее.
 
Регуляция работы лактозного оперона в зависимости от концентрации лактозы происходит по принципу [[w:отрицательная обратная связь|отрицательной обратной связи]]: чем больше лактозы — тем больше ферментов для её усвоения (положительная прямая связь); чем больше ферментов — тем меньше лактозы, чем меньше лактозы — тем меньше производится ферментов (двойная отрицательная обратная связь).
 
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/lacoperon.html] Анимация «Регуляция работы лактозного оперона» (англ. текст)
 
=== Регуляция работы генов эукариот ===
У эукариот ''опероны отсутствуют'', и система управления активностью генов более сложная. Во-первых, у эукариот часто одновременно включаются не три гена (или чуть больше), а целые батареи генов. Во-вторых, регуляция активности генов происходит не только за счет связывания белков с промоторами генов, но и за счет взаимодействия с генами энхансеров и сайленсеров, за счет спирализации и деспирализации хромосом и других механизмов. В-третьих, у эукариот регуляция работы генов чаще происходит не по принципу «да–нет», а по принципу «больше–меньше».<br />
 
В клетках эукариот от ДНК исходят сигналы, которые в конечном счете передаются РНК-полимеразе: стимулируют или подавляют инициацию синтеза РНК. Источником сигналов служат определенные локусы ДНК — регуляторные элементы. Эти участки имеют небольшие размеры, порядка 10 н. п. Регуляторные элементы, стимулирующие транскрипцию, называют энхансерами (англ. enhancer — усилитель), а подавляющие транскрипцию — сайленсерами (англ. silencer — глушитель, успокоитель).
Регуляторные элементы могут избирательно соединяться с белками-регуляторами.
Белки, соединяющиеся с энхансерами, называют индукторами, а соединяющиеся с сайленсерами — репрессорами. Цис-элементы действуют на гены только той молекулы ДНК, в которой они сами находятся. Энхансеры и сайленсеры могут располагаться вблизи от промотора и от стартовой точки транскрипции регулируемого гена, но могут быть и удалены от него, даже на тысячи нуклеотидных пар, как в сторону 5'-конца, так и в сторону З'-конца. Однако они могут быть сближены в результате изгибания молекулы ДНК.
Белки-регуляторы (индукторы и репрессоры) содержат по крайней мере три домена:
* домен, узнающий определенную нуклеотидную последовательность ДНК; ;
* домен, узнающий трансэлементы;
* домен, взаимодействующий с факторами транскрипции в области ТАТА-последовательности; в результате этого белки-регуляторы влияют на транскрипцию, а именно увеличивают (индукторы) или уменьшают (репрессоры) частоту инициации транскрипции.
Каждый ген регулируется независимо от других. Следовательно, для каждого гена существуют специфические регуляторные элементы (локусы ДНК) и специфические регуляторные белки, узнающие эти элементы. Уже известно много регуляторных белков и регуляторных элементов разных генов, и постоянно обнаруживаются все новые и новые.
Присоединение регуляторных белков к энхансерам или сайленсерам зависит от других веществ — трансэлементов, сигнальных молекул, приносимых в клетку с кровью или образующихся в самой клетке. К числу таких молекул относятся гормоны, некоторые метаболиты, ионы металлов. Есть регуляторные белки, реагирующие на изменение температуры. Все эти сигналы стимулируют присоединение индукторов к соответствующим энхансерам или репрессоров к соответствующим сайленсерам. Трансэлементами их называют потому, что они могут действовать на любую молекулу ДНК (любую хромосому), если только в ней есть подходящий цис-элемент.
 
== Методы исследования клеток ==
 
=== Световой микроскоп ===
 
==== Принцип работы ====
 
==== Приготовление срезов и окрашивание препаратов ====
 
==== Современные методы световой микроскопии ====
[http://bioclass520.ru/lukyanov5.pdf] — Использование [[w:Зеленый флуоресцентный белок|GFP]] и других флуоресцентных белков в молекулярной биологии
 
=== Электронная микроскопия ===
 
==== Принцип работы ====
 
==== Трансмиссионная и сканирующая электронная микроскопия ====
 
=== Основные биохимические методы ===
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/gelelectrophoresis.html] Анимация «Гель-электрофорез ДНК» (агл.текст)
 
=== Основные методы молекулярной биологии ===
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/plasmidcloning.html] — Анимация «Клонирование ДНК с помощью плазмид» (англ.текст)
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/dnalibrary.html] Анимация «Создание библиотек ДНК» (англ. текст)
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/pcr.html] — Анимация «Полимеразная цепная реакция» (англ.текст)
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/dnachips.html] — Анимация «Технология исследования ДНК с помощью чипов» (англ. текст)
 
== Обмен веществ и превращения энергии в клетках ==
[http://www.life.illinois.edu/crofts/bioph354/index.html] — Курс лекций по биоэнергетике проф. Э. Крофтса (Университет штата Иллинойс, 2000 г) (англ.)
 
=== Основные способы питания и получения энергии ===
Все живые организмы с точки зрения физики — [[w:открытая система (физика)|открытые системы]]. Они обмениваются с окружающей средой веществами, энергией и информацией.
 
Внешние источники энергии нужны живым системам, чтобы
* получать из внешней среды и использовать вещества для роста и размножения,
* двигаться, выбирая лучшие условия для жизни,
* поддерживать высокую упорядоченность (например, синтезировать сложные веществ из простых и доставлять определенные вещества в разные части клеток, создавая из сложную структуру).
 
При любых процессах превращения энергии, которые происходят в живых системах (и в неживых тоже!) часть энергии рассеивается в виде тепла, и её невозможно повторно использовать для совершения полезной работы. «[[w:Энтропия|Энтропия]] изолированной системы не может уменьшаться» (закон неубывания энтропии) — одна из формулировок [[w:Второе начало термодинамики|второго начала термодинамики]] — в применении к живым системам означает. что без притока энергии извне невозможно поддерживать сложную структуру. Поэтому все живые системы относятся к [[w:Диссипативная система|диссипативным]].
 
Внешние источники веществ нужны, так как в ходе обмена веществ образуются ядовитые «осколки» молекул. Например, при превращении аминокислот в глюкозу выделяется ядовитый [[w:аммиак|аммиак]] — NH<sub>3</sub>. Эти вещества выводятся из организма, а новые атомы азота должны поступать с пищей. На выведение ядовитых отходов расходуется вода, в которой они растворяются, так что её запасы тоже приходится восполнять. Наконец, часть органики используется организмами для получения энергии в ходе [[w:гликолиз|гликолиза]], [[w:клеточное дыхание|клеточного дыхания]] и других процессов. При этом органические молекулы расщепляются, и конечными продуктами могут быть такие вещества, как углекислый газ или водород, которые также выводятся и которые данный организм не может использовать для повторного синтеза органических веществ.
 
Способы питания и получения энергии живыми организмами, как и все биологические явления и процессы, можно классифицировать по-разному.
 
<big>Первая классификация основана на том, какой внешний источник энергии использует живой организм. Таких источников для основных процессов жизнедеятельности всего два - свет и энергия химических связей молекул. Если организм использует в качестве источника энергии свет, то это '''фототроф'''. Если же источник энергии для организма - энергия химических связей (не важно. органических или неорганических молекул) - это '''хемотроф'''.</big>
 
=== Связь обмена веществ и энергии в клетках. Катаболизм и анаболизм ===
 
=== АТФ и мембранный потенциал — универсальные источники энергии ===
 
=== Гликолиз — универсальный способ получения энергии ===
 
==== Брожение и гликолиз. История изучения брожения ====
 
==== Гликолиз как пример метаболического пути ====
 
=== Дыхание. Строение и функции митохондрий ===
 
==== Клеточное дыхание, его распространенность среди живых организмов ====
 
==== Строение митохондрий ====
[[w:Митохондрии|Митохондрии]] — округлые или цилиндрические тельца диаметром 1-2 микрометра, окруженные двумя мембранами. Во внутреннюю мембрану заключено содержимое митохондрии — матрикс. Матрикс содержит генетический материал митохондрий (кольцевые, реже линейные молекулы ДНК), рибосомы и другие компоненты системы синтеза белка, ферменты, участвующие в [[w:цикл Кребса|цикле Кребса]]). Внутренняя мембрана митохондрий образует впячивания — кристы. Во внутреннюю мембрану встроены белки цепи переноса электронов, а также протонная [[w:АТФ-синтаза|АТФ-синтетаза]].
 
Митохондрии разных эукариот сильно различаются по размерам и числу в клетке, форме крист, количеству и структуре молекул ДНК и другим признакам.
 
[http://www.pereplet.ru/nauka/Soros/pdf/9712_010.pdf] Ченцов Ю. С. Хондриом — совокупность митохондрий клетки. СОЖ, 1997, N 12, с. 10-16
 
==== Теория симбиогенеза: происхождение митохондрий ====
Гипотеза симбиотического происхождения хлоропластов впервые появилась в 1883 году. Её предложил Андреас Шимпер. Достаточно подробно в 1910-е годы теорию симбиогенеза обосновал [[w:Мережковский, Константин Сергеевич|К.С. Мережковский]]. В 1920-е годы теория симбиогенеза была развита [[w:Козо-Полянский, Борис Михайлович|Б.М. Козо-Полянским]], был предложен вариант симбиотического происхождения [[w:Митохондрии|митохондрий]]. Активное развитие [[w:Теория|теории]] началось уже в работе Линн Маргулис с 1960 года.
 
Согласно теории [[w:Симбиогенез|симбиогенеза]] [[w:Митохондрии|митохондрии]] произошли от бактерий-[[w:симбиоз|симбионтов]]. Древние прото[[w:Эукариоты|эукариоты]] не могли использовать [[w:Кислород|кислород]] для генерации энергии, поэтому они вступили в симбиотическую связь с будущими митохондриями, захватив их в результате [[w:Фагоцитоз|фагоцитоза]]. В результате [[w:Эволюция|эволюции]] они больше не могут существовать без клеток.
 
http://biotriton.narod.ru/text/fagocitoz.gif - Анимация фагоцитоза
 
Митохондрии обладают признаками [[w:Бактерия|бактерий]]:
 
1. У них имеется 2 замкнутые [[w:Клеточная мембрана|мембраны]], унаследованные от их предков - грамотрицательных бактерий.
 
2. Размножаются бинарным делением, и только делением.
 
3. Есть кольцевая [[w:ДНК|ДНК]].
 
4. Имеют [[w:Рибосома|рибосомы]] прокариотического типа для [[w:Синтез|синтеза]] [[w:Белок|белков]].
 
То же самое можно сказать и о [[w:Пластида|пластидах]].
 
==== Основные процессы, происходящие в митохондриях. Цикл Кребса и электронтранспортная цепь ====
 
==== Основные процессы, происходящие в митохондриях. Строение и работа АТФ-синтетазы ====
[[Файл:Atp synthase.PNG|thumb|upright=1.3|Молекулярная модель АТФ-синтазы]]
Созданный протонный градиент использует для синтеза АТФ белок со сложной четвертичной структурой - [[w:АТФ-синтаза|протонная АТФ-синтетаза]]. Этот белок состоит из закрепленного во внутренней мембране митохондрии статора и вращающегося ротора. При одном обороте ротор пропускает через себя с наружной стороны мембраны на внутреннюю, в матрикс, около десятка протонов через специальный канал. За счет энергии, которая при этом расходуется, меняется конформация трех субъединиц ротора, где происходит синтез трех молекул АТФ из АДФ и фосфорной кислоты.При этом электрическая энергия протонного градиента преобразуется сначала в механическую, а затем - в энергию химических связей АТФ. [[w:Коэффициент полезного действия|КПД]] этого процесса приближается к 100% - больше, чем у любых созданных человеком устройств, преобразующих энергию.
 
 
[http://www.pereplet.ru/nauka/Soros/pdf/9906_008.pdf]Тихонов А. Н. Молекулярные моторы. Часть 1. Вращающиеся моторы живой клетки // СОЖ. 1999, № 6, с. 8-16
 
[http://bio.fizteh.ru/student/files/biology/biolections/lection03.html]- Лекция «Молекулярные машины» (ФМБФ физтеха; в начале лекции речь идет о наследовании групп крови, а затем про АТФ-синтазу)
 
[http://www.youtube.com/watch?v=uOoHKCMAUMc] — Анимация и видео (текст на английском)
 
=== Фотосинтез, его роль в клетке и в биосфере ===
 
==== Варианты фотосинтеза у прокариот ====
 
==== Строение и функции хлоропластов ====
==== Теория симбиогенеза: происхождение хлоропластов ====
Хлоропласты клетки, как и митохондрии - потомки бактерий.
 
Предками хлоропластов красных и зеленых водорослей, а также глаукофитовых водорослей были цианобактерии. Цианобактерии относятся к грам-отрицательным бактериям (как и предки митохондрий), и пластиды унаследовали от них обе мембраны - плазматическую и наружную. У хоропластов глаукофитовых между ними сохранилась рудиментарная клеточная стенка (их пластиды называют цианеллами, подчеркивая сходство с цинобактериями; однако по размеру генома они похожи на "обычные" пластиды). Такие пластиды, окруженные двумя мембранами, называют первичными.
 
Пластиды остальных групп водорослей (бурых, диатомовых, эвгленовых, криптофитовых, динофлагеллят и др.) возникли в результате вторичного эндосимбиоза - поглощения эукариотических водорослей бесцветными фаготрофными протистами. Многие из таких вторичных пластид окружены не двумя, а тремя или четырьмя мембранами.
 
Patrick J. Keeling. The endosymbiotic origin, diversification and fate of plastids. Phil. Trans. R. Soc. B 2010 365, 729-748[http://www.botany.ubc.ca/keeling/PDF/10roysoc.pdf]
 
==== Основные процессы, происходящие в хлоропластах: световые стадии ====
 
==== Основные процессы, происходящие в хлоропластах: темновые стадии ====
 
=== Жизненный цикл и функциональные перестройки пластид ===
 
== Строение и функции плазматической мембраны ==
<big>Наружная мембрана клеток (плазматическая мембрана, [[w:плазмалемма|плазмалемма]]) — обязательный компонент любой клетки. Она состоит из двух слоёв молекул фосфолипидов (см. [[#Фосфолипиды|Фосфолипиды]]), обязательно содержит белки и может содержать другие вещества (например, в состав плазмалеммы животных клеток входит [[w:холестерин|холестерин]]). Сходное строение имеют и мембраны органелл клетки.</big>
 
 
=== Фосфолипиды амфифильны и самопроизвольно образуют бислои при взаимодействии с водой===
[[Файл:Phospholipids aqueous solution structures.svg|thumb|250px|right|Полуобъёмная реконструкция структур, которые могут формировать фосфолипиды при взаимодействии с водой]]
 
 
Так как молекулы [[w:Фосфолипиды|фосфолипидов]] амфифильны, их гидрофильные «головы» притягивают к себе диполи воды, а гидрофобные «хвосты» «стремятся» избежать взаимодействия с водой. Если растворить фосфолипиды в эфире или ацетоне и вылить раствор на поверхность воды, то при определенных условиях формируется слой толщиной всего в одну молекулу. В этом слое все «головы» фосфолипидов погружены в воду, а «хвосты» торчат из воды. Если перемешать фосфолипиды с водой (например, встряхиванием или действуя ультразвуком), то истинный раствор (в котором молекулы плавают поодиночке) не возникнет. В толще воды формируются разные структуры из фосфолипидов, в том числе [[w:мицеллы|мицеллы]] и [[w:липосомы|липосомы]].
 
Молекулы мыла, в которых присутствует один остаток жирной кислоты, более склонны к образованию мицелл (см. рис.). Молекулы фосфолипидов чаще образуют липосомы, стенка которых состоит из двойного слоя молекул. В таком липидном бислое гидрофобные "хвосты" с двух сторон заэкранированы "головами" и не контактируют с водой.
 
Те же силы гидрофильно-гидрофобных взаимодействий делают липидные бислои самозамыкающимися. Любое отверстие в слое создает свободные края, а там гидрофобные хвосты соприкасаются с водой. Это энергетически невыгодно, и молекулы бислоя спонтанно перегруппировываются так, что края исчезают. Если отверстие небольшое, то оно в результате замыкается. Если же отверстие велико, то слой может разделиться на несколько замкнутых пузырьков. В обоих случаях свободные края удаляются.
 
=== Липидный бислой — основа биологических мембран ===
Основой всех биологических мембран, кроме мембран клеток [[w:археи|архей]], служит фосфолипидный бислой.
[[Файл:Archaea membrane.svg|thumb|left|180px|Вверху — фосфолипид архей, в центре — фосфолипид бактерий и эукариот, внизу справа — мембрана бактерий и эукариот, слева — мембрана архей в виде монослоя]]
''У архей мембрана состоит из бислоя или монослоя фосфолипидов, представляющих собой эфиры глицерина и изопреноидных спиртов (алкилов) с разветвленными цепями, а иногда и с циклопропановыми или циклогексановыми кольцами. Изопреноиды имеют длину 20 (в случае бислоя) или 40 (в случае монослоя) атомов. У фосфолипидов однослойных мембран архей (таких, как показанный на рис.слева внизу диалкилглицерол-тетраэфир) две гидрофильные головки.''
 
Фосфолипиды, входящие в состав мембран, у эукариот довольно разнообразны; роль их разнообразия не до конца ясна. В состав мембран эукариотических клеток входит [[w:холестерин|холестерин]].
 
'''Задача1.''' Известно, что [[w:эритроцит|эритроциты]] человека практически лишены внутренних мембран. Зная размеры и форму эритроцитов, можно определить их площадь поверхности. Допустим, что общая площадь поверхности эритроцитов из 1 мм³ крови составляет около 250 мм² (попробуйте оценить, насколько правдоподобно это число). Можно разрушить эритроциты, растворить их мембраны в ацетоне и вылить раствор на поверхность воды. При определенных условиях фосфолипиды образуют слой толщиной в одну молекулу. Какова будет площадь этого слоя? Каковы возможные ошибки этой оценки?
 
==== Липидный бислой - двумерная жидкость ====
[[Файл:Lipid bilayer section.gif]]
 
Молекулы фосфолипидов самопроизвольно (без участия ферментов) очень редко перемещаются из одного слоя мембраны в другой. Поэтому наружный и внутренний слои могут отличаться по составу фосфолипидов. Однако в пределах «своего» слоя в определённом диапазоне температуры молекулы фосфолипидов двигаются примерно с такой же скоростью, что и в жидкости. Образно говоря, мембрана — «двумерная жидкость». Отдельная молекула фосфолипида в этой жидкости перемещается за секунду в среднем на расстояние около 2 мкм. Так что на картинке вверху движение молекул фосфолипидов не такое, как в жизни. Зато на картинке видно, что эти молекулы время от времени слегка «выпирают» из слоя, а между ними образуются небольшие щели. Так и происходит на самом деле.
 
Течучесть мембран обеспечивает самозамыкание (о его причинах - см. выше). Если воткнуть в клетку тонкую иглу или трубку (микропипетку), а затем вытащить её обратно, то во многих случаях клетка остается целой и невредимой. Образовавшееся в мембране отверстие затягивается, как пленка нефти на поверхности воды, и содержимое клетки не успевает вытечь наружу.
 
'''Задача'''. Как Вы думаете, почему текучесть мембраны важна для ее функционирования? Какие функции мембраны нарушились бы при резком уменьшении текучести?
 
Текучесть мембраны падает при понижении температуры. При определенной температуре текучесть зависит от состава мембраны. Чем теснее упакованы "хвосты" фосфолипидов, тем менее текучей будет мембрана. Главные свойства углеводородных хвостов, влияющие на плотность упаковки – их длина и количество в них двойных связей.
 
При увеличении длины "хвостов" (она варьирует от 14 до 24 атомов углерода) текучесть мембраны понижается. Двойные связи в остатках ненасыщенных жирных кислот создают изгибы "хвостов", снижают плотность упаковки и повышают текучесть мембраны.
 
'''Задача'''. В каком масле больше ненасыщенных жирных кислот - сливочном или подсолнечном? Ответ обоснуйте.
 
У бактерий, грибов и растений при повышении температуры синтезируются фосфолипиды с более длинными "хвостами" и/или меньшим числом двойных связей, чтобы поддерживать текучесть мембран на постоянном уровне.
 
У животных на текучесть мембран сильнее влияет содержание [[w:холестерин|холестерина]]. При высокой (35-40<sup>0</sup>С) температуре он снижает текучесть. При низкой температуре он препятствует "замерзанию" мембраны, способствует сохранению подвижности молекул фосфолипидов. Особенно много холестерина в наружной мембране (до 50%, то есть по одной молекуле холестерина на каждую молекулу фосфолипидов).
 
<small>Вопреки распространенному мнению, стеролы (к которым относится и холестерин) присутствуют и в мембранах клеток некоторых прокариот. Наиболее полный путь биосинтеза стеролов найден у [[w:Миксобактерии|миксобактерий]]. Правда, нельзя исключить, что часть генов, необходимых для синтеза стеролов, они получили от эукариот путем горизонтального переноса [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2817430/]</small>
 
[[Syndai_virus_cell_fusion.jpg]]
 
====Липидный бислой гибок. но нерастяжим====
====Липидный бислой обладает избирательной проницаемостью====
 
====Новые фосфолипиды синтезируются на мембранах ЭПС и доставляются в другие мембраны двумя способами====
 
==== Липосомы — искусственные бислойные структуры, используемые в практике ====
 
Жидкие свойства мембран можно изучать, используя искусственные липидные бислои. Часто в опытах используют замкнутые сферические пузырьки – липосомы. Они образуются, если в воду помещают чистые фосфолипиды; их диаметр варьирует от 25 нм до нескольких микрометров (чаще - 25-250 нм).
 
[http://www.pereplet.ru/nauka/Soros/pdf/9810_002.pdf]Барсуков Л. И. Липосомы — Соросовский образовательный журнал, 1998
 
=== Основные функции наружной мембраны ===
* '''Отграничительная''' функция. Наружная мембрана обеспечивает целостность клетки, не давая её содержимому (растворимым веществам цитоплазмы) смешаться с окружающей средой или межклеточной жидкостью.
* '''Транспортная''' функция. Важное свойство мембраны, связанное с выполнением этой функции — избирательная проницаемость. Некоторые вещества свободно проходят через липидный бислой за счет диффузии, для других он практически непроницаем. За транспорт таких веществ в клетки и из клеток отвечают особые транспортные белки.
* '''Рецепторная функция'''. Белки-рецепторы, имеющиеся на наружной мембране любой клетки, обеспечивают восприятие сигналов из внешней среды, их передачу в клетку и запуск ответной реакции. Самый распротсраненный вид сигналов — химические вещества, которые связываются с рецепторами.
* '''Образование межклеточных контактов'''.
 
=== Белки — обязательный компонент биологических мембран. Типы мембранных белков ===
 
Для многих веществ, которые необходимы клетке для роста и получения энергии, липидный бислой практически непроницаем. Так, очень медленно диффундируют через него глюкоза и другие моносахариды, аминокислоты и нуклеотиды.
 
Уже из этого ясно, что в мембране должны существовать «поры» для транспорта веществ в клетку и из клетки. Транспорт веществ, которые медленно проходят через липидный бислой, осуществляют транспортные белки. Две их основные разновидности - это белки-каналы и белки-переносчики.
 
Рецепторную функцию мембраны тоже обеспечивают белки. Это - белки-рецепторы. (Часто в состав мембранных рецепторов входят олигосахарадиные цепи, так что, строго говоря, это [[w:гликопротеиды|гликопротеиды]]). При этом часть рецепторов одновременно служат и ионными каналами. Это, прежде всего, рецепторы [[w:Нейромедиатор|нейромедиаторов]]. Другие рецепторы являются ферментами - они либо активируют специальные белки-посредники ([[w:G-белки|G-белки]]), либо "работают" [[w:протеинкиназы|протеинкиназами]].
 
=== Другие компоненты мембран, их роль ===
 
В состав клеточных мембран всегда входят белки, а в составе большинства мембран присутствуют также углеводы (точнее, гликолипиды и гликопротеиды). В состав клеточных мембран животных входит [[w:холестерин|холестерин]].
 
=== Отграничительная функция. Слияние и разделение клеток ===
Наружная мембрана обеспечивает целостность клетки, не давая её содержимому (растворимым веществам цитоплазмы) смешаться с окружающей средой или межклеточной жидкостью. Только самые мелкие из органических молекул клетки с заметной скоростью «теряются», проходя сквозь липидный бислой.
 
Замечательная особенность мембраны, связанная с выполнением этой функции — её текучесть. Мембрана представляет собой «двухмерную жидкость» — молекулы фосфолипидов быстро (как в жидкости) диффундируют в плоскости «своего» слоя мембраны. Поэтому мембрана способна к '''самозамыканию'''. Если проткнуть мембрану сравнительно тонкой иглой или трубочкой, а потом вынуть её, во многих случаях клетка останется целой — мембрана сомкнётся и «залечит» отверстие.
 
=== Транспортная функция. Транспорт веществ через мембрану, его типы ===
 
* [http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/carrier_proteins.html] — Анимация «Унипорт, симпорт, антипорт» (англ. текст)
 
==== Тепловое движение молекул — одно из основных свойств материи ====
[[Файл:Translational motion.gif|thumb|right|300px| Хаотическое тепловое движение частиц вещества, таких как атомы и молекулы]]
''Теплово́е движе́ние''' — процесс [[w:хаос|хаотического]] (беспорядочного) [[w:Движение|движения]] частиц, образующих [[w:вещество|вещество]]. Чаще всего рассматривается тепловое движение [[w:атом|атомов]] и [[w:молекула|молекул]].
 
[[w:Хаотичность|Хаотичность]] — важнейшая черта теплового движения. Важнейшими доказательствами существования движения молекул является [[w:Броуновское движение|броуновское движение]] и [[w:диффузия|диффузия]].
 
==== Пассивный транспорт не требует затрат энергии====
[[w:Пассивный транспорт|Пассивный транспорт]] — транспорт, не требующий затрат энергии. Он всегда идет по градиенту концентрации — оттуда, где вещества больше, туда, где его меньше. При этом вещества могут диффундировать через липидный бислой (простая [[w:диффузия|диффузия]]) или проходить через специальные каналообразующие белки (облегченная диффузия). Иногда пассивный транспорт происходит при участии белков-переносчиков.
 
Через липидный бислой путем пассивного транспорта проходят малые неполярные молекулы (кислород, углекислый газ, азот, бензол) и полярные молекулы массой до 100 дальтон (глицерин, этанол и др.). ВОда обычно также проходит в клетки и из клеток чеез липдных бислой; в особых случаях, когда транспорт воды нужно резко ускорить, она рпоходит через особые канальные белки - [[w:Аквапорин|аквапорины]].
 
<small>У человека аквапорины экпрессируются многими клетками - прежде всего, клетками почечных канальцев и эритроцитами. Мутации генов аквапоринов приводят к некоторым наседственным болезням - например. могу вызывать наследственную катаракут и наследственный несахарный диабет. Аквапорины и родственные белки - акваглицеропорины - есть также у растений, грибов, протистов и бактерий. Через акваглицеропорины могут проходить глицерин, мочевина, а также (у растений) ортоборная и ортокрмниевая ислоты и похожие на них соединения. </small>
 
[[Файл:Osmotic pressure on blood cells diagram.svg|thumb|right]]
 
====Осмос - диффузия растворенных веществ====
Частный случай пассивного транспорта —- [[w:осмос|осмос]]. Обычно осмосом называют диффузию растворителя через преграду, непроницаемую для растворенных веществ. Такие преграды — это обычно тонкие пленки (например,
пленки из [[w:целлофан|целлофана]], в которые упаковывают многие сорта сосисок). Типичная полупроницаемая пленка — липидный бислой биологических мембран.
 
==== Белки-каналы, их строение и функции ====
Белки-каналы - порообразующие белки, пронизывающие клеточные мембраны. Они имеют сложную третичную, а часто и четвертичную структуру (многие каналы состоят из 2-6 полипептидных цепей). В центре канала находится водная пора. Самое узкое место поры (селективный фильтр) по диаметру лишь немного превышает диаметр атома. У многих каналов есть "ворота" - участки молекулы, которые могут менять конформацию и закрывать пору. У таких каналов есть как минимум два состояния - открытое и закрытое. Наконец. у части каналов есть дополнительный участок (домен), часто похожий по форме на шарик на подвижной проволочке. который может закрывать канал при определенных условиях, делая его нечуствительным к воздействиям. обычно открывающим канал. Такое состояние канала называется инактивированным.
 
Большинство каналов пропускает определенные ионы. Некоторые каналы пропускают все ионы одного знака заряда ([[w:катионы|катионы]] или [[w:|анионы]]. Многие каналы пропускают преимущественно одну разновидность ионов. На мембране большинства клеток есть каналы для ионов натрия, калия, хлора и кальция. Многие натриевые каналы непроницаемы для ионов калия. Это неудивительно, так как ионы калия имеют больший диаметр. Но и многие калиевые каналы непроницаемы для ионов натрия! Лишь недавно удалось понять, как обеспечивается такая избирательность.
 
Два основных типа каналов - лиганд-зависимые и потенциал-зависимые. Лиганд-зависимые каналы открываются при присоединении к ним извне какого-либо вещества (лиганда). Этим они похожи на белки-рецепторы (такие каналы - то же самое, что ионотропные рецепторы). Потенциал-зависимые каналы открываются или закрываются в зависимости от [[w:потенциал действия|разности потенциала]] на мембране клетки.
 
Существуют и другие типы каналов. Например, многие каналы открываются при воздействии на них циклических нуклеотидов (цАМФ или цГМФ)не извне, а из цитоплазмы, с внутренней стороны мембраны. Есть механочувствительные каналы. Некоторые из них открываются при растяжении мембраны. В других случаях канал при натяжении открывает присоединенный к нему элемент цитоскелета или внеклеточного матрикса (так, например, открываются и закрываются натриевые каналы на [[w:волосковая клетка|волосковых клетках]] внутреннего уха позвоночных.
 
[http://nanobiologynotes.blogspot.com/2006/02/ion-channels-gates-in-cell-wall.html] Схема и описание прохождения ионов калия через калиевый канал (англ.)
 
==== Белки-переносчики ====
 
[[Файл:Scheme sodium-potassium pump-en.svg|thumb|350px|Схема рабочего цикла натрий-калиевой АТФазы]]
 
'''Белки-переносчики''' — это ещё одна группа транспортных белков. Они участвуют в транспорте веществ, которые не могут пройти сквозь липидный бислой. Белки-переносчики связываются с ионами или молекулами того вещества, которое они переносят, и доставляют их в клетку или из клетки.<br /> От белков–каналов они отличаются тем, что белки-канала - порообразующие белки, они пропускают вещества сквозь заполненную водой пору, а не захватывают и не перетаскивают их на другую сторону мембраны.
 
Чтобы лучше понять принцип работы белков-переносчиков, рассмотрим работу [[w:Натрий-калиевая аденозинтрифосфатаза|натрий-калиевой АТФазы]].
Натрий-калиевая АТФаза присутствует на мембране почти всех клеток человека. Она действует как насос, перекачивая ионы Na<sup>+</sup> из клетки во внешнюю среду, а ионы К<sup>+</sup> в клетку. Na<sup>+</sup>/K<sup>+</sup> АТФаза отвечает за поддержание мембранного потенциала клетки.<br />
Как же происходит перенос ионов Na<sup>+</sup> и K<sup>+</sup>? Сначала к натрий-калиевой АТФазе присоединяются три иона Na<sup>+</sup>, из-за чего изменяется конформация АТФазы. Затем АТФаза расщепляет молекулу АТФ на АДФ и фосфат (РО<sup>-</sup>³<sub>4</sub>).
При этом фосфат-ион присоединяется к поверхности белка. Энергия, выделившаяся за счёт расщепления АТФ, расходуется на изменение конформации АТФазы. После всех превращений белок „переворачивается“, и три иона Na<sup>+</sup> оказываются на внешней стороне мембраны, а фосфат заменяется на два иона K<sup>+</sup>, при этом ионы K<sup>+</sup>присоединяются не к тому месту, где были ионы Na<sup>+</sup> , а связываются со своим определённым участком. Из-за этого АТФаза вновь меняет свою конформацию, и ионы К<sup>+</sup> переносятся на внутреннюю сторону мембраны. Здесь ионы К<sup>+</sup> отсоединяются от АТФазы.<br />Кроме натрий-калиевой АТФазы есть также кальциевая АТФаза, хлорная АТФаза и другие. Важная особенность белков-насосов заключается в том, что каждый ион движется из области низкой концентрации в область высокой, то есть каждый ион перемещается против своего градиента концентрации. Это движение называется активным транспортом и может происходить только при помощи расходования АТФ.<br />Помимо активного транспорта белки-переносчики могут осуществлять пассивный транспорт, перемещая вещества из области высокой концентрации в область низкой. Также этот транспорт называют облегчённой диффузией. Например, поступление глюкозы в эритроциты происходит при помощи облегчённой диффузии.
 
[http://www.youtube.com/watch?v=6o6GCP3ROqo Работа натрий-калиевой АТФазы (на русском языке)]
 
==== Активный транспорт. Примеры и роль активного транспорта ====
Активный транспорт обычно обеспечивается белками-переносчиками, которые обладают АТФ-азной активностью.
 
[http://www.vivo.colostate.edu/hbooks/molecules/sodium_pump.html]- Описание строения и работы и анимация натрий-калиевой АТФ-азы (англ.)
 
=== Рецепторная функция. Типы белков-рецепторов ===
У любых клеток есть мембранные [[w:Трансмембранный рецептор|белки-рецепторы]]. Это трансмембранные белки, пересекающие липидный бислой один или несколько раз. В состав многих из них входят олигосахариды (такие рецепторы правильнее называть гликопротеидами).
 
''Такие белки присутствуют не только на наружной мембране, но и на многих внутриклеточных мембранах. Например, [[w:Кальциевые каналы|рианодиновые рецепторы]] и рецепторы [[w:Инозитолтрифосфат|инозитолтрифосфата]] есть на мембране [[w:Эндоплазматический ретикулум|эндоплазматического ретикулума]]''.
 
Мембранные рецепторы связывают сигнальное вещество ('''лиганд''') и при этом изменяют свою конформацию. Часть из них одновременно являются ионными каналами; при связывании лиганда канал может открываться или закрываться. Такие белки называются '''ионотропные рецепторы'''. Другие рецепторы при связывании лиганда запускают какую-нибудь химическую реакцию на внутренней стороне мембраны (так что они являются одновременно ферментами или регуляторными белками); такие белки называются '''метаботропные рецепторы'''.
 
Два главных типа метаботропных рецепторов - это [[w:GPCR|рецепторы, сопряженные с G-белками]] , и [[w:Протеинкиназа|рецепторы с протеинкиназной активностью]] .
 
Рецепторы, сопряженные с G-белками - это семиспиральные (семь раз пересекающие мембрану в виде альфа-спиралей) белки. Рассмотрим механизм их действия на примере [[w:Бета-2 адренорецептор|бета-2 адренорецепторов]]. Это - один из типов [[w:Адренорецепторы|адренорецепторов]], чувствительный в основном к [[w:Адреналин|андреналину]] ([[w:Норадреналин|норадреналин]] действует на них в меньшей степени).
 
[[File:Beta-2 adrenergic receptor.png|thumb|Выявленная с помощью рентгеноструктурного анализа структура β<sub>2</sub>-адренорецептора, связанного с одним из искусственных лигандов]]
 
При действии адреналина на эти рецепторы гладкие мышцы бронхов и кровеносных сосудов скелетных мышц расслабляются, а в клетках печени усиливается распад гликогена (гликогенолиз), и образующаяся глюкоза выходит в кровь. С данным типом рецепторов связан Gs-белок. Этот белок, как и другие G-белки, состоит из трех субъединиц (полипептидных цепей) - α,β, и γ. Он "приделан" к внутренней стороне мембраны с помощью двух хвостов жирных кислот и свободно передвигается в плоскости мембраны. С α-субъединицей неактивного Gs-белка связана молекула [[w:ГДФ|ГДФ]]. Когда на бета-2 рецептор действует адреналин, рецептор активируется (меняет свою конформацию) и активирует Gs-белок. В результате α-субъединица отделяется от βγ-субъединицы и обменивает молекулу ГДФ на молекулу [[w:ГТФ|ГТФ]]. Такая активная α-субъединица соединяется с трансмембранным белком-ферментом [[w:аденилатциклаза|аденилатциклазой]], активируя его.
 
[[File:Activatoin-Adenylate cyclase-outlined.svg|thumb|left|430px|Активация G<sub>s</sub>-белка и аденилатциклазы]]
 
Этот фермент осуществляет синтез [[w:циклический аденозинмонофосфат|циклического аденозинмонофосфата (цАМФ)]] из [[w:АТФ|АТФ]]. цАМФ - один из универсальных [[w:Вторичные посредники|вторичных посредников]], используемых для передачи сигнала в клетках. В данном случае цАМФ активирует одну из [[w:протеинкиназа|протеинкиназ]] - [[w:Протеинкиназа А|протеинкиназу А (РКА)]]. Этот фермент состоит из четырех субъединиц - двух регуляторных и двух каталитических. При связывании четырех молекул цАМФ регуляторные субъединицы отделяются от каталитических, которые при этом активируются. В клетках печени РКА фосфорилирует другую протеинкиназу - киназу фосфорилазы. Киназа фосфорилазы, в свою очередь, фосфорилирует фосфорилазу гликогена. Под действием фосфорилазы происходит фосфоролиз гликогена [http://lib4all.ru/base/B2319/B2319Part36-83.php]. В результате образуется глюкоза,которая через белки-переносчики выходит из клеток печени в кровь и потребляется активно работающими при стрессе органами - в первую очередь скелетными мышцами.
 
[[File:PKARII.svg|thumb|280px|Механизм активации и инактивации протеинкиназы А (РКА). PDE - фосфодиэстераза.]]
 
Зачем же нужна такая сложная и многоступенчатая система передачи сигнала? Во-первых, на первых этапах сигнал передается с внешней стороны мембраны (на которую действует гормон) на внутреннюю, где происходит синтез цАМФ. Хорошо растворимая, гидрофильная молекула цАМФ быстро диффундирует по всей клетке и передает сигнал во все ее участки. Во-вторых, на каждом этапе сигнализацию можно регулировать. Но главный смысл многоступенчатой передачи - в том, что на большинстве этапов происходит усиление сигнала. Так, за время активности рецептора он может активировать множество молекул G-белка. Каждый Gs-белок активирует одну молекулу аденилатциклазы, но аденилатциклаза синтезирует тысячи молекул цАМФ. 4 молекулы цАМФ активируют всего две каталитических субъединицы РКА, но те могут фосфорилировать множество молекул киназы фосфорилазы, и т.п. В результате такой системы многократного усиления под действием одной молекулы адреналина в клетке печени образуется около 10.000.000 молекул глюкозы.
 
Когда стресс прошел, уровень секреции адреналина снижается. Из крови адреналин быстро выводится через почки и перестает действовать на рецепторы. После этого инактивируется Gs-белок. G-белки обладают ГТФ-азной активностью: α-субъединица расщепляет связанную с ней молекулу ГТФ до ГДФ (и фосфата), после чего связывается с βγ-субъединицей и переходит в неактивное состояние. таким образом, G-белок действует как автоматический "молекулярный выключатель". Уровень цАМФ в клетке понимается до исходного за счет того, что цАМФ расщепляет особый фермент - фосфодиэстераза. В результате каталитические субъединицы РКА объединяются с регуляторными и инактивируются. Инактивацию киназы фосфорилазы и фосфорилазы гликогена осуществляют ферменты протеинфосфатазы, отщепляющие от этих ферментов фосфатные группы. Так распад гликогена прекращается.
 
=== Электрические свойства мембраны. Генерация и проведение нервных импульсов ===
====Потенциал покоя====
Разность зарядов достигается за счёт '''разности концентраций [[w:Ион|ионов]] внутри и снаружи клетки'''. '''Внутри концентрация ионов калия высокая, а натрия - низкая, а снаружи - наоборот.''' Эта разность достигается за счёт работы [[w:Натрий-калиевая аденозинтрифосфатаза|Натрий-Калиевой АТФазы]]. В состоянии покоя нейрона '''калиевые каналы открыты, а натриевые закрыты.''' [[w:Катион|Катионы]] калия выходят в зону меньшей концентрации (из клетки) и создают избыточный положительный заряд снаружи клетки.
 
<small>Таблица по пособию А.А.Мартьянова и О.С.Тарасовой: (Содержание ионов в Нейроне)</small>
{| class="wikitable"
|-
! !! Внутри клетки !! Во внешней среде
|-
| Ионы натрия || 50 ммоль/литр || 440 ммоль/литр
|-
| Ионы калия || 400 ммоль/литр || 20 ммоль/литр
|}
 
Разность зарядов мембраны в состоянии покоя называется [[w:потенциал покоя|потенциалом покоя]], а разность зарядов при любом состоянии аксона называется [[w:мембранный потенциал|мембранным потенциалом]]. Когда '''мембранный потенциал (МП) клетки равен потенциалу покоя(ПП), натриевые каналы закрыты'''.
 
====Потенциал действия. Генерация нервного импульса====
Электрические свойства [[w:Мембрана (биология)|мембраны]] [[w:Нейрон|нейронов]] и других возбудимых клеток (например, мышечных) позволяют этим клеткам генерировать и передавать [[w:потенциал действия|потенциалы действия]] (если их генерируют нейроны, то они называются также нервные импульсы). Потенциалы действия обычно возикают на дендритах или на теле нейрона, а затем передаются по [[w:Аксон|аксону]]. Ключевую роль в генерации и передаче нервных импульсов играют свойства каналов наружной мембраны клетки.
 
Как только МП станет достаточно отличаться от ПП, т.е. изменится до нужной величины - '''порога''', происходит '''[[w:Возбуждение (физиология)|возбуждение]]'''. Здесь действует принцип "всё или ничего": если раздражающий фактор не способен изменить МП до порога, то возбуждения нет, а если способен, то возбуждение происходит. При возбуждении нейрона '''открываются натриевые каналы''', и '''ионы натрия устремляются внутрь клетки, уменьшая отрицательный [[w:Электрический заряд|заряд]] внутренней стороны мембраны'''. Это уменьшение мембранного потенциала называется '''[[w:деполяризация|деполяризацией]]'''. Ионы натрия будут входить в клетку, пока внутренняя сторона мембраны не станет положительно заряженной относительно внешней стороны. '''Мембрана перезарядится (+ станет внутри, а - снаружи)''' После перезарядки мембраны '''натриевые каналы закрываются''', и данный участок аксона определённое время не может возбуждаться. Этот период называется '''[[w:рефрактерность| рефрактерностью]]'''.
После закрытия натриевых каналов, '''ионы Калия устремляются наружу, уменьшая отрицательный заряд наружной стороны мембраны, пока внешняя сторона не станет положительно заряжена относительно внутренней'''. '''Мембрана перезарядится до исходного состояния.''' Этот этап называется '''[[w:Реполяризация|реполяризацией]]'''.
Все изменения мембранного потенциала '''от деполяризации до реполяризации''' называется '''[[w:потенциал действия|потенциалом действия]]''', или '''[[w:Нервный импульс|нервным импульсом]]'''.
Схема движения нервного импульса по аксону:
 
 
[[File:Neyronsygnal3.JPG]]
 
'''+''' и '''-''' - заряды мембраны
 
А- Внутренняя среда клетки
 
Б- Мембрана
 
В- Внешняя среда
 
Г- Направление движения Нервного импульса
 
Д- Возбуждённый участок
 
'''Нервный импульс может двигаться только вперёд, так как все задние участки аксона находятся в состоянии рефрактерности. На каждом участке нейрона нервный импульс возникает заново.''' ''На рисунке показана схема движения импульса без использования миелиновых оболочек . Скорость движения такого импульса достаточно невелика - приблизительно 3 м/сек. Для ускорения импульса используются [[w:глиальные клетки]], и скорость импульса приблизительно равна 100 м/сек. Глиальные клетки окружают аксон по всей его длине и образуют оболочки - электроизоляторы - [[w:Миелин|миелиновые оболочки]], но оставляют небольшие участки нейрона - перехваты Ранье - открытыми. В центральной нервной системе миелиновую оболочку образуют олигодендроциты, а в периферической – леммоциты. Миелиновая оболочка образуется из отростка тела глиальной клетки, лишенного цитоплазмы. Многократно обмотанного вокруг аксона, то есть миелиновая оболочка состоит из многочисленных слоёв мембраны глиальной клетки.
[[File:Neuron with oligodendrocyte and myelin sheath-2.svg]]
 
 
Нервный импульс не может двигаться по участкам, покрытыми миелиновыми оболочками, поэтому нервному импульсу приходится "перепрыгивать" от одного перехвата Ранье к другому.''
 
Далее нервный импульс достигает [[w:синапс|синапса]] и вызывает открытие кальциевых каналов. Ионы кальция входят внутрь клетки, и это приводит к слиянию пузырьков с нейромедиаторами с пресинаптической мембранной. Нейромедиаторы попадают в синаптичскую щель, и воздействуют на белки – рецепторы постсинаптической мембраны.
 
 
Видео на Английском языке:
[[Файл:Action potential video.ogg]]
 
=== Образование межклеточных контактов, их типы ===
 
==== Плотные контакты ====
[[Файл:Плотный контакт.jpg|thumb|right|300px|Схема строения плотного контакта]]
Плотные, или замыкающие контакты (zonula occludens) — участки, на которых мембраны двух соседних (эпителиальных) клеток тесно сближены и образуют барьер, практически непроницаемый для растворенных веществ. У беспозвоночных типичные замыкающие контакты не встречаются, им соответствуют по функциям септированные контакты.
 
Плотные контакты — система ветвящихся полосок. Каждая полоска состоит из белков, пронизывающих мембраны соседних клеток и непосредственно соединяющихся друг с другом во внеклеточном пространстве. Хотя в образовании плотных контактов участвуют многочисленные белки, главные из них — [[w:клаудин|клаудины]] и окклюдины. Различные периферические белки, расположенные на цитоплазматической стороне мембран, соединяют плотные контакты с [[w:актин|актиновым]] [[w:цитоскелет|цитоскелетом]].
 
Плотные контакты выполняют три основные функции:
* Механически соединяют клетки эпителия
* Обеспечивают барьер для латеральной диффузии белков, благодаря чему сохраняется полярность клеток эпителия. На апикальной (смотрящей в просвет органа или на поверхность тела) поверхности локализованы одни белки, а на базолатеральной (нижне-боковой) — другие. Благодаря этому, например, клетки кишечного эпителия могут поглощать вещества путем активного транспорта или [[w:эндоцитоз|эндоцитоза]] из просвета кишки и выделять их в кровь (обычно путем пассивного транспорта или [[w:экзоцитоз|экзоцитоза]]). Для поглощения веществ нужны одни белки, а для их выделения в кровь — другие.
* Обеспечивают барьер на пути большинства веществ, из-за чего эти вещества транспортируются в организм через мембраны и через цитоплазму клеток. Это позволяет отчасти контролировать транспорт веществ (в большей степени, чем когда они просачиваются между клетками).
 
По степени «плотности» контактов эпителии lелятся на проницаемые и мало проницаемые. К первым относится, например. эпителий почечных капсул и проксимальных извитых трубочек, а ко вторым — эпителий дистальных извитых трубочек почек или капилляров мозга (где плотные контакты обеспечивают [[w:гематоэнцефалический барьер|гематоэнцефалический барьер]]).
 
==== [[w: Десмосомы|Десмосомы]] и [[w:гемидесмосомы|гемидесмосомы]] ====
 
[[Файл:Desmosome cell junction en.svg|thumb|338px|desmosomes]]
[[Файл:Desmosome_-_2.png|thumb|right|250px|Основные белки, формирующие десмосому]]
 
'''Десмосома''' — один из типов межклеточных контактов, обеспечивающих прочное соединение клеток (как правило, эпителиальной или мышечной ткани) у животных. Функции z десмосом заключается главным образом в обеспечении механической связи между клетками.
 
Существуют 3 типа десмосом — точечные, опоясывающие и гемидесмосомы. Точечная десмосома собой небольшую площадку (диаметром до 0,5 мкм), соединяющую мембраны двух соседних клеток. Количество точечных десмосом на одной клетке может достигать 2000.
 
Десмосомы образуются между клетками тех тканей, которые могут подвергаться трению, растяжению и другим механическим воздействиям (эпителиальные клетки, клетки сердечной мышцы). Со стороны цитоплазмы к десмосомам прикрепляются [[w:промежуточные филаменты|промежуточные филаменты]], которые формируют в цитоплазме сеть, обладающий большой прочностью на разрыв. Через десмосомы промежуточные филаменты соседних клеток объединяются в непрерывную сеть, охватывающую всю ткань.
 
Десмосома состоит из белков клеточной адгезии [[w:кадгерины|из семейства кадгеринов]] и соединительных (адапторных) белков, которые соединяют их с промежуточными филаментами. Белки клеточной адгезии, формирующие десмосомы — десмоглеин и десмоколлин. Как и другие кадгерины, эти трансмембранные белки имеют по пять внеклеточных доменов и являются кальцийсвязывающими. Они обеспечивают гомофильное соединение клеток — между собой соединяются две одинаковые по строению молекулы белка. Внутриклеточный белок десмоплакин (при участии еще двух белков, плакофиллина и плакоглобина) соединяет внутриклеточные домены десмоглеина с промежуточными филаментами. Тип промежуточных филаментов зависит от типа клеток: в большинстве эпителиальных клеток они [[w:кератин|кератиновые]], а в клетках сердечной мышцы — десминовые, и т. п.
 
Если контакты похожего строения образуются между клетками и внеклеточным матриксом, то они называются [[w:гемидесмосомы|гемидесмосомами]], или полудесмосомами. Хотя по структуре они напоминают десмосомы и тоже содержат промежуточные филаменты, они образованы другими белками. Основные трансмембранные белки гемидесмосом — [[w:интегрины|интегрины]] и [[w:коллаген|коллаген]] XVII. С промежуточными филаментами они соединяются при участии дистонина и плектина. Основной белок межклеточного матрикса, к которому клетки присоединяются с помощью гемидесмосом — [[w:ламинин|ламинин]].
 
'''Медицинское значение'''
 
С нарушением функции десмосом связаны кожные болезни, которые объединены под названием «пузырчатка» (pemphigus). Две её наиболее распространенные формы — pemphigus vulgaris (вульгарная пузырчатка) и pemphigus foliaceus (пластинчатая пузырчатка). Обычно они имеют аутоиммунную природу, хотя сходные патологии могут быть и наследственными. При вульгарной пузырчатке антитела атакуют белок десмоглеин-3, который присутствует во всех слоях эпителия. При пластинчатой пузырчатке образуются аутоантитела против белка десмоглеин-1, который экспрессируется только в верхних слоях эпидермиса кожи. У больных образуются пузыри, так как слои эпидермиса разрываются, часть его клеток гибнет, а в образующиеся полости поступает межклеточная жидкость.
 
''При вульгарной пузырчатке пузыри образуются не только на коже, но на других слизистых (в основном во рту). Эта болезнь протекает более тяжело и может закончиться смертью. Развивается она обычно в возрасте 40-60 лет. При пластинчатой пузырчатке поражения захватывают только кожу, которая отслаивается в виде пластинок.''
 
При нарушении функции гемидесмосом развивается буллёзный эпидермолиз (врожденная, буллёзная пузырчатка). При малейшем механическом воздействии эпидермис кожи отстаёт от [[w:базальная пластинка|базальной пластинки]], под ним образуются пузыри с серозным или геморрагическим содержимым. Одна из причин этого заболевания — мутации гена коллагена XVII. Данный вариант заболевания наследуется по аутосомно-рецессивному типу.
 
==== Высокопроницаемые (щелевые) контакты ====
[[Файл:Gap cell junction-en.svg|thumb|300px|Щелевое соединение]]
'''Щелевое соединение''', '''щелевой контакт''' — способ соединения клеток в организме с помощью белковых каналов (коннексонов). Через щелевые контакты могут непосредственно передаваться от клетки к клетке электрические сигналы (потенциалы действия), а также малые молекулы (с молекулярной массой примерно до 1.000 Д). Этим щелевые контакты отличаются от [[w:плазмодесмы|плазмодесм]], через которые могут транспортироваться макромолекулы и даже органоиды.
 
Структурную основу щелевого соединения составляют [[w:коннексоны|коннексоны]] — каналы, образуемые шестью белками-[[w:коннексины|коннексинами]]. В нервной системе щелевое соединение между нейронами встречается в так называемых [[w:электрический синапс|электрических синапсах]]. Отдельные коннексоны обычно сосредоточены на ограниченных по площади участках мембран — [[w:нексус|нексусах]], или бляшках (англ. plaque) диаметром 0,5-1 мкм. В области нексуса мембраны соседних клеток сближены, расстояние между ними составляет 2-4 нм.
 
'''Белки щелевых контактов'''
 
У позвоночных основу щелевых контактов составляют [[w:коннексины|коннексины]] — первое из описанных семейств белков щелевых контактов. В геноме человека идентифицирован 21 ген щелевых контактов, в геноме мыши — 20 генов.
 
У беспозвоночных имеется другое семейство белков щелевых контактов, сходных с коннексинами по структуре и функциям. но негомологичных им (имеющих несходную первичную структуру) — [[w:иннексины|иннексины]]. В геноме [[w:Caenorhabditis elegans|Caenorhabditis elegans]] найдено 25 генов иннексинов, в геноме [[w:Drosophila melanogaster|Drosophila melanogaster]] — 8.
 
Позднее выяснилось, что у позвоночных, кроме коннексинов, имеются также белки, гомологичные иннексинам. Эти белки, открытые группой российских ученых под руководством Ю. В. Панчина, получили название [[w:паннексины|паннексины]]. В геноме человека и мыши к настоящему времени идентифицированы 3 гена паннексинов.
 
У кишечнополостных и иглокожих есть щелевые контакты, но нет генов ни одного из вышеназванных семейств. Это означает, что существуют ещё не открытые семейства белков щелевых контактов.
 
==== Другие типы контактов ====
 
Адгезионные (адгезивные) контакты образуются между соседними клетками (как правило, 'пиелиальными) или между клетками и межклеточным веществом (фокальные контакты, пятна адгезии). В первом случае трансмембранные белки, обеспечивающие контакт клеток, относятся к семейству [[w:кадгерин|кадгерин]]ов; присоединение клетки к межклеточному веществу обеспечивают [[w:интегрин|интегрин]]ы. Этим адгезивные контакты сходны с десмосомами и гемидесмосомами. Однако внутри клетки белки этих контактов через различные линкерные белки связываются не с промежуточными фиалментами (как в случае десмосом и гемидесмосом), а с актиновыми микрофиламентами.
 
[http://www.cellbiol.ru/book/kletka/kletochnye_kontakty#gap] Клеточные контакты — Cellbiol.ru
 
==== Клеточные стенки растений и бактерий ====
 
== Цитоскелет и клеточная подвижность ==
 
'''[[w:Цитоскелет|Цитоскелет]]- система внутриклеточных белковых нитей и трубочек. Цитоскелет участвует в поддержании формы клеток и обеспечивает все формы клеточной подвижности эукариот. Ползание амебы и плавание инфузории, сокращение мышц человека и продвижение растущего аксона к мышце-мишени, расхождение хромосом при митозе и перемещение секреторных пузырьков к наружной мембране - всё эторезультат работы цитоскелета. Таким образом, он выполняет функции не только "клеточных костей", но и "клеточных мышц".'''
 
До недавнего времени считалось, что цитосклет есть только у эукариот. Но сейчас известно, что и в клетках прокариот (по крайней мере, некоторых) тоже присутстуют белки, образующие цитоскелет.
 
=== Белки «цитоскелета» прокариот ===
 
Долгое время считалось, что цитоскелетом обладают только [[w:эукариоты|эукариоты]]. Однако с выходом в 2001 году статьи Jones и соавт. ([http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=AbstractPlus&list_uids=11290328 PMID: 11290328]), описывающей роль бактериальных гомологов актина в клетках ''Bacillus subtilis'', начался период активного изучения элементов бактериального цитоскелета. К настоящему времени найдены бактериальные гомологи всех трех типов элементов цитоскелета эукариот — [[тубулин]]а, [[актин]]а и промежуточных филаментов (''Shih Y.-L., Rothfield L.'' The Bacterial Cytoskeleton. // Microbiology And Molecular Biology Reviews. — 2006. — V. 70., No. 3 — pp. 729—754. [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=AbstractPlus&list_uids=16959967 PMID: 16959967]). Также было установлено, что как минимум одна группа белков бактериального цитоскелета, MinD/ParA, не имеет эукариотических аналогов.
 
''' Бактериальные гомологи актина '''
 
К наиболее изученным актиноподобным компонентам цитоскелета относятся MreB, ParM и MamK.
 
 
Белки MreB и его гомологи являются актиноподобными компонентами цитоскелета бактерий, играющими важную роль в поддержании формы клетки, сегрегации хромосом и организации мембранных структур. Некоторые виды бактерий, такие как ''[[w:Escherichia coli|Escherichia coli]]'', имеют только один белок MreB, тогда как другие могут иметь 2 и более MreB-подобных белков. Примером последних служит бактерия ''[[w:Bacillus subtilis|Bacillus subtilis]]'', у которой были обнаружены белки MreB, Mbl ('''M'''re'''B'''-'''l'''ike) и MreBH ('''MreB''' '''h'''omolog).
 
В геномах ''E. coli'' и ''B. subtilis'' ген, отвечающий за синтез MreB, находится в одном [[w:оперон|опероне]] с генами белков MreC и MreD. Мутации, подавляющие экспрессию данного оперона, приводят к образованию клеток сферической формы с пониженной жизнеспособностью.
 
Субъединицы белка '''MreB''' образуют филаменты, обвивающие палочковидную бактериальную клетку. Они располагаются на внутренней поверхности цитоплазматической мембраны. Филаменты, образуемые MreB, динамичны, постоянно претерпевают полимеризацию и деполимеризацию. Непосредственно перед делением клетки MreB концентрируется в области, в которой будет формироваться перетяжка. Считается, что функцией MreB также является координация синтеза [[w:муреин|муреина]] — полимера клеточной стенки.
 
Гены, отвечающие за синтез гомологов MreB, были обнаружены только у палочковидных бактерий и не были найдены у кокков.
 
 
Белок '''ParM''' присутствует в клетках, содержащих малокопийные плазмиды. Его функция заключается в разведении плазмид по полюсам клетки. При этом субъединицы белка формируют филаменты, вытянутые вдоль большой оси палочковидной клетки.
 
Филамент по своей структуре представляет собой двойную спираль. Рост филаментов, образуемых ParM, возможен с обоих концов, в отличие от актиновых филаментов, растущих только на ±полюсе.
 
 
MamK — это актинподобный белок ''Magnetospirillum magneticum'', отвечающий за правильное расположение магнитосом. Магнитосомы представляют собой впячивания цитоплазматической мембраны, окружающие частички железа. Филамент MamK выполняет роль направляющей, вдоль которой, одна за другой, располагаются магнитосомы. В отсутствие белка MamK магнитосомы располагаются беспорядочно по поверхности клетки.
 
''' Гомологи тубулина '''
 
В настоящее время у прокариот найдены 2 гомолога тубулина: FtsZ и BtubA/B. Как и эукариотический тубулин, эти белки обладают ГТФазной активностью.
 
Белок '''FtsZ''' чрезвычайно важен для клеточного деления бактерий, он найден практически у всех эубактерий и архей. Также гомологи этого белка были обнаружены в пластидах эукариот, что является еще одним подтверждением их [[w:Симбиогенез|симбиотического происхождения]].
 
FtsZ формирует так называемое Z-кольцо, выполняющее роль каркаса для дополнительных белков клеточного деления. Вместе они представляют собой структуру, ответственную за образование перетяжки (септы).
 
'''BtubA/B'''
 
В отличие от широко распространенного FtsZ, эти белки обнаружены только у бактерий рода ''Prosthecobacter''. Они более близки к тубулину по своему строению, чем FtsZ.
 
''' Кресцентин, гомолог белков промежуточных филаментов '''
 
'''Кресцентин''' был найден в клетках ''Caulobacter crescentus''. Его функцией является придание клеткам ''C. crescentus'' формы вибриона. В случае отсутствия экспрессии гена кресцентина клетки ''C. crescentus'' приобретают форму палочки. Интересно, что клетки двойных мутантов, кресцентин<sup>−</sup> и MreB<sup>−</sup>, имеют сферическую форму.
 
''' MinD и ParA '''
 
Эти белки не имеют гомологов среди эукариот. '''MinD''' отвечает за положение сайта деления у бактерий и пластид. '''ParA''' участвует в разделении ДНК по дочерним клеткам.
=== Типы клеточной подвижности прокариот ===
 
=== Строение и принцип работы бактериального жгутика ===
* [http://bio.fizteh.ru/student/files/biology/bioarticles/bionanomotor.html] — Юрий Свидиненко. Обзор биолгических наномоторов
* [http://window.edu.ru/window_catalog/files/r20294/9906_008.pdf]Тихонов А. Н. Молекулярные моторы. Часть 1. Вращающиеся моторы живой клетки // Соросовский образовательный журнал, 1999, № 6, с. 8-16.
* [http://window.edu.ru/window_catalog/files/r20479/9809_002.pdf]Скулачев В. П. Электродвигатель бактерий // Соросовский образовательный журнал, 1998, № 9, с. 2-7.
* [http://www.inbi.ras.ru/ubkh/41/metlina.pdf] Метлина А. Л. Жгутики прокариот как система биологической подвижности. Успехи биологической химии, 2001, т.41, с.229-282
 
=== Основные компоненты цитоскелета эукариот ===
'''Основные элементы цитоскелета эукариот - [[w:микротрубочки|микротрубочки]], [[w:микрофиламенты|микрофиламенты]] и [[w:промежуточные филаменты|промежуточные филаменты]].
 
'''Микротрубочки - белковые трубочки диаметром около 25 нм. Они состоят из глобулярного белка [[w:тубулин|тубулин]]а. Микрофиламенты похожи на две перекрученные нити бусинок. Они имеют диаметр около 7 нм и состоят из глобулярного белка [[w:актин|актин]]а. Промежуточные филаменты похожи на многожильный кабель диаметром около 10 нм. Они состоят в разных клетках из разных фибриллярных белков; например, в клетках эпителиальных тканей животных это белок [[w:кератин|кератин]].'''
 
'''Микротрубочки и микрофиламенты есть во всех клетках эукариот. Промежуточные филаменты в цитоплазме есть не у всех эукариот, а только у некоторых групп животных. причем не во всех клетках. В ядре промежуточные филаменты распространены более широко: видимо, они есть у всех животных и растений.'''
 
=== Основные типы клеточной подвижности эукариот — амебоидное движение, ресничное движение и мышечное сокращение ===
[[Файл:Amoeba motility DIC.ogv|Амебоидное движение]]
 
=== Микротрубочки, их строение и функции ===
[[Файл:Microtubules.png|thumb|right|150px|Строение микротрубочки. По её периметру укладывается 13 молекул тубулина]]
[[w:Микротрубочки|Микротрубочки]] - трубочки диаметром около 24-25 нм, состоящие из белка [[w:тубулин|тубулин]]а. Микротрубочки есть во всех клетках эукариот и могут собираться в цитоплазме, а у многих эукариот и внутри ядра. Микротрубочки:
*Участвуют в поддержании формы клеток
*Влияют на взаимное расположение органелл (например, ЭПС и аппарата Гольджи)
*Обеспечивают транспорт веществ (по их поверхности, как по рельсам, мс помощью двигательных белков [[w:кинезин|кинезин]]ов и [[w:динеин|динеин]]ов могут передвигаться мембранные пузырьки с грузом и макромолекулы)
*Составляют основу жгутиков и ресничек эукариот, при участии динеинов обеспечивают ресничное и жгутиковое движение
*Составляют основу [[w:центриоль|центриолей]], которые во многих клетках эукариот выполняют роль ЦОМТ - центра организации микротрубочек
*Образуют [[w:митотическое веретено|веретено деления]] и обеспечивают расхождение хромосом к полюсам клетки в ходе ее деления
 
 
==== Строение молекул тубулина. Структура микротрубочек ====
 
<big>[[w:Тубулин|Тубулин]] — глобулярный белок. В клетках эукариот есть несколько слегка различающихся генов-[[w:Гомология(биология|ортологов]], которые кодируют три разных формы тубулина — α-тубулин, β-тубулин и γ-тубулин. У каждого из этих белков выделяют три [[w:домен|домена]]. Одна молекула α-тубулина и одна молекула β-тубулина в цитоплазме клеток объединяются в димер (изображен на рисунки). В составе такого димера к каждой молекуле тубулина присоединено по одной молекуле ГТФ. </big>
 
''На самом деле каждую из форм тубулина кодирует не один ген, а около десятка, так что каждая форма существует в виде множества подтипов. Они могут быть специфичны для определенных тканей. Например, тубулин III-β встречается только в нейронах. Кроме того, по одному гену кодируют еще две формы тубулина — δ- и ε-тубулин, которые, как и γ-тубулин, встречаются в основном в центриолях.''
 
==== Сборка и разборка микротрубочек. Динамическая нестабильность ====
Новые молекулы тубулина могут прикрепляться как к ±, так и к --концу микротрубочки, но легче (при более низкой концентрации) присоединяются к + -концу (и легче отделяются от --конца).
 
 
Тубулин способен связываться в растворе с молекулами [[w:ГТФ|ГТФ]]. Рост микротрубочек осуществляется только за счет присоединения димеров тубулина, в которых обе субъединицы связаны с молекулами ГТФ. В стенках [[w:микротрубочки|микротрубочек]] происходит гидролиз ГТФ, связанной с β-субъединицей, до ГДФ (связанная с α-субъединицей ГТФ стабильна). Связанная с ГДФ форма тубулина легче отделяется от микротрубочек, что определяет динамическую нестабильность микротрубочек — при определенных условиях они быстро распадаются почти полностью.
 
Микротрубочка распадается, когда расщепление ГТФ происходит быстрее, чем присоединение новых димеров. Тогда защитная "шапочка" (кэп) на +-конце из димеров, связанных с ГТФ, разрушается, и после эого быстро отваливаются от микротрубочки димеры, связанные с ГДФ.
 
 
[[http://www.sinauer.com/cooper/4e/animations1203.html]] Анимация сборки и разборки микротрубочки
 
==== Микротрубочки участвуют в поддержании формы клеток ====
 
==== Транспортная роль микротрубочек. Строение и функции кинезинов и динеинов ====
 
По поверхности микротрубочек, как по рельсам, могут транспортироваться мембранные пузырьки (везикулы) с грузом или макромолекулы. Их перемещение осуществляют две группы моторных белков - [[w:кинезин|кинезины]] и [[w:динеин|динеины]]. Кинезины перемещаются по микротрубочке от --конца к +-концу, то есть обеспечивают транспорт к периферии клеток. Динеины двигаются в противоположном направлении - от +-конца микротрубочки к --концу, то есть обычно перемещают грузы к центру клетки.
 
''Транспорт к периферии клетки часто называют антероградным транспортом, транпорт к центру - ретроградным (особенно эти термины применимы к движению по отросткам клеток - например, аксонам или дендритам. Одно из семейств кинезинов (кинезины-14, в том числе NCD дрозофилы, KAR3 почкующихся дрожжей и ATK5 [[w:Arabidopsis|арабидопсиса]], двигаются по микротрубочкам от +-конца к --концу.''
 
[http://www.rpi.edu/dept/bcbp/molbiochem/MBWeb/mb2/part1/kinesin.htm] Строение и функции кинезинов и динеинов (англ.)
* [http://www.dnatube.com/video/2376/Organelle-Movement-on-Microtubules] '''Видео''': Движение органелл по микротрубочкам
 
==== Жгутики и реснички (ундулиподии) встречаются у большинства групп эукариот ====
[[Файл:Eukaryotic flagellum.svg|thumb|right]]
Реснички и жгутики — органеллы, которые есть у многих групп эукариот. Это тонкие (диаметром 0,1-0,6 мкм) волосковидные выросты на поверхности клетки. Длина их составляет от 3-15 мкм до 2 мм (реснички гребных пластинок гребневиков).
 
Жгутики и реснички всех эукариот имеют сходное строение, поэтому иногда их обозначают общим термином ундулиподии. Это сходство — одно из свидетельств единого (монофилетического) происхождения эукариот. Ундулиподии есть у большинства групп протистов, у споровых и некоторых голосеменных растений раст и практически у всех животных. Настоящие грибы (Eumycota) лишены жгутиков и ресничек.
 
Различие между жгутиками и ресничками на самом деле заключается в характере их движения: реснички совершают удары в одной плоскости, а жгутик вращается (одновременно по нему может пробегать волна). Но в зоологии принято называть жгутиковыми любые клетки, у которых есть один подвижный жгутик (или ресничка). При наличии многочисленных ресничек клетки называют ресничными.
 
У многих беспозвоночных животных ими покрыта вся поверхность тела (ресничные черви, личинки кишечнополостных и губок) или отдельные его участки (например, жабры у полихет и двустворчатых моллюсков, подошва ноги у брюхоногих моллюсков). У коловраток из специализированных ресничек состоит коловращательный аппарат. У многих беспозвоночных (кишечнополостные, гребневики, турбеллярии и др.) реснички также имеются на клетках кишечного эпителия.
 
У позвоночных (в том числе человека) клетки с подвижными ресничками также есть во многих органах. У человека ресничным эпителием выстланы дыхательные пути, евстахиевы трубы, семявыносящие канальцы, желудочки мозга и спинномозговой (центральный) канал. Видоизмененные реснички служат световоспринимающим аппаратом фоторецепторов сетчатки глаза и воспринимающим запахи аппаратом хеморецепторов обонятельного эпителия.
 
==== Жгутики и реснички выполняют разнообразные функции ====
Подвижные реснички и жгутики либо служат для движения, либо создают токи жидкости. Эти токи могут приносить пищу или кислород из внешней среды или служить для транспорта растворенных веществ внутри организма. Неподвижные жгутики и реснички (часто сильно видоизмененные) служат рецепторами у самых разных групп организмов.
 
==== Строение и функции центриолей ====
 
==== Веретено деления, его строение и работа ====
[http://www.youtube.com/watch?v=m73i1Zk8EA0] '''Видео''' — веретено деления в раннем эмбрионе дрозофилы
 
=== Микрофиламенты, их строение и функции ===
Микрофиламенты — элементы цитоскелета, свойственные всем клеткам эукариот. Они состоят из белка актина и имеют диаметр 6-7 нм. С актином взаимодействуют многие другие «вспомогательные» белки. Актиновые филаменты могут ветвиться и соединяться поперечными сшивками, образуя трехмерные сети. Обычно эта сеть более густая под наружной мембраной, во внешнем слое цитоплазмы, который называется '''кортекс'''. Микрофиламенты участвуют в поддержании формы клетки и формировании выростов на её поверхности — [[w:микроворсинки|микроворсинок]] и [[w:псевдоподия|псевдоподий]] (ложноножек). Взаимодействуя с миозином, микрофиламенты обеспечивают [[w:амебоидное дивжение|амебоидное]] и мышечное движение, а также деление клетки «перетяжкой», характерное для животных. С помощью цитоплазматических миозинов по микрофиламентам могут двигаться пузырьки с грузом; т.о., они участвуют в [[w:везикулярный транспорт|везикулярном транспорте]]. С помощью вспомогательных белков микрофиламенты могут присоединяться изнутри к мембране клетки, образуя [[w:адгезивные контакты|адгезивные контакты]]. Эти контакты участвуют в амебоидном движении многих клеток (в том числе внутри многоклеточного организма). С их помощью клетки прикрепляются к межклеточному веществу при ползании. Они могут выполнять и сигнальную функцию, меняя поведение клеток в зависимости от состава окружающей среды.
 
==== Строение молекул [[w:актин|актина]] ====
[[Файл:Actin with ADP highlighted.png|thumb|G-актин. Показаны связанные с ним молекула АТФ и двухвалентный катион]]
[[Файл:Actin filament atomic model.png|thumb|F-актин; модель актинового микрофиламента, показаны 13 субъединиц]]
 
==== Сборка и разборка микрофиламентов ====
[http://www.sinauer.com/cooper/4e/animations1201.html] Анимация "Сборка актиновых филаментов" (англ.)
 
==== Мышечное сокращение. Строение и сокращение поперечнополосатых мышц ====
 
==== Тонкое строение поперечно-полосатой мышцы ====
Основные сократимые элементы скелетных мышц - это экстрафузальные мышечные волокна. (Видоизмененные интрафузальные волокна – [[w:Нервно-мышечное веретено|мышечные веретена]] - служат рецепторами растяжения.) Это гигантские многоядерные клетки, имеющие форму цилиндра с заострёнными концами. Длина их в разных мышцах обычно составляет от 1 до 40 мм, а толщина 50-100 мкм. Число ядер может достигать нескольких сотен; располагаются они неглубоко под плазматической мембраной, которая носит специальное название – сарколемма. Сарколемма имеет глубокие впячивания в цитоплазму – Т-трубочки. При сокращении мышца тратит очень много энергии, поэтому в цитоплазме находится большое количество митохондрий, обеспечивающих функционирование основных сократимых элементов мышцы – миофибрилл. Также в цитоплазме находится специализированный ЭПР (см. ниже).
 
В процессе эмбрионального развития мышечные волокна возникают путем слияния одноядерных клеток-предшественников — миобластов. Часть миобластов дифференцируются в мелкие, с малым количеством цитоплазмы клетки-спутницы. Эти клетки при повреждении мышцы могут начать делиться и сливаться, обеспечивая регенерацию мышечных волокон.
 
Две трети объёма мышечного волокна занимают [[w:миофибрилла|миофибриллы]], которые, в свою очередь, состоят из нескольких [[w:саркомер|саркомеров]]. Поперек миофибрилл находятся перегородки, являющиеся границами саркомеров. Эти перегородки называются Z-дисками. Z-диски состоят из альфа-актинина (актин-связывающего белка), винкулина и [[w:интегрин|интегрина]]. От Z-дисков отходят нити - тонкие филаменты, между ними расположены более толстые пучки - толстые филаменты. Места перекрывания тонких и толстых филаментов под световым микроскопом выглядят, как более темные полосы. Из-за этого мышца получила название поперечно-полосатой. Когда мышца сокращается, длина толстых и тонких филаментов не меняется. Мышца сокращается за счет того, что филаменты скользят по поверхности друг друга.
[[Файл:Sarcomere.gif]]
 
Толстые филаменты состоят из белка [[w:миозин|миозина]]. Молекулы миозина симметричны, они состоят из двух половинок, каждая из которых имеет "головку" и "хвост". В толстом филаменте молекулы миозина находятся "хвостом" к "хвосту", а "головки" торчат по краям наружу. Толстые филаменты также соединяются с Z-дисками, но не напрямую, а с помощью специального белка [[w:титин|титина]]. Тонкие филаменты состоят из нескольких белков: актина, тропонина и тропомиозина. Последние два образуют тропонин-тропомиозиновый комплекс. Актин - глобулярный белок, его молекулы имеют форму шариков. Из-за этого тонкий филамент напоминает две перекрученные цепочки бус, в которых каждый шарик– это молекула актина.
'''Саркоплазматический ретикулум''' (СР) - специализированный [[w:эндоплазматический ретикулум|эндоплазматический ретикулум]] (ЭПР) мышечных клеток поперечнополосатых мышц. По структуре напоминает гладкий ЭПР. СР расположен в непосредственной близости от миофибрилл. Его структуры подразделяются на терминальные цистерны, которые охватывают миофибриллы полукольцом, и продольные трубочки, кторые соединяют соседние терминальные цистерны. К терминальным цистернам СР примыкают [[w:т-трубочка|Т-трубочки]] - глубокие впячивания наружной мембраны. Число Т-трубочек примерно соответствует числу саркомеров.
 
СР служит депо ионов кальция. Концентрация ионов кальция в СР может достигать 10<sup>−3</sup> [[w:моль|моль]], в то время как в [[w:цитозоль|цитозоле]] составляет порядка 10<sup>−7</sup> [[w:моль|моль]] (в состоянии покоя).
 
* [http://www.sinauer.com/cooper/4e/animations1202.html] Анимация Тонкий филамент скелетной мышцы (англ.)
* [http://neuromuscular.wustl.edu/mother/myogenesis.html#devel]- Механизмы развития мышечной ткани (англ.)
 
==== Молекулярный механизм скольжения филаментов====
У миозина есть два состояния: с вытянутой "головкой" и с согнутой "головкой". Состояние зависит от того, какое вещество находится в его активном центре: АТФ, АДФ + фосфат, просто АДФ или вообще ничего. Если в активном центра находится АТФ или ничего нет, то "головка" будет изогнута. Если же там АДФ + фосфат или АДФ, головка будет вытянута. Связан миозин с актином или нет, тоже зависит от вещества, находящегося в активном центре миозина. Если в нем находится АТФ или АДФ + фосфат, то миозин не будет взаимодействовать с актином. Если там АДФ или ничего, то миозин связывается с актином.
[[Файл:Muscle Contraction.svg|thumb|right|300px]]
Итак, если в активный центр миозина поступил АТФ, то "головка" белка изогнута, а с актином он не связан. Затем миозин расщепляет АТФ, с образованием АДФ + фосфат. Из-за этого "головка" миозина выпрямляется, но с актином белок еще не связан. После этого из активного центра уходит фосфат. При этом "головка" миозина по-прежнему выпрямлена, и миозин связывается с актином. Потом из активного центра уходит и АДФ. Поскольку в нем ничего не осталось, головка миозина изгибается, не отрываясь при этом от актина. В результате миозин будет подтягивать весь тонкий филамент. Наконец, активный центр миозина связывает еще одну молекулу АТФ, миозин отсоединяется от актина, весь цикл повторяется, и тонкий филамент подтягивается еще на один шаг.
 
==== Регуляция мышечного сокращения ====
Нейромедиатор ацетилхолин воздействует на ацетилхолиновые рецепторы - гетероолигомерные комплексы, состоящие из 5 субъединиц (2α, β, γ, δ). Трансмембранная часть рецептора образует ионный канал, стенки которого сформированы сегментами всех пяти субъединиц. 2 молекулы ацетилхолина связываются с α-субъединицами рецептора, из-за чего рецептор меняет свою конформацию, что приводит к открытию Na<sup>+</sup>/K<sup>+</sup>-каналов примерно на 1 миллисекунду, ионы натрия входят в клетку, ионы калия выходят из клетки - происходит деполяризация наружной мембраны мышечной клетки. Потенциал действия мышцы распространяется по сарколемме и внутрь Т-трубочек. На мембране Т-трубочек открываются потенциалзависимые кальциевые ионные каналы L-типа (дигидропиридиновые рецепторы), связанные с кальциевыми ионными каналами СР (рианодиновыми рецепторами). В результате ионы кальция поступают из внеклеточной среды и СР в межфибриллярное пространство. Обратно ионы кальция попадают в СР с помощью мембранных кальциевых насосов — Ca<sup>2+</sup>-АТФазы. Ранее полагали, что между кальциевыми каналами и мембраной Т-трубочек имеется домен белка, который обеспечивает механическое сопряжение деполяризации с открыванием канала. Однако теперь преобладает точка зрения, согласно которой при деполяризации открываются кальциевые каналы на Т-трубочке, первые порции ионов кальция входят в клетку извне, связываются с цитоплазматическим доменом кальциевых ионных каналов СР и вызывают их открывание.
 
На поверхности тонкого филамента находится тропонин-тропомиозиновый комплекс, который состоит из соединенных белков [[w:тропонин|тропонина]] и [[w:тропомиозин|тропомиозина]]. Тропомиозин механически мешает миозину взаимодействовать с актином. Тропонин же при наличии Ca<sup>2+</sup> связывается с этим ионом, изменяет свою конформацию и смещается в сторону. Вместе с ним сдвигается и тропомиозин, т.к. эти белки очень тесно связаны. Сместившись, тропомиозин больше не мешает связи между миозином с актином.
 
Когда концентрация ионов кальция в саркоплазме возрастет до 10 мкМ/л, эти ионы могут связаться с С-субъединицей тропонина. В результате тропонин-тропомиозиновый комплекс смещается из-за изменения конформации тропонина С, и на актиновых микрофиламентах открываются места связывания для "головок" миозина.
 
'''Нервно-мышечный синапс''' — эффекторное нервное окончание на скелетном мышечном волокне.
Нервный отросток, проходя к сарколемме, утрачивает миелиновую оболочку и образует с ней систему складок, похожих на глубокие карманы.
Пресинаптическая мембрана аксона и постсинаптическая мембрана мышечного волокна разделены синаптической щелью. В этой области мышечное волокно не имеет поперечной исчерченности, зато тут есть скопление митохондрий и ядер. Терминали аксонов содержат большое количество митохондрий и синаптических пузырьков с медиатором ацетилхолином. Некоторые вещества могут влиять на процесс выделения медиатора в синаптическую щель: карбахолин усиливает выделение ацетилхолина на уровне пресинаптических окончаний, а ботулотоксин препятствует высвобождению медиатора. На постсинаптической мембране находятся чувствительные к нему холинорецепторы, сложные белковые молекулы. На пресинаптической мембране их нет, поэтому обратная передача сигнала невозможна.
 
<gallery>
Файл:Synapse diag4.png| 1. Пресинаптическое окончание<br />2. Сарколемма<br />3. Синаптический пузырек<br />4. Никотиновый ацетилхолиновый рецептор<br />5. Митохондрия
</gallery>
 
При деполяризации пресинаптической терминали открываются потенциал-чувствительные кальциевые каналы, ионы кальция входят в пресинаптическую терминаль и запускают механизм слияния синаптических пузырьков с мембраной. Открыты два механизма высвобождения нейромедиатора: с полным слиянием везикулы с плазмалеммой и так называемый «поцеловал и убежал» (англ. kiss-and-run), когда везикула соединяется с мембраной, и из неё в синаптическую щель выходят небольшие молекулы (ацетилхолин), а крупные остаются в везикуле. Второй механизм предположительно быстрее первого, с помощью него происходит синаптическая передача при высоком содержании ионов кальция в синаптической бляшке. Слияние везикул с мембраной обеспечивают белки группы v-SNARE. У белков этой группы SNARE-домен (около 60 аминокислот) отвечает за образование обратимой, но прочной четырёхспиральной сцепки. Такой метастабильный транс-SNARE комплекс включает синтаксин 1 и SNAP-25, находящиеся на клеточной мембране, и синаптобревин на поверхности доставляемой пресинаптической везикулы. Синтаксин и синаптобревин связаны с мембраной С-коцевым фрагментом и предоставляют по одной альфа-спирали в четырёхспиральную сцепку комплекса. SNAP-25 заякорен на мембране за счёт пальмитоильных ацильных цепей и обеспечивает две оставшиеся альфа-спирали.
В результате медиатор выходит в синаптическую щель и присоединяется к белкам-рецепторам постсинаптической мембраны. Холинорецептор нервно-мышечных синапсов включает 5 белковых субъединиц (α, α, β, γ, δ), окружающих ионный (натриевый) канал и проходящих через всю толщу липидной мембраны. Две молекулы ацетилхолина взаимодействуют с двумя α-субъединицами, что приводит к открыванию ионного канала и деполяризации постсинаптической мембраны.
Ацетилхолин действует недолго, потому что разрушается ацетилхолинэстеразой(В нервно-мышечных синапсах - ее т-версией). Она катализирует гидролиз нейромедиатора ацетилхолина до холина и остатка уксусной кислоты. т-ацетилхолинэстераза представляет из себя асимметричную белковую молекулу с "хвостом" из коллагеновой субъединицы, которая прикрепляет его к постсинаптической мембране.
 
Из-за снижения концентрации нейромедиатора закрываются Na<sup>+</sup>-каналы на мембране мышечной клетки, мембрана реполяризуется. После реполяризации мембраны ионы кальция выкачиваются из цитоплазмы в СР, и за время порядка 30 мс их концентрация возвращается к исходной. Этот процесс обеспечивается белком — кальциевым насосом (Са-АТФаза, Са<sup>2+</sup>-АТФаза), который в больших количествах содержится в мембране СР. Са-АТФаза активируется при связывании двух ионов кальция с цитоплазматической стороны [http://www.inbi.ras.ru/ubkh/45/rubtsov.pdf], так что её активация происходит при повышении концентрации ионов кальция в цитоплазме.
 
[http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/muscle.html] Анимация «Сокращение поперечнополосатой мышцы» (англ.текст)
 
==== Взаимодействие с немышечными миозинами и транспортная роль микрофиламентов ====
 
 
"Шагание" молекулы миозина V по актиновому микрофиламенту
 
==== Амебоидное движение ====
 
==== Роль микрофиламентов в поддержании формы клеток ====
 
=== Промежуточные филаменты, их строение и функции ===
 
[http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/intermediate_filaments.html] Анимация «Строение промежуточных филаментов» (англ. текст)
 
'''[[w:Промежуточные филаменты|Промежуточные филаменты]]''' (ПФ) — элементы цитоскелета, состоящие из сходных по строению и функциям белков. Своё название они получили из-за того, что их диаметр — около 10 нм — промежуточный между диаметром микрофиламентов и микротрубочек. К белкам ПФ относятся [[w:ламины|ламины]], из которых состоит внутренняя выстилка ядерной оболочки, и цитоплазматические белки, различающиеся в разных клетках. Ламины есть у большинства эукариот, цитоплазматические ПФ — только у некоторых животных, причем не во всех тканях. Так, ламины есть у нематод, моллюсков и позвоночных, но не найдены у членистоногих и иглокожих.
 
==== Сборка и разборка промежуточных филаментов ====
[[Файл:Intermediate filament sr.svg|thumb|right|Сборка промежуточного филамента из молекул кератина]]
 
Две молекулы кератина (или иного белка ПФ), имеющие вытянутую форму, закручиваются друг вокруг друга, образуя гомо- или гетеродимер. При этом они направлены "голова к голове " (NH<sub>2</sub>-концы обеиз молекул смотрят в одну и ту же сторону). Затем два таких димера объединяются в тетрамер «головой к хвосту». Из таких тетрамеров собираются протофиламенты, а затем 8 протофиламентов объединяются в ПФ диаметром около 10 нм.
 
Тетрамеры удерживаются вместе в основном за счет гидрофильно-гидрофобных взаимодействий. Между отдельными ПФ образуются дисульфидные мостики; это придаёт сетям из ПФ особую прочность и делают их малорастворимыми. Сети из ПФ сохраняют целостность даже после гибели клетки (из таких заполненных кератином мертвых клеток состоит верхний слой кожи, волосы, ногти и другие роговые структуры у наземных позвоночных).
 
Мономеры и димеры белков ПФ, в отличие от димеров тубулина и мономеров актина, не связывают трифосфатнуклеотиды. Регуляция сборки и разборки ПФ изучена плохо. Видимо, в некоторых случаях их быстрая разборка происходит за счет фосфорилирования (как и распад ядерной оболочки из ламинов).
 
==== Ядерные ламины поддерживают форму ядра, обеспечивают целостность ядерной оболочки и прикрепление хромосом ====
[[Файл:Structure and function of the nuclear lamina.jpg|thumb|right|Строение ядерной оболочки. Ядерная ламина — извилистые зеленые линии (см. текст).]]
 
<big>Ядерная ламина прилегает к внутренней поверхности внутренней ядерной мембраны (INM) и помогает поддерживать ядро в стабильном состоянии, участвует в организации хроматина, связывает ядерные поры. В профазе митоза или мейоза у многих организмов белки ядерной ламины фосфорилируются, и это приводит к распаду ядерной оболочки.</big>
 
 
Также ядерная ламина взаимодействует с белками ядерной оболочки. Число известных белков, взаимодействующих с ламиной, постоянно растёт благодаря новым открытиям. Белки отмечены пурпурным цветом. Среди белков, связывающихся с ядерной ламиной — несприн, эмерин, LAP1, LAP2, рецептор ламина B (LBR) и MAN1. К ламине присоединяются факторы транскрипции, такие как retinoblastoma transcriptional regulator (RB), germ cell-less (GCL), sterol response element binding protein (SREBP1), FOS and MOK2. Barrier to autointegration factor (BAF) — связанный с хроматином белок,
который также присоединяется к ламинам и некоторым из вышеупомянутых белков. Белок гетерохроматина-1 (HP1) связывается с хроматином и LBR.
 
<small>Мутации генов, кодирующих [[w:ламины|ламины]], вызывают редкие расстройства, объединяемые в группу ламинопатий. Мутация гена [[w:LMNA|LMNA]], кодирующего [[w:ламин A|ламин A]], вызывает [[w:прогерия|синдром прогерии Хатчинсона-Гилфорда]] — исключительно редкое заболевание, вызывающее по неизвестным причинам ускоренное старение: большинство пациентов не доживает до 13 лет.</small>
 
==== Состав промежуточных филаментов различается в разных тканях ====
 
В эпителиальных тканях ПФ состоят из различных [[w:кератин|кератинов]]. В клетках и тканях мезодермального происхождения (например. в фибробластах) ПФ состоят из белка [[w:виментин|виментина]]. В мышечных клетках присутствуют ПФ, образованные [[w:десмин|десмином]]. В большинстве типов нервных клеток присутствуют белки нейрофиламентов.
 
==== Промежуточные филаменты эпителиальных клеток состоят из множества разных кератинов ====
В геноме человека содержится несколько десятков генов белков-кератинов. В эпителиальных клетках обычно одновременно экспрессируются несколько таких генов.
 
==== Промежуточные филаменты эпителиальных клеток обеспечивают механическую прочность эпителиальных пластов ====
 
 
 
 
ПФ участвуют в образовании межклеточных контактов эпителиальных клеток — десмосом и гемидесмосом.
 
==== Промежуточные филаменты других тканей также важны для их функционирования ====
 
=== Взаимодействие различных систем цитоскелета в клетках эукариот ===
 
== Одномембранные органоиды — обзор ==
[[File:Blausen 0208 CellAnatomy.png|thumb|Изображение, демонстрирующее основные органоиды (в том числе и компартменты) эукариотической клетки]]
Компартменты эукариотической клетки:
* Одномембранные
** [[#Эндоплазматическая сеть, ее функции|Эндоплазматический ретикулум]]
** [[#Аппарат Гольджи, его функции|Аппарат Гольджи]]
** [[#Эндосомы и лизосомы, их функции. Вакуоли клеток растений и грибов|Эндосомы и лизосомы]]
** [[#Пероксисомы, их функции|Пероксисомы]]
 
=== Роль компартментализации в клетках эукариот ===
 
'''Компартмент''' - участок клетки, ограниченный двойной мембраной, в котором проходят специфические для данного компартмента биохимические процессы. Таким образом, не каждый органоид является компартментом, но компартмент - это органоид.
 
Компартментализация - дань специализации различных отделов одной клетки. Её смысл состоит в увеличении эффективности биохимических процессов.
 
=== Единая мембранная система клетки ===
 
=== Эндоплазматическая сеть, ее функции ===
'''Эндоплазматический ретикулум''' (ЭПР) или '''эндоплазматическая сеть''' (ЭПС) - клеточный компартмент, образующий сложную сеть из уплощённых мембранных мешочков или трубочек, называемых '''цистернами'''. Эта структура открыта в 1945 году американским учёным Кейтом Портером посредством электронной микроскопии. <ref name="FirstER">{{cite journal| author=Porter KR, Claude A, Fullam EF| year=1945| month=March| title=A study of tissue culture cells by electron microscopy| journal=J Exp Med.| volume=81| pages=233–246| doi=10.1084/jem.81.3.233| pmid=19871454| issue=3| pmc=2135493}}</ref>
 
====Строение ЭПР====
Диаметр просвета (или '''люмена''') ЭПР варьирует от 20 нм до нескольких мкм в зависимости от функциональной активности клетки. ЭПР подразделяется на '''гладкий''' (англ. '''"smooth"'''), или '''агранулярный''', и '''шероховатый''' (англ. '''"rough"'''), или '''гранулярный'''.
 
ГЭПР отличается наличием '''[[#Свободные и сидячие рибосомы: попадание белков в ЭПС |сидячих рибосом]]''' на своих стенках; они и обсулавливают различия в функциях Г и АЭПР. Может быть представлен в цитоплазме или разрозненными, относительно редкими цистернами, или в виде локальных скоплений мембран (цитоплазма с такими скоплениями называется '''эргастоплазмой'''). Первый тип характерен для клеток с низкой метаболической активностью, второй - клеткам, активно секретирующим белки (например, клеткам печени, железистым клеткам растений).
 
<gallery>
File:Blausen_0350_EndoplasmicReticulum.png|Трёхмерная отрисовка ЭПР
Файл:Clara_cell_lung_-_TEM.jpg|Электронная микрофотография среза эукариотической клетки близ ядра (изображено слева внизу)
</gallery>
 
====Функции ЭПР====
Агранулярный ЭПР выполняет следующие функции:
* Синтез и транспорт липидов и стероидов
* Накопление и преобразование углеводов
* Нейтрализация ядов
* Депонирование Ca<sup>2+</sup>
 
Главной функцией гранулярного ЭПР является '''синтез белков''', причём на ГЭПР синтезируются белки, предназначенные для '''секреции''', отсюда не менее важна функция '''транспорта''' продуктов синтеза. Оба этих процесса могут проходить как [[#Котрансляционный транспорт в ЭПР|совместно]], так и [[#Посттрансляционный транспорт в ЭПР|раздельно]]. Нужные же клетке белки синтезируются на [[#Свободные и сидячие рибосомы: попадание белков в ЭПС|рибосомах, свободно плавающих]] в цитоплазме.
 
====Стресс ЭПР====
 
=== Аппарат Гольджи, его функции ===
[[Файл:Human leukocyte, showing golgi - TEM.jpg|thumb|right|Аппарат Гольджи в лейкоците человека (снимок получен с помощью трансмиссионного электронного микроскопа)]]
Из-за достаточно большого размера [[w:Аппарат Гольджи|аппарат Гольджи]] (АГ) был обнаружен одним из первых среди органелл клетки. АГ был открыт в 1897 году итальянским врачом [[w:Камилло Гольджи|Камилло Гольджи]] в ходе его исследований нервной системы. После первого наблюдения он назвал АГ внутренним ретикулярным аппаратом, но вскоре органелла была переименована — названа в честь первооткрывателя. Однако некоторые сомневались в открытии новой органеллы, утверждая, что обнаруженная структура была просто оптической иллюзией, созданной техникой, используемой Гольджи. С развитием современных микроскопов в XX веке открытие было подтверждено.
 
Аппарат Гольджи найден и в растительных, и в животных клетках. Аппарат Гольджи хорошо развит у клеток, выполняющих секреторные функции (например, у клеток поджелудочной железы). АГ – одномембранный органоид. Он состоит из стопок мембранных структур, называемых цистернами. Кроме цистерн, в АГ присутствует множество мембранных пузырьков — везикул.
 
У аппарата Гольджи есть несколько важных функций.
 
1. Аппарат Гольджи участвует в изменении, сортировке и упаковке синтезируемых клеткой макромолекул для секреции ([[w:экзоцитоз| экзоцитоза]]) или использования внутри клетки. При сортировке белков аппарат Гольджи модифицирует их. Для того, чтобы опознать и направить по нужному адресу белок, к нему в аппарате Гольджи прикрепляется специальная углеводная метка. Например, метка белка, который должен быть доставлен в лизосому – манноза-6-фосфат.
 
2. Аппарат Гольджи участвует в транспорте [[w:липиды |липидов]] и создании лизосом.
 
 
''Аппарат Гольджи присутствует в большинстве эукариотических клеток. Хотя цистерны, похожие на аппарат Гольджи, не обнаружены в клетках ряда протистов (лямблий, дизентерийных амеб и др.), недавние молекулярно-биологические исследования показали, что и у них есть гены белков, обычно работающих у других протистов и животных в аппарате Гольджи. Вероятно, АГ уже имелся у последнего общего предка эукариот и был утрачен некоторыми протистами вторично.''
 
=== Эндосомы и лизосомы, их функции. Вакуоли клеток растений и грибов ===
 
=== Пероксисомы, их функции ===
 
== Транспорт белков, секреция и внутриклеточное пищеварение ==
 
=== Свободные и сидячие рибосомы: попадание белков в ЭПС ===
 
[[w:|Рибосомы]] - внутриклеточные органоиды, осуществляющие синтез белков. От синтезируемого в данный момент белка зависит расположение рибосомы в клетке.
 
'''"Свободные" рибосомы''' плавают в цитоплазме, не прикрепляясь к мембранам. Эти рибосомы синтезируют белки, которые работают в цитоплазме или поступают из цитоплазмы в митохондрии, пластиды и ядро. Например, [[w:АТФ-синтаза|протонная АТФ-синтетаза]] - белок, работающий в митохондриях; следовательно, рибосома, которая её синтезирует- "свободная". [[w:Миозин|Миозин]] - двигательный белок, работающий в цитоплазме клетки, также синтезируется "свободными" рибосомами. [[w:ДНК-полимераза|ДНК-полимераза]] синтезируется "свободными" рибосомами, т.к. находится в ядре.
 
'''"Сидячие" рибосомы''' прикреплены к мембранам шероховатой эндоплазматической сети (ЭПС).
Эти рибосомы синтезируют белки, поступающие в ЭПС. Большинство из таких белков затем поступает в АГ, а оттуда - в лизосомы, на наружную мембрану или во внеклеточную среду (секреция). Например, рецептор SRP - белок, который работает на мембране ЭПС, а следовательно рибосома, синтезирующая его - "сидячая". Белок [[w:коллаген|коллаген]] выделяется во внешнюю среду; значит, рибосома - "сидячая".
 
==== Котрансляционный транспорт в ЭПР ====
Транспорт белков в ЭПР осуществляется по мере их синтеза, так как рибосомы, синтезирующие белки с сигнальной последовательностью для ЭПР, «садятся» на специальные транслокационные комплексы на мембране ЭПР.
 
Сигнальная (лидерная) последовательность для ЭПР включает обычно 5-10 преимущественно гидрофобных аминокислот и расположена на N-конце белка. В ее удаленной от конца части имеется консенсусная последовательность, узнаваемая специфической протеазой (за счет этого лидерные последовательности удаляются после завершения синтеза белка). Сигнальная последовательность опознаётся специальным комплексом — «опознающей сигнал частицей» (signal-recognition particle, SRP). В состав SRP входит шесть белков и короткая молекула РНК.
 
[[File:Protein translation.gif|frame|right|Анимация, демонстрирующая процесс котрансляционного транспорта. Общая продолжительность ролика - 2 минуты]]
Этапы синтеза и транспорта белков в ЭПР:
 
# Один участок SRP связывает сигнальную последовательность, а другой связывается с рибосомой и блокирует трансляцию. Отдельный домен SRP отвечает за связывание с SRP-рецептором на мембране ЭПР. <br><br>
# Вместе с SRP рибосома перемещается к ЭПР и связывается с рецептором SRP (интегральным белком) на цитозольной стороне мембраны ЭПР. Этот комплекс (рибосома — SRP — рецептор SRP) связывается с порой — транслокатором белка на мембране ЭПР. Обычно с мРНК связаны несколько рибосом, и на мембране ЭПР сидят полирибосомы, причем каждая рибосома присоединена к своей поре. Дойдя до 3'-конца мРНК, рибосома возвращается в цитоплазму, однако мРНК удерживается у мембраны ЭПР за счет того, что новые рибосомы, cвязанные с SRP, присоединяются к ее 5'-концу. <br><br>
# После связывания с транслокатором комплекс SRP — рецептор SRP отделяется от рибосомы, и это приводит к возобновлению трансляции. Сейчас доказано, что белок по мере трансляции проникает в ЭПР через водный канал транслокатора, имеющий воротный механизм и сформированный у эукариот четырьмя субъединицами комплекса Sec61 (гомологичные белки есть и на мембранах бактериальных клеток). <br><br>
# После возобновления трансляции гидрофобный участок сигнальной последовательности остается связан с транслокатором, а вновь синтезируемый белок в виде петли проталкивается внутрь ЭПР. Этот процесс не требует дополнительных затрат энергии АТФ. После того, как С-конец белка отделяется от рибосомы и оказывается внутри ЭПР, протеаза сигнальной последовательности отрезает ее от белка. Белок внутри ЭПР сворачивается, приобретая нормальную конформацию, а сигнальный пептид через открывшийся в транслокаторе боковой канал перемещается в липидный бислой мембраны ЭПР, где быстро разрушается протеазами.
 
 
Попавший в ЭПР белок остается в этой органелле, если имеет специальную «удерживающую в ЭПР» (ER-retaining) последовательность из четырех аминокислот на С-конце. Некоторые из остающихся в ЭПР белков играют важную роль в сворачивании и посттрансляционной модификации проходящих через ЭПР белков. Так, фермент дисульфид-изомераза катализирует окисление свободных SH-групп цистеина и образование дисульфидных связей, а белок-шаперон BiP препятствует неправильному сворачиванию и аггрегации белков до образования ими четвертичных структур, а также способствует удержанию связанных с ним белков в ЭПР.
 
==== Встраивание белков в мембраны ЭПР ====
 
Похожий, но более сложный механизм обеспечивает котрансляционное встраивание трансмембранных белков в мембрану ЭПР.
 
[http://www.youtube.com/watch?v=PUy_Em5dXmc] - Видео с описанием транслокации белка в ЭПР. Также описан процесс встраивания в мембрану. Третье издание "Молекулярной биологии клетки" Б. Альбертса и др.
 
==== Посттрансляционный транспорт в ЭПР ====
 
''Существует также посттранляционный транспорт белков в ЭПР (более обычный у дрожжей), при котором полностью синтезированный белок связывается в цитозоле с шаперонами, а затем переносится в ЭПР через транслокатор при участии шаперонов семейства Hsp70. Этот вид транспорта является АТФ-зависимым. Для транспорта пептидов (длиной преимущественно в 8-16 аминокислот) из цитозоля в ЭПР для последующей их презентации в комплексе с молекулами MHC-I существует специальный транслокатор — TAP-белок.''
 
=== Транспорт белков из ЭПР в аппарат Гольджи ===
Белки поступают из ЭПР в АГ внутри окаймленных мембранных пузырьков, оболочка которых образуется из белка COP-II. Все правильно свернутые белки попадают в такие пузырьки «по умолчанию» и перемещаются в АГ, а затем некоторые из них возвращаются в ЭПР. Однако белки со специальными сигнальными метками концентрируются в транспортных пузырьках, а белки без таких меток попадают туда в небольшом количестве. Отделившиеся от ЭПР пузырьки, лишившись оболочек, сливаются в трубчато-везикулярные кластеры, которые с помощью моторных белков перемещаются по микротрубочкам к АГ. От этих кластеров (как и от цис-Гольджи) отделяются пузырьки, одетые белком COP-I, обеспечивающие обратный транспорт резидентных белков в ЭПР. Возврат белков в ЭПР обеспечивается короткой сигнальной последовательностью на их С-конце, которая связывается либо непосредственно с COP-I (для мембранных белков), либо со специфическим рецептором, взаимодействующим с COP-I (для растворимых белков). Лишенные этих последовательностей белки преимущественно остаются в АГ.
 
Заключённые в пузырьки белки постепенно перемещаются из цис-Гольджи в транс-Гольджи. По мере перемещения белков внутри АГ ферменты гликозилтрансферазы осуществляют модификацию их олигосахаридных «меток». С помощью подобных ферментов в АГ происходит синтез гликопротеидов — муцинов и протеогликанов.
 
=== Основная функция аппарата Гольджи — сортировка белков ===
 
=== Транспорт белков в лизосомы ===
 
==== Транспорт белков из АГ в лизосомы ====
 
Мембранные белки и пищеварительные ферменты лизосом поступают из транс-Гольджи в составе окаймленных клатрином пузырьков в раннюю эндосому, а оттуда — в лизосомы. Для попадания лизосомальных ферментов (кислых гидролаз) в лизосомы на них должна присутсвовать специальная метка — остатки маннозо-6-фосфата на концах олигосахаридных цепей.
 
Эта метка наносится в два этапа. Сперва в цис-Гольджи фермент N-ацетилглюкозаминфосфотрансфераза присоединяет к олигосахаридам остатки N-ацетилглюкозаминфосфата, а затем в транс-Гольджи второй фермент отщепляет N-ацетилглюкозамин.
 
Метка наносится на те белки, которые имеют специфические черты третичной структуры — «сигнальный бугорок» (signal patch). Затем маннозо-6-фосфаты опознаются специфическим мембранным рецептором, к которому присоединяются гидролазы. В эндосомах при понижении рН гидролазы отделяются от рецепторов. Затем рецепторы в составе специальных пузырьков доставляются обратно а АГ.
 
Мутации гена N-ацетилглюкозаминфосфотрансферазы приводят к развития тяжелой формы [[w:мукополисахаридоз|мукополисахаридоза]] — I-клеточной болезни. При этом заболевании все ферменты лизосом секретируются во внеклеточную среду.
 
==== Транспорт белков из внешней среды в лизосомы ====
 
Даже в норме часть лизосомальных ферментов выделяется из клетки, а часть мембранных белков лизосом попадает на её наружную мембрану. Из внеклеточной среды лизосомальные ферменты могут поглощаться путем эндоцитоза и доставляться в лизосомы (см. [2]).
 
==== Транспорт белков из цитоплазмы в лизосомы ====
 
Кроме везикулярного транспорта из АГ, существует и другой путь транспорта белков в лизосомы. Так, при шаперон-опосредованной аутофагии происходит направленный транспорт частично денатурировавших белков из цитоплазмы сквозь мембрану лизосомы в ее полость, где они перевариваются. Этот тип аутофагии, описанный только для млекопитающих, индуцируется стрессом. Она происходит при участии цитоплазматических белков-шаперонов семейства hsр-70, вспомогательных белков и LAMP-2, который служит мембранным рецептором комплекса шаперона и белка, подлежащего транспорту в лизосому. В антиген-презентирующих клетках (например, в дендритных клетках) транспорт пептидов, презентируемых в комплексе с MHC-II, может происходить прямо в лизосомы с помощью белка-транслокатора TAPL.
 
=== Транспорт белков в ядро и из ядра ===
 
[[File:Rancycle nuclearimport nuclearexport.png|thumb|right|Схема транспорта белков через ядерные поры]]
<big>В ядро и из ядра белки транспортируются через [[w:ядерные поры|ядерные поры]]. Через ядерную пору может одновременно транспортироваться до 500 макромолекул в обоих направлениях. Белки (пептиды) с молекулярной массой до 5.000 дальтон свободно диффундируют через ядерные поры (так что их концентрация в цитоплазме и в ядре одинаковая). Путем пассивного транспорта (диффузии) через поры могут проникать белки с молекулярной массой до 60.000 дальтон.</big>
 
<big>Из более крупных белков в ядро попадают только обладающие сигнальной последовательностью для ядра</big> (это один или два коротких участка белка, богатых остатками положительно заряженных аминокислот — аргинина или лизина). С этой последовательностью связываются специальные белки — рецепторы импорта в ядро (иногда с помощью дополнительных адаптерных белков). Рецепторы импорта в ядро связываются также с компонентами ядреных пор. Энергию для транспорта обеспечивает гидролиз ГТФ, осуществляемый малыми мономерными ГТФ-азами — Ran-белками. В цитоплазме Ran-белок находится в связанном с ГДФ виде, так как в цитоплазме локализованы Ran-GAP белки (белки-активаторы ГТФ-азной активности Ran), а в ядре Ran-белок находится в связанном с ГТФ виде, так как в ядре локализован белок, обеспечивающий обмен ГДФ на ГТФ. Ran-ГТФ, связываясь на внутренней стороне ядреной поры с «нагруженным» рецептором импорта в ядро, обеспечивает его прохождение внутрь ядра и разгрузку. Затем рецептор с присоединенным Ran-ГТФ выходит в цитоплазму, где GAP-белок вызывает гидролиз ГТФ и отделение Ran-ГДФ от рецептора импорта в ядро.
 
Аналогичный механизм обеспечивает экспорт белков из ядра, только эти белки должны обладать иной сигнальной последовательностью, с которой связываются рецепторы экспорта из ядра (белки, сходные по структуре с рецепторами импорта).
 
Подробнее этот вопрос рассмотрен в разделе [[#Транспорт веществ через ядерные поры|Транспорт веществ через ядерные поры]].
 
=== Транспорт белков из аппарата Гольджи на наружную мембрану ===
Белки, встроившиеся в мембрану ЭПС и попавшие оттуда в составе везикул в АГ, могут перемещаться на наружную мембрану клетки. Их направление к мембране осуществляется благодаря взаимодействию везикул с микротрубочками цитоскелета и благодаря особым стыковочным белкам, которые обеспечивают слияние везикул с мембраной.
 
=== Секреторная функция аппарата Гольджи ===
 
=== [[w:Эндоцитоз|Эндоцитоз]]: [[w:фагоцитоз|фагоцитоз]] и [[w:пиноцитоз|пиноцитоз]] ===
<big>
'''Эндоцитоз''' — способ поглощения клеткой веществ, при котором поглощаемые вещества окружаются мембраной и первоначально попадают в пузырек из мембраны.
 
'''Фагоцитоз''' — поглощение клеткой крупных оформленных частиц (обычно видимых в световой микроскоп, то есть размером не меньше сотен нанометров). Типичный пример фагоцитоза - поглощение бактерий амебой или клеткой-фагоцитом в теле человека.
 
'''Пиноцитоз''' — поглощение клеткой более мелких частиц: растворенных макромолекул (чаще всего белков) или их комплексов (например, поглощение [[w:липопротеины низкой плотности|ЛПНП]] клетками печени из плазмы крови). </big>
 
 
В целом механизмы фагоцитоза и пиноцитоза очень сходны; принципиальной разницы и четкой границы между этими процессами нет, хотя одно отличие все-таки можно указать. При пиноцитозе (если он рецептор-опосредованный, см. ниже) одна молекула рецептора обычно связывает одну молекулу лиганда; при фагоцитозе несколько молекул рецепторов связываются с поглощаемой частицей.
Типичный эндоцитоз встречается у эукариот, лишенных клеточной стенки - животных и многих протистов. Долгое время считалось, что прокариоты полностью лишены способности к эндоцитозу. Однако в 2010 г была опубликована статья, сообщающая об открытии эндоцитоза у бактерий рода ''Gemmata''.
 
[[Файл:Clathrin.png|thumb|right|Схема клатриновой оболочки эндоцитозного пузырька]]
[http://www.sumanasinc.com/webcontent/animations/content/endocytosis.html] — Анимация пиноцитоза (на примере поглощения холестерина в составе ЛПНП) (англ.текст)
 
=== [[w:Экзоцитоз|Экзоцитоз]] и трансцитоз ===
[[Файл:Exocytosis-machinery.jpg|thumb|400px|right|Молекулярная машина [[w:экзоцитоз|экзоцитозного]] высвобождения [[w:нейромедиатор|нейромедиатора]] в [[w:синапс|синапсе]]. ''SNARE'' комплекс формируется за счёт образования четырёхспиральной сцепки между [[w:синаптобревин|синаптобревином]], [[w:синтаксин|синтаксином]] и [[w:SNAP-25|SNAP-25]]. [[w:Синаптотагмин|Синаптотагмин]] служит кальциевым сенсором и внутренним регулятором образования белкового комплекса]]
 
[[w:Экзоцитоз|Экзоцитоз]] есть как у эукариот, так иу прокариот.
'''Экзоцитоз''' (от {{lang-el|Έξω}} — внешний и {{lang-el2|κύτος}} — клетка) у '''эукариот''' — клеточный процесс, при котором внутриклеточные везикулы (мембранные пузырьки) сливаются с наружной [[w:Клеточные мембраны|клеточной мембраной]]. При экзоцитозе содержимое секреторных [[w:везикула|везикул]] ([[w:экзоцитозный пузырек|экзоцитозных пузырьков]]) выделяется наружу, а их мембрана сливается с клеточной мембраной. Практически все макромолекулярные соединения (белки, пептидные гормоны и др.) выделяются из клеток эукариот этим способом.
 
У '''прокариот''' везикулярный механизм экзоцитоза не встречается, у них экзоцитозом называют встраивание белков в клеточную мембрану (или в наружную мембрану у грамотрицательных бактерий), выделение белков из клетки во внешнюю среду или в [[w:периплазматическое пространство|периплазматическое пространство]] <ref name="">Лузиков В. Н. Экзоцитоз белков (курс лекций). М.: ИКЦ «Академкнига», 2006, 253 с. </ref>.
 
Экзоцитоз может выполнять различные задачи:
* доставка на клеточную мембрану липидов, необходимого для роста клетки;
* доставка на клеточную мембрану [[w:Мембранные белки|мембранных белков]], таких как [[w:Клеточный рецептор|рецепторы]] или белки-транспортёры. При этом часть белка, которая была направлена внутрь секреторной везикулы, оказывается выступающей на наружной поверхности клетки;
* выделение различных веществ из клетки; это могут быть, например, непереваренные остатки пищи у фаготрофных протистов, пищеварительные ферменты у животных с полостным пищеварением, белки межклеточного вещества у животных и материал клеточной стенки у растений, сигнальные молекулы ([[w:гормон|гормоны]] или [[w:нейромедиатор|нейромедиаторы]]).
 
У эукариот различают два типа экзоцитоза:
# '''[[w:Кальций|Кальций]]-независимый''' конститутивный экзоцитоз встречается практически во всех эукариотических клетках. Это необходимый процесс для построения внеклеточного матрикса и доставки белков на внешнюю клеточную мембрану. При этом секреторные везикулы доставляются к поверхности клетки и сливаются с наружной мембраной по мере их образования.
# '''Кальций-зависимый''' неконститутивный экзоцитоз встречается, например, в химических [[w:синапс|синапсах]], где служит для выделения [[w:нейромедиатор|нейромедиаторов]]. При этом типе экзоцитоза секреторные пузырьки накапливаются в клетке, а процесс их высвобождения запускается по определённому сигналу, опосредованному быстрым повышением концентрации ионов кальция в [[w:цитозоль|цитозоле]] клетки. В пресинаптических мембранах процесс осуществляется специальным кальций-зависимым белковым комплексом ''[w:[SNARE|]]''.
 
=== Внутриклеточное пищеварение ===
 
==== Механизм внутриклеточного пищеварения ====
[[File:Phagocytosis2.png|thumb|right|Общая схема фагоцитоза и внутриклеточного пищеварения]]
 
==== Роль внутриклеточного пищеварения для животных ====
 
==== Аутофагия, её роль ====
[[Файл:Autophagy.jpg|thumb|400px|right]]
'''Аутофагия''' (от др.-греч. αὐτός — сам и φαγεῖν — «есть»), «самопожирание» — это процесс, при котором компоненты клетки доставляются внутрь её лизосом и подвергаются в них деградации.
 
Сейчас различают три типа аутофагии — микроаутофагию, макроаутофагию и шаперон-зависимую аутофагию.
 
 
При микроаутофагии, как при образовании мультивезикулярных телец, образуются впячивания мембраны эндосомы или лизосомы, которые затем отделяются в виде внутренних пузырьков, только в них попадают вещества, синтезированные в самой клетке. Таким путем клетка может переваривать белки при нехватке энергии или строительного материала (например, при голодании). Но процессы микроаутофагии происходят и при нормальных условиях и в целом неизбирательны. Иногда в ходе микроаутофагии перевариваются и органоиды; так, у дрожжей описана микроаутофагия пероксисом и частичная микроаутофагия ядер, при которой клетка сохраняет жизнеспособность.
 
При макроаутофагии участок цитоплазмы (часто содержащий какие-либо органоиды) окружается мембранным компартментом, похожим на цистерну эндоплазматической сети. В результате этот участок отделяется от остальной цитоплазмы двумя мембранами. Такие двухмембранные органеллы, окружающие удаляемые органеллы и цитоплазму, называются аутофагосомы. Аутофагосомы соединяются с [[w:лизосома|лизосомами]], образуя аутофаголизосомы, в которых органеллы и остальное содержимое аутофагосом перевариваются.
 
Видимо, макроаутофагия также неизбирательна, хотя часто подчеркивается, что с помощью нее клетка может избавляться от «отслуживших свой срок» органоидов (митохондрий. рибосом и др.).
 
Третий тип аутофагии — шаперон-опосредованная. При этом способе происходит направленный транспорт частично денатурировавших белков из цитоплазмы сквозь мембрану лизосомы в ее полость, где они перевариваются. Этот тип аутофагии, описанный только для млекопитающих, индуцируется стрессом. Она происходит при участии цитоплазматических белков-[[w:шаперон|шаперонов]] семейства hsc-70, вспомогательных белков и [[w:LAMP-2|LAMP-2]], который служит мембранным рецептором комплекса шаперона и белка, подлежащего транспорту в лизосому.
 
При аутофагическом типе клеточной гибели перевариваются все органеллы клетки, оставляя лишь [[w:клеточный дебрис|клеточный дебрис]], поглощаемый [[w:макрофаг|макрофагами]].
 
==== Патологии при нарушениях внутриклеточного пищеварения ====
 
=== Клетки и межклеточное вещество ===
 
==== Образование и состав межклеточного вещества ====
 
==== Взаимодействия клеток с межклеточным веществом ====
 
== Транспорт белков в ядро, митохондрии и хлоропласты. Деградация белков ==
 
=== Транспорт белков в митохондрии и хлоропласты ===
 
=== Деградация белков. Строение и работа протеасом ===
[[Файл:Proteaosome 1fnt side.png|thumb|right|Схема строения протеасомы (вид сбоку). Активный сайт находится внутри цилиндра (показан синим). Красным показаны 11S регуляторные частицы, которые регулируют поступление белков в «деградационную камеру»]]
[[Файл:Proteaosome 1fnt top.png|thumb|right|Протеасома (вид сверху)]]
 
[[Файл:Ubiquitylation.png|thumb|250px|Схема убиквитинилирования белков]]
 
<big>Белки не вечны. Они вступают в химические реакции, в результате которых «портятся», утрачивают работоспособность. Поэтому практически все белки в клетке и в организме регулярно заменяются. «Испорченные» белки внутри клеток метятся с помощью специального белка — [[w:убиквитин|убиквитина]]. Помеченные убиквитином белки поступают в специальные органоиды — [[w:протеасома|протеасомы]], внутри которых распадаются на отдельные аминокислоты. </big>
 
'''Убиквити́н''' (от {{lang-en|ubiquitous}} — ''вездесущий'') — небольшой консервативный [[w:белки|белок]], который у [[w:эукариоты|эукариот]] может присоединяться к другим белкам. Убиквитинирование — это [[w:посттрансляционная модификация|посттрасляционное]] присоединение [[w:фермент|ферментами]] [[w:убиквитин-лигаза|убиквитин-лигаза]]ми одного или, чаще, нескольких [[w:мономер|мономеров]] убиквитина с помощью [[w:ковалентная связь|ковалентной связи]] к боковым [[w:аминогруппа|аминогруппам]] белка-мишени. Присоединение убиквитина влияет на внутриклеточную локализацию и функцию белков. Самым первым открытием роли убиквитина в клетке стало доказательство его участия в деградации белков. Белки, помеченных мультиубиквитиновыми цепями, расщепляются с помощью 26S-[[w:протеасома| протеасомы]]. Однако впоследствии оказалось, что система убиквитина вовлечена и в такие важные процессы, как размножение и дифференцировка клеток, реакция на стресс и патогены, репарация ДНК.
 
В 2004 г [[w:Чехановер, Аарон|Аарон Чехановер]], [[w:Гершко, Аврам|Аврам Гершко]] и [[w:Роуз, Ирвин|Ирвин Роуз]] были удостоены [[w:Нобелевская премия по химии|Нобелевской премии по химии]] «за открытие убиквитин-опосредованной деградации белка».